Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
NGMPLNQGAALGIATVDAQGRIQIVNQNKPIAANTISNISFKCDVCSDMFPHLALLNAHKRMHTDGE

The query sequence (length=67) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 7nf9:A 67 67 1.0000 1.0000 1.0000 6.23e-46
2 2enh:A 46 24 0.1642 0.2391 0.4583 0.004
3 2em6:A 46 24 0.1642 0.2391 0.4583 0.007
4 2cot:A 77 24 0.1642 0.1429 0.4583 0.007
5 2cot:A 77 24 0.1493 0.1299 0.4167 1.6
6 2ep0:A 46 24 0.1642 0.2391 0.4583 0.009
7 2ena:A 46 24 0.1493 0.2174 0.4167 0.009
8 2ene:A 46 24 0.1493 0.2174 0.4167 0.011
9 2eos:A 42 24 0.1493 0.2381 0.4167 0.013
10 5wjq:D 281 29 0.1940 0.0463 0.4483 0.021 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
11 5wjq:D 281 24 0.1343 0.0320 0.3750 5.7 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
12 2eoy:A 46 26 0.1642 0.2391 0.4231 0.022
13 2eml:A 46 24 0.1343 0.1957 0.3750 0.043
14 2en1:A 46 24 0.1493 0.2174 0.4167 0.044 2yth:A
15 2eoh:A 46 24 0.1493 0.2174 0.4167 0.059
16 2en9:A 46 24 0.1493 0.2174 0.4167 0.068
17 2en6:A 46 24 0.1343 0.1957 0.3750 0.069
18 2eoq:A 46 24 0.1642 0.2391 0.4583 0.10
19 2emc:A 46 23 0.1493 0.2174 0.4348 0.19
20 2em3:A 46 24 0.1493 0.2174 0.4167 0.21
21 2ytd:A 46 24 0.1493 0.2174 0.4167 0.21
22 2eor:A 46 24 0.1343 0.1957 0.3750 0.29
23 7w1m:H 322 26 0.1493 0.0311 0.3846 0.32 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
24 2lce:A 64 30 0.1791 0.1875 0.4000 0.38
25 2lce:A 64 24 0.1194 0.1250 0.3333 6.3
26 2ema:A 46 24 0.1194 0.1739 0.3333 0.42
27 2yrj:A 46 24 0.1343 0.1957 0.3750 0.52
28 2ely:A 46 24 0.1493 0.2174 0.4167 0.53
29 2eoz:A 46 25 0.1642 0.2391 0.4400 0.55
30 2yta:A 41 24 0.1194 0.1951 0.3333 0.55
31 2en2:A 42 24 0.1493 0.2381 0.4167 0.56
32 2adr:A 60 26 0.1642 0.1833 0.4231 0.60 1paa:A
33 2elr:A 36 22 0.1343 0.2500 0.4091 0.77 2rv3:A
34 2i13:B 144 24 0.1642 0.0764 0.4583 0.85
35 2i13:B 144 24 0.1642 0.0764 0.4583 0.97
36 2ept:A 41 24 0.1194 0.1951 0.3333 0.91
37 6ml4:A 143 25 0.1642 0.0769 0.4400 0.93 6ml2:A, 6ml3:A, 6ml5:A, 6ml6:A, 6ml7:A
38 2eq2:A 46 24 0.1194 0.1739 0.3333 1.0 2ytr:A
39 2i13:A 151 24 0.1642 0.0728 0.4583 1.1
40 2i13:A 151 24 0.1642 0.0728 0.4583 1.2
41 2i13:A 151 34 0.1493 0.0662 0.2941 8.7
42 2eoe:A 46 24 0.1343 0.1957 0.3750 1.1 2ytk:A
43 8jpy:A 64 30 0.1343 0.1406 0.3000 1.1 8jq1:A
44 2ysv:A 42 24 0.1194 0.1905 0.3333 1.1
45 2yts:A 46 24 0.1343 0.1957 0.3750 1.6
46 2rsj:A 92 25 0.1493 0.1087 0.4000 1.6 2els:A, 2rut:A, 2rv6:A
47 2ytb:A 42 24 0.1343 0.2143 0.3750 1.6
48 2el6:A 46 24 0.1493 0.2174 0.4167 1.7
49 2ytg:A 46 24 0.1343 0.1957 0.3750 1.9
50 2n26:A 55 24 0.1194 0.1455 0.3333 1.9
51 2mdg:A 55 23 0.1343 0.1636 0.3913 2.1
52 2eme:A 46 24 0.1493 0.2174 0.4167 2.4
53 2emf:A 46 24 0.1194 0.1739 0.3333 2.8
54 2emz:A 46 24 0.1343 0.1957 0.3750 3.0
55 2en8:A 46 24 0.1343 0.1957 0.3750 3.2
56 7ysh:D 213 29 0.1940 0.0610 0.4483 3.5 1fq9:C, 1fq9:D, 7ysh:E
57 7ysu:C 211 55 0.2388 0.0758 0.2909 3.5 7ysu:E
58 2epr:A 48 22 0.1194 0.1667 0.3636 4.4
59 2emw:A 44 24 0.1194 0.1818 0.3333 4.8
60 1x6e:A 72 26 0.1493 0.1389 0.3846 5.0
61 2emj:A 46 24 0.1343 0.1957 0.3750 5.2
62 2emg:A 46 24 0.1343 0.1957 0.3750 5.2
63 2yu5:A 44 23 0.1343 0.2045 0.3913 5.3
64 2em5:A 46 25 0.1493 0.2174 0.4000 5.4
65 2ep1:A 46 24 0.1194 0.1739 0.3333 5.9 2ep2:A
66 8xd5:A 419 26 0.1642 0.0263 0.4231 6.1 8hho:A, 8hiq:A, 8hiz:A, 8hj9:A, 8xco:A, 8xcp:A, 8xcq:A, 8xcr:A, 8xcs:A, 8xct:A, 8xcu:A, 8xcv:A, 8xcw:A, 8xcx:A, 8xcy:A, 8xcz:A, 8xd0:A, 8xd1:A, 8xd2:A, 8xd3:A, 8xd4:A, 8xd6:A, 8znb:A, 8znc:A, 8znd:A, 8zne:A, 8zng:A
67 1mey:F 84 24 0.1343 0.1071 0.3750 6.3 1mey:C
68 1mey:F 84 24 0.1343 0.1071 0.3750 7.2 1mey:C
69 2dmd:A 96 23 0.1493 0.1042 0.4348 6.4
70 7txc:E 84 23 0.1343 0.1071 0.3913 6.7
71 2epz:A 46 24 0.1493 0.2174 0.4167 7.3
72 2emk:A 46 24 0.1194 0.1739 0.3333 7.3
73 2drp:D 65 27 0.1194 0.1231 0.2963 7.4 2drp:A
74 8tho:A 100 22 0.1194 0.0800 0.3636 7.6 8dtn:F, 6ki6:A, 6ki6:B, 8tlo:A, 6u9q:A
75 2emm:A 46 23 0.1493 0.2174 0.4348 7.7
76 2epv:A 44 23 0.1194 0.1818 0.3478 8.1
77 6hjg:B 376 32 0.1940 0.0346 0.4062 8.5 6hje:A, 6hje:B, 6hjf:A, 6hjf:B, 6hjg:A, 1w61:A, 1w61:B, 1w62:A
78 6h0g:C 30 25 0.1194 0.2667 0.3200 9.0 6h0g:F
79 2em2:A 46 24 0.1493 0.2174 0.4167 9.3
80 2ma7:A 73 29 0.1791 0.1644 0.4138 9.3

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218