BioLiP

>protein
NLRAAGPGWLFCPADRPERFAKAAAAADVVILDLEDGVAEAQKPAARNALRDTPLDPERTVVRINAGGTADQARDLEALA
GTAYTTVMLPKAESAAQVIELAPRDVIALVETARGAVCAAEIAAADPTVGMMWGAEDLIATLGGSSSRRADGAYRDVARH
VRSTILLAASAFGRLALDAVHLDILDVEGLQEEARDAAAVGFDVTVCIHPSQIPVVRKAYRPSHEKLAWARRVLAASRSE
RGAFAFEGQMVDSPVLTHAETMLRRAGE

The query sequence (length=268) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6aq4:B	268	267	0.9963	0.9963	1.0000	0.0	6aq4:A, 6aq4:C, 6arb:A, 6arb:B, 6arb:C, 6as5:A, 6as5:C, 6as5:B, 6chu:A, 6cj3:A, 6cj4:A, 1u5v:A, 1z6k:A
2	5vxc:A	301	287	0.3619	0.3223	0.3380	7.04e-41	5vxo:A, 5vxo:B, 5vxo:C
3	8khl:A	275	268	0.4291	0.4182	0.4291	2.03e-36	8khl:B, 8khl:C, 8wco:A, 8wco:C, 8wco:B
4	4l9y:C	316	296	0.3582	0.3038	0.3243	3.19e-23	4l9y:A, 4l9y:B, 4l9y:D, 4l9y:E, 4l9y:F, 4l9z:A, 4l9z:B, 4l9z:C, 4l9z:D, 4l9z:E, 4l9z:F
5	5ugr:A	323	301	0.3172	0.2632	0.2824	6.05e-19
6	1sgj:A	231	228	0.2761	0.3203	0.3246	3.47e-16	1sgj:B, 1sgj:C
7	4l80:C	347	286	0.2687	0.2075	0.2517	2.45e-13	6kkh:C, 6kkh:F, 6kkh:I, 6kkh:L, 4l80:A, 4l80:B, 4l80:D, 4l80:F, 4l80:E
8	3r4i:A	321	265	0.2388	0.1994	0.2415	3.68e-04	3r4i:B, 3r4i:C, 3r4i:D, 3r4i:E, 3r4i:F
9	8cou:A	413	46	0.0821	0.0533	0.4783	0.26	4b7v:A, 4b7v:B, 8cn2:B, 8cn2:A, 8cn4:A, 8cn4:B, 8cn5:B, 8cn5:A, 8cn7:A, 8cn7:B, 8cne:A, 8cne:B, 8cng:A, 8cng:B, 8cou:B, 8cov:A, 8cov:B, 4jb6:A, 4jb6:B, 4jpf:A, 7oc0:A, 7oc0:B, 7oc1:A, 7oc1:B, 8pd1:A, 8pd1:B, 8pfz:A, 8pfz:B, 8pj0:A, 8pj0:B, 8pj0:C, 8pj0:D, 8qer:A, 8qer:B, 8qm1:A, 8qm1:B, 8r0i:A, 8r0i:B, 8r1v:A, 8r1v:B, 5sn5:A, 5sn6:A, 5sn7:A, 5sn7:B, 5sn8:A, 5sn9:A, 5sna:B, 5snb:A, 5snc:A, 5snd:A, 5snd:B, 5sne:A, 5sne:B, 5snf:A, 5sng:A, 5snh:A, 5snh:B, 5sni:A, 5sni:B, 5snj:A, 5snj:B, 5snk:A, 5snl:B, 5snm:A, 5snn:A, 5snn:B, 5sno:A, 5sno:B, 5snp:A, 5snp:B, 5snq:B, 5sns:B, 5snt:A, 5snu:A, 5snu:B, 5snv:A, 5snv:B, 5snw:A, 5snx:A, 5snx:B, 5sny:A, 5snz:B, 5so0:A, 5so0:B, 5so1:A, 5so1:B, 5so2:A, 5so2:B, 5so3:A, 5so4:A, 5so4:B, 5so5:A, 5so5:B, 5so6:A, 5so7:A, 5so7:B, 5so8:A, 5so8:B, 5so9:B, 5soa:A, 5sob:A, 5sob:B, 5soc:A, 5soc:B, 5sod:A, 5soe:A, 5soe:B, 5sof:A, 5sog:A, 5sog:B, 5soh:A
10	3oyz:A	376	53	0.0709	0.0505	0.3585	0.75
11	5tao:A	356	53	0.0709	0.0534	0.3585	0.86	3oyx:A, 3pug:A
12	4cnj:A	391	60	0.0821	0.0563	0.3667	1.2	4cnj:B, 4cnj:C, 4cnj:D, 4cnk:A, 4cnk:B
13	7ane:t	226	45	0.0672	0.0796	0.4000	1.4
14	2h0v:A	335	16	0.0448	0.0358	0.7500	7.5	2h0v:B, 8hfb:A, 8hfb:B, 1y3t:A, 1y3t:B
15	6f45:B	72	55	0.0560	0.2083	0.2727	7.7	6f45:A
16	6hac:A	342	70	0.0821	0.0643	0.3143	9.1	6hae:A, 6hae:K, 6hav:A

[Back]