Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
NASKLANTNVMVVGGAGFVGSNLVKRLLELGVNQVHVVDNLLSAEKINVPDHPAVRFSETSITDDALLASLQDEYDYVFH
LATYHGNQSSIHDPLADHENNTLTTLKLYERLKHFKRLKKVVYSAAGEETDIVSLHNNDSPYSMSKIFGEFYSVYYHKQH
QLPTVRARFQNVYGPGEILGAGRWRGTPATVWRNVTPTFIYKALKGMPLPLENGGVATRDFIFVEDVANGLIACAADGTP
GGVYNIASGKETSIADLATKINEITGNNTELDRLPKRPWDNFGSPEKARRELGFSADVSIDDGLRKTIEWTKANLAVIEQ
IMRKHDSALATY

The query sequence (length=332) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2q1s:A 336 335 1.0000 0.9881 0.9910 0.0 2pzj:A, 2q1t:A, 2q1u:A, 2q1u:B
2 6pnl:A 336 330 0.3765 0.3720 0.3788 1.18e-61 6pmh:A
3 6dnt:A 310 319 0.2922 0.3129 0.3041 2.94e-33
4 4zrn:A 309 322 0.2892 0.3107 0.2981 5.83e-32 4zrm:A, 4zrm:B, 4zrn:B
5 6bwl:A 313 324 0.3012 0.3195 0.3086 6.32e-31
6 6wj9:B 308 297 0.2861 0.3084 0.3199 1.08e-29 6wj9:A, 6wja:A, 6wja:B, 6wjb:A, 6wjb:B
7 6zll:A 321 324 0.2801 0.2897 0.2870 3.46e-27 6zl6:A, 6zl6:B, 6zla:A, 6zla:B, 6zla:C, 6zla:D, 6zld:A, 6zld:B, 6zlj:A, 6zlj:B, 6zlk:A, 6zlk:B, 6zlk:C, 6zlk:D, 6zll:B, 6zll:C, 6zll:D
8 4lk3:B 274 306 0.2651 0.3212 0.2876 7.87e-24 4lk3:A, 4lk3:C, 4lk3:D, 4lk3:E, 4lk3:F, 4m55:A, 4m55:B, 4m55:C, 4m55:D
9 1bxk:B 344 351 0.3042 0.2936 0.2877 1.07e-23 1bxk:A
10 6bi4:C 311 328 0.2620 0.2797 0.2652 1.14e-23 6bi4:B, 6bi4:D, 6bi4:A
11 2b69:A 312 323 0.2711 0.2885 0.2786 1.35e-23 4gll:A, 4gll:B
12 2p5u:A 311 323 0.2861 0.3055 0.2941 1.42e-22 2p5u:B, 2p5u:C, 2p5u:D, 2p5y:A
13 1keu:A 361 362 0.2801 0.2576 0.2569 5.82e-22 1g1a:A, 1g1a:B, 1g1a:C, 1g1a:D, 1keu:B, 1kew:A, 1kew:B
14 8sk0:B 330 341 0.2741 0.2758 0.2669 7.16e-22 8shh:A, 8shh:B, 8sk0:A
15 1r66:A 322 326 0.2651 0.2733 0.2699 3.27e-21 1r6d:A
16 8vr2:B 321 328 0.2560 0.2648 0.2591 2.46e-20 8vr2:A, 8vr2:C, 8vr2:D
17 6vlo:A 319 289 0.2349 0.2445 0.2699 1.63e-19 6vlo:B, 6vlo:C, 6vlo:D
18 8wov:B 341 345 0.2831 0.2757 0.2725 1.88e-19 8wop:A, 8wop:B, 8wov:A, 8wow:A, 8wow:B
19 3vps:A 303 322 0.2681 0.2937 0.2764 1.04e-18 3vps:B
