BioLiP

>protein
NLQDILAANAKWASQMNNIQPTLFSPHTLFIGCSDSRYNENCLGVLPGEVFTWKNVANICHSEDLTLKATLEFAIICLKV
NKVIICGHTDCGGIKTCLTNQREALPKVNCSHLYKYLDDIDTMYHEESQNLIHLKTQREKSHYLSHCNVKRQFNRIIENP
TVQTAVQNGELQVYGLLYNVEDGLLQTVSTYTKVTPK

The query sequence (length=197) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3eyx:A	197	197	1.0000	1.0000	1.0000	5.22e-149	3eyx:B
2	6gwu:A	208	169	0.3198	0.3029	0.3728	3.45e-34	6gwu:B, 6gwu:C, 6gwu:D
3	7coj:A	211	193	0.3503	0.3270	0.3575	1.08e-32	7coi:A, 7coi:B, 7coi:C, 7coi:D, 7coj:B, 7coj:C, 7coj:D
4	5bq1:A	209	209	0.3350	0.3158	0.3158	5.50e-30	6d2j:A, 6d2m:A, 6d2n:A, 6d2o:A, 5jj8:A, 5jj8:B, 4rxy:A
5	4o1j:A	197	195	0.2893	0.2893	0.2923	7.34e-28	4o1j:B
6	4o1k:A	211	195	0.2843	0.2654	0.2872	2.40e-25
7	1ddz:A	481	196	0.3350	0.1372	0.3367	2.05e-24	1ddz:B
8	1ddz:A	481	199	0.3198	0.1310	0.3166	4.69e-24	1ddz:B
9	2a8c:A	221	193	0.2995	0.2670	0.3057	5.13e-24	2a8c:B, 2a8c:C, 2a8c:D, 2a8c:E, 2a8c:F, 2a8d:A, 2a8d:B, 2a8d:C, 2a8d:D, 2a8d:E, 2a8d:F, 3e1v:A, 3e1v:B, 3e1w:A, 3e1w:B, 3e24:A, 3e24:B, 3e28:A, 3e28:B, 3e28:C, 3e28:D, 3e28:E, 3e28:F, 3e2a:A, 3e2a:B, 3e2a:C, 3e2a:D, 3e2a:E, 3e2a:F, 3e2w:A, 3e2w:B, 3e2w:C, 3e2w:D, 3e2w:E, 3e2w:F, 3e2x:A, 3e2x:B, 3e31:A, 3e31:B, 3e3f:A, 3e3f:B, 3e3g:A, 3e3g:B, 3e3g:C, 3e3g:D, 3e3g:E, 3e3g:F, 3e3i:A, 3e3i:B, 3e3i:C, 3e3i:D, 3e3i:E, 3e3i:F, 3e3i:G, 3e3i:H, 3e3i:I, 3e3i:J, 3e3i:K, 3e3i:L, 3mf3:A, 3mf3:B, 3mf3:C, 3mf3:D, 3mf3:E, 3mf3:F, 4waj:A, 4waj:B, 4wak:A, 4wak:B, 4wam:A, 4wam:B
10	7cxy:A	214	193	0.2843	0.2617	0.2902	1.28e-23	7cxy:B
11	3qy1:B	216	199	0.2944	0.2685	0.2915	5.59e-23	2esf:A, 2esf:B, 1i6o:A, 1i6o:B, 1i6p:A, 3qy1:A, 7sev:A, 1t75:A, 1t75:B, 1t75:D, 1t75:E, 4znz:A
12	5cxk:A	222	198	0.2792	0.2477	0.2778	2.86e-22	5cxk:B, 5cxk:H, 5cxk:G, 5cxk:D, 5cxk:C, 5cxk:F, 5cxk:E
13	3ucj:A	222	195	0.2944	0.2613	0.2974	1.05e-21	3ucj:B, 3uck:A, 3uck:B, 3ucm:A, 3ucm:B, 3ucn:A, 3ucn:B, 3uco:A, 3uco:B
14	2w3n:A	230	199	0.2995	0.2565	0.2965	1.06e-20	2w3n:B, 2w3n:C, 2w3q:A
15	6yjn:A	212	190	0.2792	0.2594	0.2895	4.22e-19	6yl7:A
16	5swc:A	223	172	0.2437	0.2152	0.2791	1.44e-15	5swc:B, 5swc:C, 5swc:D, 5swc:E, 5swc:F
17	6lai:A	172	154	0.2284	0.2616	0.2922	1.09e-13	6jqe:A, 6jqe:B, 6lac:A, 6lac:B, 6lai:B
18	1ekj:G	220	80	0.1574	0.1409	0.3875	8.40e-11	1ekj:A, 1ekj:B, 1ekj:C, 1ekj:D, 1ekj:E, 1ekj:F, 1ekj:H
19	1g5c:A	169	94	0.1624	0.1893	0.3404	1.24e-06	1g5c:B, 1g5c:C, 1g5c:D, 1g5c:E, 1g5c:F
20	2a5v:A	210	171	0.1777	0.1667	0.2047	8.04e-05	2a5v:B, 2a5v:C, 2a5v:D, 1ym3:A
21	4yf4:A	163	91	0.1371	0.1656	0.2967	2.75e-04	4yf4:B, 4yf4:C, 4yf4:D, 4yf5:A, 4yf5:C, 4yf6:A, 4yf6:C, 1ylk:A, 1ylk:B, 1ylk:C, 1ylk:D
22	3ten:A	201	64	0.0964	0.0945	0.2969	0.060	3ten:B, 3ten:C, 3ten:D, 3ten:E, 3ten:F, 3ten:G, 3ten:H
23	3w0l:B	598	86	0.1269	0.0418	0.2907	0.11	3w0l:D
24	6l2m:A	144	46	0.0660	0.0903	0.2826	1.4	6l2l:A
25	4ako:A	506	92	0.1320	0.0514	0.2826	3.7	4a66:A, 4a67:A, 4a68:A, 4akp:A, 4akq:A, 2bhf:A, 1gsk:A, 1of0:A, 4q89:A, 4q89:B, 4q8b:A, 4q8b:B, 1w6l:A, 1w6w:A, 1w8e:A, 2wsd:A, 2x87:A, 2x88:A, 7y8b:A, 7y8b:B, 7y8c:A, 7y8c:B, 4yvn:A, 4yvu:A, 3zdw:A, 5zlj:A, 5zlk:A, 5zll:A, 5zlm:A
26	4r9x:A	225	97	0.0964	0.0844	0.1959	4.4	4r9x:B
27	3i77:A	230	41	0.0609	0.0522	0.2927	5.0	3beu:A, 3beu:B, 2fmj:A, 1os8:A, 1oss:A, 1sgt:A

[Back]