Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MVSKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLVQCFARYPDHMKQHD
FFKSAMPEGYVQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNAISDNVYITADKQKNGIK
ANFKIRHNIEDGSVQLADHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSALSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGIT

The query sequence (length=228) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6hr1:A 406 226 0.9561 0.5369 0.9646 2.66e-163 6hr1:B
2 4z4k:A 282 224 0.9561 0.7730 0.9732 8.30e-163 5aas:A, 4bmj:A, 4bmj:B, 4bmj:D, 4bmj:E, 4bmj:F, 4bmj:G, 4bmj:I, 4bmj:K, 3vht:B, 5yt6:D, 4z4k:B, 4z4m:A, 4z4m:B
3 7ydq:A 598 229 0.9693 0.3696 0.9651 6.54e-161 4as8:A, 2b3q:A, 2b3q:D, 8dhy:A, 8dpd:A, 4eul:A, 6gqg:A, 6ir7:A, 4jfg:A, 4jfg:B, 4jfg:C, 4jfg:D, 4jfg:E, 4jfg:F, 4jfg:G, 4jfg:H, 6jgj:A, 4ka9:A, 4kw9:A, 1kyr:A, 1kys:A, 4l1i:A, 5nhn:B, 5nhn:A, 5ni3:A, 5ni3:D, 5ni3:B, 5ni3:C, 2o24:A, 7pca:A, 6sm0:A, 5t3i:A, 4w7c:D, 4w7e:A
4 8b6s:A 517 224 0.9561 0.4217 0.9732 3.72e-159 8b6r:A, 8b6s:B, 8b6t:A, 8b6t:B, 1cqw:A, 4fwb:A, 4hzg:A, 8j1o:A, 4kac:A, 4kac:B, 4kaj:A, 4kyv:A, 4kyv:B, 7o3o:A, 7o8b:A, 7ond:A, 7ond:B, 7oo4:A, 7pcw:A, 7pcw:B, 7pcw:C, 7pcw:D, 7pcx:A, 7pcx:B, 7pcx:F, 7pcx:C, 7pcx:D, 7pcx:E, 3rk4:A, 8sw8:AAA, 6u32:A, 5uxz:A, 5uxz:B, 5vnp:A, 5vnp:B, 7wam:A, 7wan:A, 5y2y:A, 5y2y:B, 6y7a:A, 6y7b:A, 6y7b:B, 6y7b:E, 6y7b:C, 6y7b:D, 7zba:A, 7zba:B, 7zbb:A, 7zbb:B, 7zbd:A, 7zbd:B, 6zcc:A, 7ziv:A, 7ziw:A, 7ziw:B, 7zix:A, 7zix:B, 7ziy:A, 7ziy:B, 7ziz:A, 7zj0:A, 7zj0:B, 6zvu:A, 6zvv:A, 6zvv:B, 6zvv:C, 6zvv:D, 6zvw:A, 6zvw:B, 6zvx:A, 6zvy:A, 6zvy:B
5 7bwn:J 280 230 0.9430 0.7679 0.9348 8.62e-159 7bwn:O, 7bwn:C, 7bwn:M, 4gf6:B, 4w74:A, 4w74:B, 4w74:H, 4w74:C, 4w74:D, 4w74:E, 4w76:A, 4w76:B, 4w77:A, 4w77:B, 4w7a:A, 4w7a:B, 4w7c:B, 4w7d:A, 4w7f:A, 4w7r:A, 4w7r:B, 4w7r:C, 4w7r:D
6 6gez:B 532 221 0.9386 0.4023 0.9683 1.21e-155 6gel:A, 6gel:B, 6gez:A
