Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
NATNVKAMKYLIEHYFDNFKVDSIEIIGSGYDSVAYLVNNEYIFKTKFSTKKGYAKEKAIYNFLNTNLETNVKIPNIEYS
YISDELSILGYKEIKGTFLTPEIYSTMSEEEQNLLKRDIASFLRQMHGLDYTDISECTIDNKQNVLEEYILLRETIYNDL
TDIEKDYIESFMERLNATTVFEGKKCLCHNDFSCNHLLLDGNNRLTGIIDFGDSGIIDEYCDFIYLLEDSEEEIGTNFGE
DILRMYGNIDIEKAKEYQDIVEEYYPIETIVYGIKNIKQEFIENGRKEIYKRTYKD

The query sequence (length=296) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5iqc:A 301 298 1.0000 0.9834 0.9933 0.0 5byl:A, 5byl:B, 5byl:C, 5byl:D, 6c5u:A, 6c5u:B, 6c5u:C, 6c5u:D, 6cav:A, 6cav:B, 6cav:C, 6cav:D, 6cey:A, 6cey:B, 6cey:C, 6cey:D, 6cgd:A, 6cgd:B, 6cgd:C, 6cgd:D, 6cgg:A, 6cgg:B, 6cgg:C, 6cgg:D, 6ch4:A, 6ch4:B, 6ch4:C, 6ch4:D, 5iqa:A, 5iqa:B, 5iqa:C, 5iqa:D, 5iqb:A, 5iqb:B, 5iqb:C, 5iqb:D, 5iqc:B, 5iqc:C, 5iqc:D, 5iqd:A, 5iqd:B, 5iqd:C, 5iqd:D, 5iqe:A, 5iqe:B, 5iqe:C, 5iqe:D, 5iqf:A, 5iqf:B, 5iqf:C, 5iqf:D, 5iqg:A, 5iqg:B, 5iqg:C, 5iqg:D, 5iqh:A, 5iqh:B, 5iqh:C, 5iqh:D, 5iqi:A, 5iqi:B, 5iqi:C, 5iqi:D, 4ork:A, 4ork:B, 4ork:C, 4ork:D
2 3ham:A 299 288 0.3108 0.3077 0.3194 1.84e-35 4dca:A, 3ham:B, 3hav:A, 3hav:B, 3hav:C, 3uzr:A
3 4dfb:B 301 284 0.2905 0.2857 0.3028 3.10e-31 5c4k:A, 5c4l:A, 5c4l:B, 6cd7:B, 4dfb:A, 4dfu:A, 4dfu:B, 4dt8:A, 4dt8:B, 4dt9:A, 4dt9:B, 4dta:A, 4dta:B, 4dtb:A, 4dtb:B, 4n57:A, 4n57:B, 3sg8:A, 3sg8:B, 3sg9:A, 3sg9:B
4 3tdw:A 302 289 0.2331 0.2285 0.2388 6.68e-20 6ctz:A, 3tdv:A, 3tdv:B
5 1nd4:A 255 134 0.1115 0.1294 0.2463 1.61e-04 1nd4:B
6 4gki:A 272 157 0.1250 0.1360 0.2357 5.20e-04 4ej7:A, 4ej7:B, 4ej7:C, 4feu:A, 4feu:B, 4feu:C, 4feu:D, 4feu:E, 4feu:F, 4fev:A, 4fev:B, 4fev:C, 4fev:D, 4fev:E, 4fev:F, 4few:A, 4few:B, 4few:C, 4few:D, 4few:E, 4few:F, 4fex:A, 4fex:B, 4fex:C, 4fex:D, 4fex:E, 4gkh:A, 4gkh:B, 4gkh:C, 4gkh:D, 4gkh:E, 4gkh:F, 4gkh:G, 4gkh:H, 4gkh:I, 4gkh:J, 4gkh:K, 4gkh:L, 4gki:B, 4gki:C, 4gki:D, 4gki:E, 4gki:F, 4gki:G, 4gki:H, 4gki:I, 4gki:J, 4gki:K, 4gki:L
7 5uxa:A 301 55 0.0541 0.0532 0.2909 0.002 5igv:A, 5igw:A, 5igy:A, 5igz:A, 5ih0:A, 5ih1:A, 5iwu:A
8 3csv:A 322 114 0.1115 0.1025 0.2895 0.014
