Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MVPISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALVEICTEMEKEGKISKIGPENPYNTPVFAIKKKDSTKWRKLVDFR
ELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKKKSVTVLDVGDAYFSVPLDEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPA
IFQSSMTKILEPFAAQNPDIVIYQYMDDLYVGSDLEIGQHRTKIEELRQHLLRWGLTTPDKKHQKEPPFLWMGYELHPDK
WTVQPIVLPEKDSWTVNDIQKLVGKLNWASQIYPGIKVRQLSKLLRGTKALTEVIPLTEEAELELAENREILKEPVHGVY
YDPSKDLIAEIQKQGQGQWTYQIYQEPFKNLKTGKYARMRGAHTNDVKQLTEAVQKITTESIVIWGKTPKFKLPIQKETW
ETWWTEYWQATWIPEWEFVNTPPLVKLWYQLEKEPIVGAETFYVDGAANRETKLGKAGYVTNKGRQKVVPLTNTTNQKTE
LQAIYLALQDSGLEVNIVTDSQYALGIIQAQPDKSESELVNQIIEQLIKKEKVYLAWVPAHKGIGGNEQVDKLVSA

The query sequence (length=556) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3kle:A 560 554 0.9820 0.9750 0.9856 0.0 7ahx:A, 7ahx:C, 7aid:A, 7aid:C, 7aif:A, 7aif:C, 7aig:A, 7aig:C, 7aii:A, 7aii:C, 7aij:A, 7aij:C, 6amo:A, 6amo:C, 6an2:A, 6an2:C, 6an8:A, 6an8:C, 6anq:A, 6anq:C, 6aoc:A, 6aoc:C, 6asw:A, 6asw:C, 6avm:A, 6avm:C, 6avt:A, 6avt:C, 4b3o:A, 4b3o:B, 4b3q:A, 4b3q:B, 2b5j:A, 2b6a:A, 2ban:A, 2be2:A, 2be2:B, 3bgr:A, 6bhj:A, 6bhj:C, 6bhj:B, 6bhj:D, 1bqm:A, 1bqn:A, 6bsg:A, 6bsh:A, 6bsi:A, 6bsj:A, 1c0t:A, 1c0u:A, 6c0j:A, 6c0k:A, 6c0l:A, 6c0n:A, 6c0o:A, 6c0p:A, 6c0r:A, 1c1b:A, 1c1c:A, 5c24:A, 5c25:A, 5c42:A, 3c6t:A, 3c6u:A, 6cgf:A, 5cym:A, 5cym:B, 5cyq:A, 5cyq:B, 5d3g:C, 5d3g:A, 5d3g:B, 5d3g:D, 7dbm:A, 7dbm:B, 7dbm:C, 7dbn:A, 7dbn:B, 7dbn:C, 4dg1:A, 4dg1:B, 3di6:A, 3dle:A, 3dlg:A, 3dm2:A, 3dmj:A, 3dok:A, 3dol:A, 3drp:A, 3drr:A, 3drs:A, 1dtq:A, 1dtt:A, 6dtw:A, 6dtx:A, 6duf:A, 6dug:A, 6duh:A, 8dx2:A, 8dx2:B, 8dx3:A, 8dx8:A, 8dxb:A, 8dxe:A, 8dxg:A, 8dxh:A, 8dxi:A, 8dxi:B, 8dxj:A, 8dxk:A, 8dxk:B, 8dxl:A, 8dxl:B, 8dxm:A, 3dya:A, 3e01:A, 6ecl:A, 1eet:A, 6eli:A, 