BioLiP

>protein
NLPNIVILATGGTIAGVETLIQAVPELKTLANIKGEQVASIGSENMTSDVLLTLSKRVNELLARSDVDGVVITHGTDTLD
ESPYFLNLTVKSDKPVVFVAAMRPATAISADGPMNLYGAVKVAADKNSRGRGVLVVLNDRIGSARFISKTNASTLDTFKA
PEEGYLGVIIGDKIYYQTRLDKVHTTRSVFDVTNVDKLPAVDIIYGYQDDPEYMYDASIKHGVKGIVYAGMGAGSVSKRG
DAGIRKAESKGIVVVRSSRTGSGIVPPDAGQPGLVADSLSPAKSRILLMLALTKTTNPAVIQDYFHAY

The query sequence (length=308) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2gvn:A	325	325	1.0000	0.9477	0.9477	0.0	2gvn:B, 2gvn:C, 2gvn:D, 2gvn:E, 2gvn:F, 2gvn:G, 2gvn:H, 2hln:A, 2hln:B, 2hln:E, 2hln:F, 2hln:C, 2hln:D, 2hln:G, 2hln:H, 2hln:I, 2hln:J, 2hln:K, 2hln:L, 2jk0:A, 2jk0:B, 2jk0:C, 2jk0:D, 2jk0:E, 2jk0:F, 2jk0:G, 2jk0:H
2	7u6m:C	342	324	0.7792	0.7018	0.7407	5.47e-175	5f52:A, 5f52:B, 5f52:C, 5f52:D, 1hfw:A, 1hfw:B, 1hfw:C, 1hfw:D, 1hg0:A, 1hg0:B, 1hg0:C, 1hg0:D, 1hg1:A, 1hg1:B, 1hg1:C, 1hg1:D, 5hw0:A, 5hw0:B, 5hw0:C, 5hw0:D, 5i3z:A, 5i3z:B, 5i3z:C, 5i3z:D, 5i48:A, 5i48:B, 5i48:C, 5i48:D, 5i4b:A, 5i4b:B, 5i4b:C, 1jsl:A, 1jsl:B, 1jsl:C, 1jsl:D, 1jsr:A, 1jsr:B, 1jsr:C, 1jsr:D, 6pae:A, 6pae:B, 6pae:C, 6pae:D, 7u6m:A, 7u6m:B, 7u6m:D
3	5k3o:A	328	327	0.5032	0.4726	0.4740	1.26e-100	5k3o:B, 5k3o:C, 5k3o:D, 5k45:A, 5k45:B, 5k45:C, 5k45:D, 5k4g:A, 5k4g:B, 5k4g:C, 5k4g:D, 5k4h:A, 5k4h:B, 5k4h:C, 5k4h:D, 5k4h:E, 5k4h:F, 5k4h:G, 5k4h:H, 6rue:A, 6rue:B, 6rue:C, 6rue:D, 6ruf:A, 6ruf:B, 6ruf:C, 6ruf:D
4	2wlt:A	326	327	0.4870	0.4601	0.4587	1.02e-85	2wt4:A
5	1djo:A	330	299	0.4578	0.4273	0.4716	1.52e-84	1djo:B, 1djp:A, 1djp:B, 4pga:A, 4pga:B, 6wyw:A, 6wyw:B, 6wyw:C, 6wyw:D, 6wyx:A, 6wyx:B, 6wyx:C, 6wyx:D, 6wyy:A, 6wyy:B, 6wyy:C, 6wyy:D, 6wyz:A, 6wyz:B, 6wyz:C, 6wyz:D, 6wz4:A, 6wz4:B, 6wz4:C, 6wz4:D, 6wz6:A, 6wz6:B, 6wz6:C, 6wz6:D
