Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
NETLSADVVIIGAGICGSLLAHKLVRNGLSVLLLDAGPRRDRSQIVENWRNMPPDNKSQYDYATPYPSVPWAPHTNYFPD
NNYLIVKGPDRTAYKQGIIKGVGGTTWHWAASSWRYLPNDFKLHSTYGVGRDYAMSYDELEPYYYEAECEMGVMGPNGEE
ITPSAPRQNPWPMTSMPYGYGDRTFTEIVSKLGFSNTPVPQARNSRPYDGRPQCCGNNNCMPICPIGAMYNGVYAAIKAE
KLGAKIIPNAVVYAMETDAKNRITAISFYDPDKQSHRVVAKTFVIAANGIETPKLLLLAANDRNPHGIANSSDLVGRNMM
DHPGIGMSFQSAEPIWAGGGSVQMSSITNFRDGDFRSEYAATQIGYNNTAQNSRAGMKALSMGLVGKKLDEEIRRRTAHG
VDIYANHEVLPDPNNRLVLSKDYKDALGIPHPEVTYDVGEYVRKSAAISRQRLMDIAKAMGGTEIEMTPYFTPNQHITGG
TIMGHDPRDSVVDKWLRTHDHSNLFLATGATMAASGTVNSTLTMAALSLRAADAILNDLK

The query sequence (length=540) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8jej:A 540 540 0.9981 0.9981 0.9981 0.0 8jek:A, 8k6j:A, 8k6k:A, 7w2j:A, 7w2j:D, 7wsq:A, 7wsq:D, 8xcm:A, 8xcn:A
2 8grj:B 531 525 0.5019 0.5104 0.5162 0.0 6a2u:B, 6a2u:D, 8grj:D, 8hdd:A
3 4mif:B 581 161 0.0778 0.0723 0.2609 1.10e-07 4mif:A, 4mif:C, 4mif:D, 4mig:A, 4mig:B, 4mig:C, 4mig:D, 4mih:A, 4mih:B, 4mih:C, 4mih:D, 4mih:E, 4mih:F, 4mih:G, 4mih:H
4 8b7s:A 458 271 0.1352 0.1594 0.2694 2.97e-07
5 8b7s:A 458 32 0.0296 0.0349 0.5000 1.8
6 7qf8:A 494 270 0.1130 0.1235 0.2259 4.70e-05
7 7qfd:A 458 130 0.0630 0.0742 0.2615 1.23e-04 7qva:A
8 4mjw:A 532 88 0.0556 0.0564 0.3409 7.89e-04 2jbv:A, 2jbv:B, 3ljp:A, 3ljp:B, 4mjw:B, 3nne:A, 3nne:B, 3nne:C, 3nne:D, 3nne:E, 3nne:F, 3nne:G, 3nne:H
9 8orh:A 649 35 0.0370 0.0308 0.5714 0.002 8orh:B, 8ors:A, 8ors:B, 7yx3:A, 7yx3:B, 4z24:A, 4z24:B, 4z25:A, 4z25:B, 4z25:C, 4z25:D, 4z25:E, 4z25:F, 4z25:G, 4z25:H, 4z25:I, 4z25:J, 4z25:K, 4z25:L, 4z26:A, 4z26:B, 4z26:C, 4z26:D, 4z26:E, 4z26:F, 4z26:G, 4z26:H
10 3atq:A 452 37 0.0333 0.0398 0.4865 0.004 3atr:A, 4opc:A, 4opd:A, 4opd:B, 4opg:A, 4opi:A, 4opl:A, 4opt:A, 4opu:A
