BioLiP

>protein
NKITERITGHTELIGLIATPIRHSLSPTMHNEAFAKLGLDYVYLAFEVGDKELKDVVQGFRAMNLRGWNVSMPNKTNIHK
YLDKLSPAAELVGAVNTVVNDDGVLTGHITDGTGYMRALKEAGHDIIGKKMTICGAGGAATAICIQAALDGVKEISIFNR
KDDFYANAEKTVEKINSKTDCKAQLFDIEDHEQLRKEIAESVIFTNATGVGMKPFEGETLLPSADMLRPELIVSDVVYKP
TKTRLLEIAEEQGCQTLNGLGMMLWQGAKAFEIWTHKEMPVDYIKEILF

The query sequence (length=289) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3toz:A	291	289	1.0000	0.9931	1.0000	0.0	3tnl:A, 3tnl:B, 3tnl:C, 3tnl:D, 3toz:B, 3toz:C, 3toz:D, 3toz:E, 3toz:F, 3toz:G, 3toz:H
2	1npd:B	288	282	0.4775	0.4792	0.4894	3.66e-105	1npd:A, 1o9b:A, 1o9b:B, 3t4e:A, 3t4e:B, 1vi2:A, 1vi2:B
3	1nvt:A	287	292	0.3945	0.3972	0.3904	1.64e-52	1nvt:B
4	2hk9:A	269	274	0.3356	0.3606	0.3540	4.92e-50	2hk9:B, 2hk9:C, 2hk9:D
5	3doo:A	258	276	0.3218	0.3605	0.3370	1.59e-39
6	7col:A	280	278	0.3322	0.3429	0.3453	7.56e-35	7col:B
7	2ev9:B	263	268	0.2907	0.3194	0.3134	2.01e-29	2cy0:A, 2d5c:A, 2d5c:B, 2ev9:A
8	2o7q:A	501	286	0.2907	0.1677	0.2937	1.26e-27	6bmb:A, 6bmq:A, 2gpt:A, 2o7s:A
9	3pgj:A	272	263	0.2734	0.2904	0.3004	3.32e-25	3pgj:B, 3pgj:C, 3pgj:D, 3sef:A, 3sef:B
10	3jyo:A	282	283	0.2907	0.2979	0.2968	3.10e-21	3jyp:A, 3jyq:A
11	1nyt:A	271	273	0.2630	0.2804	0.2784	3.81e-21	1nyt:B, 1nyt:C, 1nyt:D
12	4k28:A	266	262	0.2491	0.2707	0.2748	7.59e-21	4k28:B
13	3sef:C	244	259	0.2422	0.2869	0.2703	2.74e-20
14	7tbv:A	682	291	0.2976	0.1261	0.2955	5.52e-20	7tbv:B, 7tbv:C, 7tbv:D
15	6hqv:A	1555	281	0.2803	0.0521	0.2883	1.36e-18	6hqv:B
16	4p4g:A	265	268	0.2630	0.2868	0.2836	2.90e-15	4p4l:A, 4p4l:B, 4p4l:C
17	4fos:A	263	285	0.2422	0.2662	0.2456	1.03e-14	4fq8:A, 4fq8:B, 4fr5:A, 4fr5:B, 4fsh:A, 3phh:A, 3phi:A, 3phi:B, 3phj:A, 3phj:B
18	1p77:A	265	267	0.2284	0.2491	0.2472	7.94e-10
19	3h4m:A	261	49	0.0588	0.0651	0.3469	0.12	3h4m:B, 3h4m:C
20	5tpr:A	400	58	0.0692	0.0500	0.3448	0.25	5tpr:B
21	7cmy:C	417	96	0.0865	0.0600	0.2604	0.69
22	7aq4:B	588	75	0.0865	0.0425	0.3333	1.8	7apy:A, 7apy:B, 7aq0:A, 7aq0:B, 7aq2:A, 7aq2:B, 7aq3:A, 7aq3:B, 7aq4:A, 7aq5:A, 7aq5:B, 7aq6:A, 7aq6:B, 7aq7:A, 7aq7:B, 7aq8:A, 7aq8:B, 7aq9:A, 7aq9:B, 7aqa:A, 7aqa:B, 7qba:H, 7qba:I, 6rkz:A, 6rkz:B, 6rl0:A, 6rl0:B, 6rl0:C, 6rl0:D, 3sbp:A, 3sbp:B, 3sbp:C, 3sbp:D, 3sbp:E, 3sbp:F, 3sbp:G, 3sbp:H, 3sbq:A, 3sbq:B, 3sbr:A, 3sbr:B, 3sbr:C, 3sbr:D, 3sbr:E, 3sbr:F, 3sbr:G, 3sbr:H, 6y6y:A, 6y6y:B, 6y71:A, 6y71:B, 6y72:A, 6y72:B, 6y77:A, 6y77:B, 6y7d:A, 6y7d:B, 6y7e:A, 6y7e:B
23	1pie:A	388	60	0.0761	0.0567	0.3667	6.3
24	6w29:A	545	128	0.1142	0.0606	0.2578	6.6	6w49:A, 6w53:A, 6w56:A, 6w57:A, 6w59:A
25	3lzw:A	329	89	0.1038	0.0912	0.3371	6.8	3lzx:A, 3lzx:B
26	7d5c:A	919	41	0.0519	0.0163	0.3659	7.2
27	6c4a:A	428	54	0.0554	0.0374	0.2963	8.2	6c4a:B, 6c4a:C, 6c4a:D, 6c4a:E, 6c4a:F, 6c4a:G, 6c4a:H, 6c4c:A, 6c4c:B, 6c4c:C, 6c4c:D, 6c4c:E, 6c4c:F, 6c4c:G, 6c4c:H, 7cp1:A, 7cp1:B, 5dql:A, 5dql:B, 5dql:C, 5dql:D, 1f61:A, 1f61:B, 1f8i:A, 1f8i:B, 1f8i:C, 1f8i:D, 1f8m:A, 1f8m:B, 1f8m:C, 1f8m:D, 7rb1:A, 7rb1:B, 7rb1:C, 7rb1:D, 6vb9:A, 6vb9:B, 6vb9:C, 6vb9:D, 6wsi:A, 6wsi:B, 6wsi:C, 6wsi:D, 6xpp:A, 6xpp:B, 6xpp:C, 6xpp:D
28	3bb8:A	420	35	0.0484	0.0333	0.4000	8.3	3bb8:B

[Back]