BioLiP

>protein
NKSLPILHEWKFFDYDFGSDERRQDAILSGEYDYKNNYPSDIDQWHDKIFVTMLRYNGVPSSLNVISKKVGDGGPLLQPY
PDWSFAKYDCSIVSASKLAIDKCDRLWVLDSGLVNNTQPMCSPKLLTFDLTTSQLLKQVEIPVAVNATTGKRLSSLAVQC
DTMVYIADEKGEGLIVYHNDSFHRLTSNTFDYDPKFTKMTDGTAQDGISGMALSPMTNNLYYSPVASTSLYYVNTEQFQQ
YEGVQNILDTQSSAKVVSKSGVLFFGLVGDSALGCWNEHRTLERHNIRTVAQSDETLQMIASMKIKEALPHVPIFDRYIN
REYILVLSNKMQKMDFNFDDVNFRIMNANVNELILNTRCENPDNDRTPFKISIHL

The query sequence (length=375) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5yyl:B	375	375	1.0000	1.0000	1.0000	0.0
2	7asd:AA	413	405	0.9920	0.9007	0.9185	0.0	7asd:BA, 7asd:CA, 7asd:DA, 7asd:EA, 7asd:FA, 7asd:GA, 7asd:HA, 5yyl:A
3	3q6k:B	381	284	0.1947	0.1916	0.2570	4.13e-05	3q6k:A
4	5ej4:A	556	121	0.0773	0.0522	0.2397	0.061	5ej4:B, 5ej4:C, 5ej4:D, 5ej4:E, 5ej4:F, 5ej4:G, 5ej4:H, 5ej5:A, 5ej5:B, 5ej5:C, 5ej5:D, 5ej5:E, 5ej5:F, 5ej5:G, 5ej5:H, 5ej6:A, 5ej6:B, 5ej6:C, 5ej6:D, 5ej6:E, 5ej6:F, 5ej6:G, 5ej6:H, 5ej7:A, 5ej7:B, 5ej7:C, 5ej7:D, 5ej7:E, 5ej7:F, 5ej7:G, 5ej7:H, 5ej8:A, 5ej8:B, 5ej8:C, 5ej8:D, 5ej8:E, 5ej8:F, 5ej8:G, 5ej8:H, 5ej9:A, 5ej9:B, 5ej9:C, 5ej9:D, 5ej9:E, 5ej9:F, 5ej9:G, 5ej9:H, 5eja:A, 5eja:B, 5eja:C, 5eja:D, 5eja:E, 5eja:F, 5eja:G, 5eja:H, 5ejm:A, 5ejm:B, 5ejm:C, 5ejm:D, 5ejm:E, 5ejm:F, 5ejm:G, 5ejm:H, 3hww:A, 3hwx:A, 3hwx:B, 3hwx:I, 3hwx:J, 3hwx:R, 3hwx:S, 3hwx:Z, 3hwx:1, 2jla:A, 2jla:B, 2jla:C, 2jla:D, 2jlc:A, 2jlc:B, 5z2p:A, 5z2p:B, 5z2p:C, 5z2p:D, 5z2p:E, 5z2p:G, 5z2p:F, 5z2p:H, 5z2r:A, 5z2r:B, 5z2r:C, 5z2r:D, 5z2r:E, 5z2r:F, 5z2r:G, 5z2r:H, 5z2u:A, 5z2u:H, 5z2u:B, 5z2u:G, 5z2u:C, 5z2u:D, 5z2u:E, 5z2u:F
5	3hww:D	532	121	0.0773	0.0545	0.2397	0.073
6	1zh8:A	325	65	0.0507	0.0585	0.2923	1.4	1zh8:B
7	6sc2:B	3930	42	0.0400	0.0038	0.3571	2.0	6rla:A, 6rla:B, 6sc2:A
8	4rh7:A	3005	42	0.0400	0.0050	0.3571	2.1
9	6yra:B	579	76	0.0640	0.0415	0.3158	2.9	6yra:D
10	3vkh:A	3042	46	0.0400	0.0049	0.3261	3.3
11	3vkg:B	2853	46	0.0400	0.0053	0.3261	3.4
12	3vkh:B	2908	46	0.0400	0.0052	0.3261	3.4
13	3vkg:A	2954	46	0.0400	0.0051	0.3261	3.5
14	4hnn:F	320	52	0.0373	0.0437	0.2692	3.8	4hnn:A, 4hnn:B, 4hnn:C, 4hnn:D, 4hnn:E, 4hnn:G, 4hnn:H
15	2r6r:1	323	62	0.0427	0.0495	0.2581	6.1	2r75:1
16	8pqw:A	2892	38	0.0347	0.0045	0.3421	6.1	8pqy:A, 8pqz:A, 8pqz:J
17	5nug:A	2920	38	0.0347	0.0045	0.3421	6.3	5nug:B
18	8fcy:A	2864	38	0.0347	0.0045	0.3421	6.3	8fd6:A, 8fdt:A
19	8ptk:f	4502	38	0.0347	0.0029	0.3421	6.4	8ptk:e
20	8dyu:A	2562	38	0.0347	0.0051	0.3421	6.4	8dyv:A
21	1mzj:A	334	54	0.0427	0.0479	0.2963	6.6	1mzj:B
22	7z8f:e	4579	38	0.0347	0.0028	0.3421	6.6	5owo:A, 8pr2:f, 8ptk:m, 8ptk:n, 7z8f:f, 7z8f:m, 7z8f:n, 7z8h:A
23	7z8g:A	3047	38	0.0347	0.0043	0.3421	7.0	8fdu:A, 7z8l:f
24	8e05:A	1749	62	0.0400	0.0086	0.2419	8.3	8e05:B, 8e06:A
25	1y7p:B	217	79	0.0587	0.1014	0.2785	9.0	1y7p:A, 1y7p:C
26	8fac:A	1377	61	0.0400	0.0109	0.2459	9.4	8e04:A

[Back]