Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
NAMEIKSILIANRGEIALRALRTIKEMGKKAICVYSEADKDALYLKYADASICIGKARSSESYLNIPAIIAAAEIAEADA
IFPGYGFLSENQNFVEICAKHNIKFIGPSVEAMNLMSDKSKAKQVMQRAGVPVIPGSDGALAGAEAAKKLAKEIGYPVIL
KAAAGGGGRGMRVVENEKDLEKAYWSAESEAMTAFGDGTMYMEKYIQNPRHIEVQVIGDSFGNVIHVGERDCSMQRRHQK
LIEESPAILLDEKTRTRLHETAIKAAKAIGYEGAGTFEFLVDKNLDFYFIEMNTRLQVEHCVSEMVSGIDIIEQMIKVAE
GYALPSQESIKLNGHSIECRITAEDSKTFLPSPGKITKYIPPAGRNVRMESHCYQDYSVPAYYDSMIGKLVVWAEDRNKA
IAKMKVALDELLISGIKTTKDFHLSMMENPDFINNNYDTNYLARH

The query sequence (length=445) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 3ouu:A 446 445 1.0000 0.9978 1.0000 0.0 3ouu:B, 3ouz:A, 3ouz:B
2 2vqd:A 447 442 0.5236 0.5213 0.5271 2.54e-167
3 2vpq:B 448 443 0.5169 0.5134 0.5192 6.51e-166 2vpq:A
4 1dv2:A 450 442 0.5258 0.5200 0.5294 3.02e-157 1dv1:A, 1dv2:B, 3g8c:A, 3g8c:B, 3g8d:B, 2j9g:A, 2j9g:B, 3jzf:B, 3jzi:A, 3jzi:B, 6oi9:A, 6oi9:B, 3rup:A, 3rup:B, 3rv3:A, 3rv3:B, 3rv4:A, 2v58:A, 2v58:B, 2v59:A, 2v59:B, 2v5a:A, 2vr1:A, 2w6m:A, 2w6m:B, 2w6n:A, 2w6n:B, 2w6o:A, 2w6o:C, 2w6p:A, 2w6q:A, 2w6q:B, 2w6z:A, 2w70:A, 2w70:B, 2w71:A, 2w71:C
5 1dv1:B 428 442 0.5124 0.5327 0.5158 3.08e-155
6 6ojh:A 445 442 0.5079 0.5079 0.5113 3.28e-154 4mv1:A, 4mv3:A, 4mv4:A, 4mv8:A, 6oi8:A
7 4rzq:A 422 441 0.4899 0.5166 0.4943 1.90e-149 4mv6:A, 4mv7:A, 4mv9:A
8 7kct:A 453 443 0.4944 0.4857 0.4966 2.74e-148 7kbl:A, 7kbl:B, 7kc7:A, 7kct:B
9 8hz4:A 456 443 0.4697 0.4583 0.4718 8.07e-140 8hz4:B, 8hz4:C, 8hz4:D
10 7ybu:A 670 447 0.4427 0.2940 0.4407 2.13e-131 7ybu:B, 7ybu:D, 7ybu:F, 7ybu:H, 7ybu:J
11 3n6r:G 646 438 0.4292 0.2957 0.4361 4.12e-128 3n6r:I, 3n6r:K
12 8sgx:X 657 437 0.4382 0.2968 0.4462 1.16e-125 8sgx:S, 8sgx:Z, 8sgx:V, 8sgy:V, 8sgy:B, 8sgy:S, 8sgy:Z, 8sgy:Y, 8sgz:V, 8sgz:Z, 8sgz:X, 8sgz:S, 8sgz:B, 8sgz:Y
13 7wtb:B 1147 445 0.4337 0.1683 0.4337 6.97e-125 3bg3:A, 3bg3:B, 3bg3:C, 3bg3:D, 3bg9:A, 3bg9:B, 3bg9:C, 3bg9:D, 8j7o:A, 8j7o:B, 8j7o:C, 8j7o:E, 7wta:C, 7wta:B, 7wta:D, 7wta:A, 7wtb:C, 7wtb:A, 7wtb:D, 7wtc:C, 7wtc:A, 7wtc:B, 7wtc:D, 7wtd:C, 7wtd:D, 7wte:C, 7wte:D