20 7yst:A 312 318 0.2892 0.3077 0.3019 1.39e-18 7ys8:A, 7ys8:B, 7ys9:A, 7ys9:B, 7ysa:A, 7ysa:B, 7ysm:A, 7ysm:B, 7yst:B, 7ysy:A, 7ysy:B, 7yt0:A, 7yt0:B
21 2hun:A 329 325 0.2500 0.2523 0.2554 2.19e-18 2hun:B
22 5u4q:A 321 338 0.2440 0.2523 0.2396 3.05e-18
23 6kv9:A 299 328 0.2651 0.2943 0.2683 7.81e-18 6kvc:A
24 7xpo:A 344 344 0.2620 0.2529 0.2529 8.84e-18 7xpo:B, 7xpp:B, 7xpp:A, 7xpq:A, 7xpq:B
25 6k0g:A 335 339 0.2681 0.2657 0.2625 2.30e-17 6k0h:A, 6k0i:A
26 1a9y:A 338 334 0.2500 0.2456 0.2485 1.43e-16 1a9z:A, 5gy7:A, 5gy7:B, 1kvq:A, 1kvr:A, 1kvs:A, 1kvt:A, 1kvu:A, 1lrj:A, 1lrk:A, 1lrl:A, 1nah:A, 1nai:A, 1uda:A, 1udb:A, 1udc:A, 2udp:A, 2udp:B, 1xel:A
27 2c20:A 329 310 0.2500 0.2523 0.2677 3.50e-16 2c20:B, 2c20:C, 2c20:D, 2c20:E, 2c20:F
28 8du1:A 361 356 0.2590 0.2382 0.2416 6.81e-16 8du1:B, 8du1:C, 8du1:D
29 5u4q:B 304 338 0.2500 0.2730 0.2456 3.55e-15
30 3lu1:A 336 329 0.2500 0.2470 0.2523 1.05e-14 3lu1:B, 3lu1:C, 3lu1:D, 3ru7:A, 3ru7:B, 3ru7:C, 3ru7:D, 3ru9:A, 3ru9:B, 3ru9:C, 3ru9:D, 3rua:A, 3rua:B, 3rua:C, 3rua:D, 3ruc:A, 3ruc:B, 3ruc:C, 3ruc:D, 3rud:A, 3rud:B, 3rud:C, 3rud:D, 3rue:A, 3rue:B, 3rue:S, 3rue:b, 3ruf:A, 3ruf:B, 3ruf:S, 3ruf:b, 3ruh:A, 3ruh:B, 3ruh:C, 3ruh:D
31 1sb8:A 341 327 0.2349 0.2287 0.2385 1.38e-14 1sb9:A
32 4twr:A 325 312 0.2590 0.2646 0.2756 6.05e-14 4wok:A
33 1i3k:A 347 342 0.2530 0.2421 0.2456 1.05e-13 1ek5:A, 1ek6:A, 1ek6:B, 1hzj:A, 1hzj:B, 1i3k:B, 1i3l:A, 1i3l:B, 1i3m:A, 1i3m:B, 1i3n:A, 1i3n:B
34 1z45:A 674 335 0.2620 0.1291 0.2597 4.31e-13
35 2pzm:A 316 320 0.2229 0.2342 0.2313 5.15e-12 2pzk:A, 2pzk:B, 2pzl:A, 2pzl:B, 2pzm:B
36 7k3p:A 329 296 0.2199 0.2219 0.2466 2.92e-11 7k3p:B
37 2q1w:A 300 299 0.2470 0.2733 0.2742 3.20e-11 2q1w:B, 2q1w:C
38 7kn1:A 336 338 0.2500 0.2470 0.2456 7.31e-11 7kn1:B
39 2c59:A 364 345 0.2199 0.2005 0.2116 1.72e-10 2c54:A, 2c54:B, 2c59:B, 2c5a:A, 2c5a:B, 2c5e:A, 2c5e:B, 8sg0:A, 8sg0:B, 8skb:A, 8skb:B, 8skb:C, 8skb:D
