BioLiP

>protein
NLIKQLQERGLVAQVTDEEALAERLAQGPIALYCGFDPTADSLHLGHLVPLLCLKRFQQAGHKPVALVGGATGLIGDPSF
KAAERKLNTEETVQEWVDKIRKQVAPFLDFDCGENSAIAANNYDWFGNMNVLTFLRDIGKHFSVNQMINKEAVKQRLNRE
DQGISFTEFSYNLLQGYDFACLNKQYGVVLQIGGSDQWGNITSGIDLTRRLHQNQVFGLTVPLITKADGTKFGKTEGGAV
WLDPKKTSPYKFYQFWINTADADVYRFLKFFTFMSIEEINALEEEPRAQYVLAEQVTRLVHGEEGLQAAKRITECLFSGS
LSALSEADFEQLAQDGVPMVEMEKGADLMQALVDSELQPSRGQARKTIASNAITINGEKQSDPEYFFKEEERLFGRFTLL
RRGKKNYCLICWK

The query sequence (length=413) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6hb5:B	417	420	0.9927	0.9832	0.9762	0.0	7ap3:A, 7ap3:B, 6hb5:A, 6hb6:A, 6hb6:B, 6hb7:A, 6hb7:B, 6i5y:A, 6i5y:B, 4oud:A, 1vbm:A, 1vbm:B, 1vbn:A, 1vbn:B, 6wn2:A, 6wn2:B, 1wq3:A, 1wq4:A, 1x8x:A, 2yxn:A
2	6otj:B	431	427	0.6465	0.6195	0.6253	0.0	6otj:A
3	3ts1:A	317	320	0.4722	0.6151	0.6094	2.30e-141	4ts1:A, 4ts1:B, 1tya:E, 1tyb:E, 1tyd:E
4	1jil:A	323	324	0.4140	0.5294	0.5278	5.44e-124	1jii:A, 1jij:A, 1jik:A
5	4ojm:X	382	345	0.2930	0.3168	0.3507	5.93e-65	2rkj:B, 2rkj:F, 2rkj:J, 2rkj:N, 1y42:X
6	2pid:B	324	305	0.3099	0.3951	0.4197	1.21e-64	2pid:A, 3zxi:A, 3zxi:B
7	5ihx:A	360	352	0.2663	0.3056	0.3125	3.82e-50
8	5ijx:A	365	338	0.2712	0.3068	0.3314	8.42e-46
9	6bqz:A	215	219	0.1671	0.3209	0.3151	3.48e-25	6bqz:B
10	1h3e:A	427	439	0.2712	0.2623	0.2551	1.91e-23
11	1h3f:B	406	425	0.2567	0.2611	0.2494	4.46e-20	1h3f:A
12	2cyb:A	319	225	0.1162	0.1505	0.2133	3.63e-06	2cyb:B
13	3kt8:D	410	60	0.0484	0.0488	0.3333	5.95e-04	3kt0:A, 3kt3:A, 3kt3:B, 3kt3:C, 3kt3:D, 3kt6:A, 3kt6:B, 3kt6:C, 3kt6:D, 3kt8:A, 3kt8:B, 3kt8:C
14	3tze:A	360	53	0.0460	0.0528	0.3585	0.002	3tze:B
15	3hv0:A	352	60	0.0484	0.0568	0.3333	0.005	3hv0:B
16	5ujj:A	446	39	0.0315	0.0291	0.3333	0.014	2ake:A, 2azx:A, 2azx:B, 2dr2:A, 2quh:A, 2quh:B, 2qui:A, 2qui:B, 2quj:A, 2quj:B, 1r6t:A, 1r6u:A, 5ujj:B
17	4jfa:C	348	60	0.0460	0.0546	0.3167	0.025
18	4j75:A	374	60	0.0460	0.0508	0.3167	0.029	4j75:B, 4jfa:A, 4jfa:B, 4jfa:D
19	5mrc:DD	287	96	0.0630	0.0906	0.2708	0.56	5mre:DD, 5mrf:DD
20	1hpl:A	449	119	0.0775	0.0713	0.2689	1.0	1hpl:B
21	7jil:i	194	40	0.0339	0.0722	0.3500	1.3
22	1h9t:A	232	30	0.0291	0.0517	0.4000	1.8	1h9g:A, 1h9t:B, 1hw2:A, 1hw2:B
23	5n0c:A	1293	49	0.0484	0.0155	0.4082	2.0	1dfq:A, 1diw:A, 1dll:A, 1fv2:A, 1fv3:A, 1fv3:B, 3hmy:A, 3hn1:A, 5n0b:A, 5n0c:B, 1yxw:A, 1yyn:A, 1z7h:A
24	5b2o:A	1455	115	0.0702	0.0199	0.2522	5.8	5b2p:A, 5b2q:A
25	8d8j:D	308	97	0.0726	0.0974	0.3093	7.0	8d8k:D
26	7xcm:A	494	60	0.0460	0.0385	0.3167	9.7	7xcm:B, 7xcm:C, 7xcm:D, 7xcm:E, 7xcm:F, 7xcn:A, 7xcn:B, 7xcn:C, 7xcn:D, 7xcn:E, 7xcn:F

[Back]