14 8j78:I 651 444 0.4337 0.2965 0.4347 1.48e-123 8j78:C, 8j7d:D, 8j7d:F, 8j7d:I, 8j7d:L, 8jaw:A, 8jaw:C, 8jaw:E, 8jaw:F, 8jaw:H, 8jaw:K, 8k2v:A, 8k2v:B, 8k2v:C, 8k2v:D, 8k2v:E, 8k2v:F
15 3tw6:B 1129 455 0.4449 0.1754 0.4352 1.97e-119 4jx4:A, 4jx4:B, 4jx4:C, 4jx4:D, 4jx5:A, 4jx5:B, 4jx5:C, 4jx5:D, 4jx6:A, 4jx6:B, 4jx6:C, 4jx6:D, 4loc:A, 4loc:B, 4loc:C, 4loc:D, 4m6v:A, 4m6v:B, 4m6v:C, 4m6v:D, 4mfd:A, 4mfd:B, 4mfd:C, 4mfd:D, 4mfe:A, 4mfe:B, 4mfe:C, 4mfe:D, 4mim:A, 4mim:B, 4mim:C, 4mim:D, 3tw6:C, 3tw6:D
16 3bg5:A 1137 449 0.4404 0.1724 0.4365 1.28e-118 3bg5:C, 8gk8:A, 8gk8:B, 3hb9:A, 3hb9:C, 3hbl:A, 3hbl:C, 4hnt:A, 4hnt:C, 4hnu:A, 4hnu:C, 4hnv:A, 4hnv:C
17 5vyz:A 1144 447 0.4360 0.1696 0.4340 1.28e-115 5vyw:D, 5vyz:B, 5vyz:D, 5vz0:A, 5vz0:B, 5vz0:D, 7zyy:A, 7zyy:C, 7zyy:B, 7zyy:D, 7zyz:A, 7zz0:A, 7zz1:A, 7zz2:A, 7zz3:A, 7zz3:C, 7zz3:B, 7zz3:D, 7zz4:A, 7zz5:A, 7zz6:D, 7zz6:A, 7zz8:A, 7zz8:C, 7zz8:D, 7zz8:B
18 8rth:A 666 452 0.4270 0.2853 0.4204 6.26e-115 8rth:C, 8rth:E, 8rth:G, 8rth:I, 8rth:K
19 2qf7:B 1017 454 0.3888 0.1701 0.3811 9.23e-96 3tw7:A, 3tw7:B
20 3jzf:A 380 248 0.2921 0.3421 0.5242 1.67e-90
21 3jzf:A 380 131 0.1640 0.1921 0.5573 1.72e-39
22 2qf7:A 1076 455 0.3685 0.1524 0.3604 5.73e-86 3tw6:A
23 8hwl:A 941 254 0.2899 0.1371 0.5079 3.85e-80 8hwl:B, 8hwl:C, 8hwl:E
24 3n6r:A 591 240 0.2629 0.1980 0.4875 3.85e-75 3n6r:C, 3n6r:E
25 3n6r:A 591 129 0.1258 0.0948 0.4341 3.47e-28 3n6r:C, 3n6r:E
26 3jrx:A 496 494 0.3326 0.2984 0.2996 2.93e-72 5kkn:B, 5kkn:C
27 8jxn:J 541 245 0.2539 0.2089 0.4612 4.34e-71
28 8jxn:J 541 55 0.0652 0.0536 0.5273 5.23e-10
29 5csl:B 2072 512 0.3596 0.0772 0.3125 7.42e-68 5ctb:A, 5ctb:C, 5ctc:A, 5ctc:B, 5ctc:C, 5cte:B, 5cte:C, 3h0s:A, 3k8x:A, 3k8x:B, 3k8x:C, 1od2:A, 1od2:B, 3pgq:A, 3pgq:C, 3tv5:A, 3tv5:B, 3tv5:C, 3tvu:A, 3tvu:B, 3tvu:C, 3tvw:A, 3tvw:B, 3tvw:C, 3tz3:A, 3tz3:B, 3tz3:C, 1w96:A, 1w96:B, 1w96:C, 4wyo:B, 4wyo:C, 4wz8:B, 4wz8:C
30 4qsh:C 1081 254 0.2427 0.0999 0.4252 2.01e-65 4qsh:A, 4qsh:D, 4qsh:B, 4qsk:A, 4qsk:B
