Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
NLELRPLGSTGLKVSCVGFGASPLGRVFPVSEDEAVASVREAFRLGINFFDTSPYYGGTLSEKMLGMALKASGVPRDQYV
VSTKCGRYKEGFDFSAERVTRSIDESLERLQLDYVDILQCHDIEFGSLDQIVNETIPALLKLKQTGKIRFIGITGLPLGI
FTYVLDRVPPGSVDVVLSYCHFSINDNTLEDLLPYLKSKGVGIISASPLAMGLLTEGGPPEWHPAPPELKSACQDAAAFC
QKKGKNISKLAMQYSLTNKDISSVLVGMNSVKQVGENVAAAIELVSAGMDQEMLSEVEAILKPGKNLTWPSGI

The query sequence (length=313) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8usu:A 316 314 1.0000 0.9905 0.9968 0.0 8usu:B
2 7svq:A 315 313 0.7508 0.7460 0.7508 1.25e-180 7svq:B
3 7ezi:A 323 313 0.7508 0.7276 0.7508 9.41e-175 7ezl:A
4 1ynp:B 298 290 0.2939 0.3087 0.3172 2.49e-35 1ynp:A, 1ynq:A, 1ynq:B
5 8hw0:A 329 310 0.3003 0.2857 0.3032 9.18e-27
6 1pz0:A 311 320 0.2780 0.2797 0.2719 1.88e-25
7 3v0s:A 287 297 0.2812 0.3066 0.2963 4.09e-25 3v0t:A
8 5t79:A 315 316 0.2843 0.2825 0.2816 4.08e-24 3erp:A, 3erp:B
9 4aub:B 335 300 0.2524 0.2358 0.2633 1.22e-23 4aub:A, 4aub:C, 4aub:G, 3n6q:D
10 8jwo:L 311 318 0.2907 0.2926 0.2862 2.74e-22 8jwk:H, 8jwo:A, 8jwo:C, 8jwo:D, 8jwo:E, 8jwo:G, 8jwo:I, 8jwo:K, 8jwo:M, 8jwo:O
11 4aub:F 298 291 0.2428 0.2550 0.2612 4.39e-21 4aub:E, 4aub:H
12 6ow0:B 301 307 0.2492 0.2591 0.2541 1.74e-20 6ovx:A, 6ovx:B
13 8jwm:B 331 333 0.2971 0.2810 0.2793 1.84e-20 8jwk:D, 8jwk:J, 8jwk:L, 8jwk:N, 8jwk:P, 8jwl:C, 8jwl:H, 8jwm:A, 8jwm:C, 8jwm:D, 8jwm:E, 8jwm:F, 8jwm:G, 8jwm:H, 8jwn:A, 8jwn:B, 8jwn:C, 8jwn:D, 8jwn:E, 8jwn:F, 8jwn:G, 8jwn:H, 8jwo:B, 8jwo:F, 8jwo:H, 8jwo:J, 8jwo:N, 8jwo:P, 8xr4:A, 8xr4:B, 8xr4:C, 8xr4:D, 8xr4:E, 8xr4:F, 8xr4:G, 8xr4:H
14 7wf3:C 328 322 0.2684 0.2561 0.2609 8.17e-20 2a79:A, 3eau:A, 3eb3:A, 3eb4:A, 6ebk:A, 6ebk:C, 6ebk:E, 6ebk:G, 6ebl:A, 6ebl:C, 6ebl:E, 6ebl:G, 7ej1:A, 7ej1:C, 7ej1:E, 7ej1:G, 7ej2:A, 7ej2:C, 7ej2:E, 7ej2:G, 1exb:A, 4jta:A, 4jta:P, 4jtc:A, 4jtc:G, 4jtd:A, 4jtd:G, 3lnm:A, 3lnm:C, 3lut:A, 1qrq:A, 1qrq:B, 1qrq:C, 1qrq:D, 2r9r:A, 2r9r:G, 7sit:A, 7sit:C, 7siz:A, 7siz:C, 7wf3:G, 7wf3:I, 7wf3:M, 7wf4:G, 7wf4:I, 7wf4:M, 7wf4:o, 5wie:A, 5wie:G, 1zsx:A
15 6ow0:A 323 329 0.2748 0.2663 0.2614 1.10e-19
16 4exa:F 259 217 0.2268 0.2741 0.3272 6.96e-19 4exa:A, 4exa:B, 4exa:C, 4exa:D, 4exa:E
17 1pz1:A 333 222 0.2013 0.1892 0.2838 1.07e-17 1pz1:B