7 6gez:B 532 169 0.6930 0.2970 0.9349 6.83e-110 6gel:A, 6gel:B, 6gez:A
8 6gez:B 532 115 0.2982 0.1278 0.5913 3.24e-30 6gel:A, 6gel:B, 6gez:A
9 4anj:A 995 225 0.9518 0.2181 0.9644 7.47e-155 1jbz:A
10 6quh:B 228 225 0.8246 0.8246 0.8356 1.85e-150 6quh:E, 6qui:B, 6qui:E, 6quj:B, 6quj:E
11 4pa0:A 974 221 0.8904 0.2084 0.9186 1.07e-140 4db1:A, 4db1:B, 8efe:A, 8efh:A, 9f6c:A, 6fsa:A, 6fsa:B, 5n69:A, 5n69:B, 5n6a:A, 8qyu:A
12 3u8p:A 336 188 0.7982 0.5417 0.9681 9.79e-136 3c63:A, 3c63:B, 3c63:C, 3c63:D, 8drj:A, 6dy8:A, 6dy8:B, 6dy8:D, 6dy8:C, 6dyf:A, 6dyf:B, 6dyg:A, 6dyg:B, 6dyh:A, 6dyh:D, 7lr5:C, 7lr5:A, 7lra:C, 7lra:A, 7lrb:A, 7lrb:B, 7lrr:A, 7lrr:B, 7lrv:C, 7lrv:A, 7lv1:C, 7lv1:A, 7lv4:C, 7lv4:A, 7mk4:A, 7mk4:B, 7n4f:C, 7n4f:A, 7n4g:C, 7n4g:A, 3u8p:B, 3u8p:C, 6wyu:A, 6wyu:B, 6wyu:C, 6wz0:A, 6wz0:B, 6wz0:C
13 3u8p:A 336 38 0.1623 0.1101 0.9737 2.46e-17 3c63:A, 3c63:B, 3c63:C, 3c63:D, 8drj:A, 6dy8:A, 6dy8:B, 6dy8:D, 6dy8:C, 6dyf:A, 6dyf:B, 6dyg:A, 6dyg:B, 6dyh:A, 6dyh:D, 7lr5:C, 7lr5:A, 7lra:C, 7lra:A, 7lrb:A, 7lrb:B, 7lrr:A, 7lrr:B, 7lrv:C, 7lrv:A, 7lv1:C, 7lv1:A, 7lv4:C, 7lv4:A, 7mk4:A, 7mk4:B, 7n4f:C, 7n4f:A, 7n4g:C, 7n4g:A, 3u8p:B, 3u8p:C, 6wyu:A, 6wyu:B, 6wyu:C, 6wz0:A, 6wz0:B, 6wz0:C
14 8smu:D 394 188 0.7939 0.4594 0.9628 3.35e-134 8smu:A, 8smu:C, 8smu:B
15 8smu:D 394 40 0.1711 0.0990 0.9750 4.28e-18 8smu:A, 8smu:C, 8smu:B
16 4w75:B 187 212 0.7193 0.8770 0.7736 1.06e-109
17 4pa0:B 920 214 0.7412 0.1837 0.7897 6.13e-103 8qyu:B
18 7vcm:A 371 140 0.6053 0.3720 0.9857 3.49e-100 7pvc:A, 7vcm:B
19 7vcm:A 371 83 0.3377 0.2075 0.9277 1.07e-47 7pvc:A, 7vcm:B
20 6xu4:A 389 142 0.5921 0.3470 0.9507 3.59e-98 6xu4:B, 6xu4:E
21 6xu4:A 389 79 0.3246 0.1902 0.9367 1.41e-45 6xu4:B, 6xu4:E
22 3osq:A 607 141 0.6096 0.2290 0.9858 7.51e-98
23 3osq:A 607 94 0.3596 0.1351 0.8723 2.96e-48
24 3o78:A 402 141 0.5965 0.3383 0.9645 1.18e-97 7aug:A, 3ek4:A, 3ek7:A, 3ek8:A, 3ekh:A, 3evr:A, 3evu:A, 3evv:A, 4ik1:A, 4ik3:A, 4ik4:A, 4ik5:A, 4ik8:A, 4ik9:A, 3o77:A, 3o78:B, 3sg2:A, 3sg3:A, 3sg4:A, 3sg5:A, 3sg6:A, 3sg7:A, 7st4:A, 6tv7:A, 3wlc:A, 3wld:A, 6ya9:A, 6zsm:A, 6zsn:A
