>protein
NGHLQHHPPMPPISNHPAPEYWCSIAYFEMDVQVGETFKVPSSCPIVTVDGYVDPSGGDRFCLGQLSNVHRTEAIERARL
HIGKGVQLECKGEGDVWVRCLSDHAVFVQSYYLDREAGRAPGDAVHKIYPSAYIKVFDLRQCHRQMQQQAATAQAAAAAQ
AAAVAGNAPAISLSAAAGIGVDDLRRLCILRMSFVKGWGPDYPRQSIKETPCWIEIHLHRALQLLDEVLHTMPIADPQPL
D
The query sequence (length=241) is searched through a non-redundant set of database sequences
protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.
# |
Hit |
Hit length |
Aligned length |
Identity (normalized by query) |
Identity (normalized by hit) |
Identity (normalized by aligned length) |
E-value |
Homologs to hit |
1 |
1dd1:B |
249 |
249 |
1.0000 |
0.9679 |
0.9679 |
4.90e-178 |
1dd1:A, 1dd1:C |
2 |
6m64:A |
203 |
217 |
0.4025 |
0.4778 |
0.4470 |
3.81e-54 |
7co1:A, 7co1:C, 7co1:E, 6m64:C, 6m64:E, 5xod:A, 6zvq:A |
3 |
4kbz:A |
231 |
99 |
0.0830 |
0.0866 |
0.2020 |
0.77 |
5a3u:B, 5a3u:C, 4bqw:A, 4bqx:A, 4bqy:A, 2g19:A, 2g1m:A, 2hbt:A, 2hbu:A, 3hqr:A, 3hqu:A, 4jzr:A, 5l9b:A, 5l9b:B, 5l9r:A, 5l9v:A, 5l9v:B, 5la9:A, 5la9:B, 5las:A, 5las:B, 5lat:A, 5lb6:A, 5lbb:A, 5lbc:A, 5lbe:A, 5lbf:A, 6nmq:A, 3ouh:A, 3oui:A, 3ouj:A, 5ox5:A, 5ox6:A, 7q5v:A, 7q5x:A, 8q5s:A, 8q64:A, 8q6d:A, 8q6e:A, 6st3:A, 6st3:B, 7ujv:B, 7ump:A, 4uwd:A, 5v18:A, 2y33:A, 2y34:A, 6yvt:B, 6yvt:D, 6yvw:A, 6yvx:A, 6yvz:A, 6yw0:A, 6yw1:A, 6yw2:A, 6yw3:A, 6yw4:A, 6zbn:B, 6zbn:D, 6zbo:A, 6zbo:C, 6zbo:D |
4 |
2zwa:B |
683 |
80 |
0.0871 |
0.0307 |
0.2625 |
1.7 |
2zw9:A, 2zw9:B, 2zwa:A |
5 |
5olu:A |
310 |
50 |
0.0788 |
0.0613 |
0.3800 |
2.6 |
|
6 |
5y7w:A |
125 |
38 |
0.0664 |
0.1280 |
0.4211 |
2.7 |
5nwx:A, 1oj5:A, 5y7w:B |
7 |
2pop:D |
80 |
28 |
0.0581 |
0.1750 |
0.5000 |
7.3 |
6gjw:A, 6gjw:B, 6gjw:C, 6gjw:D, 4mtz:A, 4mtz:B, 4mtz:C, 4mtz:D, 4oxc:A, 4oxc:B, 4oxc:C, 4oxc:D, 2poi:A, 2pop:B, 6qci:A, 6qci:B, 6qci:C, 6qci:D, 2qra:D, 2qra:C, 2qra:B, 2qra:A |
8 |
4ac9:C |
471 |
27 |
0.0456 |
0.0234 |
0.4074 |
9.9 |
4ac9:A, 4ac9:B, 4aca:B, 4aca:C, 4acb:A, 4acb:B, 4acb:C |
[Back]