BioLiP

>protein
NAHQRQTLYQLMDGLNTFYQQSLQQPVATSARQYLEKRGLSHEVIARFAIGFAPPGWDNVLKRFGGNPENRQSLIDAGML
VTNDRSYDRFRERVMFPIRDKRGRVIGFGGRVLGNDTPKYLNSPETDIFHKGRQLYGLYEAQQDNAEPNRLLVVEGYMDV
VALAQYGINYAVASLGTSTTADHIQLLFRATNNVICCYDGDRAGRDAAWCALETALPYMTDGRQLRFMFLPDGEDPDTLV
RKEGKEAFEARMEQAMPLSAFLFNSLMPQVDLSTPDGRARLSTLALPLISQVPGETLRIYLRQELGNKLGILDDSQL

The query sequence (length=317) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3b39:A	317	317	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	3b39:B
2	2au3:A	403	265	0.2997	0.2357	0.3585	9.99e-44
3	5w35:A	321	299	0.3123	0.3084	0.3311	2.30e-43	5w34:A, 5w36:A
4	4edg:A	321	248	0.2681	0.2648	0.3427	1.24e-42	4edk:A, 4edr:A, 4edt:A, 4edv:A, 4ee1:A
5	6pcm:A	793	46	0.0442	0.0177	0.3043	2.0	6pcm:B
6	4jbb:A	208	124	0.1073	0.1635	0.2742	2.7
7	4yan:A	252	67	0.0599	0.0754	0.2836	2.7	4yan:B, 4yan:C, 4yan:D
8	8czq:A	655	39	0.0410	0.0198	0.3333	3.9
9	6cq2:A	688	39	0.0410	0.0189	0.3333	4.0	6cqi:A
10	8dwj:A	339	68	0.0568	0.0531	0.2647	5.5	8dvf:H, 8dvi:H, 8dw6:H, 8gao:G
11	6bu8:03	134	138	0.1262	0.2985	0.2899	7.0	7jsz:a, 7jt3:a, 7k50:a, 7k51:a, 7k52:a, 7k53:a, 7k54:a, 7k55:a, 7lv0:a, 7n2c:LA, 6ofx:a, 6og7:a, 6ogf:a, 6ogg:a, 6ogi:a, 8peg:a, 8pkl:a, 7qg8:C, 7qgh:C, 7qgn:C, 7qgr:C, 8r3v:a2, 8rcl:a2, 8rcm:a2, 7ss9:a, 7ssd:a, 7ssl:a, 7sso:a, 7ssw:a, 7st2:a, 7st7:a, 7tos:L1, 7ug7:LA, 5uyl:03, 5uym:03, 5uyn:03, 5uyp:03, 5uyq:03, 8vs9:L1, 8vsa:L1, 6wd0:a, 6wd1:a, 6wd2:a, 6wd3:a, 6wd4:a, 6wd5:a, 6wd6:a, 6wd7:a, 6wd8:a, 6wd9:a, 6wda:a, 6wdb:a, 6wdc:a, 6wdd:a, 6wde:a, 6wdf:a, 6wdg:a, 6wdh:a, 6wdi:a, 6wdj:a, 6wdk:a, 6wdl:a, 6wdm:a, 6wnt:a, 6wnv:a, 6wnw:a
12	7dy1:D	458	30	0.0473	0.0328	0.5000	8.1	7dy1:A, 7dy1:B, 7dy1:C, 7dy1:E, 7dy1:F
13	1yrh:F	202	43	0.0473	0.0743	0.3488	8.4	1yrh:A, 1yrh:B, 1yrh:C, 1yrh:D, 1yrh:E, 1yrh:G, 1yrh:H
14	1iby:A	112	66	0.0631	0.1786	0.3030	8.4	1iby:B, 1iby:C, 1iby:D, 1ibz:A, 1ibz:B, 1ibz:C, 1ibz:D, 1ic0:A, 1ic0:B, 1ic0:C, 1ic0:D, 1ic0:E, 1ic0:F
15	7jn7:A	846	86	0.0631	0.0236	0.2326	8.9	6eor:A, 6eor:C, 6eor:D, 7jn7:D, 6qzv:A, 6qzv:C, 6qzv:D, 7svl:A, 7svl:B, 7svl:C, 7svl:D, 7svn:A, 7svn:B, 7svn:C, 7svn:D, 6x6c:A, 6x6c:D, 7zxs:A, 7zxs:B, 7zxs:C, 7zxs:D
16	6eor:B	805	86	0.0631	0.0248	0.2326	9.1	6qzv:B
17	3fef:A	434	96	0.0757	0.0553	0.2500	9.4	3fef:B, 3fef:C, 3fef:D

[Back]