40 1ker:B 347 333 0.2500 0.2392 0.2492 3.09e-10 1kep:A, 1kep:B, 1ker:A, 1ket:A, 1ket:B, 1oc2:A, 1oc2:B
41 1orr:A 338 349 0.2470 0.2426 0.2350 3.14e-10 1orr:B, 1orr:C, 1orr:D
42 1gy8:C 370 377 0.2560 0.2297 0.2255 8.61e-10 2cnb:A, 2cnb:B, 2cnb:C, 2cnb:D, 1gy8:A, 1gy8:B, 1gy8:D
43 3enk:A 340 343 0.2349 0.2294 0.2274 1.18e-09 3enk:B
44 2pk3:A 309 321 0.2259 0.2427 0.2336 4.54e-09 2pk3:B
45 4lis:A 364 361 0.2500 0.2280 0.2299 6.38e-09 4lis:B, 4lis:C
46 8v4h:B 342 278 0.2078 0.2018 0.2482 7.45e-09 8v4g:A, 8v4g:B, 8v4h:A
47 3aw9:A 304 291 0.2169 0.2368 0.2474 1.98e-08 3aw9:B, 3aw9:C, 3icp:A, 3ko8:A
48 3ehe:A 290 309 0.2259 0.2586 0.2427 2.49e-08 3ehe:B
49 2x6t:G 308 264 0.2018 0.2175 0.2538 1.51e-07 1eq2:B, 1eq2:D, 1eq2:E, 1eq2:F, 1eq2:G, 1eq2:H, 1eq2:I, 1eq2:J, 2x6t:A, 2x6t:B, 2x6t:C, 2x6t:D, 2x6t:E, 2x6t:F, 2x6t:H, 2x6t:I, 2x6t:J, 2x86:A, 2x86:B, 2x86:C, 2x86:D, 2x86:E, 2x86:F, 2x86:G, 2x86:H, 2x86:I, 2x86:J, 2x86:K, 2x86:L, 2x86:M, 2x86:N, 2x86:O, 2x86:P, 2x86:Q, 2x86:R, 2x86:S, 2x86:T
50 1eq2:A 273 264 0.2048 0.2491 0.2576 1.56e-07 1eq2:C
51 6x3b:A 300 256 0.1928 0.2133 0.2500 2.00e-07 6x3b:B, 6x3b:C, 6x3b:D
52 8ewu:B 354 364 0.2440 0.2288 0.2225 2.50e-07 8ewu:A
53 3sxp:D 314 283 0.2319 0.2452 0.2721 1.16e-06 3sxp:A, 3sxp:B, 3sxp:C, 3sxp:E
54 4ej0:A 330 280 0.2048 0.2061 0.2429 7.19e-06 4ej0:B, 4ej0:C, 4ej0:D, 4ej0:E, 4ej0:F, 4ej0:G, 4ej0:H, 4ej0:I, 4ej0:J
55 3m2p:B 255 296 0.2108 0.2745 0.2365 1.16e-05
56 4m55:E 164 145 0.1114 0.2256 0.2552 3.92e-05
57 1bsv:A 317 329 0.2319 0.2429 0.2340 9.26e-05 1bws:A, 1e6u:A, 1e7q:A, 1e7r:A, 1e7s:A, 1fxs:A
58 5bju:A 340 283 0.2078 0.2029 0.2438 8.08e-04 5bju:B, 5bjv:A, 5bjv:B, 5bjw:A, 5bjw:B, 5bjx:A, 5bjx:B, 5bjy:A, 5bjy:B
59 4b79:A 236 66 0.0693 0.0975 0.3485 0.001 4b79:B
60 3w1v:A 347 257 0.1566 0.1499 0.2023 0.002 4g5h:A, 3vvc:A, 3w1v:B
61 8gjh:A 639 360 0.2500 0.1299 0.2306 0.003 8gjh:B, 8gjh:C, 8gjh:D, 8gjh:E, 8gjh:F
