BioLiP

>protein
NATFGMGDRVRKKSGAAWQGQIVGWYCTNLTPEGYAVESEAHPGSVHIYPVAALERIN

The query sequence (length=58) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6ny0:A	58	58	0.9655	0.9655	0.9655	3.35e-38	6nxz:A, 2p4t:A, 2rk1:A, 2rk2:A
2	7s5o:C	160	40	0.2241	0.0813	0.3250	0.66	7s5o:A, 7s5o:B
3	4mc5:C	497	34	0.2414	0.0282	0.4118	0.76	8gv7:A, 4k3x:B, 4k3x:D, 4k3x:F, 4mc5:A, 4mc5:B, 7wvg:A
4	6iig:A	495	34	0.2069	0.0242	0.3529	1.3	6cfg:B, 6ijt:A, 6in5:A, 6vmz:B, 6vmz:D, 6vmz:F, 5z88:A
5	6ntf:A	491	29	0.1897	0.0224	0.3793	1.3	5ajm:A, 4bgx:A, 4bgy:A, 4bh0:A, 4bh0:C, 4bh0:E, 4bh1:A, 4bh1:C, 4bh1:E, 4bh3:A, 4bh4:A, 6cf5:A, 6cf5:C, 6cf5:E, 6cfg:A, 4cqq:A, 4cqr:A, 4cqu:A, 4cqw:A, 4cqw:C, 4cqw:E, 4cqx:A, 4cqx:C, 4cqx:E, 4cqy:A, 4cqy:C, 4cqy:E, 4cqz:A, 5e2z:C, 5e2z:A, 5e2z:E, 5e30:C, 5e30:A, 5e30:E, 6e7h:C, 2fk0:Q, 1jsn:A, 1jso:A, 4k63:A, 4k63:C, 4k63:E, 4k63:G, 4k64:A, 4k64:C, 4k66:A, 4k66:C, 4k67:A, 4k67:C, 4k67:E, 4k67:G, 4kdn:A, 4kdn:C, 4kdo:C, 4kdo:A, 4n5z:A, 6p3s:U, 6p3s:H, 6vmz:A, 6vmz:C, 6vmz:E, 8zdw:H, 8zdw:C, 8zdw:A, 3znk:A, 3znk:C, 3znk:E, 3znl:A, 3znl:C, 3znl:E, 3znm:A, 3znm:C, 3znm:E, 3zp0:E, 3zp1:E, 3zp2:E, 3zp3:E, 3zp6:E, 3zpb:E
6	2wr1:B	490	29	0.1897	0.0224	0.3793	1.9	2wr1:C, 2wr2:B, 2wr2:C, 2wr3:A, 2wr4:A, 2wr7:A, 2wrb:A, 2wre:A, 2wre:B, 2wre:C, 2wrf:F, 2wrf:D
7	2rjb:A	418	24	0.1724	0.0239	0.4167	3.0	2rjb:B, 2rjb:C
8	2r1b:A	198	31	0.1897	0.0556	0.3548	6.5	2r1b:B
9	3poy:A	1005	31	0.1897	0.0109	0.3548	9.7	3asi:A, 3b3q:E, 3b3q:F, 3biw:E, 3biw:F, 3biw:G, 3bod:A, 2h0b:A, 2h0b:B, 2h0b:C, 2h0b:D, 2r16:A, 2r1d:H, 2r1d:B, 2r1d:D, 2r1d:I, 3vkf:C, 3vkf:D, 2wqz:C, 2wqz:D, 2xb6:C, 2xb6:D, 5z8y:B, 5z8y:D, 5z8y:F, 5z8y:H

[Back]