11 3q9t:A 577 337 0.1463 0.1369 0.2344 0.008 3q9t:B, 3q9t:C, 5zu2:A, 5zu2:B, 5zu2:C, 5zu3:A, 5zu3:B, 5zu3:C
12 8qve:A 495 126 0.0593 0.0646 0.2540 0.008
13 8qve:A 495 229 0.1037 0.1131 0.2445 0.14
14 5hxw:A 433 33 0.0315 0.0393 0.5152 0.009 5hxw:B, 5hxw:C, 5hxw:D, 5hxw:E, 5hxw:F
15 5i39:A 383 33 0.0315 0.0444 0.5152 0.010
16 7yx4:A 650 37 0.0352 0.0292 0.5135 0.012 7ptv:A, 7ptv:B, 7yx4:B, 7yx5:A
17 3he3:A 366 38 0.0296 0.0437 0.4211 0.021 3hdq:A, 3hdq:B, 3hdq:C, 3hdq:D, 3hdq:E, 3hdq:F, 3hdq:G, 3hdq:H, 3hdq:I, 3hdq:J, 3hdy:A, 3hdy:B, 3hdy:C, 3hdy:D, 3hdy:E, 3hdy:F, 3hdy:G, 3hdy:H, 3hdy:I, 3hdy:J, 3he3:B, 3he3:C, 3he3:D, 3he3:E, 3he3:F, 3he3:G, 3he3:H, 3he3:I, 3he3:J, 3mj4:A, 3mj4:B, 3mj4:C, 3mj4:D, 3mj4:E, 3mj4:F, 3mj4:G, 3mj4:H, 3mj4:I, 3mj4:J
18 6bza:C 501 31 0.0296 0.0319 0.5161 0.030 6bza:A, 6bza:B, 6bzn:D, 6bzq:A, 6bzq:B, 6bzq:C, 6bzq:D, 6bzt:A, 6bzt:B, 6bzt:C, 6bzt:D, 6bzz:A, 6bzz:B, 6bzz:C, 6bzz:D
19 7v0b:A 539 31 0.0259 0.0260 0.4516 0.063 7v0b:B, 7v0b:C, 7v0b:D
20 3bg6:A 577 169 0.0722 0.0676 0.2308 0.082 3bg6:B, 3bg6:C, 3bg6:D, 3bg6:E, 3bg6:F, 3bg6:G, 3bg6:H, 3bg7:A, 3bg7:B, 3bg7:C, 3bg7:D, 3bg7:E, 3bg7:F, 3bg7:G, 3bg7:H, 3bly:A, 2f5v:A, 2f6c:A, 3fdy:A, 2igk:A, 2igk:B, 2igk:C, 2igk:D, 2igk:E, 2igk:F, 2igk:G, 2igk:H, 2igm:A, 2igm:B, 2igm:D, 2igm:C, 2igm:E, 2igm:F, 2igm:G, 2igm:H, 2ign:A, 2ign:B, 2ign:D, 2ign:C, 2ign:E, 2ign:F, 2ign:H, 2ign:G, 2igo:A, 2igo:B, 2igo:D, 2igo:C, 2igo:E, 2igo:F, 2igo:H, 2igo:G, 3k4b:A, 3k4c:A, 3k4c:B, 3k4c:C, 3k4c:D, 3k4j:A, 3k4k:A, 3k4l:A, 3k4l:B, 3k4m:A, 3k4m:B, 3k4m:C, 3k4m:D, 3k4m:E, 3k4m:F, 3k4m:G, 3k4m:H, 3k4n:A, 3k4n:B, 3lsh:A, 3lsh:B, 3lsh:C, 3lsh:D, 3lsi:A, 3lsi:B, 3lsk:A, 3lsk:B, 3lsk:C, 3lsk:D, 3lsm:A, 3lsm:B, 4moe:A, 4moe:B, 4moe:C, 4moe:D, 4mof:A, 4mog:A, 4moh:A, 4moi:A, 4moi:B, 4moj:A, 4moj:B, 4moj:C, 4moj:D, 4mok:A, 4mok:B, 4mok:C, 4mok:D, 4mol:A, 4mol:B, 4mol:C, 4mol:D, 4mom:A, 4mom:B, 4mom:C, 4mom:D, 4moo:A, 4mop:A, 4mop:B, 4mop:C, 4mop:D, 4moq:A, 4moq:B, 4mor:A, 4mor:B, 4mor:C, 4mor:D, 4mos:A, 3pl8:A, 1tt0:A, 1tt0:B, 1tt0:C, 1tt0:D, 1tzl:A, 1tzl:B, 1tzl:C, 1tzl:D, 1tzl:E, 1tzl:F, 1tzl:G, 1tzl:H
