Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
NFSKQASEILNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELARKCGITVSQVSNWFGNKRIRYKKNIGKAQEEANLYAA

The query sequence (length=69) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1lfu:P 82 69 0.9130 0.7683 0.9130 1.16e-42 1b72:B, 1b8i:B, 4cyc:B, 1puf:B, 2r5y:B, 2r5z:B, 4uus:B, 4uus:F, 5zjq:B, 5zjr:B, 5zjs:B, 5zjt:B
2 4xrm:B 64 51 0.3623 0.3906 0.4902 5.09e-15 5bng:B, 5bng:A, 5eg0:A, 5ego:A, 8vts:B, 8vts:D, 8vtt:D, 4xrm:A, 4xrs:A, 4xrs:B
3 6fqp:A 67 57 0.3043 0.3134 0.3684 2.46e-09 6fqp:B, 6fqq:A, 6fqq:B, 6fqq:D, 6fqq:E
4 4egc:A 539 44 0.3478 0.0445 0.5455 9.51e-09
5 1akh:B 78 68 0.3188 0.2821 0.3235 3.18e-07 1apl:C, 1apl:D, 1k61:A, 1k61:B, 1k61:C, 1k61:D, 1le8:B, 1yrn:B
6 1le8:A 53 54 0.3478 0.4528 0.4444 1.02e-06 1akh:A, 1yrn:A
7 1mnm:C 77 49 0.2174 0.1948 0.3061 2.74e-05 1mnm:D
8 5zjr:A 64 52 0.2899 0.3125 0.3846 3.64e-05 5zjq:A, 5zjs:A, 5zjt:A, 5zjt:E
9 3a01:F 61 35 0.2029 0.2295 0.4000 7.16e-05 3a01:B, 3lnq:A
10 3cmy:A 60 51 0.2464 0.2833 0.3333 1.25e-04
11 1fjl:A 65 47 0.2174 0.2308 0.3191 6.65e-04 1fjl:B, 1fjl:C
12 8osb:E 62 35 0.1884 0.2097 0.3714 6.84e-04
13 4qtr:C 57 57 0.2609 0.3158 0.3158 7.13e-04 4qtr:A, 4qtr:B, 4qtr:D
14 6e8c:A 135 32 0.2029 0.1037 0.4375 7.90e-04 6a8r:A, 6a8r:B, 6dfy:C, 6dfy:D, 7dw5:A, 7dw5:B, 6u81:A, 6u82:A, 6u82:D, 5z2t:C, 5z2t:D, 5z6z:A, 5zfw:A, 5zfy:A, 5zfz:A
15 6e8c:A 135 51 0.2754 0.1407 0.3725 0.006 6a8r:A, 6a8r:B, 6dfy:C, 6dfy:D, 7dw5:A, 7dw5:B, 6u81:A, 6u82:A, 6u82:D, 5z2t:C, 5z2t:D, 5z6z:A, 5zfw:A, 5zfy:A, 5zfz:A
16 2lkx:A 68 50 0.2319 0.2353 0.3200 0.001
17 4uus:A 67 44 0.2029 0.2090 0.3182 0.001 4uus:E
18 1puf:A 77 51 0.2464 0.2208 0.3333 0.002 2lp0:A
19 8ejo:A 56 52 0.2754 0.3393 0.3654 0.002 8ejo:B, 8ejp:A, 8ejp:B
20 3d1n:I 150 50 0.2609 0.1200 0.3600 0.005 3d1n:K, 3d1n:J, 3d1n:L, 3d1n:M, 3d1n:N, 3d1n:O, 3d1n:P
