Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
NKASSLTEFFKNFKMESKIISKETIDSIQSCIQEGDIQKVISIINAALTDIEKAPLNIAVTGETGAGKSTFINALRGIGH
EESESAESTMDRKKYTHPKFPNVTIWDLPGVGTTNFKPEEYLKKMKFQEYDFFLIISSARFRNNEAQLAEAIKKMKKKFY
FVRTKIDSDLWNEKKAKPSSYNREKILEAIRSDCVKNLQASTRVFLVSSFEVAQFDFPSLESTLLEELPAHKRHIFVQCL
PTITEPAIDRRRDVLKQTIWLEALKAGASATIPMMSFFNDDIEEFEKILSHYRACFGLDDESLENMAKEWSMSVEELEST
IKSPHLLSSEPNESVADKLVKTMEKIFAVTGGFVATGLYFRKSYYMQNYFLDTVTEDAKVLLKKLEHHH

The query sequence (length=389) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7c3k:B 389 389 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 7c3k:A, 8jqz:A, 8jqz:B
2 7vex:A 412 384 0.5476 0.5170 0.5547 1.38e-153 8h4m:A
3 1tq6:A 402 392 0.4499 0.4353 0.4464 1.28e-123 5fph:A, 5fph:B, 5fph:C, 5fph:D, 5fph:E, 5fph:F, 5fph:G, 4lv5:B, 4lv8:B, 1tpz:A, 1tpz:B, 1tq2:A, 1tq2:B, 1tq4:A
4 1v33:A 346 138 0.0900 0.1012 0.2536 0.009 1v34:A
5 3cbq:A 169 102 0.0643 0.1479 0.2451 0.019
6 5cyp:A 248 61 0.0591 0.0927 0.3770 0.069 5cyp:B, 5cyp:C
7 2wvk:A 391 85 0.0488 0.0486 0.2235 0.14 2wvk:B, 2wvl:A, 2wvl:B, 2wvm:A, 2wvm:B
8 8v7z:A 1104 136 0.0977 0.0344 0.2794 0.15
9 5ucv:A 187 57 0.0488 0.1016 0.3333 0.19
10 2wkw:A 315 75 0.0514 0.0635 0.2667 0.37 2wkw:B
11 5cyp:D 227 59 0.0540 0.0925 0.3559 0.37
12 1r0z:C 277 101 0.0617 0.0866 0.2376 0.38 1q3h:A, 1q3h:B, 1q3h:C, 1q3h:D, 1r0x:A, 1r0x:B, 1r0x:C, 1r0x:D, 1r0y:A, 1r0y:B, 1r0y:C, 1r0y:D, 1r0z:A, 1r0z:B, 1r0z:D, 1r10:A, 1r10:B, 3si7:A, 3si7:B, 3si7:C, 3si7:D, 1xf9:A, 1xf9:B, 1xf9:C, 1xf9:D, 1xfa:A, 1xfa:B
13 2wjg:A 170 58 0.0566 0.1294 0.3793 0.39 2wjg:B, 2wjh:A, 2wjh:B, 2wji:A, 2wji:B, 2wjj:A, 2wjj:B
14 1xmi:C 270 100 0.0668 0.0963 0.2600 0.49 2bbo:A, 2bbs:A, 2bbt:A, 2bbt:B, 4wz6:A, 1xmi:A, 1xmi:B, 1xmi:E, 1xmi:D, 1xmj:A
15 4wnr:A 323 95 0.0643 0.0774 0.2632 0.60
16 5uz4:Z 323 111 0.0746 0.0898 0.2613 0.73 4a2i:V, 7boi:W, 7nar:W, 5no2:Z, 5no3:Z, 5no4:Z, 2rcn:A, 2ykr:W
17 6upr:B 270 123 0.0900 0.1296 0.2846 0.91
