Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
NGLTYCTHASGFSFNPQTADAGTSMNVVTEQIYNKLFDIKNHSATLTPMLAQSYSISADGKEILLNLRHGVKFHQTPWFT
PTRDFNAEDVVFSINRVLGHNFPYFDSIKLNEKIKSVTALSPYQVKIELFAPDSSILSHLASQYAIIFSQEYAYQLSADD
NLAQLDTHPVGTGPYQVKDYVYNQYVRLVRNENYWKKEAKIEHIIVDLSTDRSGRLVKFFNNECQIASYPEVSQIGLLKN
DDKHYYMQSTDGMNLAYLAFNFDKPLMRDHEIRAAISQSLNRARIIHSIYHNTATVANNIIPEVSWASTVNTPEFEFDYH
PKIAKNKLADKNLLLNLWVINEEQVYNPAPFKMAEMIKWDLAQAGVKVKVRAVTRPFLTAQLRNQSENYDLILSGWLAGN
LDPDGFMRPILSCGTKNELTNLSNWCNEEFDQFMDRAITTSHLSSRAKAYNEAQELVLRELPIIPIANVKRILVANSRVK
GVKMTPFGSLDFSTLYFI

The query sequence (length=498) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7og0:B 498 498 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 7ofw:A, 7ofz:A, 7og0:A
2 4qfl:A 507 508 0.3474 0.3412 0.3406 6.60e-116 4qfl:B, 4qfn:A, 4qfn:B, 4qfo:A, 4qfo:B, 4qfp:A, 4qfp:B
3 1dpp:A 507 507 0.3153 0.3097 0.3097 1.77e-90 1dpp:C, 1dpp:E, 1dpp:G
4 5f1q:A 513 507 0.3133 0.3041 0.3077 7.03e-88 5f1q:B
5 3m8u:A 508 498 0.3193 0.3130 0.3193 4.76e-84
6 6ofq:A 512 500 0.2751 0.2676 0.2740 6.49e-50 6pu3:A
7 8upi:A 510 482 0.2450 0.2392 0.2531 1.82e-39
8 4oev:A 494 470 0.2510 0.2530 0.2660 3.84e-30 4oeu:A, 4oeu:B, 4oev:B
9 1uqw:A 487 466 0.2108 0.2156 0.2253 8.08e-29 1uqw:B
10 8caw:A 491 464 0.2169 0.2200 0.2328 7.13e-23 8cay:A, 8cb9:A, 8cdo:A
11 4oes:A 498 478 0.2008 0.2008 0.2092 3.21e-22
12 7kz9:A 478 482 0.2390 0.2490 0.2469 3.98e-22 7kz9:B
13 8ch2:A 479 473 0.2209 0.2296 0.2326 9.59e-18 8ch1:A, 8ch3:A, 8chc:A, 8ci6:A, 8cju:A
14 3e3k:B 500 466 0.2129 0.2120 0.2275 1.61e-17 7a0c:A, 7a0c:B, 4dcx:A, 4dcx:B, 4dcy:A, 4dcy:B, 3dp8:A, 3dp8:B, 3dp8:C, 3e3k:A, 3e3k:C, 4i8c:A, 4i8c:B, 4i8c:C, 4i9d:A, 4i9d:B, 5l8d:A, 5l8d:B, 3mvw:A, 3mvw:B, 3mvx:A, 3mvx:B, 3mvy:A, 3mvy:B, 3mvz:A, 3mvz:B, 3mw0:A, 3mw0:B, 5mwu:A, 5mwu:B, 3mz9:A, 3mz9:B, 3mzb:A, 3mzb:B, 2noo:A, 5on0:A, 5on0:B, 5on1:A, 5on1:B, 5on4:A, 5on4:B, 5on5:A, 5on5:B, 5on8:A, 5on8:B, 5on9:A, 5on9:B, 6r4q:A, 6r4q:B, 8spm:A, 1zlq:A, 1zlq:B
15 8ay0:B 496 515 0.2329 0.2339 0.2252 3.40e-17 8ay0:A, 8ay0:C
16 4ofj:A 465 467 0.2108 0.2258 0.2248 1.37e-16 3rqt:A, 4xkn:A, 4xkp:A, 4xkq:A, 4xkr:A
17 1xoc:A 504 438 0.1948 0.1925 0.2215 5.15e-16