21 4cyc:A 66 39 0.1884 0.1970 0.3333 0.006 1b8i:A
22 5hod:A 61 53 0.2319 0.2623 0.3019 0.012 5hod:D
23 8pna:A 67 49 0.2029 0.2090 0.2857 0.012 8pm5:A, 8pm5:D, 8pm5:G, 8pm5:M, 8pm5:J, 8pm7:A, 8pm7:C, 8pm7:E, 8pm7:G, 8pmc:A, 8pmc:C, 8pmc:E, 8pmc:G, 8pmf:A, 8pmn:A, 8pmv:A, 8pmv:D, 8pmv:G, 8pmv:J, 8pn4:A, 8pn4:D, 8pn4:G, 8pn4:M, 8pn4:J, 8pnc:A, 8pnc:K, 8pnc:E, 8pnc:H
24 1b72:A 68 56 0.2609 0.2647 0.3214 0.013
25 8eml:A 58 37 0.2029 0.2414 0.3784 0.013 8eml:B
26 4rdu:D 62 34 0.2174 0.2419 0.4412 0.013 4rdu:A, 4xrs:I, 4xrs:G
27 2h1k:B 60 38 0.2029 0.2333 0.3684 0.014 2h1k:A
28 8ik5:C 67 33 0.1884 0.1940 0.3939 0.019 8ike:C, 8ilw:C
29 1ahd:P 68 51 0.2174 0.2206 0.2941 0.020
30 2r5z:A 75 51 0.2174 0.2000 0.2941 0.024 9ant:A, 9ant:B, 5jlw:A, 5jlw:D, 5jlx:A, 5jlx:D, 2r5y:A, 4xic:A, 4xic:D, 4xid:A, 4xid:D
31 4j19:A 77 73 0.3043 0.2727 0.2877 0.028 4j19:B
32 2ld5:A 67 50 0.1884 0.1940 0.2600 0.029
33 5eea:G 63 52 0.1594 0.1746 0.2115 0.047 8byx:B, 8byx:J, 8byx:A, 8byx:K, 8byx:G, 8byx:L, 5edn:A, 5edn:B, 5edn:G, 5edn:J, 5eea:B, 5eea:A, 5eea:J, 5ef6:A, 5ef6:J, 5ef6:B, 5ef6:G, 5eg0:B, 5ego:B, 5no6:A, 5no6:B, 7psx:A, 7psx:B, 7psx:G, 7psx:J
34 6es3:K 72 51 0.2609 0.2500 0.3529 0.054 6es2:K, 6es2:L, 6es3:M, 5lty:K, 5lty:M, 5lux:K, 5lux:L, 7q3o:K, 7q3o:C, 7q3o:E, 7q3o:G, 7q4n:K, 7q4n:C
35 4rbo:A 55 54 0.2319 0.2909 0.2963 0.056 4rbo:D
36 3a01:A 78 28 0.1449 0.1282 0.3571 0.075 3a01:E
37 6m3d:C 108 37 0.1739 0.1111 0.3243 0.11 1du0:A, 1du0:B, 1hdd:C, 1hdd:D, 2hdd:A, 2hdd:B, 3hdd:A, 3hdd:B, 2hos:A, 2hos:B, 2hot:A, 2hot:B
38 6m3d:C 108 33 0.1594 0.1019 0.3333 0.31 1du0:A, 1du0:B, 1hdd:C, 1hdd:D, 2hdd:A, 2hdd:B, 3hdd:A, 3hdd:B, 2hos:A, 2hos:B, 2hot:A, 2hot:B
39 2d5v:A 135 33 0.1884 0.0963 0.3939 0.28 2d5v:B, 8t0f:A, 8t11:A
40 6cpu:A 526 59 0.2609 0.0342 0.3051 0.35 6cpt:A