18 5cyo:A 272 68 0.0591 0.0846 0.3382 0.95 5cyo:B, 4yqf:B, 4yqf:A
19 6nak:D 165 87 0.0617 0.1455 0.2759 0.95 6n9a:E, 6nak:E, 6s84:E, 6s84:B
20 8sgd:A 291 70 0.0566 0.0756 0.3143 0.97 8fwp:A, 8pfh:A, 8sgd:C
21 2iw3:B 980 20 0.0360 0.0143 0.7000 0.97 7b7d:EF, 2iw3:A, 2iwh:A, 2iwh:B
22 7rzy:1 311 52 0.0411 0.0514 0.3077 1.0 7rzy:2, 7rzy:7, 7rzy:3, 7rzy:4, 7rzy:5, 7rzy:6, 7ufi:1, 7ufi:7, 7ufi:2, 7ufi:3, 7ufi:4, 7ufi:5, 7ufi:6, 7ufm:D, 7ufm:I, 7ufm:A, 7ufm:B, 7ufm:C, 7ufm:E, 7ufm:F, 7ufm:G, 7ufm:H, 7ufm:J, 7ufm:K, 7ufm:L, 7ufm:M, 7ufm:N
23 5oxf:B 591 34 0.0360 0.0237 0.4118 1.2
24 3b1v:A 264 63 0.0463 0.0682 0.2857 1.2 3b1w:A, 3b1w:B, 3b1w:C, 3b1w:D, 3b1x:A, 3b1x:B, 3b1y:A, 7bvu:A, 7bvu:B, 7bwv:A, 7bwv:B, 3lx5:A, 3lx8:A, 4non:A, 4non:B, 3ss8:A, 3ss8:B, 3tah:A, 3tah:B
25 6ojz:D 361 95 0.0771 0.0831 0.3158 1.2 6ojx:A, 6ojx:B, 6ojx:C, 6ojz:A, 6ojz:B, 6ojz:C, 6ojz:E, 6ojz:F, 6ok2:A, 6ok2:B, 6ok2:C, 6ok2:D, 6ok2:E, 6ok2:F, 6okv:A, 6okv:B, 6okv:C, 6okv:D, 6okv:E, 6okv:F, 6olm:A, 6olm:B, 6olm:C, 6olm:D, 6olm:E, 6olm:F
26 8jwf:A 1204 17 0.0308 0.0100 0.7059 1.2 8jwg:A, 8jwi:A
27 5t62:W 306 66 0.0591 0.0752 0.3485 1.3
28 5uak:A 1139 100 0.0668 0.0228 0.2600 1.3 2bbs:B, 7svr:A, 8v81:A
29 5lqw:A 2130 80 0.0617 0.0113 0.3000 1.4
30 5gan:A 2196 80 0.0617 0.0109 0.3000 1.5 5gam:A, 5mps:A, 5mq0:A
31 5oxf:A 703 34 0.0360 0.0199 0.4118 1.5
32 5nrl:A 2216 80 0.0617 0.0108 0.3000 1.5 6bk8:A, 6exn:A, 7fju:A, 7fjv:A, 7fjw:A, 7fjy:A, 7fjz:A, 7fk1:A, 7fk2:A, 7fk3:A, 7fk4:A, 7fk6:A, 7fka:A, 7fkh:A, 7fkj:A, 7fkk:A, 7fkl:A, 7fkn:A, 7fko:A, 7fkp:A, 7fkr:A, 7fkt:A, 7fkv:A, 7fkw:A, 7fkx:A, 7fl1:A, 7fl3:A, 7fl6:A, 7fl9:A, 7fla:A, 7fld:A, 7fle:A, 7flf:A, 7flg:A, 7fli:A, 7flk:A, 7fll:A, 7flm:A, 7flp:A, 7flr:A, 7flu:A, 7flx:A, 7fly:A, 7fm7:A, 7fmb:A, 7fmf:A, 7fmg:A, 7fmi:A, 7fmk:A, 7fml:A, 7fmo:A, 7fmq:A, 7fms:A, 7fmx:A, 7fmy:A, 7fn1:A, 7fn2:A, 7fn4:A, 7fne:A, 7fno:A, 7fnq:A, 7fns:A, 7fnu:A, 7fny:A, 7fo3:A, 7fo4:A, 7fo6:A, 7fo8:A, 7fok:A, 7fol:A, 7fon:A, 7foo:A, 7foq:A, 7for:A, 