18 8cko:A 492 472 0.2008 0.2033 0.2119 1.30e-15 8ckd:A, 8cke:A, 6i7w:A, 4ra1:A, 4ze9:A, 4zeb:A, 4zeb:B, 4zec:A, 4zed:A, 4zei:A, 4zek:A
19 8arn:A 509 508 0.2269 0.2220 0.2224 2.02e-15 8are:A, 8arn:B
20 3o9p:A 509 485 0.2229 0.2181 0.2289 7.91e-15
21 7z6f:E 581 429 0.1827 0.1566 0.2121 8.79e-15 7atr:A, 8fsq:A, 8fsr:A, 8fss:A
22 6hlx:A 491 469 0.2129 0.2159 0.2260 1.09e-14
23 4gfr:A 529 293 0.1526 0.1437 0.2594 2.32e-14 8i5j:A, 8i5j:B, 8i5k:A, 1zu0:A
24 5yh8:A 510 522 0.2289 0.2235 0.2184 4.34e-14 5yhe:A, 5yhe:B, 5yhg:A
25 5kzt:B 510 506 0.2169 0.2118 0.2134 5.09e-14 5kzt:A
26 5z99:A 485 518 0.2369 0.2433 0.2278 4.12e-12 5yyb:A, 5yyb:B
27 4gl8:A 500 482 0.2169 0.2160 0.2241 3.11e-11 4gl8:B
28 6tfx:B 494 455 0.1988 0.2004 0.2176 4.22e-11 6tfq:A, 6tfq:B, 6tfs:A, 6tfs:B, 6tfx:A
29 4faj:A 507 525 0.2390 0.2347 0.2267 4.48e-11
30 7ebi:A 537 294 0.1506 0.1397 0.2551 6.93e-11 7ebm:A, 6lzq:A, 6lzt:A, 6lzu:A, 6lzv:A, 6lzw:A
31 6npo:A 518 481 0.2108 0.2027 0.2183 2.71e-09
32 6dtg:A 522 333 0.1627 0.1552 0.2432 1.66e-08 6dqq:A, 6dqr:A, 6dqt:A, 6dqu:A, 6dtf:A, 6dth:A
33 8wda:A 517 500 0.2189 0.2108 0.2180 1.77e-08 6e3d:A, 6e4d:A, 7jls:A
34 3tcf:A 517 318 0.1386 0.1335 0.2170 1.91e-08 3tcf:B, 3tcf:C, 3tcf:D, 3tcf:E, 3tcf:F, 3tcf:G, 3tcf:H, 3tcg:A, 3tcg:B, 3tcg:C, 3tcg:D, 3tcg:E, 3tcg:F, 3tcg:G, 3tcg:H
35 2z23:A 517 352 0.1586 0.1528 0.2244 2.22e-07
36 7veu:A 612 297 0.1446 0.1176 0.2424 2.48e-06 7vev:A, 7vew:A, 7vew:B
37 1b05:A 517 316 0.1345 0.1296 0.2120 3.56e-06 1b0h:A, 1b1h:A, 1b2h:A, 1b32:A, 1b3f:A, 1b3g:A, 1b3h:A, 1b3l:A, 1b3l:C, 1b40:A, 1b46:A, 1b4h:A, 1b4z:A, 1b51:A, 1b52:A, 1b58:A, 1b5h:A, 1b5i:A, 1b5j:A, 1b6h:A, 1b7h:A, 1b9j:A, 1jet:A, 1jeu:A, 1jev:A, 1ola:A, 1olc:A, 2olb:A, 1qka:A, 1qkb:A, 2rkm:A
38 8a42:A 627 286 0.1426 0.1132 0.2483 4.67e-06 8qm0:A, 8qm0:B, 8qm0:C, 8qm0:D
39 3zs6:A 506 327 0.1325 0.1304 0.2018 9.40e-06
40 4pfy:A 539 511 0.2169 0.2004 0.2114 9.87e-06 4pft:A, 4pft:B, 4pfy:B
41 4ofo:A 497 423 0.1807 0.1811 0.2128 6.47e-05 4ofl:A, 4ofl:B, 4ofo:B, 4ofo:C, 4ofo:D
42 2d5w:A 602 229 0.1104 0.0914 0.2402 1.65e-04 2d5w:B
43 3ryb:A 563 152 0.0723 0.0639 0.2368 6.38e-04 3drf:A, 3drg:A, 3drh:A, 3dri:A, 3drj:A, 3drk:A, 3rya:A