18 6hg6:A 313 311 0.2875 0.2875 0.2894 2.41e-17
19 8hnq:A 286 290 0.2364 0.2587 0.2552 1.80e-16
20 6kik:A 275 217 0.1789 0.2036 0.2581 8.10e-15 5dan:A, 6kiy:A, 6ky6:A, 6ky6:B
21 2wzm:A 274 239 0.2141 0.2445 0.2803 1.73e-13 2wzm:B
22 1vbj:A 281 287 0.2332 0.2598 0.2544 2.77e-12 1vbj:B
23 7bc1:A 295 220 0.1949 0.2068 0.2773 1.68e-11
24 5c7h:A 281 207 0.1917 0.2135 0.2899 3.02e-11 4pmj:A
25 6cia:A 284 296 0.2204 0.2430 0.2331 5.13e-11 4wgh:A
26 1lqa:A 346 344 0.2396 0.2168 0.2180 9.82e-11 1lqa:B
27 4gie:A 288 181 0.1597 0.1736 0.2762 9.41e-10 4fzi:A, 4fzi:B
28 4h8n:A 303 182 0.1565 0.1617 0.2692 1.11e-09 4h8n:B
29 4g5d:A 283 215 0.1885 0.2085 0.2744 1.49e-09 4g5d:B
30 3h7r:A 307 218 0.1885 0.1922 0.2706 3.61e-09
31 3d3f:A 275 207 0.1917 0.2182 0.2899 4.67e-09 3d3f:B
32 3h7u:A 312 218 0.2013 0.2019 0.2890 6.23e-09
33 5jh2:A 257 211 0.2045 0.2490 0.3033 7.01e-08
34 1og6:C 298 150 0.1214 0.1275 0.2533 8.62e-08 1og6:A, 1og6:B
35 7twz:A 298 150 0.1214 0.1275 0.2533 1.28e-07 7twz:B, 7twz:C, 7twz:D, 7twz:E, 7twz:F
36 1q13:A 322 304 0.2428 0.2360 0.2500 1.18e-06 1q13:B, 1q5m:A, 1q5m:B
37 3wcz:A 307 293 0.2300 0.2345 0.2457 1.64e-06
38 1vp5:A 284 152 0.1246 0.1373 0.2566 2.38e-06 1vp5:B
39 5z6t:A 317 176 0.1406 0.1388 0.2500 4.71e-06 5z6t:B
40 2bgs:A 308 220 0.1693 0.1721 0.2409 1.61e-04 2vdg:A
41 3ln3:A 319 246 0.2109 0.2069 0.2683 1.84e-04 6m7k:A, 5uxf:A
42 4l1w:A 325 306 0.2236 0.2154 0.2288 2.42e-04 6a7a:A, 3c3u:A, 3gug:A, 2hdj:A, 2hdj:B, 1ihi:A, 1ihi:B, 6ijx:A, 2ipj:A, 2ipj:B, 1j96:A, 1j96:B, 8jp2:A, 4jq1:A, 4jq1:B, 4jq2:A, 4jq2:B, 4jq3:A, 4jq3:B, 4jq4:A, 4jq4:B, 4jqa:A, 4jqa:B, 4jtq:A, 4jtq:B, 4jtr:A, 4jtr:B, 4l1w:B, 4l1x:A, 4l1x:B, 1mrq:A, 3nty:A, 1xjb:A, 1xjb:B, 4xo6:A, 4xo6:B, 4xo7:A, 4xo7:B, 4yvp:A, 4yvp:B
43 1gve:A 324 205 0.1789 0.1728 0.2732 3.78e-04
44 3fx4:A 325 226 0.1725 0.1662 0.2389 4.04e-04 1ae4:A, 3cv7:A, 1cwn:A, 3h4g:A, 1hqt:A
45 1k8c:B 319 176 0.1470 0.1442 0.2614 4.24e-04 1k8c:A, 1k8c:C, 1k8c:D, 1mi3:A, 1mi3:B, 1mi3:C, 1mi3:D, 1r38:A, 1r38:B, 1r38:C, 1r38:D, 1sm9:A, 1sm9:B, 1sm9:C, 1sm9:D, 1ye4:A, 1ye4:B, 1ye4:C, 1ye4:D, 1ye6:A, 1ye6:B, 1ye6:C, 1ye6:D, 1z9a:A, 1z9a:B, 1z9a:C, 1z9a:D