41 9b8u:B 66 27 0.1739 0.1818 0.4444 0.38 9b8u:A, 9b8u:C, 9b8u:D
42 1zq3:P 68 52 0.2464 0.2500 0.3269 0.41
43 5flv:M 229 34 0.1739 0.0524 0.3529 0.72 5flv:A, 5flv:E, 5flv:I, 4s0h:A, 4s0h:B, 4s0h:E, 4s0h:F, 6wc2:N, 6wc2:M, 6wc2:O, 6wc5:I, 6wc5:N, 2x6u:A, 2x6v:A, 2x6v:B
44 3rkq:A 58 29 0.1594 0.1897 0.3793 0.93 3rkq:B
45 3l1p:A 147 38 0.1739 0.0816 0.3158 1.1 8bx2:A, 6ht5:E, 3l1p:B, 8sps:L, 8spu:L, 6t90:K, 7u0g:M, 7u0g:L, 7u0i:L, 7u0i:M
46 8bx1:A 127 33 0.1594 0.0866 0.3333 1.3
47 6qs4:C 630 54 0.2464 0.0270 0.3148 1.7 5og1:C, 5og1:D, 6qs4:D, 6qs4:E, 6qs6:C, 6qs6:D, 6qs7:C, 6qs7:D, 6qs7:E, 6qs8:C, 6qs8:D, 6qs8:E
48 7mgm:A 2274 41 0.1739 0.0053 0.2927 2.6
49 4ai6:A 2650 41 0.1739 0.0045 0.2927 2.7 4ai6:B, 4akg:A, 4akg:B, 4akh:A, 4akh:B, 4aki:A, 4aki:B, 3crt:A, 3cru:A, 3d0z:A, 1dug:A, 1dug:B, 1gne:A, 1gtb:A, 8gyd:A, 8gyd:B, 5gzz:B, 5gzz:C, 5gzz:D, 5gzz:E, 5gzz:F, 5gzz:G, 6ji6:A, 1m99:A, 1m9a:A, 1m9b:A, 7mi3:A, 7mi6:A, 6rwd:A, 6rwd:B, 1u87:A, 1u88:A, 1ua5:A, 4wr4:A, 4wr5:A
50 4w8f:B 2609 41 0.1739 0.0046 0.2927 2.8 220l:A, 223l:A, 225l:A, 227l:A, 148l:E, 258l:A, 259l:A, 260l:A, 182l:A, 183l:A, 184l:A, 185l:A, 186l:A, 187l:A, 188l:A, 2a4t:A, 1c61:A, 1c62:A, 1c65:A, 1c66:A, 1c67:A, 1c68:A, 1c6a:A, 1c6b:A, 1c6d:A, 1c6e:A, 1c6g:A, 1c6h:A, 1c6j:A, 1c6k:A, 1c6m:A, 1c6n:A, 1c6q:A, 1c6t:A, 2cuu:A, 3dmx:A, 3dmz:A, 3dn0:A, 3dn1:A, 3dn2:A, 3dn3:A, 3dn4:A, 3dn6:A, 3dn8:A, 3dna:A, 1epy:A, 5g27:A, 3g3v:A, 3g3w:A, 3g3x:A, 3guj:A, 3guk:A, 3gul:A, 3gul:B, 3gum:A, 3gum:B, 3gun:A, 3gun:B, 3guo:A, 3guo:B, 3gup:A, 3gup:B, 3hh3:A, 3hh5:A, 3hh6:A, 3ht6:A, 3ht7:A, 3ht8:A, 3ht9:A, 3htb:A, 3htd:A, 3htf:A, 3htg:A, 3hu8:A, 3hu9:A, 3hua:A, 3huk:A, 3huq:A, 3hwl:A, 2igc:A, 5jdt:A, 5jgn:A, 5jgr:A, 5jgv:A, 5jgz:A, 5jws:A, 5jwt:A, 5jwu:A, 5jwv:A, 5jww:A, 3k2r:A, 3l2x:A, 7l3b:A, 7l3c:A, 