1ep4:A, 8fcc:A, 8fcd:A, 8fce:A, 5fdl:A, 8fe8:A, 3ffi:A, 8ffx:A, 1fk9:A, 1fko:A, 4g1q:A, 4h4m:A, 4h4o:A, 6hak:A, 6hak:C, 6hak:B, 5hbm:A, 5hlf:C, 5hlf:A, 5hlf:B, 5hlf:D, 1hmv:A, 1hmv:C, 1hmv:E, 1hmv:G, 2hmi:A, 1hni:A, 1hnv:A, 2hnz:A, 1hpz:A, 5hp1:A, 5hp1:C, 5hp1:B, 5hp1:D, 1hqu:A, 5hro:A, 5hro:B, 5hro:C, 5hro:D, 1hvu:A, 1hvu:D, 1hvu:G, 1hvu:J, 1hys:A, 3i0r:A, 3i0s:A, 4i2p:A, 4i2q:A, 5i3u:A, 5i3u:C, 5i3u:B, 5i3u:D, 5i42:A, 5i42:C, 5i42:D, 2i5j:A, 2i5j:B, 4i7f:A, 2iaj:A, 2ic3:A, 4icl:A, 4id5:A, 4idk:A, 4ifv:A, 4ifv:B, 4ify:A, 3ig1:A, 4ig0:A, 4ig3:A, 4ig3:B, 1ikv:A, 1ikw:A, 1ikx:A, 1iky:A, 6ik9:A, 6ik9:B, 6ik9:C, 6ika:A, 6ika:B, 6ika:C, 3irx:A, 3is9:A, 3isn:C, 3ith:A, 3ith:C, 5j1e:A, 5j1e:C, 5j2m:A, 5j2n:A, 5j2p:A, 5j2q:A, 1j5o:A, 1jkh:A, 1jla:A, 1jlc:A, 1jlg:A, 1jlq:A, 2jle:A, 2jle:B, 3jsm:A, 3jyt:A, 5k14:A, 3k2p:A, 3k2p:B, 6kdj:A, 6kdj:B, 6kdj:C, 6kdk:A, 6kdk:B, 6kdk:C, 6kdm:A, 6kdm:B, 6kdm:C, 6kdn:A, 6kdn:B, 6kdn:C, 6kdo:A, 6kdo:B, 6kdo:C, 4kfb:A, 3kjv:A, 7kjv:A, 7kjw:A, 7kjx:A, 3kk1:A, 3kk2:A, 3kk3:A, 4kko:A, 1klm:A, 3kle:J, 3kle:E, 3kle:I, 3kle:M, 3klf:A, 3klf:E, 3klf:I, 3klf:M, 3klg:A, 3klg:E, 3klh:A, 4ko0:A, 7krc:A, 7krd:A, 7kre:A, 7krf:A, 4kv8:B, 4kv8:A, 7kwu:A, 3lak:A, 3lal:A, 3lam:A, 3lan:A, 3lp0:A, 3lp1:A, 3lp2:A, 3lp3:A, 3lp3:B, 7lpw:A, 7lpx:A, 7lqu:A, 7lri:A, 7lri:B, 7lri:C, 7lrm:C, 7lrm:A, 7lrm:B, 7lrm:D, 7lrx:C, 7lrx:A, 7lrx:B, 7lrx:D, 7lry:C, 7lry:A, 7lry:B, 7lry:D, 4lsl:A, 4lsn:A, 7lsk:C, 7lsk:A, 7lsk:D, 7lsk:B, 3m8p:A, 3m8q:A, 3mec:A, 3med:A, 3mee:A, 3meg:A, 4mfb:A, 1n5y:A, 1n6q:A, 3nbp:A, 4ncg:A, 4o44:A, 4o4g:A, 6o9e:C, 6o9e:A, 6o9e:B, 6o9e:D, 6oe3:A, 2opp:A, 2opq:A, 2opr:A, 2ops:A, 6or7:A, 6otz:A, 7ot6:C, 7ot6:A, 7ota:C, 7ota:A, 7otk:C, 7otk:A, 7otn:C, 7otn:A, 7otx:C, 7otx:A, 7otz:C, 7otz:A, 6oun:A, 7out:C, 7out:A, 7oxq:A, 7oxq:C, 