31 4qsh:C 1081 134 0.1258 0.0518 0.4179 2.18e-26 4qsh:A, 4qsh:D, 4qsh:B, 4qsk:A, 4qsk:B
32 5vyz:C 1083 250 0.2449 0.1006 0.4360 1.91e-63 5vyw:A, 5vyw:B, 5vyw:C, 5vz0:C
33 5vyz:C 1083 134 0.1213 0.0499 0.4030 4.23e-19 5vyw:A, 5vyw:B, 5vyw:C, 5vz0:C
34 8hz5:A 350 224 0.2157 0.2743 0.4286 4.29e-63
35 8hz5:A 350 150 0.1483 0.1886 0.4400 6.52e-41
36 3gid:A 460 477 0.3146 0.3043 0.2935 4.37e-62 3gid:B
37 5csl:A 2050 514 0.3483 0.0756 0.3016 5.02e-61
38 3ho8:D 934 246 0.2382 0.1135 0.4309 3.85e-56
39 3ho8:D 934 133 0.1416 0.0675 0.4737 1.69e-30
40 3bg5:B 1074 246 0.2382 0.0987 0.4309 5.05e-56 3bg5:D, 8gk8:C, 3hb9:B, 3hb9:D, 3hbl:B, 3hbl:D, 4hnt:B, 4hnt:D, 4hnu:B, 4hnu:D, 4hnv:D, 3ho8:A, 3ho8:C, 3ho8:B
41 3bg5:B 1074 133 0.1416 0.0587 0.4737 1.64e-30 3bg5:D, 8gk8:C, 3hb9:B, 3hb9:D, 3hbl:B, 3hbl:D, 4hnt:B, 4hnt:D, 4hnu:B, 4hnu:D, 4hnv:D, 3ho8:A, 3ho8:C, 3ho8:B
42 3va7:A 1130 230 0.2112 0.0832 0.4087 4.87e-49
43 3va7:A 1130 133 0.1326 0.0522 0.4436 1.41e-30
44 4hnv:B 1033 244 0.2112 0.0910 0.3852 3.00e-44 8gk8:D
45 4hnv:B 1033 133 0.1393 0.0600 0.4662 9.66e-30 8gk8:D
46 6u1d:B 326 229 0.1461 0.1994 0.2838 1.26e-11 6u1d:A, 6u1e:A, 6u1e:B, 6u1f:A, 6u1f:B, 6u1g:A, 6u1g:B, 6u1h:A, 6u1h:B, 6u1h:C, 6u1i:C, 6u1j:A, 6u1j:C, 6u1k:A, 6u1k:B, 6u1k:C, 6u1k:D, 2yzm:A, 2yzm:B, 2yzm:C, 2yzn:A, 2yzn:B, 2yzn:C, 2zdg:A, 2zdg:B, 2zdg:C, 2zdg:D, 2zdh:A, 2zdh:B, 2zdh:C, 2zdh:D, 2zdq:A, 2zdq:B
47 6u1h:D 305 220 0.1461 0.2131 0.2955 2.17e-11 6u1i:A
48 1bxr:A 1073 237 0.1191 0.0494 0.2236 1.28e-10 1a9x:A, 1a9x:C, 1a9x:E, 1a9x:G, 1bxr:C, 1bxr:E, 1bxr:G, 1c30:A, 1c30:C, 1c30:E, 1c30:G, 1c3o:A, 1c3o:C, 1c3o:E, 1c3o:G, 1ce8:A, 1ce8:C, 1ce8:E, 1ce8:G, 1cs0:A, 1cs0:C, 1cs0:E, 1cs0:G, 1jdb:B, 1jdb:E, 1jdb:H, 1jdb:K, 1kee:A, 1kee:C, 1kee:E, 1kee:G, 1m6v:A, 1m6v:C, 1m6v:E, 1m6v:G, 1t36:A, 1t36:C, 1t36:E, 1t36:G