21 3bg6:A 577 135 0.0630 0.0589 0.2519 0.11 3bg6:B, 3bg6:C, 3bg6:D, 3bg6:E, 3bg6:F, 3bg6:G, 3bg6:H, 3bg7:A, 3bg7:B, 3bg7:C, 3bg7:D, 3bg7:E, 3bg7:F, 3bg7:G, 3bg7:H, 3bly:A, 2f5v:A, 2f6c:A, 3fdy:A, 2igk:A, 2igk:B, 2igk:C, 2igk:D, 2igk:E, 2igk:F, 2igk:G, 2igk:H, 2igm:A, 2igm:B, 2igm:D, 2igm:C, 2igm:E, 2igm:F, 2igm:G, 2igm:H, 2ign:A, 2ign:B, 2ign:D, 2ign:C, 2ign:E, 2ign:F, 2ign:H, 2ign:G, 2igo:A, 2igo:B, 2igo:D, 2igo:C, 2igo:E, 2igo:F, 2igo:H, 2igo:G, 3k4b:A, 3k4c:A, 3k4c:B, 3k4c:C, 3k4c:D, 3k4j:A, 3k4k:A, 3k4l:A, 3k4l:B, 3k4m:A, 3k4m:B, 3k4m:C, 3k4m:D, 3k4m:E, 3k4m:F, 3k4m:G, 3k4m:H, 3k4n:A, 3k4n:B, 3lsh:A, 3lsh:B, 3lsh:C, 3lsh:D, 3lsi:A, 3lsi:B, 3lsk:A, 3lsk:B, 3lsk:C, 3lsk:D, 3lsm:A, 3lsm:B, 4moe:A, 4moe:B, 4moe:C, 4moe:D, 4mof:A, 4mog:A, 4moh:A, 4moi:A, 4moi:B, 4moj:A, 4moj:B, 4moj:C, 4moj:D, 4mok:A, 4mok:B, 4mok:C, 4mok:D, 4mol:A, 4mol:B, 4mol:C, 4mol:D, 4mom:A, 4mom:B, 4mom:C, 4mom:D, 4moo:A, 4mop:A, 4mop:B, 4mop:C, 4mop:D, 4moq:A, 4moq:B, 4mor:A, 4mor:B, 4mor:C, 4mor:D, 4mos:A, 3pl8:A, 1tt0:A, 1tt0:B, 1tt0:C, 1tt0:D, 1tzl:A, 1tzl:B, 1tzl:C, 1tzl:D, 1tzl:E, 1tzl:F, 1tzl:G, 1tzl:H
22 4udq:A 525 344 0.1481 0.1524 0.2326 0.098 6f97:A, 6f97:B, 4udp:A, 4udp:B, 4udq:B, 4udr:A, 4udr:B
23 4udq:A 525 63 0.0389 0.0400 0.3333 8.1 6f97:A, 6f97:B, 4udp:A, 4udp:B, 4udq:B, 4udr:A, 4udr:B
24 4i58:A 451 33 0.0333 0.0399 0.5455 0.13 4i58:B, 4i58:C, 4i58:D, 4i59:A, 4i59:B, 4i59:C, 4i59:D
25 1c0i:A 363 167 0.0704 0.1047 0.2275 0.15 1c0k:A, 1c0l:A, 1c0p:A
26 3rha:A 459 41 0.0370 0.0436 0.4878 0.22 3rha:B