9 5igi:A 300 109 0.0642 0.0633 0.1743 0.025 5igj:A, 5igp:A, 5igr:A, 5igs:A, 5igt:A
10 7s3l:A 254 156 0.1351 0.1575 0.2564 0.029
11 6fux:A 267 84 0.0777 0.0861 0.2738 0.037
12 7xfz:H 234 183 0.1318 0.1667 0.2131 0.044 7xg0:H, 7xg2:H, 7xg3:H, 7xg4:H
13 6td3:B 333 53 0.0574 0.0511 0.3208 0.26 5acb:C, 5acb:D, 6b3e:A, 6b3e:C, 8bu1:B, 8bu1:E, 8bu1:H, 8bu2:B, 8bu2:E, 8bu2:H, 8bu3:B, 8bu3:E, 8bu3:H, 8bu4:B, 8bu4:E, 8bu4:H, 8bu5:B, 8bu5:E, 8bu5:H, 8bu6:H, 8bu6:E, 8bu6:B, 8bu7:B, 8bu7:E, 8bu7:H, 8bu9:B, 8bu9:E, 8bu9:H, 8bua:B, 8bua:E, 8bua:H, 8bub:B, 8bub:E, 8bub:H, 8buc:B, 8buc:E, 8buc:H, 8bud:B, 8bud:E, 8bud:H, 8bue:B, 8bue:E, 8bue:H, 8buf:B, 8buf:E, 8buf:H, 8bug:B, 8bug:E, 8bug:H, 8buh:B, 8buh:E, 8buh:H, 8bui:B, 8bui:E, 8bui:H, 8buj:B, 8buj:E, 8buj:H, 8buk:B, 8buk:E, 8buk:H, 8bul:B, 8bul:E, 8bul:H, 8bum:B, 8bum:E, 8bum:H, 8bun:B, 8bun:E, 8bun:H, 8buo:B, 8buo:E, 8buo:H, 8bup:B, 8bup:E, 8bup:H, 8buq:B, 8buq:E, 8buq:H, 8bur:E, 8bur:B, 8bur:H, 8bus:E, 8bus:B, 8bus:H, 8but:B, 8but:E, 8but:H, 6ckx:A, 6ckx:C, 4cxa:A, 4nst:A, 4nst:C, 7nxk:A, 7nxk:C, 8p81:A, 6td3:E, 6td3:H
14 3lft:A 295 82 0.0608 0.0610 0.2195 0.44 3lft:B
15 2b0q:A 263 176 0.1351 0.1521 0.2273 0.47 2bkk:A, 2bkk:C, 1j7l:A, 1j7l:B, 1j7u:A, 1j7u:B, 1l8t:A, 3q2j:A, 3q2j:B, 3tm0:A
16 7sxf:A 340 78 0.0642 0.0559 0.2436 0.48 7sxg:A
17 5efq:C 326 63 0.0709 0.0644 0.3333 0.75 5efq:A, 7nxj:A, 7nxj:C
18 7nz2:D2 431 180 0.1385 0.0951 0.2278 0.87 7nyw:C, 7nyx:C, 7nyz:C, 7nz0:C, 7nz2:D1, 7nz2:C1, 7nz2:C2, 7nz3:C1, 7nz3:C2
19 2pml:X 340 40 0.0473 0.0412 0.3500 1.0 2pmn:X, 2pmo:X
20 5u9c:A 288 75 0.0676 0.0694 0.2667 1.4 5u9c:C
21 1j1b:B 364 48 0.0439 0.0357 0.2708 2.0 4acc:A, 4acc:B, 4acd:A, 4acd:B, 4acg:A, 4acg:B, 4ach:A, 4ach:B, 6ae3:A, 6ae3:B, 4afj:A, 4afj:B, 8auz:A, 8auz:B, 8av1:A, 8av1:B, 7b6f:A, 4b7t:A, 6b8j:A, 8djc:A, 8djc:B, 8djd:A, 8djd:B, 8dje:A, 8dje:B, 3du8:A, 3du8:B, 3f7z:A, 3f7z:B, 3f88:A, 3f88:B, 5f94:A, 5f94:B, 5f95:A, 5f95:B, 8ff8:A, 8ff8:B, 3gb2:A, 6gjo:A, 6gjo:B, 1gng:A, 1gng:B, 6gn1:B, 6gn1:A, 6h0u:A, 6h0u:B, 6hk3:A, 6hk3:B, 6hk4:A, 6hk4:B, 6hk7:A, 5hln:A, 5hln:B, 5hlp:A, 5hlp:B, 1i09:B, 3i4b:A, 3i4b:B, 