BioLiP

>protein
NKCGACGRTVYHAEEVQCDGRSFHRCCFLCMVCRKNLDSTTVAIHDAEVYCKSCYGKKYG

The query sequence (length=60) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1a7i:A	60	60	1.0000	1.0000	1.0000	9.28e-40
2	2o10:A	60	58	0.7000	0.7000	0.7241	5.11e-28
3	1b8t:A	192	54	0.6667	0.2083	0.7407	1.05e-24	1ctl:A
4	1b8t:A	192	58	0.5000	0.1562	0.5172	4.40e-15	1ctl:A
5	2o13:A	58	58	0.4667	0.4828	0.4828	1.27e-15
6	1cxx:A	59	57	0.4667	0.4746	0.4912	1.97e-14	1ibi:A, 1qli:A
7	2cu8:A	76	61	0.4000	0.3158	0.3934	9.14e-09
8	1iml:A	76	60	0.4000	0.3158	0.4000	1.32e-07
9	2lzu:A	72	57	0.3333	0.2778	0.3509	1.84e-05
10	8y6k:A	741	51	0.3000	0.0243	0.3529	5.45e-05	2bra:A, 2bra:B, 2bry:A, 2bry:B, 2c4c:A, 2c4c:B, 4txi:A, 4txk:A
11	2d8y:A	91	57	0.3000	0.1978	0.3158	1.39e-04
12	2ehe:A	82	56	0.3000	0.2195	0.3214	2.48e-04
13	1x4k:A	72	58	0.2500	0.2083	0.2586	3.92e-04
14	2miu:A	98	61	0.2833	0.1735	0.2787	0.002
15	2egq:A	77	42	0.2667	0.2078	0.3810	0.002
16	1wyh:A	72	47	0.2333	0.1944	0.2979	0.002
17	2co8:A	82	53	0.3000	0.2195	0.3396	0.007
18	2cuq:A	80	58	0.2500	0.1875	0.2586	0.007
19	2d8z:A	70	35	0.2000	0.1714	0.3429	0.007
20	1zfo:A	30	26	0.1833	0.3667	0.4231	0.012
21	2dlo:A	81	61	0.2333	0.1728	0.2295	0.012
22	1x61:A	72	35	0.2167	0.1806	0.3714	0.078
23	1x63:A	82	59	0.2333	0.1707	0.2373	0.091
24	2mbv:A	96	36	0.2333	0.1458	0.3889	0.11
25	6u4m:A	65	40	0.2000	0.1846	0.3000	0.11	6u4n:B
26	2xqn:T	125	59	0.2333	0.1120	0.2373	0.14	2iyb:E, 2iyb:F, 2iyb:G, 2iyb:H
27	2dfy:X	158	36	0.2333	0.0886	0.3889	0.25	2dfy:C, 1rut:X
28	2cur:A	69	35	0.1833	0.1594	0.3143	0.29
29	2cup:A	101	42	0.2167	0.1287	0.3095	0.33
30	1v6g:A	81	55	0.2667	0.1975	0.2909	0.34
31	4jcj:C	150	40	0.2333	0.0933	0.3500	0.86	4jcj:A, 4jcj:B
32	1v87:A	114	39	0.2333	0.1228	0.3590	1.5
33	2rgt:B	154	63	0.2833	0.1104	0.2698	3.3	2rgt:A
34	1x3h:A	80	59	0.2667	0.2000	0.2712	3.7
35	2jtn:A	182	58	0.2667	0.0879	0.2759	4.9
36	3mkh:A	426	24	0.1833	0.0258	0.4583	5.8	3mkh:B, 3mkh:C, 3mkh:D
37	5z2c:I	408	38	0.2000	0.0294	0.3158	6.2
38	5z2c:A	445	38	0.2000	0.0270	0.3158	6.2	5z2c:B, 5z2c:C, 5z2c:D, 5z2c:E, 5z2c:F, 5z2c:G, 5z2c:H
39	2luy:A	96	57	0.2500	0.1562	0.2632	7.6
40	6cme:A	154	63	0.2667	0.1039	0.2540	8.7	6cme:B, 3mmk:A, 3mmk:B
41	1x64:A	89	30	0.1667	0.1124	0.3333	8.7
42	7dge:A	784	29	0.1667	0.0128	0.3448	9.5	1ewk:A, 1ewk:B, 1isr:A, 1iss:A, 1iss:B, 3ks9:A, 3ks9:B

[Back]