27 4jn9:A 299 74 0.0463 0.0836 0.3378 0.40 4jn9:B, 4jna:A, 4jna:B, 4nte:A, 4nte:B
28 5fn0:A 455 32 0.0296 0.0352 0.5000 0.42 5fn0:B, 5fn0:C, 5fn0:D, 6fox:A, 6fox:B, 6foy:A, 6foy:B, 6foz:A, 6foz:B, 6fp0:A, 6fp0:B, 6fp1:A, 6fp1:B, 6fph:A, 6fph:B, 5mzc:A, 5mzc:B, 5mzi:A, 5mzi:B, 5mzk:A, 5mzk:B, 5n7t:A, 5n7t:B, 5na5:A, 5na5:B, 5nab:A, 5nab:B, 5nae:A, 5nae:B, 5nag:A, 5nag:B, 5nah:A, 5nah:B, 5nak:A, 5nak:B, 5x6p:A, 5x6p:B, 5x6q:A, 5y66:A, 5y77:A, 5y77:B, 5y7a:A
29 2z5x:A 513 36 0.0352 0.0370 0.5278 0.47 2bxr:A, 2bxr:B, 2bxs:A, 2bxs:B, 2z5y:A
30 7yj0:D 622 33 0.0296 0.0257 0.4848 0.54 7yj0:A, 7yj0:B, 7yj0:C
31 7dve:A 498 132 0.0630 0.0683 0.2576 0.71
32 7vwp:B 491 33 0.0278 0.0305 0.4545 0.77 7vwp:D, 7vwp:A, 7vwp:C
33 1pj6:A 828 32 0.0315 0.0205 0.5312 0.92 3gsi:A, 1pj5:A, 1pj7:A
34 3fbs:B 295 39 0.0315 0.0576 0.4359 0.92 3fbs:A
35 4aos:A 523 80 0.0389 0.0402 0.2625 1.0 4aox:A, 4ap1:A, 4ap3:A
36 6j0z:C 488 34 0.0296 0.0328 0.4706 1.1
37 4c5o:D 333 32 0.0296 0.0480 0.5000 1.2 4a9w:A, 4a9w:B, 4c5o:A, 4c5o:B, 4c5o:C, 4c5o:E, 4c5o:F, 4c5o:G, 4c5o:H
38 2vvm:A 481 36 0.0296 0.0333 0.4444 1.2 2vvl:A, 2vvl:B, 2vvl:C, 2vvl:D, 2vvl:E, 2vvl:F, 2vvl:G, 2vvl:H, 2vvm:B, 3zdn:A, 3zdn:B, 3zdn:C, 3zdn:D
39 5bva:A 398 29 0.0278 0.0377 0.5172 1.6 5bul:A
40 2yg3:B 450 40 0.0352 0.0422 0.4750 1.6 2yg3:A, 2yg4:A, 2yg4:B, 2yg5:A, 2yg6:A, 2yg6:B, 2yg7:A, 2yg7:B
41 2cvj:A 180 47 0.0352 0.1056 0.4043 1.8 2ywl:A, 2ywl:B
42 2gb0:B 389 30 0.0222 0.0308 0.4000 1.9 2a89:A, 2a89:B, 3bhf:A, 3bhf:B, 3bhk:A, 3bhk:B, 1el5:A, 1el5:B, 1el7:A, 1el7:B, 1el8:A, 1el8:B, 1el9:A, 1el9:B, 1eli:A, 1eli:B, 2gb0:A, 2gf3:A, 2gf3:B, 1l9c:A, 1l9c:B, 1l9d:A, 1l9d:B, 1l9e:A, 1l9e:B, 3m0o:A, 3m0o:B, 3m12:A, 3m12:B, 3m13:A, 3m13:B, 3m13:C, 3m13:D, 3qse:A, 3qse:B, 3qsm:A, 3qsm:B, 3qss:A, 3qss:B