25 3o78:A 402 83 0.3421 0.1940 0.9398 1.74e-49 7aug:A, 3ek4:A, 3ek7:A, 3ek8:A, 3ekh:A, 3evr:A, 3evu:A, 3evv:A, 4ik1:A, 4ik3:A, 4ik4:A, 4ik5:A, 4ik8:A, 4ik9:A, 3o77:A, 3o78:B, 3sg2:A, 3sg3:A, 3sg4:A, 3sg5:A, 3sg6:A, 3sg7:A, 7st4:A, 6tv7:A, 3wlc:A, 3wld:A, 6ya9:A, 6zsm:A, 6zsn:A
26 3osr:A 603 141 0.6009 0.2272 0.9716 2.58e-97 3osr:B
27 3osr:A 603 84 0.3421 0.1294 0.9286 8.62e-47 3osr:B
28 6m63:A 359 143 0.5921 0.3760 0.9441 5.36e-97 6m63:B
29 6m63:A 359 82 0.3333 0.2117 0.9268 1.44e-47 6m63:B
30 8ovo:A 503 141 0.5921 0.2684 0.9574 2.15e-95 8ovo:B, 8ovp:A, 8ovp:B, 2vha:A, 2vha:B
31 8ovo:A 503 85 0.3553 0.1610 0.9529 4.81e-51 8ovo:B, 8ovp:A, 8ovp:B, 2vha:A, 2vha:B
32 6wv7:B 388 141 0.5877 0.3454 0.9504 3.13e-95 6wv3:A, 6wv4:A, 6wv5:A, 6wv6:A, 6wv7:A, 6wvh:A, 6wvh:B
33 6wv7:B 388 84 0.3553 0.2088 0.9643 1.06e-51 6wv3:A, 6wv4:A, 6wv5:A, 6wv6:A, 6wv7:A, 6wvh:A, 6wvh:B
34 7e9y:A 563 141 0.5921 0.2398 0.9574 1.20e-94
35 7e9y:A 563 84 0.3333 0.1350 0.9048 3.61e-46
36 6wvb:A 408 139 0.5833 0.3260 0.9568 1.28e-94 6wv8:A
37 6wvb:A 408 84 0.3553 0.1985 0.9643 1.42e-51 6wv8:A
38 6wvf:A 386 139 0.5833 0.3446 0.9568 2.86e-94 3e9j:C, 3e9j:F, 2hi7:B, 2leg:B, 2ltq:A, 2zup:B, 2zuq:A, 2zuq:D
39 6wvf:A 386 84 0.3553 0.2098 0.9643 1.35e-51 3e9j:C, 3e9j:F, 2hi7:B, 2leg:B, 2ltq:A, 2zup:B, 2zuq:A, 2zuq:D
40 7s7t:A 509 141 0.5877 0.2633 0.9504 5.05e-93 8i4o:A, 8i4o:C, 8i4o:E, 8i4o:G, 8i4o:I, 8i4o:K
41 7s7t:A 509 82 0.3509 0.1572 0.9756 1.61e-49 8i4o:A, 8i4o:C, 8i4o:E, 8i4o:G, 8i4o:I, 8i4o:K
42 8xld:A 213 216 0.2939 0.3146 0.3102 1.76e-29 8ill:B
43 4ljb:C 223 139 0.2018 0.2063 0.3309 2.95e-21 4ljb:A, 4ljc:C, 4ljd:A, 4ljd:B, 4ljd:C, 4ljd:D, 3p8u:A, 3p8u:B, 3p8u:D, 3tmr:A, 3tmr:B, 3tmr:C, 3tmr:D, 2vvh:A, 2vvh:B, 2vvh:C, 2vvh:D, 2vvi:A, 2vvi:B, 2vvi:C, 2vvi:D, 2vvj:A, 2vvj:B, 2vvj:C, 2vvj:D