7oz2:A, 7oz2:C, 7oz5:A, 7oz5:C, 7oz5:B, 7oz5:D, 7ozw:A, 6p1i:A, 6p1x:A, 7p15:A, 7p15:B, 6p2g:A, 4pqu:A, 4pqu:B, 4pqu:C, 4pqu:D, 4puo:A, 4puo:C, 4puo:D, 4pwd:A, 4pwd:C, 4q0b:A, 4q0b:C, 4qag:A, 4qag:B, 3qip:A, 3qlh:A, 3qo9:A, 1r0a:A, 4r5p:A, 4r5p:C, 4r5p:B, 4r5p:D, 1rev:A, 2rf2:A, 2rki:A, 1rt1:A, 1rt2:A, 1rt3:A, 1rt4:A, 1rt5:A, 1rt6:A, 1rt7:A, 1rtd:A, 1rtd:C, 1rth:A, 1rti:A, 4rw4:A, 4rw6:A, 4rw7:A, 4rw8:A, 4rw9:A, 1s1t:A, 1s1v:A, 1s1w:A, 1s6p:A, 1s6q:A, 1s9e:A, 1s9g:A, 7slr:A, 7sls:A, 7snp:A, 7snz:A, 7snz:B, 7so1:A, 7so2:A, 7so3:A, 7so4:A, 8stp:A, 8stq:A, 8str:A, 8sts:C, 8stt:A, 8stt:C, 8stu:A, 8stv:A, 8stv:C, 1suq:A, 1sv5:A, 1t03:A, 1t05:A, 3t19:A, 3t1a:A, 3tam:A, 7taz:A, 5ter:A, 1tkt:A, 1tkx:A, 1tkz:A, 1tl1:A, 1tl3:A, 5tuq:A, 1tv6:A, 1tvr:A, 5tw3:A, 5txl:A, 5txl:C, 5txl:B, 5txl:D, 5txm:A, 5txm:C, 5txm:B, 5txm:D, 5txn:A, 5txn:C, 5txn:B, 5txn:D, 5txo:A, 5txo:C, 5txo:B, 5txo:D, 5txp:A, 5txp:C, 5txp:B, 5txp:D, 7u5z:A, 8u69:A, 8u6a:A, 8u6c:A, 8u6e:A, 8u6f:A, 8u6g:A, 8u6h:A, 8u6i:A, 8u6j:A, 8u6j:B, 8u6k:A, 8u6l:A, 8u6l:B, 8u6m:A, 8u6n:A, 8u6o:A, 8u6p:A, 8u6q:A, 8u6r:A, 8u6s:A, 8u6t:A, 6uir:A, 6uis:A, 6uit:A, 6ujx:A, 6ujy:A, 6ujz:A, 6uk0:A, 6ul5:A, 5uv5:A, 5uv5:C, 1uwb:A, 3v4i:A, 3v4i:C, 3v6d:A, 3v6d:C, 3v81:A, 3v81:C, 2vg5:A, 2vg6:A, 2vg7:A, 5vqq:A, 5vqr:A, 5vqs:A, 5vqt:A, 5vqu:A, 5vqv:A, 5vqw:A, 5vqx:A, 5vqy:A, 5vqz:A, 1vru:A, 6vug:A, 5vz6:A, 6waz:A, 6wb0:A, 6wb1:A, 6wb2:A, 4we1:A, 2wom:A, 2won:A, 6wpf:A, 6wph:A, 6wpj:A, 8x1z:A, 8x1z:B, 8x1z:C, 8x20:A, 8x20:B, 8x20:C, 8x20:D, 8x21:A, 8x21:B, 8x21:C, 8x22:A, 8x22:B, 8x22:C, 6x47:A, 6x49:A, 6x4a:A, 6x4b:A, 6x4c:A, 6x4d:A, 6x4e:A, 6x4f:A, 5xn0:A, 5xn0:B, 5xn0:C, 5xn1:A, 5xn1:B, 5xn1:C, 5xn2:A, 5xn2:B, 5xn2:C, 2ykm:A, 2ykn:A, 2ynf:A, 2yng:A, 2ynh:A, 2yni:A, 7z24:A, 7z29:A, 7z2d:A, 7z2d:B, 7z2e:A, 7z2g:A, 7z2g:B, 7z2h:A, 7z2h:B, 2zd1:A, 2ze2:A