43 7u6l:D 436 33 0.0241 0.0298 0.3939 2.0 7e7h:A, 7e7h:B, 7u6l:A, 7u6l:B, 7u6l:C
44 3woj:A 698 53 0.0296 0.0229 0.3019 2.1 3woi:B, 3woj:B, 3wol:A, 3wol:B, 3wom:A, 3wom:B, 3won:A, 3won:B, 3woo:A, 3woo:B, 3wop:A, 3wop:B, 3woq:A, 3woq:B, 3wor:A, 3wor:B, 4y06:A, 4y06:B
45 6cr0:A 430 47 0.0296 0.0372 0.3404 2.3
46 2qa2:A 489 35 0.0259 0.0286 0.4000 2.3
47 7to3:A 568 37 0.0333 0.0317 0.4865 2.3 7to3:B, 7tqd:A, 7tsq:A, 7tsx:B, 7tsx:A
48 7tsq:B 208 37 0.0333 0.0865 0.4865 2.4
49 8i6i:A 448 34 0.0296 0.0357 0.4706 2.4 8i6i:C
50 6jdk:B 516 31 0.0241 0.0252 0.4194 2.6 6jdk:A
51 3t37:A 509 345 0.1407 0.1493 0.2203 2.8 4ha6:A
52 6y48:B 538 82 0.0426 0.0428 0.2805 2.9 6y48:A, 6y48:C, 6y48:D
53 4usr:A 357 32 0.0278 0.0420 0.4688 3.3
54 8p84:B 450 36 0.0315 0.0378 0.4722 3.4 8p84:A
55 7koe:C 438 34 0.0259 0.0320 0.4118 3.6 7koe:G
56 8gu0:B 450 32 0.0259 0.0311 0.4375 4.1 8gu0:A
57 6cz7:B 234 86 0.0463 0.1068 0.2907 4.1 6cz7:D, 6cz8:D, 6cz8:B, 6cz9:B, 6cz9:D, 6cza:B, 6cza:D
58 8k40:A 448 32 0.0259 0.0312 0.4375 4.2 8k40:B, 8k41:A
59 3ng7:X 427 47 0.0296 0.0375 0.3404 4.3 3k7m:X, 3k7q:X, 3k7t:A, 3k7t:B, 3ngc:X, 3nh3:X, 3nho:X, 3nk0:X, 3nk1:X, 3nk2:X, 3nn0:X, 3nn6:X
60 7cyx:A 363 29 0.0241 0.0358 0.4483 4.8 7cyx:B
61 6c6r:A 451 29 0.0241 0.0288 0.4483 5.0 6c6n:A, 6c6n:B, 6c6p:A, 6c6p:B, 6c6r:B
62 2wul:A 109 44 0.0352 0.1743 0.4318 5.4 2wul:B, 2wul:C, 2wul:D
63 4mo2:B 365 46 0.0222 0.0329 0.2609 5.5 4mo2:A
64 4j34:B 390 43 0.0315 0.0436 0.3953 5.8 4j2w:A, 4j2w:B, 4j31:A, 4j31:B, 4j33:A, 4j33:B, 4j34:A, 4j36:A, 4j36:B, 5x6r:A, 5x6r:B
65 7fgp:A 379 28 0.0204 0.0290 0.3929 5.9 7fgp:B
66 6fho:A 368 37 0.0296 0.0435 0.4324 6.2 6sw1:A, 6sw2:A, 2x3n:A
67 6lqc:A 450 34 0.0296 0.0356 0.4706 7.2 6lql:A
