BioLiP

>protein
NLKLGFLVKQPEEPWFQTEWKFADKAGKDLGFEVIKIAVPDGEKTLNAIDSLAASGAKGFVICTPDPKLGSAIVAKARGY
DMKVIAVDDQFVNAKGKPMDTVPLVMMAATKIGERQGQELYKEMQKRGWDVKESAVMAITANELDTARRRTTGSMDALKA
AGFPEKQIYQVPTKSNDIPGAFDAANSMLVQHPEVKHWLIVGMNDSTVLGGVRATEGQGFKAADIIGIGINGVDAVSELS
KAQATGFYGSLLGSPDVHGYKSSEMLYNWVAKDVEPPKFTEVTDVVLITRDNFKEELEKKGLGGK

The query sequence (length=305) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1abe:A	305	305	0.9967	0.9967	0.9967	0.0	1abf:A, 5abp:A, 6abp:A, 7abp:A, 8abp:A, 9abp:A, 1apb:A, 1bap:A
2	4kzk:A	301	302	0.4525	0.4585	0.4570	1.87e-90
3	5ibq:A	287	291	0.2131	0.2265	0.2234	2.07e-08	4ry0:A
4	5kws:A	307	237	0.1836	0.1824	0.2363	2.96e-06
5	2fn8:A	292	294	0.2197	0.2295	0.2279	5.07e-06
6	2gbp:A	309	234	0.1836	0.1812	0.2393	2.68e-05	2fvy:A, 2fw0:A, 8fxt:A, 3ga5:A, 3ga5:B, 3gbp:A, 1gca:A, 1gcg:A, 1glg:A, 2hph:A, 2ipl:A, 2ipm:A, 2ipn:A, 2qw1:A
7	2ioy:A	274	293	0.2197	0.2445	0.2287	3.21e-05	2ioy:B
8	4ry9:A	297	222	0.1738	0.1785	0.2387	7.73e-04	4ry9:B
9	4ys6:A	324	138	0.1213	0.1142	0.2681	0.047
10	4rxm:A	291	114	0.1016	0.1065	0.2719	0.19	4rxm:B
11	2vk2:A	296	103	0.1016	0.1047	0.3010	0.25
12	2v0n:A	459	94	0.0820	0.0545	0.2660	1.3	2v0n:B, 1w25:A, 1w25:B, 2wb4:A, 2wb4:B
13	3urm:A	329	115	0.0918	0.0851	0.2435	1.9	3urm:B, 3uug:A, 3uug:B
14	4rxu:A	340	89	0.0885	0.0794	0.3034	2.0
15	1dxq:A	273	75	0.0721	0.0806	0.2933	3.5	1dxq:C, 1dxq:B, 1dxq:D, 1qrd:A, 1qrd:B
16	6oat:A	158	103	0.0885	0.1709	0.2621	3.7	6oat:C
17	5e68:B	172	26	0.0393	0.0698	0.4615	4.1	5e68:A, 5v2w:A, 5v2w:B
18	2xzj:A	386	53	0.0557	0.0440	0.3208	5.5	4m4v:A, 2xzi:A, 2xzi:B, 2xzj:B, 2xzk:A, 2xzk:B
19	6xbb:H	420	46	0.0557	0.0405	0.3696	7.2	6xbb:A, 6xbb:B, 6xbb:C, 6xbb:D, 6xbb:E, 6xbb:F, 6xbb:G, 6xbc:A, 6xbc:B, 6xbc:C, 6xbc:D, 6xbc:E, 6xbc:F, 6xbc:G, 6xbc:H
20	4z0n:A	307	263	0.2033	0.2020	0.2357	9.2
21	3bow:B	174	18	0.0361	0.0632	0.6111	9.8	1alv:A, 1alv:B, 1alw:A, 1alw:B, 5d69:A, 5d69:B, 3df0:B, 1dvi:A, 1dvi:B, 1np8:A, 1np8:B, 1nx0:A, 1nx0:B, 1nx1:A, 1nx1:B, 1nx2:A, 1nx3:A, 4phj:A, 4phj:B, 4phk:A, 4phk:B, 4phm:A, 4phm:B, 4phn:A, 4phn:B, 6qlb:A, 6qlb:B, 6qlb:C, 6qlb:D, 4wq2:A, 4wq2:B, 4wq3:A, 4wq3:B
22	3c9i:B	242	31	0.0525	0.0661	0.5161	9.8	3c9i:C, 3c9i:A, 3c9i:E, 3c9i:F, 3c9i:D, 4zkp:A, 4zkp:B, 4zku:A, 4zku:B

[Back]