44 8qlg:A 624 285 0.1365 0.1090 0.2386 7.38e-04 8qlg:B
45 3i5o:A 582 120 0.0683 0.0584 0.2833 7.41e-04 3i5o:B, 4jsd:A, 4jso:A, 2o7i:A
46 7z8e:A 590 192 0.0884 0.0746 0.2292 0.001
47 4pfu:B 542 346 0.1506 0.1384 0.2168 0.009 5hm4:B, 4pfu:A, 4pfw:A, 4pfw:B
48 8j5u:A 534 354 0.1345 0.1255 0.1893 0.015 8j5q:A, 8j5s:A
49 4rjw:A 426 87 0.0442 0.0516 0.2529 1.4 4rjx:A
50 6epz:C 673 57 0.0361 0.0267 0.3158 1.4 6epy:A, 6epy:B, 6epy:C, 6epy:D, 6epz:A, 6epz:D, 6epz:B, 6eq0:A, 6eq0:B, 6eq1:A, 6eq1:B, 6eq8:D, 6eq8:B, 6eq8:C, 6eq8:A
51 6g7a:A 262 36 0.0301 0.0573 0.4167 1.6 8co3:A, 8co3:B, 8co3:C, 8co3:D, 6g5l:A, 6g5l:B, 6g5l:C, 6g5l:D, 6g7a:B, 6g7a:C, 6g7a:D, 4ht2:A, 4ht2:B, 4ht2:C, 4ht2:D, 1jcz:A, 1jcz:B, 1jd0:A, 1jd0:B, 4kp5:A, 4kp5:B, 4kp5:C, 4kp5:D, 4kp8:A, 4kp8:B, 4kp8:C, 4kp8:D, 5ll5:A, 5ll5:B, 5ll5:C, 5ll5:D, 5ll9:A, 5ll9:B, 5ll9:C, 5ll9:D, 5llo:A, 5llo:B, 5llo:C, 5llo:D, 5llp:A, 5llp:B, 5llp:C, 5llp:D, 5msa:A, 5msa:B, 5msa:C, 5msa:D, 5msb:A, 5msb:B, 5msb:C, 5msb:D, 7pp9:A, 7pp9:B, 7pp9:C, 7pp9:D, 7puu:A, 7puu:B, 7puu:C, 7puu:D, 7puv:A, 7puv:B, 7puv:C, 7puv:D, 7puw:A, 7puw:B, 7puw:C, 7puw:D, 4q0l:A, 4q0l:B, 4q0l:C, 4q0l:D, 4qj0:A, 4qj0:B, 4qj0:C, 4qj0:D, 4qjo:A, 4qjo:B, 4qjo:C, 4qjo:D, 4qjw:A, 4qjw:B, 4qjw:C, 4qjw:D, 6qn0:A, 6qn0:B, 6qn0:C, 6qn0:D, 6qng:A, 6qng:B, 6qng:C, 6qng:D, 6qnl:A, 6qnl:B, 6qnl:C, 6qnl:D, 6r6y:A, 6r6y:B, 6r6y:C, 6r6y:D, 6r71:A, 6r71:B, 6rps:A, 6rps:B, 6t5p:A, 6t5p:B, 6t5p:C, 6t5p:D, 6t5q:A, 6t5q:B, 6t5q:C, 6t5q:D, 4ww8:A, 4ww8:B, 4ww8:C, 4ww8:D
52 4ntd:A 318 48 0.0261 0.0409 0.2708 3.9
53 8wk3:o 250 59 0.0402 0.0800 0.3390 4.1 7cgo:b, 7cgo:e, 7cgo:a, 7cgo:c, 7cgo:d, 7e80:b, 7e80:e, 7e80:a, 7e80:c, 7e80:d, 7e82:b, 7e82:e, 7e82:a, 7e82:c, 7e82:d, 8wk3:m, 8wk3:n, 8wk3:p, 8wk3:q, 8wkk:m, 8wkk:n, 8wkk:o, 8wkk:p, 8wkk:q, 8wl2:AA, 8wl2:AB, 8wl2:AC, 8wl2:AD, 8wl2:AE, 8wlh:m, 8wlh:n, 8wlh:o, 8wlh:q, 8wlq:m, 8wlq:n, 8wlq:o, 8wlq:q, 8wlt:AA, 8wlt:AB, 8wlt:AC, 8wlt:AE, 8wo5:AA, 8wo5:AB, 8wo5:AC, 8wo5:AE, 8woe:AA, 8woe:AB, 8woe:AC, 8woe:AD, 8woe:AE
54 3c25:A 354 55 0.0321 0.0452 0.2909 8.8 3bvq:A, 3bvq:B, 3c25:B
55 3l81:A 250 71 0.0341 0.0680 0.2394 9.7 4mdr:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218