68 4bay:A 670 38 0.0296 0.0239 0.4211 7.4 3abt:A, 3abu:A, 8bop:A, 8box:A, 7cdc:A, 7cdd:A, 7cde:A, 7cdf:A, 7cdg:A, 4czz:A, 7e0g:A, 2ejr:A, 8f2z:A, 8f30:A, 8f59:A, 8f6s:A, 8fdv:A, 8fj4:A, 8fj6:A, 8fj7:A, 8fqj:A, 8fri:A, 8frq:A, 8frv:A, 8fsk:A, 9fwg:A, 5h6q:A, 5h6r:A, 2h94:A, 2hko:A, 8inl:A, 2iw5:A, 8jf5:A, 6k3e:A, 6kgk:A, 6kgl:A, 6kgm:A, 6kgn:A, 6kgo:A, 6kgp:A, 6kgq:A, 6kgr:A, 4kum:A, 5l3b:A, 5l3c:A, 5l3d:A, 5l3e:A, 5l3f:A, 5l3g:A, 5lbq:A, 5lgn:A, 5lgt:A, 5lgu:A, 5lhg:A, 5lhh:A, 5lhi:A, 6nqm:A, 6nqu:A, 6nr5:A, 8q1g:A, 8q1h:A, 8q1j:A, 6s35:A, 6te1:A, 6tuy:A, 4uv8:A, 4uv9:A, 4uva:A, 4uvb:A, 4uvc:A, 2uxn:A, 2uxx:A, 4uxn:A, 2v1d:A, 7vqs:A, 7vqt:A, 7vqu:A, 6vyp:k, 6vyp:m, 6vyp:M, 6vyp:K, 7w3l:A, 6w4k:A, 6wc6:A, 2x0l:A, 5x60:A, 2xaf:A, 2xag:A, 2xah:A, 2xaj:A, 2xaq:A, 2xas:A, 4xbf:A, 7xw8:A, 2y48:A, 5yjb:A, 8ym7:A, 2z3y:A, 2z5u:A, 3zms:A, 3zmt:A, 3zmu:A, 3zmv:A, 3zmz:A, 3zn0:A, 3zn1:A, 7zry:A
69 1zov:A 381 30 0.0204 0.0289 0.3667 7.5 1zov:B
70 8jqo:A 391 50 0.0296 0.0409 0.3200 7.8 8jqo:B, 8jqo:C, 8jqp:A, 8jqp:B, 8jqq:A, 8jqq:B
71 5j60:A 316 52 0.0315 0.0538 0.3269 8.0 5j60:D, 5j60:B, 5j60:C, 6xtf:A, 6xtf:B
72 2uzz:B 372 33 0.0241 0.0349 0.3939 8.1 2uzz:A, 2uzz:C, 2uzz:D
73 2dw4:A 634 38 0.0296 0.0252 0.4211 8.3
74 3g5s:A 424 33 0.0259 0.0330 0.4242 8.4 3g5q:A, 3g5r:A
75 8a56:B 539 30 0.0241 0.0241 0.4333 8.5 8a56:A
76 1kdg:B 546 262 0.0981 0.0971 0.2023 8.6 1kdg:A, 1naa:A, 1naa:B
77 6gqi:A 529 33 0.0296 0.0302 0.4848 8.7 6gqi:B, 5m0z:A, 5m10:A, 7v8o:A, 7v8o:B, 7v8r:A, 7v8s:A, 7v8s:B
78 4y4m:F 262 34 0.0259 0.0534 0.4118 9.0 4y4m:A, 4y4m:B, 4y4m:C, 4y4m:D, 4y4m:E, 4y4m:G, 4y4m:H
79 1o5w:C 512 36 0.0315 0.0332 0.4722 9.5 1o5w:A, 1o5w:B, 1o5w:D
80 3uoz:A 540 31 0.0241 0.0241 0.4194 9.6 3uov:A, 3uov:B, 3uox:A, 3uox:B, 3uoy:A, 3uoy:B, 3uoz:B, 3up4:A, 3up4:B, 3up5:A, 3up5:B
81 6xut:A 589 32 0.0204 0.0187 0.3438 10.0 6xuu:A, 6xuv:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218