49 1bxr:A 1073 348 0.1730 0.0718 0.2213 7.30e-08 1a9x:A, 1a9x:C, 1a9x:E, 1a9x:G, 1bxr:C, 1bxr:E, 1bxr:G, 1c30:A, 1c30:C, 1c30:E, 1c30:G, 1c3o:A, 1c3o:C, 1c3o:E, 1c3o:G, 1ce8:A, 1ce8:C, 1ce8:E, 1ce8:G, 1cs0:A, 1cs0:C, 1cs0:E, 1cs0:G, 1jdb:B, 1jdb:E, 1jdb:H, 1jdb:K, 1kee:A, 1kee:C, 1kee:E, 1kee:G, 1m6v:A, 1m6v:C, 1m6v:E, 1m6v:G, 1t36:A, 1t36:C, 1t36:E, 1t36:G
50 5dou:D 1430 272 0.1438 0.0448 0.2353 2.25e-10 5dou:A, 5dou:B, 5dou:C, 6w2j:A
51 3orq:A 373 200 0.1101 0.1314 0.2450 6.97e-10 3orq:B
52 4c5a:A 306 214 0.1303 0.1895 0.2710 6.07e-09 4c5a:B, 4c5b:A, 4c5b:B, 4c5c:A, 4c5c:B, 2dln:A, 1iov:A, 1iow:A
53 8evy:B 317 206 0.1213 0.1703 0.2621 1.99e-07 8evy:A, 8evy:C, 8evz:A, 8evz:B, 8evz:C
54 3i12:A 360 271 0.1438 0.1778 0.2362 4.68e-06 3i12:B, 3i12:C, 3i12:D, 3q1k:A, 3q1k:B, 3q1k:C, 3q1k:D
55 8evw:B 326 232 0.1124 0.1534 0.2155 5.24e-06 8evw:A, 8evx:A
56 8fff:A 351 227 0.1303 0.1652 0.2555 6.29e-06 2i80:A, 2i80:B, 2i8c:A, 2i8c:B, 7u9k:B, 7u9k:A
57 8fxi:C 630 72 0.0674 0.0476 0.4167 7.03e-06 8fxi:D
58 5bpf:C 306 203 0.1191 0.1732 0.2611 8.77e-06 5bpf:B, 5bpf:D, 5bph:A, 5bph:B, 5bph:C, 5bph:D, 5c1o:A, 5c1o:B, 5c1o:C, 5c1o:D, 5c1p:B, 5c1p:C, 5c1p:D
59 3rfc:A 344 265 0.1371 0.1773 0.2302 1.14e-05 4l1k:A, 4me6:A, 3r5f:A
60 1ehi:A 360 299 0.1618 0.2000 0.2408 7.11e-05
61 7lgm:A 719 179 0.0966 0.0598 0.2402 8.53e-05 7lgm:B
62 7wae:B 877 148 0.0989 0.0502 0.2973 9.69e-05 7wad:A, 7wad:B, 7wad:C, 7wad:D, 7wae:D, 7wae:A, 7wae:C, 7waf:A, 7waf:C, 7waf:D, 7waf:B
63 3ax6:A 360 122 0.0719 0.0889 0.2623 4.25e-04 3ax6:B, 3ax6:C, 3ax6:D
64 8evx:B 305 227 0.1056 0.1541 0.2070 4.40e-04
65 2yw2:A 423 91 0.0629 0.0662 0.3077 6.48e-04 2yw2:B
66 3vpd:A 281 111 0.0742 0.1174 0.2973 7.79e-04 3vpd:B
67 1e4e:A 341 241 0.1371 0.1789 0.2531 0.001 1e4e:B
68 3n8d:B 334 223 0.1281 0.1707 0.2556 0.002 3n8d:A
69 7u56:A 346 227 0.1191 0.1532 0.2335 0.004 7u56:B
70 3ufx:B 378 58 0.0562 0.0661 0.4310 0.010 3ufx:E, 3ufx:G, 3ufx:I
71 5nri:A 311 226 0.1213 0.1736 0.2389 0.011 5nrh:A, 5nrh:B, 5nri:B
72 3vmm:A 471 275 0.1438 0.1359 0.2327 0.012 3wnz:A, 3wo0:A, 3wo1:A
73 3r5h:A 383 278 0.1438 0.1671 0.2302 0.012 4dlk:A, 4dlk:B, 3q2o:B, 3qff:A, 3qff:B, 3r5h:B, 3v4s:A, 3v4s:B
