BioLiP

>protein
NDIDLIKRLGPSAMDQIMLYLAFSAMRTSGHRHGAFLDAAATAAKCAIYMTYLEQGQNLRMTGHLHHLEPKRVKIIVEEV
RQALMEGKLLKTLGSQEPRYLIQFPYVWMEQYPWIPGRSRIPGTSLTSEEKRQIEHKLPSNLPDAQLVTSFEFLELIEFL
HKRSQEDLPPEHRMELSEALAEHIKRRLLYSGTVTRIDSPWGMPFYALTRPFYQERTYIMVEDTARYFRMMKDWAEKRPN
AMRALEELDVPPERWDEAMQELDEIIRTWADKYHQVIPMILQMVFGRK

The query sequence (length=288) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4yrv:A	288	288	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	4hri:B, 4hri:A, 4ynl:B, 4ynl:A, 4ynl:N, 4ynl:M
2	4j00:A	297	295	0.8958	0.8687	0.8746	0.0	4izz:A, 4izz:B, 4j00:B, 4j01:A, 4j01:B, 4j01:E, 4j01:F, 4yrv:B
3	7d21:A	328	59	0.0556	0.0488	0.2712	1.2	7d1h:A, 7d1n:A, 7d1y:A, 7d2d:A, 7d2i:A, 7d2j:A, 4mhn:A, 4mhy:A, 4mhz:A
4	8ak3:A	294	73	0.0729	0.0714	0.2877	1.7
5	8wus:E	453	77	0.0729	0.0464	0.2727	7.1	6b1q:A, 6b1r:A, 6b1s:A, 6b1s:B, 8cs0:A, 1d0e:A, 1d1u:A, 8dw1:A, 8dw8:A, 8dwm:A, 2fjv:A, 2fjw:A, 2fjx:A, 3fsi:A, 2fvp:A, 2fvq:A, 2fvr:A, 2fvs:A, 4hkq:A, 1i6j:A, 4m94:A, 4m95:A, 6mig:A, 6mih:A, 6mik:A, 1n4l:A, 1qai:A, 1qai:B, 1qaj:A, 2r2r:A, 2r2s:A, 2r2t:A, 2r2u:A, 7uyn:A, 7uyo:A, 7uyp:A, 5vbs:A, 8wut:E, 8wuv:E, 4xo0:A, 4xpc:A, 4xpe:A, 8ygj:E, 1ztt:A, 1ztw:A
6	8k7v:B	755	86	0.0729	0.0278	0.2442	7.1	8k7v:A, 8k7v:C, 8k7v:D
7	8ap6:E	383	74	0.0729	0.0548	0.2838	7.5	8ap6:e, 8ap7:E, 8ap7:e, 8apa:e, 8apb:e, 8apc:e, 8apd:e, 8ape:e, 8apf:e, 8apg:e, 8aph:e, 8apj:e, 8apk:e
8	8hzv:A	479	41	0.0521	0.0313	0.3659	9.6	8hzv:B, 8hzv:C, 8hzv:D, 8hzy:A, 8hzy:B
9	5ini:F	511	32	0.0382	0.0215	0.3438	9.7	5inf:B, 5inf:F, 5ini:A, 5ini:D, 5ini:B, 5ini:C, 5ini:E

[Back]