2 8u6b:A 532 555 0.9568 1.0000 0.9586 0.0 6bsg:B, 6bsh:B, 6bsj:B, 1hvu:B, 1hvu:E, 1hvu:H, 1hvu:K, 5j2p:B, 7so3:B, 8u6d:A, 8u6k:B
3 8sts:A 533 554 0.9514 0.9925 0.9549 0.0 4b3p:A, 6bsi:B, 3kk3:B, 1lw2:A, 7so6:A, 8u6h:C, 8u6t:B
4 6or7:B 388 423 0.6942 0.9948 0.9125 0.0
5 8tcl:B 316 271 0.4011 0.7057 0.8229 1.18e-147 8tcm:B
6 8tcl:B 316 99 0.1745 0.3070 0.9798 1.53e-58 8tcm:B
7 7xj4:A 149 139 0.2104 0.7852 0.8417 2.26e-68 3hyf:A, 8jyh:A, 8jyi:A, 8jyj:A, 3qin:A, 3qio:A, 7xis:A, 7xit:A, 7xiu:A, 7xj5:A, 7xj7:A
8 7sr6:A 566 583 0.3058 0.3004 0.2916 1.36e-52 7sr6:F, 7sr6:G
9 8wus:E 453 266 0.1295 0.1589 0.2707 5.71e-19 6b1q:A, 6b1r:A, 6b1s:A, 6b1s:B, 8cs0:A, 1d0e:A, 1d1u:A, 8dw1:A, 8dw8:A, 8dwm:A, 2fjv:A, 2fjw:A, 2fjx:A, 3fsi:A, 2fvp:A, 2fvq:A, 2fvr:A, 2fvs:A, 4hkq:A, 1i6j:A, 4m94:A, 4m95:A, 6mig:A, 6mih:A, 6mik:A, 1n4l:A, 1qai:A, 1qai:B, 1qaj:A, 2r2r:A, 2r2s:A, 2r2t:A, 2r2u:A, 7uyn:A, 7uyo:A, 7uyp:A, 5vbs:A, 8wut:E, 8wuv:E, 4xo0:A, 4xpc:A, 4xpe:A, 8ygj:E, 1ztt:A, 1ztw:A
10 7ksf:A 742 541 0.2536 0.1900 0.2606 5.01e-18
11 7o0g:A 733 614 0.2590 0.1965 0.2345 6.35e-13 7o0h:A, 7o24:A
12 4ol8:F 427 279 0.1187 0.1546 0.2366 6.03e-11 4ol8:A
13 7o0h:B 523 270 0.1169 0.1243 0.2407 7.37e-11
14 4ol8:E 381 402 0.1547 0.2257 0.2139 3.28e-08
15 8r0s:A 470 243 0.1133 0.1340 0.2593 4.30e-08
16 1rdd:A 155 133 0.0701 0.2516 0.2932 0.002 1g15:A, 7vsa:A, 7vsa:B, 7vsb:A, 7vsc:A, 7vsd:A, 7vsd:B, 7vse:A, 7vse:B, 1wse:A, 1wse:B, 1wsf:A, 1wsf:B, 1wsf:D, 1wsg:A, 1wsg:D, 4z0u:A, 4z0u:B
17 2hb5:A 150 103 0.0522 0.1933 0.2816 0.30
18 5djq:B 197 81 0.0396 0.1117 0.2716 1.9 5djq:E, 5djq:H, 5djq:L, 3mk7:B, 3mk7:E, 3mk7:H, 3mk7:L
19 5j14:A 450 47 0.0270 0.0333 0.3191 5.5 5j14:B, 5j7z:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218