BioLiP

>protein
NIPGAILHSLAELQDGLNAMIDPSWRAVRSLDNWALAITMESTELLDSYPWKWWKNLNATPDLANVRIELVDIFHFSLSG
AMQMRSTPDDEIPAASLKPLKEVMTTFLPAKECTSDPYGFVFFPLTDTQNAIASFRNIIQLANAYRFDVIIECIIYAAED
LGFNLVAYYIAKHTLNCIRQLSGYKDGSYVKVNNGVEDNSLLHNCIKDVSLDEVLDADKYVQAWNSIMANVYEAFQIKES
DRKDAERWFALAKENRL

The query sequence (length=257) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2yb0:E	264	257	1.0000	0.9735	1.0000	0.0	2cje:A, 2yay:A, 2yaz:A, 2yaz:B, 2yaz:D, 2yaz:E, 2yb0:A, 2yb0:B, 2yb0:D
2	4dl8:A	224	244	0.5097	0.5848	0.5369	4.96e-90	4dk4:A, 4dk4:B, 4dkb:A, 4dlc:A
3	1w2y:A	226	209	0.2802	0.3186	0.3445	1.84e-23	2cic:A, 1w2y:B
4	1q2v:A	518	82	0.0817	0.0405	0.2561	0.19	1q2v:B, 1q2v:C, 1q2v:D, 1q3q:A, 1q3q:B, 1q3q:C, 1q3q:D, 1q3r:A, 1q3s:A, 1q3s:B, 1q3s:C, 1q3s:D, 1q3s:E, 1q3s:F, 1q3s:G, 1q3s:H
5	4eez:B	342	80	0.0700	0.0526	0.2250	3.5	4eex:A, 4eex:B, 4eez:A
6	3vp5:A	185	50	0.0623	0.0865	0.3200	7.7	3vok:A
7	8q0m:H	318	48	0.0545	0.0440	0.2917	8.6	8q1u:H, 8q25:H, 8q45:H, 8q47:H, 8q48:H, 8q4a:H, 7qsk:H, 7r45:H, 7r46:H, 7r47:H, 7r48:H, 7r4c:H, 7r4g:H, 7zd6:H, 6zka:H, 6zkc:H, 6zkd:H, 6zke:H, 6zkf:H, 6zkh:H, 6zki:H, 6zkj:H, 6zkl:H, 6zkm:H, 6zkn:H
8	6khn:A	490	87	0.0895	0.0469	0.2644	9.1	6khn:B, 6kho:A, 6kho:B, 6khp:A, 6khp:B
9	8ahc:B	114	29	0.0428	0.0965	0.3793	9.7	8a7i:A, 8a7i:B, 8ahc:A, 6bqa:A, 5e9v:A, 5e9v:B, 5eu1:A, 5eu1:B, 5f1h:A, 5f1h:B, 5f1l:A, 5f1l:B, 5f25:A, 5f25:B, 5f2p:A, 5f2p:B, 6hm0:A, 6hm0:B, 5i40:A, 5i7x:A, 5i7y:A, 5igm:A, 5igm:B, 5ign:A, 5ign:B, 5ji8:A, 5mky:A, 4nqn:A, 5twx:A, 5twx:B, 5twx:D, 5twx:C, 4uit:A, 4uiu:A, 4uiv:A, 4uiw:A, 6v0s:A, 6v0s:B, 6v0x:A, 6v14:A, 6v1b:A, 6v1b:B, 4xy8:A, 6y7h:A, 6y7h:B, 6y7i:A, 6y7i:B, 6y7j:A, 6y7j:B, 6y7k:A, 6y7l:A, 6yqr:AAA, 6yqs:AAA, 6yqw:A, 4yy6:A, 4yyd:A, 4yyg:A, 4yyh:A, 4yyh:B, 4yyi:A, 4yyi:B, 4yyi:D, 4yyi:E, 4yyj:A, 4yyj:B, 4yyj:D, 4yyj:E, 4yyk:A, 4yyk:B, 4yyk:D, 4yyk:E, 4z6h:A, 4z6h:B, 4z6i:A, 4z6i:B

[Back]