6	6pa3:A	334	298	0.4610	0.4251	0.4765	3.82e-80	3eca:A, 3eca:B, 3eca:C, 3eca:D, 8ecd:A, 8ecd:B, 8ecd:C, 8ecd:D, 8ece:A, 8ece:B, 8ece:C, 8ece:D, 6eok:B, 6eok:C, 6eok:D, 1ho3:A, 1ho3:B, 1jaz:A, 1jaz:B, 7m11:A, 7m11:B, 7m11:C, 7m11:D, 5mq5:A, 5mq5:C, 5mq5:B, 5mq5:D, 1nns:A, 1nns:B, 6pa2:A, 6pa2:C, 6pa2:B, 6pa2:D, 6pa3:B, 6pa3:C, 6pa3:D, 6pa4:A, 6pa4:B, 6pa4:C, 6pa4:D, 6pa5:A, 6pa5:B, 6pa5:C, 6pa5:D, 6pa5:E, 6pa5:F, 6pa5:G, 6pa5:H, 6pa6:A, 6pa6:B, 6pa6:C, 6pa6:D, 6pa8:A, 6pa8:B, 6pa8:C, 6pa8:D, 6pa9:A, 6pa9:B, 6paa:A, 6paa:B, 6paa:C, 6paa:D, 6pab:A, 6pab:B, 6pab:C, 6pab:D, 6pac:A, 6pac:B, 6pac:C, 6pac:D, 7r5q:A, 7r5q:B, 7r5q:C, 7r5q:D, 6uog:A, 6uog:B, 6uog:C, 6uog:D, 6uog:E, 6uog:F, 6uog:G, 6uog:H, 6uoh:A, 6uoh:B, 6v24:A, 6v24:D, 6v25:A, 6v25:B, 6v26:A, 6v26:B, 6v26:C, 6v26:D, 6v29:A, 6v29:B, 6v29:C, 6v29:D, 6v2a:A, 6v2a:B, 6v2a:C, 6v2a:D, 6v2b:A, 6v2b:B, 6v2b:C, 6v2b:D, 6v5f:A, 6v5f:D
7	8h4a:B	328	278	0.2987	0.2805	0.3309	4.32e-36	7c8q:A, 7c8q:B, 7c8x:A, 7c8x:B, 7c91:B, 7c91:A, 7cb4:B, 7cb4:A, 7cbr:A, 7cbr:B, 7cbu:A, 7cbu:B, 7cbw:A, 7cbw:B, 8h44:A, 8h44:B, 8h45:A, 8h45:B, 8h46:A, 8h46:B, 8h47:A, 8h47:B, 8h48:A, 8h48:B, 8h49:A, 8h49:B, 8h4a:A, 8h4b:A, 8h4b:B, 8h4c:A, 8h4c:B, 8h4d:A, 8h4d:B, 8h4e:A, 8h4e:B, 8h4f:A, 8h4f:B, 8h4g:A, 8h4g:B
8	1zq1:A	437	328	0.2890	0.2037	0.2713	2.18e-18	1zq1:B
9	4q0m:A	327	273	0.2468	0.2324	0.2784	1.32e-16	5b5u:A, 5b74:B, 4nje:A
10	5ot0:A	328	251	0.2208	0.2073	0.2709	8.21e-13	5ot0:B, 5ot0:C, 5ot0:D, 5ot0:E, 5ot0:F
11	5dnd:D	357	230	0.1688	0.1457	0.2261	2.04e-09	5dnc:A, 5dnc:B, 5dnc:C, 5dnc:D, 5dnd:A, 5dnd:B, 5dnd:C, 5dne:A, 5dne:B, 5dne:C, 5dne:D, 4r8l:A, 4r8l:B, 4r8l:C, 4r8l:D
12	6nxc:B	336	97	0.1039	0.0952	0.3299	2.35e-07	2him:A, 2him:B, 2him:C, 2him:D, 6nxc:A, 6nxc:C, 6nxc:D, 6nxd:A, 6nxd:B, 6nxd:C, 6nxd:D, 2p2n:A, 2p2n:B, 2p2n:C, 2p2n:D
13	7r6b:B	301	60	0.0682	0.0698	0.3500	0.007
14	8uou:A	169	57	0.0649	0.1183	0.3509	0.28	8uou:B, 8up3:E, 8up3:F, 8up6:B, 8up6:C, 8up8:A, 8up8:B, 8up8:C
15	1i7p:A	272	104	0.0812	0.0919	0.2404	7.0	1ib0:A, 1qx4:A, 1qx4:B

[Back]