46 3wbw:A 271 140 0.1150 0.1328 0.2571 7.82e-04 3wbw:B, 3wby:A, 3wby:B
47 1a80:A 277 146 0.1374 0.1552 0.2945 0.001 1m9h:A
48 1afs:A 319 237 0.1821 0.1787 0.2405 0.001 1afs:B, 1lwi:A, 1lwi:B
49 2c91:A 325 277 0.2077 0.2000 0.2347 0.002 2bp1:A, 2bp1:B, 2bp1:C, 2bp1:D, 2c91:B, 2c91:C, 2c91:D, 2c91:E, 2c91:F, 2c91:G, 2c91:H, 2c91:I, 2c91:J
50 2fvl:A 323 295 0.2109 0.2043 0.2237 0.002 2fvl:B, 2fvl:C
51 7s5f:B 309 233 0.1661 0.1683 0.2232 0.002 7s5f:A, 7s5f:C, 7s5f:D
52 4ijr:A 328 118 0.1022 0.0976 0.2712 0.002 4ijr:C
53 3cv6:A 323 239 0.1917 0.1858 0.2510 0.007 3cv6:B, 2he5:A, 2he5:B, 2he5:C, 2he5:D, 2hej:A, 2hej:B, 2ipf:A, 2ipf:B, 2ipg:A, 2ipg:B, 2p5n:A, 2p5n:B
54 5zcm:A 329 224 0.1629 0.1550 0.2277 0.009
55 4gq0:A 318 259 0.2013 0.1981 0.2432 0.010 4ga8:A, 4gab:A, 4gqg:A, 4i5x:A, 4icc:X, 4jih:A, 4jii:X, 5lik:X, 5liu:X, 5liw:X, 5lix:X, 5liy:X, 5m2f:X, 4wev:X, 4xzl:X, 4xzm:X, 4xzn:X, 5y7n:A, 1zua:X
56 2clp:A 323 214 0.1629 0.1579 0.2383 0.026 2clp:B, 2clp:C, 2clp:D, 2clp:E, 2clp:F, 2clp:G, 2clp:H, 2clp:I, 2clp:J, 2clp:K
57 8g84:A 297 43 0.0575 0.0606 0.4186 0.032 8g84:B, 8g89:A, 8g89:B, 8g93:A, 8g93:B
58 5ket:A 328 116 0.1054 0.1006 0.2845 0.036 5ket:B
59 8g9v:E 293 45 0.0639 0.0683 0.4444 0.092 8g9v:A, 8g9v:B, 8g9v:C, 8g9v:D, 8g9v:F, 8g9v:G, 8g9v:H
60 3krb:A 307 210 0.1438 0.1466 0.2143 0.094 3krb:B
61 4zfc:B 320 208 0.1597 0.1562 0.2404 0.18 6a7b:A, 6a7b:B, 8bbs:B, 8bbs:A, 7c7f:A, 7c7f:B, 7c7g:A, 7c7g:B, 7c7h:A, 7c7h:B, 4dbs:A, 4dbs:B, 4dbu:A, 4dbu:B, 4dbw:A, 4dbw:B, 4dz5:A, 6f2u:A, 6f2u:B, 2f38:A, 6f78:A, 6f78:B, 4fa3:A, 4fal:A, 4fam:A, 4fam:B, 9ffd:A, 9ffd:B, 2fgb:A, 6gxk:A, 6gxk:B, 4h7c:A, 4hmn:A, 5hnt:A, 5hnt:C, 5hnu:A, 5hnu:C, 8i0c:A, 8i0c:B, 8jp1:A, 8jp1:B, 3r43:A, 3r58:A, 3r6i:A, 3r7m:A, 3r8g:A, 3r8h:A, 3r94:A, 8rb6:A, 8rb6:B, 1ry0:A, 1ry0:B, 1ry8:A, 1ry8:B, 1s1p:A, 1s1r:A, 1s2a:A, 1s2c:A, 3ufy:A, 3ug8:A, 3ugr:A, 3uwe:A, 4wdt:A, 4wdu:A, 4wdw:A, 4wdw:B, 4wdx:A, 4wdx:B, 7wqm:A, 7wqm:B, 7wqr:A, 7wqr:B, 7wqs:A, 7wqs:B, 4wrh:A, 7x3l:A, 7x3l:B, 7x3m:A, 7x3m:B, 7x3o:A, 7x3o:B, 1xf0:A, 4xvd:A, 4xvd:B, 4xve:A, 4yvv:A, 4yvv:B, 4yvx:A, 4yvx:B, 4zfc:A, 1zq5:A
62 7f7k:B 310 220 0.2045 0.2065 0.2909 0.35 7f7k:A, 7f7l:A, 7f7l:B, 7f7m:A, 7f7m:B, 7w1w:A, 7w1w:B, 7w1x:A, 7w1x:B