62 8du0:A 286 172 0.1295 0.1503 0.2500 0.003 7ll6:A
63 4j2o:C 316 259 0.1506 0.1582 0.1931 0.006 4j2o:A, 4j2o:B, 4j2o:D, 4j2o:E, 4j2o:F
64 4id9:B 328 194 0.1416 0.1433 0.2423 0.006 4id9:A, 4idg:A, 4idg:B
65 1wvg:A 352 198 0.1506 0.1420 0.2525 0.007 1wvg:B
66 7us5:A 346 194 0.1325 0.1272 0.2268 0.010 7us5:B, 7us5:C, 7us5:D
67 5z75:A 306 208 0.1325 0.1438 0.2115 0.012 5z75:B, 5z75:D
68 1rkx:C 351 217 0.1566 0.1481 0.2396 0.015 1rkx:A, 1rkx:B, 1rkx:D
69 7cgv:A 310 233 0.1627 0.1742 0.2318 0.032 7cgv:B, 7cgv:C, 7cgv:D
70 1z7e:D 644 283 0.1958 0.1009 0.2297 0.039 2bln:A, 2bln:B, 5j63:A, 5j63:B, 5j63:C, 5j63:D, 1z7e:A, 1z7e:B, 1z7e:C, 1z7e:E, 1z7e:F
71 6vo6:D 311 33 0.0512 0.0547 0.5152 0.067 6vo6:A, 6vo6:B, 6vo6:C, 6vo8:A, 6vo8:B
72 6h0n:A 377 291 0.1807 0.1592 0.2062 0.071 6h0n:B, 6h0p:A, 6h0p:B
73 3c1t:B 326 85 0.0904 0.0920 0.3529 0.17 3bxx:A, 3bxx:B, 3bxx:C, 3bxx:D, 3bxx:E, 3bxx:F, 3c1t:A, 3c1t:C, 3c1t:D, 2c29:D, 2c29:F, 2iod:A, 2iod:B, 2iod:C, 2iod:D, 2nnl:D, 2nnl:F
74 2z1m:A 338 268 0.1717 0.1686 0.2127 0.19 2z1m:D, 2z95:A, 2z95:D
75 2hae:B 373 43 0.0602 0.0536 0.4651 0.50 2hae:A, 2hae:C, 2hae:D
76 1rpn:D 322 322 0.2139 0.2205 0.2205 0.62 1rpn:A, 1rpn:B, 1rpn:C
77 7cxt:A 348 71 0.0633 0.0603 0.2958 0.63 7anc:A, 7cxt:B, 7m13:A, 7m13:B
78 3pvz:A 372 245 0.1687 0.1505 0.2286 0.78 3pvz:C, 3pvz:D
79 6jkh:A 212 80 0.0813 0.1274 0.3375 0.89 6jkh:B
80 8fem:A 327 26 0.0452 0.0459 0.5769 0.91 8fen:A
81 8gjb:A 320 187 0.1145 0.1187 0.2032 0.92 8gjb:B
82 6bwc:C 327 174 0.1265 0.1284 0.2414 1.0 6bwc:A, 6bwc:B, 6bwc:D, 6bwc:E, 6bwc:F
83 2nvu:B 789 35 0.0452 0.0190 0.4286 1.0 3dbh:B, 3dbh:D, 3dbh:F, 3dbh:H, 3dbl:B, 3dbl:D, 3dbl:F, 3dbl:H, 3dbr:B, 3dbr:D, 3dbr:F, 3dbr:H, 3gzn:B, 3gzn:D, 1r4m:F, 1r4m:H, 1r4n:B, 1r4n:D, 1r4n:F, 1r4n:H, 1tt5:B, 1tt5:D, 1yov:B, 1yov:D
