BioLiP

>protein
NAIKYLGQDYENLRARCLQNGVLFQDDAFPPVSHSLGFKELGPNSSKTYGIKWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGAL
GDCWLLAAIASLTLNETILHRVVPYGQSFQEGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPTKDGKLVFVHSAQGNEFWSALLE
KAYAKVNGSYEALSGGCTSEAFEDFTGGVTEWYDLQKAPSDLYQIILKALERGSLLGCSINISDIRDLEAITFKNLVRGH
AYSVTDAKQVTYQGQRVNLIRMRNPWGEVEWKGPWSDNSYEWNKVDPYEREQLRVKMEDGEFWMSFRDFIREFTKLEICN
L

The query sequence (length=321) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2g8e:A	326	321	1.0000	0.9847	1.0000	0.0	2g8j:A, 1kxr:A, 1kxr:B, 2nqg:A, 2nqi:A, 2r9c:A, 2r9f:A, 1tl9:A, 1tlo:A
2	8gx3:A	327	321	0.8754	0.8593	0.8754	0.0	2ary:A, 2ary:B, 7w7o:A, 7x79:A, 1zcm:A
3	3bow:A	680	320	0.6978	0.3294	0.7000	1.94e-166	3df0:A, 1mdw:A, 1mdw:B
4	2nqa:B	318	321	0.6667	0.6730	0.6667	1.96e-159	2nqa:A
5	2p0r:A	319	316	0.5826	0.5862	0.5918	3.12e-135	2p0r:B, 1ziv:A
6	6bdt:B	318	319	0.5670	0.5723	0.5705	1.56e-129	6bdt:A, 6bdt:C, 6bdt:D, 6bgp:A, 6bgp:B, 6bgp:C, 6bgp:D, 6bjd:A, 6bjd:C, 6bjd:B, 6bjd:D, 6bkj:A, 6bkj:B, 6bkj:C, 6bkj:D
7	7sqc:1A	1639	151	0.1215	0.0238	0.2583	0.002
8	7sqc:1B	1660	151	0.1215	0.0235	0.2583	0.003
9	7sqc:1C	1700	151	0.1215	0.0229	0.2583	0.003	7sqc:1D
10	2q3z:A	655	156	0.1246	0.0611	0.2564	0.28	9bc2:A, 3s3j:A
11	1v26:B	510	70	0.0561	0.0353	0.2571	0.76	1v25:A, 1v25:B, 1v26:A
12	1kq3:A	364	84	0.0717	0.0632	0.2738	0.79
13	7yqq:A	464	49	0.0467	0.0323	0.3061	1.0	7yqr:A, 7yqr:B
14	6w6i:F	605	90	0.0810	0.0430	0.2889	1.1	6w6j:F
15	6w6j:D	707	90	0.0810	0.0368	0.2889	1.1	6dju:D, 6dju:E, 6djv:D, 6djv:E, 6djv:F, 7l6n:D, 7l6n:E, 7l6n:F, 6w6e:D, 6w6e:E, 6w6e:F, 6w6g:D, 6w6g:E, 6w6h:D, 6w6h:E, 6w6i:D, 6w6i:E, 6w6j:E
16	6djv:C	615	90	0.0810	0.0423	0.2889	1.2	6dju:A, 6dju:B, 6dju:C, 6djv:A, 6djv:B
17	6w6h:C	636	90	0.0810	0.0409	0.2889	1.3	6w6e:B, 6w6e:C, 6w6g:A, 6w6g:B, 6w6g:C, 6w6h:A, 6w6h:B, 6w6h:F, 6w6i:A, 6w6i:B, 6w6i:C, 6w6j:A, 6w6j:B, 6w6j:C
18	7l6n:C	675	90	0.0810	0.0385	0.2889	1.4	7l6n:A, 7l6n:B, 6w6e:A
19	6x89:S1	688	76	0.0623	0.0291	0.2632	3.2	8e73:S1
20	6cpu:A	526	183	0.1215	0.0741	0.2131	4.8	6cpt:A
21	6zq4:F	512	49	0.0530	0.0332	0.3469	7.4	6zq4:A, 6zq4:B, 6zq4:C, 6zq4:D, 6zq4:E, 6zq4:G, 6zq4:H, 6zq6:A, 6zq6:B, 6zq6:C, 6zq6:D, 6zq7:A
22	4w6q:B	332	95	0.0685	0.0663	0.2316	9.1	4w6q:A, 4w6q:C, 4w6q:D
23	1ksf:X	714	77	0.0530	0.0238	0.2208	9.1	1mbu:A, 1mbu:B, 1mbx:A, 1mbx:B, 1r6b:X, 1r6o:A, 1r6o:B, 1r6q:A, 1r6q:B, 7uiv:B, 7uiv:C, 7uiv:D, 7uiv:E, 7uiv:A, 7uiv:F, 7uiw:A, 7uiw:B, 7uiw:C, 7uiw:D, 7uiw:E, 7uix:B, 7uix:C, 7uix:D, 7uix:E, 7uix:F, 7uix:A, 7uiy:B, 7uiy:C, 7uiy:D, 7uiy:E, 7uiy:A, 7uiy:F, 7uiz:B, 7uiz:C, 7uiz:D, 7uiz:E, 7uiz:A, 7uiz:F, 7uj0:B, 7uj0:C, 7uj0:D, 7uj0:E, 7uj0:A, 7uj0:F, 6uqe:A, 6uqe:B, 6uqe:C, 6uqe:D, 6uqe:E, 6uqe:F, 6uqo:C, 6uqo:D, 6uqo:A, 6uqo:B, 6uqo:E, 6uqo:F, 6w1z:A, 6w1z:B, 6w1z:C, 6w1z:D, 6w1z:E, 6w1z:F, 6w20:A, 6w20:B, 6w20:C, 6w20:D, 6w20:E, 6w20:F, 6w21:A, 6w21:B, 6w21:C, 6w21:D, 6w21:E, 6w21:F, 6w22:A, 6w22:B, 6w22:C, 6w22:D, 6w22:E, 6w22:F, 6w23:A, 6w23:B, 6w23:C, 6w23:D, 6w23:E, 6w23:F, 6w24:A, 6w24:B, 6w24:C, 6w24:D, 6w24:E, 6w24:F

[Back]