63 1zgd:A 308 107 0.1118 0.1136 0.3271 0.58 1zgd:B
64 6vvh:BBB 313 55 0.0543 0.0543 0.3091 2.1 4dpq:A, 4dpq:B, 7mds:A, 7mds:B, 6vvh:AAA, 6vvh:CCC, 6vvh:DDD
65 3bur:A 325 318 0.2268 0.2185 0.2233 2.4 3bur:B, 3buv:B, 3buv:A, 3bv7:A, 3bv7:B, 3caq:A, 3caq:B, 3cas:A, 3cas:B, 3cav:A, 3cav:B, 3cmf:A, 3cmf:B, 3cot:A, 3cot:B, 3dop:A, 3dop:B, 3g1r:A, 3g1r:B, 3uzw:A, 3uzw:B, 3uzx:A, 3uzx:B, 3uzy:A, 3uzy:B, 3uzz:A, 3uzz:B
66 7n7g:A 138 37 0.0351 0.0797 0.2973 2.5 7n7g:B
67 8b34:A 318 138 0.1118 0.1101 0.2536 4.4 8a4n:A, 1abn:A, 2acq:A, 2acr:A, 2acs:A, 2acu:A, 1ads:A, 8ae9:A, 2agt:A, 8aqg:A, 8aqp:A, 8auu:A, 1az1:A, 1az2:A, 8b3n:A, 8b3r:A, 8b66:A, 3bcj:A, 8bjl:A, 8cnf:A, 8cnp:A, 3dn5:A, 2dux:A, 2duz:A, 2dv0:A, 1ef3:A, 1ef3:B, 1el3:A, 2f2k:A, 6f7r:A, 6f81:A, 6f82:A, 6f84:A, 6f8o:A, 8fh5:A, 8fh6:A, 8fh7:A, 8fh8:A, 8fh9:A, 2fz8:A, 2fz9:A, 2fzb:A, 2fzd:A, 3g5e:A, 4gca:A, 3ghr:A, 3ghs:A, 3ght:A, 3ghu:A, 5ha7:A, 5ha7:B, 2hv5:A, 2hvn:A, 2hvo:A, 2i16:A, 2i17:A, 1iei:A, 4igs:A, 2ikg:A, 2ikh:A, 2iki:A, 2ikj:A, 2ine:A, 2inz:A, 2ipw:A, 2iq0:A, 2iqd:A, 2is7:A, 2isf:A, 2j8t:A, 4jir:A, 4lau:A, 4laz:A, 3lbo:A, 4lb3:A, 4lb4:A, 4lbr:A, 4lbs:A, 3ld5:A, 3len:A, 3lep:A, 3lqg:A, 3lql:A, 3lz3:A, 3lz5:A, 3m0i:A, 3m4h:A, 3m64:A, 1mar:A, 3mb9:A, 3mc5:A, 4nkc:A, 2nvc:A, 2nvd:A, 3onb:A, 3onc:A, 5ou0:A, 5ouj:A, 5ouk:A, 8oz2:A, 3p2v:A, 8p2r:A, 2pd5:A, 2pd9:A, 2pdb:A, 2pdc:A, 2pdf:A, 2pdg:A, 2pdh:A, 2pdi:A, 2pdj:A, 2pdk:A, 2pdl:A, 2pdm:A, 2pdn:A, 2pdp:A, 2pdq:A, 2pdu:A, 2pdw:A, 2pdx:A, 2pdy:A, 2pev:A, 2pf8:A, 2pfh:A, 4pr4:A, 4prr:A, 4prt:A, 4puu:A, 4puw:A, 1pwl:A, 1pwm:A, 2pzn:A, 3q65:A, 3q65:B, 3q67:A, 3q67:B, 4q7b:A, 4qbx:A, 4qr6:A, 2qxw:A, 4qx4:A, 4qxi:A, 2r24:A, 4rpq:A, 3rx2:A, 3rx3:A, 3rx4:A, 3s3g:A, 6syw:A, 6t27:A, 6t3p:A, 1t40:A, 1t41:A, 3t42:A, 6t5g:A, 6t7q:A, 6td8:A, 6tuc:A, 6tuf:A, 6txp:A, 3u2c:A, 1us0:A, 3v35:A, 3v36:A, 1x96:A, 1x97:A, 1x98:A, 6xum:A, 4xzh:A, 4xzh:B, 4xzi:A, 6y03:A, 6y1p:A, 4ys1:A, 4yu1:A, 1z3n:A, 1z89:A, 1z8a:A
68 1ah0:A 315 134 0.1086 0.1079 0.2537 4.7 1ah3:A, 1ah4:A, 1eko:A
69 4hnn:F 320 56 0.0511 0.0500 0.2857 5.7 4hnn:A, 4hnn:B, 4hnn:C, 4hnn:D, 4hnn:E, 4hnn:G, 4hnn:H
70 6zj3:Ld 260 31 0.0383 0.0462 0.3871 9.8

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218