4iq6:B, 1j1b:A, 1j1c:A, 1j1c:B, 4j1r:A, 4j1r:B, 4j1r:C, 4j1r:D, 4j71:A, 4j71:B, 2jld:A, 2jld:B, 5k5n:A, 5k5n:B, 5kpk:A, 5kpk:B, 5kpl:A, 5kpl:B, 5kpm:A, 5kpm:B, 3l1s:B, 3m1s:A, 3m1s:B, 4nm0:A, 4nm3:A, 4nm5:A, 4nm7:A, 4nu1:A, 2o5k:A, 1o9u:A, 2ow3:A, 2ow3:B, 5oy4:A, 5oy4:B, 7oy5:A, 7oy5:B, 4ptc:A, 4ptc:B, 4pte:A, 4pte:B, 4ptg:A, 4ptg:B, 3pup:A, 3pup:B, 1pyx:A, 1pyx:B, 1q3d:A, 1q3d:B, 1q3w:A, 1q3w:B, 3q3b:A, 3q3b:B, 1q41:A, 1q41:B, 1q4l:A, 1q4l:B, 1q5k:A, 1q5k:B, 8qji:A, 1r0e:A, 1r0e:B, 3say:A, 3say:B, 3sd0:A, 3sd0:B, 7sxh:A, 7sxj:A, 5t31:A, 5t31:B, 6tcu:A, 7u2z:A, 7u2z:B, 7u31:A, 7u31:B, 7u33:A, 7u33:B, 7u36:A, 7u36:B, 1uv5:A, 6v6l:A, 8vme:A, 8vmf:A, 8vmg:A, 8xn6:A, 8xn6:B, 6y9r:A, 6y9s:A, 6y9s:B, 7z1f:A, 7z1f:B, 7z1g:A, 3zdi:A, 3zrk:A, 3zrk:B, 3zrl:A, 3zrl:B, 3zrm:A, 3zrm:B
22 7w15:A 294 36 0.0372 0.0374 0.3056 2.0 7w15:B, 7w19:A, 7w19:B, 7w1a:B, 7w1a:A
23 6xxy:A 358 41 0.0608 0.0503 0.4390 2.0 6xxy:B
24 1i09:A 338 48 0.0439 0.0385 0.2708 2.1 4dit:A, 4iq6:A, 3l1s:A
25 5ltx:A 243 73 0.0642 0.0782 0.2603 2.6 5ltx:B, 5t65:A, 5t65:B, 5t7m:A, 5t7m:B
26 5z7w:B 271 56 0.0507 0.0554 0.2679 3.9 5z7w:A
27 2o36:A 654 25 0.0270 0.0122 0.3200 4.6 1s4b:P
28 5gan:B 1781 93 0.0777 0.0129 0.2473 5.0 4bgd:A, 5gao:B, 5gap:B, 5nrl:B, 5zwm:D, 5zwo:D
29 8atu:A 2837 88 0.0743 0.0078 0.2500 5.7 8atu:B, 8atx:A, 8atx:B, 8auk:A, 8auk:B, 8auw:B
30 8auw:A 2900 80 0.0608 0.0062 0.2250 6.1
31 3gc0:A 278 53 0.0574 0.0612 0.3208 6.2
32 4xwl:A 634 51 0.0574 0.0268 0.3333 6.9 4xwm:A, 4xwn:A
33 3c1m:C 468 139 0.1351 0.0855 0.2878 7.4 3c1m:A, 3c1m:B, 3c1m:D, 3c1n:A, 3c1n:B, 3c1n:C, 3c1n:D, 3c20:A, 3c20:B, 2hmf:A, 2hmf:B, 2hmf:C, 2hmf:D
34 5aj4:B1 244 44 0.0439 0.0533 0.2955 8.0 4ce4:1, 6gaw:B1, 6gb2:B1, 7nqh:B1, 7nql:B1, 7nsh:B1, 7nsi:B1, 7nsj:B1, 8oin:BE, 8oiq:BE, 4v19:1, 6ydp:B1, 6ydw:B1
35 5v96:A 467 33 0.0439 0.0278 0.3939 8.7 5v96:B, 5v96:C, 5v96:D
36 5lv0:A 666 25 0.0338 0.0150 0.4000 9.1 4fxy:P, 4fxy:Q, 1i1i:P, 5luz:A, 5luz:B, 5lv0:B, 2o3e:A, 8vju:A, 8vjv:A, 8vjw:A, 8vjw:B, 8vjx:A, 8vjy:A, 8vjy:C

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218