84 7csa:A 310 133 0.1054 0.1129 0.2632 1.1 7csa:B, 7csa:C, 7csa:D, 7csb:C, 7csb:D, 7csb:A, 7csb:B, 7csc:E, 7csc:F, 7csc:A, 7csc:B, 7csc:C, 7csc:D, 7csd:C, 7csd:D, 7csd:A, 7csd:B, 7cse:E, 7cse:F, 7cse:A, 7cse:B, 7cse:C, 7cse:D, 7csf:C, 7csf:D, 7csf:A, 7csf:B
85 3vvb:A 270 115 0.0723 0.0889 0.2087 1.4
86 3pvz:B 300 105 0.0843 0.0933 0.2667 1.6
87 7anc:B 314 180 0.1175 0.1242 0.2167 1.8
88 4e5y:C 290 206 0.1476 0.1690 0.2379 1.9
89 3st7:A 369 281 0.1958 0.1762 0.2313 2.2 2zkl:A
90 7cs6:F 300 127 0.1024 0.1133 0.2677 2.4 7cs3:A, 7cs3:B, 7cs3:C, 7cs3:D, 7cs3:E, 7cs3:F, 7cs4:E, 7cs4:A, 7cs4:F, 7cs4:D, 7cs4:C, 7cs4:B, 7cs5:E, 7cs5:A, 7cs5:F, 7cs5:D, 7cs5:C, 7cs5:B, 7cs6:A, 7cs6:B, 7cs6:C, 7cs6:D, 7cs6:E, 7cs7:A, 7cs7:B, 7cs7:C, 7cs7:D, 7cs7:E, 7cs7:F, 7cs8:A, 7cs8:B, 7cs8:C, 7cs8:D, 7cs8:E, 7cs8:F
91 6d2v:A 315 332 0.2078 0.2190 0.2078 2.6 6d2v:B, 6nd7:A, 6nd7:B
92 1pj6:A 828 34 0.0422 0.0169 0.4118 2.6 3gsi:A, 1pj5:A, 1pj7:A
93 4m55:F 181 129 0.1024 0.1878 0.2636 2.7
94 8om2:B 342 87 0.0663 0.0643 0.2529 2.9 8d8k:B, 8d8l:B, 5mrc:BB, 5mre:BB, 5mrf:BB, 8om3:B, 8om4:B
95 8fet:A 334 21 0.0361 0.0359 0.5714 3.2 8fet:B, 8feu:A, 8feu:B, 8fev:A, 8fev:B, 8few:A, 8few:B
96 5ilg:A 265 31 0.0392 0.0491 0.4194 3.7 5ilg:B, 5ilo:A, 5ilo:B
97 6jyg:D 307 184 0.1205 0.1303 0.2174 3.8 6jyg:A, 6jyg:B, 6jyg:C, 6jyg:E, 6jyg:F
98 7epr:B 310 191 0.1235 0.1323 0.2147 3.8 7epr:A, 7epr:C, 7epr:D
99 1y1p:A 342 68 0.0693 0.0673 0.3382 4.0 1y1p:B
100 1eg4:A 260 74 0.0512 0.0654 0.2297 5.3
101 1yxm:B 283 25 0.0422 0.0495 0.5600 5.5
102 5tqm:A 315 92 0.0813 0.0857 0.2935 6.6 5tqm:B
103 4imp:A 520 110 0.0753 0.0481 0.2273 7.7 4imp:B, 4imp:C, 4imp:D
104 8fip:A 338 21 0.0361 0.0355 0.5714 7.9 8fio:A, 8fio:B, 8fip:B
105 3c3x:A 310 25 0.0271 0.0290 0.3600 8.0 3c3x:B, 2qw8:A, 2qw8:B, 2qx7:A, 2qx7:B, 2qzz:A, 2qzz:B, 2r2g:A, 2r2g:B, 2r6j:A, 2r6j:B
106 3nt6:A 565 114 0.0873 0.0513 0.2544 8.5 3nt6:B, 3nta:A, 3nta:B, 3ntd:A, 3ntd:B, 4ocg:A, 4ocg:B
107 6ujk:A 246 85 0.0783 0.1057 0.3059 9.3 6ujk:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218