7l3d:A, 7l3e:A, 7l3f:A, 7l3g:A, 7l3h:A, 7l3i:A, 7l3j:A, 7l3k:A, 1l83:A, 1l84:A, 1lgw:A, 1lgx:A, 1li3:A, 1li6:A, 7loa:A, 7lob:A, 7loc:A, 7lod:A, 7loe:A, 7lof:A, 7log:A, 7loj:A, 5lwo:A, 7lx6:A, 7lx7:A, 7lx8:A, 7lx9:A, 7lxa:A, 4lzm:A, 5lzm:A, 6lzm:A, 7lzm:A, 1nhb:A, 2ntg:A, 2nth:A, 2oty:X, 2otz:X, 2ou0:X, 2ou8:A, 2ou9:A, 1ov5:A, 1ov7:A, 1ovh:A, 1ovj:A, 1ovk:A, 1owy:A, 1owz:A, 6pgy:A, 6pgz:A, 6pgz:B, 4pjz:A, 4pk0:A, 2q9d:A, 2q9e:B, 2q9e:C, 2ray:X, 2raz:X, 2rb0:X, 2rb1:X, 2rb2:X, 2rbn:A, 2rbo:A, 2rbp:A, 2rbq:A, 2rbr:A, 2rbs:A, 3run:A, 3sb5:B, 3sb5:A, 3sb5:C, 3sb5:D, 3sb6:A, 3sb6:B, 3sb8:A, 3sb8:B, 3sb9:A, 3sb9:B, 3sba:B, 3sba:C, 3sba:F, 8tat:A, 6v51:A, 4w52:A, 4w53:A, 4w54:A, 4w55:A, 4w56:A, 4w57:A, 4w58:A, 4w59:A, 4w8f:A, 1xep:A, 1zur:A, 1zwn:A, 1zyt:A
51 8dzz:A 2363 41 0.1739 0.0051 0.2927 2.8 8dzz:D, 8e00:A
52 8ost:A 390 64 0.2899 0.0513 0.3125 2.9
53 6fwf:A 712 27 0.1594 0.0154 0.4074 3.0
54 2gbf:A 730 33 0.1739 0.0164 0.3636 3.1 4ffw:A, 4ffw:B, 2gbg:A, 2gbi:A, 2i3z:A, 2oae:A, 5vta:A, 5vta:B, 5vta:C, 5vta:D
55 2aj8:A 728 33 0.1739 0.0165 0.3636 3.1 2aj8:B, 2aj8:C, 2aj8:D, 2ajb:A, 2ajb:B, 2ajb:C, 2ajb:D, 2ajc:A, 2ajc:B, 2ajc:C, 2ajc:D, 2ajd:A, 2ajd:B, 2ajd:C, 2ajd:D, 2bua:A, 2bua:B, 2bua:C, 2bua:D, 2buc:A, 2buc:B, 2buc:C, 2buc:D, 5lls:A, 5lls:B, 5lls:D, 5lls:C, 1orw:A, 1orw:B, 1orw:C, 1orw:D, 7xnm:B, 7xnm:A
56 4n8e:B 734 33 0.1739 0.0163 0.3636 3.3 4a5s:A, 4a5s:B, 2ajl:I, 2ajl:J, 6b1e:A, 6b1e:B, 6b1o:A, 6b1o:B, 2bgn:A, 2bgn:B, 2bgn:C, 2bgn:D, 2bgr:A, 2bgr:B, 3bjm:A, 3bjm:B, 2bub:A, 2bub:B, 3c43:A, 3c43:B, 3c45:A, 3c45:B, 3ccb:A, 3ccb:B, 3ccb:C, 3ccb:D, 3ccc:A, 3ccc:B, 3ccc:C, 3ccc:D, 3d4l:A, 3d4l:B, 4dsa:A, 4dsz:A, 4dsz:B, 4dtc:A, 4dtc:B, 3eio:A, 3eio:B, 3f8s:A, 3f8s:B, 2fjp:A, 2fjp:B, 3g0b:A, 3g0b:B, 3g0b:C, 3g0b:D, 3g0c:A, 3g0c:B, 3g0c:C, 3g0c:D, 3g0d:A, 3g0d:B, 3g0d:C, 