7foy:A, 7fp0:A, 7fp1:A, 7fp2:A, 7fp3:A, 7fp8:A, 7fpb:A, 7fpd:A, 7fpj:A, 5gap:A, 5lj3:A, 5qy4:A, 5qy6:A, 5qy8:A, 5qy9:A, 5qya:A, 5qyb:A, 5qyc:A, 5qyd:A, 5qye:A, 5qyg:A, 5qyh:A, 5r0b:A, 5r0d:A, 5r0e:A, 5r0f:A, 5r0g:A, 5r0h:A, 5r0i:A, 5r0j:A, 5r0l:A, 5r0m:A, 5st1:A, 5st3:A, 5st9:A, 5stb:A, 5stc:A, 5stn:A, 5stq:A, 5str:A, 5stu:A, 5stz:A, 5su4:A, 5su6:A, 5su8:A, 5sub:A, 5suc:A, 5sue:A, 5sug:A, 5wsg:A, 5ylz:A
33 7dco:A 2205 80 0.0617 0.0109 0.3000 1.5 7b9v:A, 5gm6:A, 3jcm:A, 5lj5:A, 5zwm:A, 5zwo:A
34 5w81:A 1173 93 0.0566 0.0188 0.2366 1.5
35 6msm:A 1181 100 0.0668 0.0220 0.2600 1.5 8eig:A, 8eio:A, 8eiq:A, 8fzq:A, 6gjq:A, 6gjq:C, 6gjq:E, 6gjq:G, 6gjs:A, 6gk4:A, 6gk4:D, 6gkd:A, 6gkd:L, 6gkd:F, 6gkd:I, 6gkd:O, 6gkd:R, 8gls:A, 6o1v:A, 6o2p:A, 2pze:A, 2pze:B, 2pzf:A, 2pzf:B, 2pzg:A, 2pzg:B, 7sv7:A, 7svd:A, 5tf7:A, 5tf8:A, 5tfa:A, 5tfb:A, 5tfc:A, 5tfd:A, 5tff:A, 5tfg:A, 5tfi:A, 5tfj:A, 5tgk:A, 8ubr:A, 6wbs:A, 6wbs:B, 6ze1:A
36 2cjw:A 178 82 0.0566 0.1236 0.2683 1.6 2cjw:B, 2g3y:A, 2ht6:A, 2ht6:B
37 2wib:A 261 56 0.0463 0.0690 0.3214 2.2 2wib:B, 2wic:A
38 3i8x:B 261 56 0.0488 0.0728 0.3393 2.3 3hyt:A, 3hyt:B, 3hyt:C, 3i8x:A, 3i8x:C, 4r98:A, 4r98:B
39 7aih:Ab 260 167 0.0746 0.1115 0.1737 2.3 7am2:Ab, 7ane:Ab
40 5kh0:A 363 111 0.0720 0.0771 0.2523 2.3 5kh0:B, 5kh0:C, 5kh0:D
41 8kab:h 430 23 0.0308 0.0279 0.5217 2.4
42 8i3a:A 562 39 0.0360 0.0249 0.3590 2.4 8i39:A, 8i39:B, 8i3a:B, 8i3b:A, 8i3b:B, 8i3c:A, 8i3c:B, 8iwn:A, 8iwn:C, 8wam:A, 8wam:B, 8wba:A, 8wba:B
43 3a1s:A 255 120 0.0694 0.1059 0.2250 2.6 3a1s:B, 3a1t:A, 3a1u:A, 3a1u:B
44 6zhm:A 269 90 0.0668 0.0967 0.2889 2.8 6zhl:A, 6zjo:A, 6zjo:B
45 8pfh:C 289 123 0.0771 0.1038 0.2439 3.0
46 6yxx:EM 308 52 0.0488 0.0617 0.3654 3.0
47 6mq9:B 267 90 0.0643 0.0936 0.2778 3.0 6mq9:A, 6mq9:D, 6mq9:C, 6mqb:A, 6mqk:A, 6mqk:D, 6mqk:B, 6mqk:C, 6mql:A