74 4fu0:A 343 251 0.1303 0.1691 0.2311 0.016 4fu0:B
75 6uel:A 1333 162 0.0809 0.0270 0.2222 0.055 6uel:B
76 3vpb:B 282 68 0.0539 0.0851 0.3529 0.057 3vpb:A, 3vpb:C, 3vpb:D, 3vpc:A, 3vpc:B, 3vpc:C, 3vpc:D
77 3se7:C 331 227 0.1146 0.1541 0.2247 0.060 3se7:A, 3se7:B, 3se7:D, 3se7:E, 3se7:F
78 7lg5:A 871 120 0.0674 0.0344 0.2500 0.065 7lg5:B, 7lg5:C, 7lg5:D, 7lgj:A, 7lgj:B, 7lgj:C, 7lgj:D, 7lgq:A, 7lgq:B, 7lgq:C, 7lgq:D, 7txu:A, 7txu:B, 7txu:C, 7txu:D, 7txv:A, 7txv:B, 7txv:C, 7txv:D
79 6w2j:B 1364 165 0.0809 0.0264 0.2182 0.096
80 5k2m:G 273 121 0.0697 0.1136 0.2562 0.14 5k2m:I, 5k2m:A, 5k2m:B, 5k2m:C, 5k2m:D, 5k2m:H, 5k2m:J
81 4mam:A 373 178 0.0966 0.1153 0.2416 0.16 5jqw:A, 4ma0:A, 4ma5:A, 4mam:B
82 2ys6:A 421 76 0.0472 0.0499 0.2763 0.28 2yrx:A
83 1uc9:A 256 215 0.1146 0.1992 0.2372 0.29 1uc9:B
84 5gq1:F 173 56 0.0449 0.1156 0.3571 0.82
85 4ffl:A 353 131 0.0742 0.0935 0.2519 1.3 4ffm:A, 4ffn:A, 4ffo:A, 4ffp:A, 4ffr:A
86 2xcl:A 421 88 0.0494 0.0523 0.2500 1.6 2xd4:A
87 2qk4:B 424 32 0.0292 0.0307 0.4062 2.3 2qk4:A
88 2m0v:A 128 81 0.0562 0.1953 0.3086 3.7
89 1eyz:A 389 86 0.0472 0.0540 0.2442 4.8 1eyz:B, 1ez1:A, 1ez1:B, 1kj8:A, 1kj8:B, 1kj9:A, 1kj9:B, 1kji:A, 1kji:B, 1kjj:A, 1kjj:B, 1kjq:A, 1kjq:B
90 8p82:A 1596 41 0.0270 0.0075 0.2927 5.1 8p82:B
91 3b03:B 364 190 0.0899 0.1099 0.2105 5.2 3b03:A, 3b03:C, 3b03:D, 3b04:A, 3b04:B, 3b04:C, 3b04:D, 3b05:A, 3b05:B, 3b05:C, 3b05:D, 3b06:A, 3b06:B, 3b06:C, 3b06:D, 3vkj:A, 3vkj:B, 3vkj:C, 3vkj:D, 2zru:A, 2zru:B, 2zru:C, 2zru:D, 2zrv:A, 2zrv:B, 2zrv:C, 2zrv:D, 2zrw:A, 2zrw:B, 2zrw:C, 2zrw:D, 2zrx:A, 2zrx:B, 2zrx:C, 2zrx:D, 2zry:A, 2zry:B, 2zry:C, 2zry:D, 2zrz:A, 2zrz:B, 2zrz:C, 2zrz:D
92 6qs4:B 582 101 0.0539 0.0412 0.2376 6.5 6oax:C, 6oax:E, 6oax:D, 6oax:B, 6oax:A, 6oax:F, 6oay:C, 6oay:E, 6oay:D, 6oay:B, 6oay:A, 5og1:B, 6og1:F, 6og1:A, 6og2:A, 6qs4:A, 6qs4:F, 6qs6:A, 6qs6:B, 6qs6:E, 6qs6:F, 6qs7:A, 6qs7:B, 6qs7:F, 6qs8:A, 6qs8:B, 6qs8:F

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218