3g0d:D, 3g0g:A, 3g0g:B, 3g0g:C, 3g0g:D, 4g1f:A, 4g1f:B, 4g1f:C, 4g1f:D, 2g5p:A, 2g5t:A, 2g63:B, 3h0c:A, 3h0c:B, 3hab:A, 3hab:B, 3hac:A, 3hac:B, 2hha:A, 2hha:B, 2i03:B, 2i78:B, 5i7u:A, 5i7u:B, 2iit:A, 2iit:B, 2iiv:A, 2iiv:B, 5ism:A, 5ism:B, 4j3j:A, 4j3j:B, 5j3j:A, 5j3j:B, 4jh0:A, 4jh0:B, 2jid:A, 2jid:B, 5kby:A, 5kby:B, 5kby:C, 5kby:D, 3kwf:A, 3kwf:B, 3kwj:A, 3kwj:B, 4lko:A, 4lko:B, 1n1m:A, 1n1m:B, 4n8d:A, 4n8d:B, 4n8e:A, 3nox:A, 3nox:B, 1nu8:B, 3o95:A, 3o95:B, 3o95:C, 3o95:D, 3o9v:A, 3o9v:B, 3o9v:C, 3o9v:D, 2oag:B, 3oc0:A, 3oc0:B, 2ogz:A, 2ogz:B, 2ole:A, 2ole:B, 2onc:A, 2onc:B, 2onc:C, 2onc:D, 2oph:A, 2oph:B, 3opm:A, 3opm:B, 3opm:C, 3opm:D, 2oqi:B, 2oqv:A, 2p8s:A, 2p8s:B, 4pnz:A, 4pnz:B, 4pv7:A, 4pv7:B, 3q0t:A, 3q0t:B, 3q8w:A, 3q8w:B, 3qbj:A, 3qbj:B, 2qjr:A, 2qjr:B, 2qky:A, 2qky:B, 2qky:C, 2qky:D, 2qoe:A, 2qoe:B, 2qt9:A, 2qt9:B, 2qtb:A, 2qtb:B, 1r9n:A, 1r9n:B, 1r9n:C, 1r9n:D, 2rgu:A, 2rgu:B, 2rip:A, 1rwq:A, 1rwq:B, 3sww:A, 3sww:B, 3sx4:A, 3sx4:B, 5t4b:A, 5t4b:B, 5t4e:A, 5t4e:B, 5t4f:A, 5t4f:B, 5t4h:A, 5t4h:B, 1tkr:A, 1tkr:B, 3vjk:A, 3vjk:B, 3vjl:A, 3vjl:B, 3vjm:A, 3vjm:B, 3w2t:A, 3w2t:B, 1wcy:A, 1wcy:B, 3wqh:A, 3wqh:B, 1x70:A, 1x70:B, 5y7h:A, 5y7h:B, 5y7j:A, 5y7j:B, 5y7j:C, 5y7j:D, 5y7k:A, 5y7k:B, 5y7k:C, 5y7k:D, 5zid:A, 5zid:B
57 6iw6:A 438 64 0.2899 0.0457 0.3125 3.3 6iw6:B
58 8g8e:X 140 39 0.1594 0.0786 0.2821 3.5 8g87:X, 8g88:X, 8g8b:X, 8g8g:X, 8sps:M, 7u0g:K
59 5ej0:A 212 41 0.1739 0.0566 0.2927 4.3
60 6y0f:C 722 33 0.1594 0.0152 0.3333 4.7 6y0f:A, 6y0f:B, 6y0f:D
61 1ig7:A 58 34 0.1594 0.1897 0.3235 5.8
62 1jgg:A 57 34 0.1594 0.1930 0.3235 6.1 1jgg:B
63 8fl2:NC 511 31 0.1739 0.0235 0.3871 7.7 8fkz:NC, 8fl0:NC, 8fl3:NC, 8fl4:NC, 8idt:A, 8idy:A, 8ie3:A, 8ine:A, 8inf:A, 8ink:w, 8ipd:w, 8ipx:w, 8ipy:w, 8ir1:w, 8ir3:w

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218