48 2no0:A 242 118 0.0823 0.1322 0.2712 3.3 2a2z:A, 2a2z:C, 2a30:A, 2a30:C, 2a7q:A, 3hp1:A, 3ipx:A, 3ipy:A, 3ipy:B, 4jlj:A, 4jlj:B, 4jlk:A, 4jlk:B, 4jlm:A, 4jlm:B, 4jln:A, 4jln:B, 4kcg:A, 4kcg:B, 3kfx:A, 3kfx:B, 4l5b:A, 4l5b:B, 3mjr:A, 3mjr:B, 3mjr:C, 5mqj:A, 5mqj:B, 5mqj:C, 5mqj:D, 5mql:A, 5mql:B, 5mql:C, 5mql:D, 5mqt:A, 5mqt:B, 5mqt:C, 5mqt:D, 2no0:B, 2no1:A, 2no1:B, 2no6:A, 2no6:B, 2no7:A, 2no7:B, 2no9:A, 2no9:B, 2noa:A, 2noa:B, 8ooj:A, 8ooj:B, 8ooj:C, 8ooj:D, 1p5z:B, 1p60:A, 1p60:B, 1p61:B, 1p62:B, 4q18:A, 4q18:B, 4q19:A, 4q19:B, 4q1a:A, 4q1a:B, 4q1b:A, 4q1b:B, 4q1c:A, 4q1c:B, 4q1d:A, 4q1d:B, 4q1e:A, 4q1e:B, 4q1f:A, 4q1f:B, 3qej:A, 3qej:B, 3qen:A, 3qen:B, 3qeo:A, 3qeo:B, 2qrn:A, 2qrn:B, 2qrn:C, 2qrn:D, 2qro:A, 2qro:B, 2qro:C, 2qro:D, 2zi3:A, 2zi3:B, 2zi4:A, 2zi5:B, 2zi6:B, 2zi9:A, 2zi9:B, 7zi1:A, 7zi2:A, 7zi3:A, 7zi5:A, 7zi6:A, 7zi7:A, 7zi8:A, 7zi9:A, 7zia:A, 7zib:A
49 6jfk:A 428 63 0.0463 0.0421 0.2857 3.3 6jfm:A, 6jfm:B
50 2iut:A 408 28 0.0334 0.0319 0.4643 3.4 2iut:B, 2iuu:A, 2iuu:B, 2iuu:C, 2iuu:D, 2iuu:E, 2iuu:F, 6t8b:A, 6t8b:B, 6t8b:C, 6t8b:F, 6t8b:D, 6t8b:E, 6t8g:A, 6t8g:B, 6t8g:C, 6t8g:D, 6t8g:E, 6t8g:F, 6t8o:A, 6t8o:B, 6t8o:C, 6t8o:D, 6t8o:E, 6t8o:F
51 8i4a:A 1218 28 0.0334 0.0107 0.4643 3.5 8bwo:A, 8i4c:A, 8j3w:A, 8j3z:A, 8xol:A, 8xom:A
52 8bjf:A 1195 28 0.0334 0.0109 0.4643 3.6 8bwp:A, 8bwq:A, 8bwr:A, 8sx7:A, 8sx8:A, 8sxb:A
53 8iza:A 1246 28 0.0334 0.0104 0.4643 3.8 8iz7:A, 8iz9:A, 8xok:A
54 8dkt:B 262 60 0.0488 0.0725 0.3167 3.8
55 6uqq:C 280 20 0.0283 0.0393 0.5500 4.1 3sop:A, 3sop:B, 6uqq:D, 4z51:A, 4z54:A, 4z54:B
56 6kev:A 317 18 0.0283 0.0347 0.6111 4.2
57 6nz4:A 467 20 0.0308 0.0257 0.6000 4.2 6nz4:B, 6nz5:B, 6nz6:A, 6nz6:B
58 3pqc:B 194 132 0.0848 0.1701 0.2500 4.4 3pqc:A
59 2vb6:A 724 54 0.0540 0.0290 0.3889 4.8
60 7r8e:A 548 20 0.0283 0.0201 0.5500 4.9 7fdv:A, 7fdv:D, 7oz1:A, 7oz1:B, 7r8d:A, 7r8d:B, 7r8e:B
61 2j68:A 680 41 0.0360 0.0206 0.3415 4.9 2w6d:A, 2w6d:B
62 4dbq:A 744 54 0.0540 0.0282 0.3889 4.9 4pjj:A, 2vas:A
63 4anj:A 995 54 0.0540 0.0211 0.3889 5.0 1jbz:A
64 6d3r:A 1127 129 0.0925 0.0319 0.2791 5.0 6d3s:A