44 4dxp:A 216 140 0.2105 0.2222 0.3429 4.22e-21
45 4q9x:A 213 188 0.2500 0.2676 0.3032 5.10e-21 4r6d:A
46 2vad:A 217 221 0.2544 0.2673 0.2624 1.30e-20
47 7qgk:A 217 185 0.2237 0.2350 0.2757 9.80e-20
48 8hgi:A 220 186 0.2412 0.2500 0.2957 1.50e-18 8hgi:B, 8tjh:A, 8tjh:B
49 2gx2:F 217 188 0.2193 0.2304 0.2660 5.85e-18 2gx2:A, 2gx2:D, 2gx2:H, 2gx2:K, 5hzs:A, 5hzs:B, 5hzs:C, 5hzs:D, 5hzs:E, 5hzs:F, 5hzs:G, 5hzs:H, 5hzs:I, 5hzs:J, 5hzs:K, 5hzs:L, 5hzt:B, 5hzt:C, 5hzt:D, 5hzt:E, 5hzt:F, 5hzt:G, 5hzt:H, 5hzt:I, 5hzt:J, 5hzt:L
50 3u0k:A 397 123 0.1798 0.1033 0.3333 2.02e-17
51 7x2b:A 217 193 0.2105 0.2212 0.2487 1.71e-16
52 1xmz:B 231 128 0.1754 0.1732 0.3125 2.38e-16 1xmz:A
53 1uis:A 224 159 0.1798 0.1830 0.2579 2.33e-15 1uis:B
54 2arl:A 218 185 0.2193 0.2294 0.2703 5.87e-15
55 6u1a:A 220 148 0.1754 0.1818 0.2703 1.48e-14
56 5ukg:A 393 133 0.1623 0.0941 0.2782 2.64e-14 5ukg:B
57 5exc:gg 165 135 0.1579 0.2182 0.2667 2.68e-10 5exc:ee, 5exc:ff, 5exc:hh
58 5hzt:A 192 138 0.1491 0.1771 0.2464 3.04e-10 5hzt:K
59 5mwc:D 275 146 0.1842 0.1527 0.2877 1.12e-08
60 8c0t:A 281 134 0.1798 0.1459 0.3060 2.20e-08
61 4q7r:A 223 215 0.2412 0.2466 0.2558 6.56e-08 8bgl:A, 8bgl:B, 4q7r:B
62 7dna:I 207 114 0.1316 0.1449 0.2632 6.81e-08 7dna:F
63 7dna:I 207 58 0.0877 0.0966 0.3448 0.002 7dna:F
64 4i2y:A 381 128 0.1316 0.0787 0.2344 2.76e-07 4i2y:B
65 6xw2:A 387 126 0.1623 0.0956 0.2937 3.31e-07
66 8osi:A 400 126 0.1623 0.0925 0.2937 4.70e-07
67 5exc:E 59 50 0.0877 0.3390 0.4000 4.16e-04 5exc:F, 5exc:G, 5exc:H
68 1oj7:A 390 74 0.0789 0.0462 0.2432 2.4 1oj7:B, 1oj7:C, 1oj7:D, 4qgs:A
69 6hvn:A 175 53 0.0789 0.1029 0.3396 3.9 8c4j:A, 8c4j:B, 8c4m:A, 8c4n:A, 8c4n:B, 8c4o:A, 8c4o:B, 8c4p:A, 8c4p:B, 8c4r:A, 6hvl:A, 6hvl:B, 6hvm:B, 4rv7:A, 4rv7:B, 4rv7:C, 4rv7:D, 8s45:B, 8s46:B, 8s47:A, 8s47:B, 8s48:B, 8s49:B, 8s4a:A, 8s4a:B, 8s4b:B
70 7n4y:B 2455 56 0.0702 0.0065 0.2857 9.8 7n4y:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218