BioLiP

>protein
NELSKQPTPDKAEDNAFFPSPYSLSQYTAPKTDFDGVEHKGAYKDGKWKVLMIAAEERYVLLENGKMFSTGNHPVEMLLP
LHHLMEAGFDVDVATLSGYPVKLELWAMPTEDEAVISTYNKLKEKLKQPKKLADVIKNELGPDSDYLSVFIPGGHAAVVG
ISESEDVQQTLDWALDNDRFIVTLCHGPAALLSAGLNREKSPLEGYSVCVFPDSLDEGANIEIGYLPGRLKWLVADLLTK
QGLKVVNDDMTGRTLKDRKLLTGDSPLASNELGKLAVNEMLNAIQNKLEHHHHHH

The query sequence (length=295) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5xr2:C	295	295	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	5xr3:E
2	1ons:A	278	280	0.5356	0.5683	0.5643	7.13e-114
3	3bwe:A	188	128	0.1186	0.1862	0.2734	7.99e-05	6af5:A, 6af9:A, 6afa:A, 6afb:A, 6afc:A, 6afd:A, 6afe:A, 6aff:A, 6afg:A, 6afh:A, 6afi:A, 6afj:A, 6afl:A, 3bwe:C, 3bwe:D, 3bwe:E, 3bwe:F, 4mnt:A, 4n0m:A, 4p35:A, 4p36:A, 7pa2:AAA, 7pa3:AAA, 8ppw:A, 8pq0:A
4	6f2f:A	166	144	0.1119	0.1988	0.2292	0.017	6f2f:B, 6f2f:C, 6f2h:A, 6f2h:B, 6f2h:E, 6f2h:F, 6f2h:G, 6f2h:I, 6f2h:J, 6f2h:K, 6f2h:L, 6hf6:A, 6hf6:B, 6hf6:C
5	2q3r:A	351	69	0.0644	0.0541	0.2754	1.0	1vji:A
6	3tr6:A	222	93	0.0780	0.1036	0.2473	2.3
7	2vrn:A	185	55	0.0508	0.0811	0.2727	4.4
8	6k2j:B	83	14	0.0339	0.1205	0.7143	8.2	6k2j:C, 6k2j:A
9	2imw:P	348	56	0.0508	0.0431	0.2679	8.7	2ago:A, 2agp:A, 2agp:B, 2agq:A, 2asd:A, 2asd:B, 2asj:A, 2asj:B, 2asl:A, 2asl:B, 2atl:A, 2atl:B, 2au0:A, 2au0:B, 2bq3:A, 2bqr:A, 2bqu:A, 2br0:A, 2c22:A, 2c28:A, 2c2d:A, 2c2e:A, 2c2r:A, 5edw:A, 4fbt:A, 4fbu:A, 4fbu:B, 4g3i:A, 4g3i:B, 4gc6:A, 4gc7:A, 4gc7:B, 3gii:A, 3gij:A, 3gij:B, 3gik:A, 3gil:A, 3gil:B, 3gim:A, 2ia6:A, 2ia6:B, 2ibk:A, 2j6s:A, 2j6t:A, 2j6u:A, 2jef:A, 2jeg:A, 2jei:A, 2jej:A, 4juz:A, 4jv0:A, 4jv1:A, 4jv2:A, 1jx4:A, 1jxl:A, 3khg:A, 3khg:B, 3khh:A, 3khh:B, 3khl:A, 3khl:B, 3khr:A, 3khr:B, 7kle:A, 7klf:A, 6l84:A, 6l97:A, 6l97:B, 3m9m:B, 3m9n:B, 3m9o:B, 1n48:A, 1n56:A, 1n56:B, 3pr4:A, 3pr5:B, 3pvx:A, 3pw0:A, 3pw2:A, 3pw4:A, 3pw5:A, 3pw7:A, 3pw7:E, 4qw8:A, 4qw9:A, 4qwa:A, 4qwb:A, 4qwc:A, 4qwc:D, 4qwd:A, 4qwe:A, 3qz7:A, 3qz8:A, 2r8g:A, 2r8h:A, 2r8i:A, 3raq:A, 3raq:B, 3rax:A, 3rax:B, 3rb0:A, 3rb0:B, 3rb3:A, 3rb4:A, 3rb4:B, 3rb6:A, 3rb6:B, 3rbd:A, 3rbd:B, 3rbe:A, 3rbe:B, 2rdj:A, 2rdj:B, 4rua:A, 4ruc:A, 1ryr:A, 1rys:A, 1rys:B, 4rzr:A, 4rzr:D, 1s0m:A, 1s0m:B, 1s0n:A, 1s0o:A, 1s0o:B, 1s10:A, 1s97:A, 1s97:B, 1s97:C, 1s97:D, 1s9f:A, 1s9f:B, 1s9f:C, 1s9f:D, 3t5h:A, 3t5j:A, 3t5k:A, 3t5l:A, 4tqr:A, 4tqs:B, 4tqs:A, 2uvr:A, 2uvu:A, 2uvv:A, 2uvw:A, 2v4q:A, 2v4r:A, 3v6h:B, 3v6h:A, 3v6j:A, 3v6j:J, 3v6k:A, 3v6k:J, 2v9w:A, 2v9w:B, 2va2:A, 2va2:B, 2va3:A, 6vg6:A, 6vg6:D, 6vgm:D, 6vgm:A, 6vkp:A, 6vkp:D, 6vnp:A, 6vnp:D, 6vnp:G, 6vnp:J, 2w8k:A, 2w8l:A, 2w9a:A, 2w9b:A, 2w9b:B, 2w9c:A, 2w9c:B, 2xc9:A, 2xca:A, 2xcp:B, 2xcp:A

[Back]