65 5goe:A 384 47 0.0437 0.0443 0.3617 5.1 5gns:A, 5gnt:A
66 3tw4:A 218 110 0.0746 0.1330 0.2636 5.3 3tw4:B
67 5gom:A 407 47 0.0437 0.0418 0.3617 5.5 5gnr:A, 5gof:A, 5gom:B, 5yew:A, 5yew:B, 5yew:C
68 7zoa:B 570 19 0.0283 0.0193 0.5789 6.0 7znu:A, 7znu:B, 7zo9:A, 7zo9:B, 7zoa:A
69 8swn:A 1135 28 0.0334 0.0115 0.4643 6.0
70 9bht:E 288 20 0.0308 0.0417 0.6000 6.1 9bht:B
71 2qag:C 224 18 0.0283 0.0491 0.6111 6.3
72 2qa5:B 234 18 0.0283 0.0470 0.6111 6.5 2qa5:A, 2qag:A, 2qnr:A
73 7am2:BU 463 34 0.0257 0.0216 0.2941 6.6
74 8tzg:A 906 208 0.1208 0.0519 0.2260 6.7
75 6yxy:EM 330 68 0.0566 0.0667 0.3235 6.8
76 3bk7:A 593 87 0.0540 0.0354 0.2414 7.2 3j15:B, 5lw7:B, 1yqt:A, 5yv5:A
77 8dk2:C 723 21 0.0283 0.0152 0.5238 7.3 8dk2:D
78 3ftq:B 252 18 0.0283 0.0437 0.6111 7.4 3ftq:C, 3ftq:D, 2qnr:B, 6upa:A
79 4q4a:A 572 18 0.0283 0.0192 0.6111 7.8 3qf4:A, 6quz:A, 6quz:C, 6qv0:A, 6qv0:C, 6qv1:A, 6qv1:C, 6qv2:A, 6qv2:C
80 8bns:A 433 30 0.0308 0.0277 0.4000 7.8 8bns:B, 8bns:C, 8bns:D
81 6upq:A 270 18 0.0283 0.0407 0.6111 8.1 3ftq:A, 7m6j:F, 6upr:A
82 7m6j:A 234 18 0.0283 0.0470 0.6111 8.6
83 2cxx:A 184 69 0.0514 0.1087 0.2899 8.6 2cxx:B, 2cxx:C
84 6evj:B 752 45 0.0308 0.0160 0.2667 8.7 6evj:E, 6evk:B, 9f2r:B, 9f37:B, 6fhh:B, 6fhi:B, 5m3h:B, 6szu:B, 6szv:B, 6t0n:B, 6t0r:B, 6t0s:B, 6t0u:B, 6t0v:B, 6t2c:B, 6tw1:B, 4wsb:B
85 2a2z:B 221 21 0.0257 0.0452 0.4762 8.8 2a2z:D, 2a30:B, 2a30:D, 3mjr:D, 2zi5:A, 2zi5:C, 2zi5:D, 2zi6:A, 2zi6:C, 2zi6:D, 2zi7:B, 2zi7:A, 2zia:A, 2zia:B
86 2r6f:B 879 23 0.0334 0.0148 0.5652 8.8
87 2r6f:A 899 23 0.0334 0.0145 0.5652 8.9
88 3uwx:A 945 23 0.0334 0.0138 0.5652 9.0
89 3ux8:A 564 23 0.0334 0.0230 0.5652 9.5
90 7m6j:D 273 18 0.0283 0.0403 0.6111 9.6 7m6j:C, 6n0b:C, 6n0b:A, 6n0b:B, 6n0b:D, 6n12:A, 6n12:B, 3t5d:A, 3t5d:C, 6uqq:A, 6uqq:B
91 8wk0:N 542 63 0.0566 0.0406 0.3492 9.8
92 7yq0:A 173 18 0.0283 0.0636 0.6111 9.8 7yq0:B, 7yq1:A, 7yq1:B, 7yq1:C, 7yq1:D, 7yq1:E, 7yq1:F

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218