BioLiP

>protein
NLIKQLQERGLVAQVTDEEALAERLAQGPIALYCGFDPTADSLHLGHLVPLLCLKRFQQAGHKPVALVGGATGLIGDPSF
KAAERKLNTEETVQEWVDKIRKQVAPFLDFDCGENSAIAANNYDWFGNMNVLTFLRDIGKHFSVNQMINKEAVKQRLNRE
DQGISFTEFSYNLLQGYDFACLNKQYGVVLQIGGSDQWGNITSGIDLTRRLHQNQVFGLTVPLITKADGTKFGKAVWLDP
KKTSPYKFYQFWINTADADVYRFLKFFTFMSIEEINALEEEDKNSGKAPRAQYVLAEQVTRLVHGEEGLQAAKRITECLF
SGSLSALSEADFEQLAQDGVPMVEMEKGADLMQALVDSELQPSRGQARKTIASNAITINGEKQSDPEYFFKEEERLFGRF
TLLRRGKKNYCLICWK

The query sequence (length=416) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6hb5:B	417	417	1.0000	0.9976	0.9976	0.0	7ap3:A, 7ap3:B, 6hb5:A, 6hb6:A, 6hb6:B, 6hb7:A, 6hb7:B, 6i5y:A, 6i5y:B, 4oud:A, 1vbm:A, 1vbm:B, 1vbn:A, 1vbn:B, 6wn2:A, 6wn2:B, 1wq3:A, 1wq4:A, 1x8x:A, 2yxn:A
2	6otj:B	431	427	0.6418	0.6195	0.6253	0.0	6otj:A
3	3ts1:A	317	320	0.4591	0.6025	0.5969	4.43e-138	4ts1:A, 4ts1:B, 1tya:E, 1tyb:E, 1tyd:E
4	1jil:A	323	324	0.4014	0.5170	0.5154	9.27e-122	1jii:A, 1jij:A, 1jik:A
5	2pid:B	324	301	0.3005	0.3858	0.4153	1.20e-65	2pid:A, 3zxi:A, 3zxi:B
6	4ojm:X	382	345	0.2861	0.3115	0.3449	1.40e-63	2rkj:B, 2rkj:F, 2rkj:J, 2rkj:N, 1y42:X
7	5ihx:A	360	348	0.2644	0.3056	0.3161	2.29e-52
8	5ijx:A	365	334	0.2692	0.3068	0.3353	4.05e-48
9	6bqz:A	215	219	0.1659	0.3209	0.3151	4.28e-25	6bqz:B
10	1h3e:A	427	446	0.2716	0.2646	0.2534	2.08e-23
11	1h3f:B	406	432	0.2572	0.2635	0.2477	4.03e-20	1h3f:A
12	2cyb:A	319	203	0.1058	0.1379	0.2167	7.21e-05	2cyb:B
13	3kt8:D	410	60	0.0481	0.0488	0.3333	5.27e-04	3kt0:A, 3kt3:A, 3kt3:B, 3kt3:C, 3kt3:D, 3kt6:A, 3kt6:B, 3kt6:C, 3kt6:D, 3kt8:A, 3kt8:B, 3kt8:C
14	3tze:A	360	53	0.0457	0.0528	0.3585	0.002	3tze:B
15	3hv0:A	352	60	0.0481	0.0568	0.3333	0.005	3hv0:B
16	5ujj:A	446	39	0.0312	0.0291	0.3333	0.014	2ake:A, 2azx:A, 2azx:B, 2dr2:A, 2quh:A, 2quh:B, 2qui:A, 2qui:B, 2quj:A, 2quj:B, 1r6t:A, 1r6u:A, 5ujj:B
17	4jfa:C	348	60	0.0457	0.0546	0.3167	0.023
18	4j75:A	374	60	0.0457	0.0508	0.3167	0.026	4j75:B, 4jfa:A, 4jfa:B, 4jfa:D
19	5mrc:DD	287	96	0.0625	0.0906	0.2708	0.50	5mre:DD, 5mrf:DD
20	1hpl:A	449	119	0.0769	0.0713	0.2689	0.93	1hpl:B
21	7jil:i	194	40	0.0337	0.0722	0.3500	1.4
22	1h9t:A	232	30	0.0288	0.0517	0.4000	1.9	1h9g:A, 1h9t:B, 1hw2:A, 1hw2:B
23	5n0c:A	1293	49	0.0481	0.0155	0.4082	2.1	1dfq:A, 1diw:A, 1dll:A, 1fv2:A, 1fv3:A, 1fv3:B, 3hmy:A, 3hn1:A, 5n0b:A, 5n0c:B, 1yxw:A, 1yyn:A, 1z7h:A
24	3mhs:A	455	55	0.0337	0.0308	0.2545	3.4	6aqr:A, 4fip:A, 4fip:E, 4fjc:A, 4fk5:A, 6t9l:K, 4w4u:A, 4wa6:A, 4zux:U, 4zux:Z, 4zux:e, 4zux:j
25	8d8j:D	308	97	0.0721	0.0974	0.3093	6.3	8d8k:D
26	6yw5:DD	290	153	0.0962	0.1379	0.2614	7.4	6ywe:DD, 6ywx:DD, 6ywy:DD
27	5d9h:B	293	91	0.0601	0.0853	0.2747	8.9	5d9h:A, 5dbx:A, 5dbx:B
28	7xcm:A	494	60	0.0457	0.0385	0.3167	9.8	7xcm:B, 7xcm:C, 7xcm:D, 7xcm:E, 7xcm:F, 7xcn:A, 7xcn:B, 7xcn:C, 7xcn:D, 7xcn:E, 7xcn:F

[Back]