BioLiP

>protein
MVKIVTVKTQAYQDQKPGTSGLRKRVKVFQSSANYAENFIQSIISTVEPAQRQEATLVVGGDGRFYMKEAIQLIARIAAA
NGIGRLVIGQNGILSTPAVSCIIRKIKAIGGIILTASHNPRGPNGDFGIKFNISNGGPAPEAITDKIFQISKTIEEYAVC
PDLKVDLGVLGKQQFDLENKFKPFTVEIVDSVEAYATMLRSIFDFSALKELLSGPNRLKIRIDAMHGVVGPYVKKILCEE
LGAPANSAVNCVPLEDFNLTYAADLVETMKSGEHDFGAAFDGDGDRNMILGKHGFFVNPSDSVAVIAANIFSIPYFQQTG
VRGFARSMPTSGALDRVASATKIALYETPTGWKFFGNLMDASKLSLCGEESFGTGSDHIREKDGLWAVLAWLSILATRKQ
SVEDILKDHWQKYGRNFFTRYDYEEVEAEGANKMMKDLEALMFDRSFVGKQFSANDKVYTVEKADNFEYSDPVDGSISRN
QGLRLIFTDGSRIVFRLSGATIRLYIDSYEKDVAKINQDPQVMLAPLISIALKVSQLQERTGRTAPTVIT

The query sequence (length=550) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6sno:A	573	561	0.9218	0.8848	0.9037	0.0	1c47:A, 1c4g:A, 5epc:A, 5epc:B, 5f9c:A, 5jn5:A, 5jn5:B, 3pmg:A, 3pmg:B, 7s0w:A, 6snp:A, 6snq:A, 5tr2:A, 5tr2:B, 6uiq:B, 6uiq:A, 6uo6:A, 6uo6:B, 5vbi:A, 5vbi:B, 5vec:A, 5vec:B, 5vg7:A, 5vg7:B, 5vin:A, 5vin:B
2	7s0w:B	499	537	0.8891	0.9800	0.9106	0.0
3	6y8y:A	572	562	0.6727	0.6469	0.6584	0.0	6y8x:AA, 6y8z:A
4	7p5o:B	558	570	0.5291	0.5215	0.5105	0.0	7p5o:A
5	7pjc:B	553	566	0.5200	0.5172	0.5053	0.0	7pjc:A
6	1kfq:A	571	580	0.5127	0.4939	0.4862	3.00e-173	1kfi:A, 1kfi:B, 1kfq:B
7	4qg5:A	565	577	0.4927	0.4796	0.4697	1.35e-167	4qg5:B, 4qg5:C, 4qg5:D
8	2fuv:A	545	416	0.1964	0.1982	0.2596	5.16e-15	2fuv:B, 3na5:A, 3na5:B, 3olp:A, 3olp:B
9	1wqa:A	455	480	0.2145	0.2593	0.2458	6.32e-14	1wqa:B, 1wqa:C, 1wqa:D
10	4il8:A	459	278	0.1255	0.1503	0.2482	3.74e-07	3bkq:X, 3c04:A, 2fkf:A, 2fkm:X, 2h4l:X, 2h5a:X, 1k2y:X, 1k35:A, 4mrq:A, 1p5d:X, 1p5g:X, 1pcj:X, 1pcm:X, 3rsm:A
11	7ojr:A	445	379	0.1473	0.1820	0.2137	5.40e-06	7oml:A
12	3i3w:A	441	402	0.1709	0.2132	0.2338	7.35e-06	3i3w:B
13	5bmp:A	449	382	0.1636	0.2004	0.2356	1.41e-04	5bmn:A, 5kl0:A, 6mlf:A, 6mlh:A, 6mlw:A, 6mnv:A, 6n1e:A, 6nn1:A, 6nn2:A, 6nnn:A, 6nno:A, 6nnp:A, 6nns:A, 6nnt:A, 6nnu:A, 6nol:A, 6noq:A, 6np8:A, 6npx:A, 6nqe:A, 6nqf:A, 6nqg:A, 6nqh:A
14	3uw2:A	458	308	0.1436	0.1725	0.2565	3.69e-04
15	4hjh:A	467	253	0.1091	0.1285	0.2372	0.003	4hjh:B
16	7sqc:1B	1660	56	0.0364	0.0120	0.3571	0.81
17	7sqc:1C	1700	56	0.0364	0.0118	0.3571	0.81	7sqc:1D
18	6bcu:A	2204	207	0.0891	0.0222	0.2367	1.1	6bcu:B, 6bcx:A, 6bcx:B, 4drh:B, 4drh:E, 4dri:B, 4drj:B, 8er6:B, 8er6:D, 8er6:F, 8er7:B, 8er7:D, 8er7:F, 8era:A, 9f44:A, 9f44:B, 9f45:A, 9f45:B, 1fap:B, 2fap:B, 3fap:B, 4fap:B, 5flc:B, 5flc:F, 5gpg:B, 4jsp:B, 4jsp:A, 4jsv:B, 4jsv:A, 4jsx:B, 4jsx:A, 4jt5:B, 4jt5:A, 4jt6:B, 4jt6:A, 6m4u:B, 6m4u:F, 6m4w:G, 6m4w:H, 6m4w:I, 1nsg:B, 7pe7:B, 7pe7:A, 7pe8:A, 7pe9:A, 7pea:B, 7pea:A, 7peb:A, 7pec:A, 8ppz:B, 7uxc:A, 7uxh:A, 7uxh:C, 5wbh:C, 5wbh:D, 5wbu:B, 5wbu:A, 6zwo:B
19	7kmq:B	754	79	0.0382	0.0279	0.2658	1.3	7kmq:A
20	8rch:A	2036	113	0.0527	0.0142	0.2566	1.4	8rch:B, 8rck:B, 8rcn:B
21	2fsn:B	311	223	0.1073	0.1897	0.2646	2.7	2fsn:A
22	1clv:A	471	86	0.0382	0.0446	0.2442	6.2	1jae:A, 1tmq:A, 1viw:A
23	7ap5:BBB	184	58	0.0345	0.1033	0.3276	7.2	7ap5:DDD, 7ap5:FFF, 7ap5:HHH, 7ap5:JJJ, 7ap5:LLL, 7ap5:NNN, 7ap5:PPP, 5aqd:O, 5aqd:M, 5aqd:N, 5aqd:Q, 5aqd:R, 5aqd:P, 5aqd:U, 5aqd:S, 5aqd:T, 5aqd:W, 5aqd:X, 5aqd:V, 7f86:M, 7f86:N, 7f86:C, 7f86:P, 7f86:G, 7f86:V, 7f86:K, 7f86:I, 7f86:E, 7f86:R, 7f86:T, 7f86:X, 5fvb:O, 5fvb:M, 5fvb:N, 5fvb:Q, 5fvb:R, 5fvb:P, 5fvb:U, 5fvb:S, 5fvb:T, 5fvb:W, 5fvb:X, 5fvb:V, 5nb3:O, 5nb3:M, 5nb3:N, 5nb3:Q, 5nb3:R, 5nb3:P, 5nb3:U, 5nb3:S, 5nb3:T, 5nb3:W, 5nb3:X, 5nb3:V, 5nb4:O, 5nb4:M, 5nb4:N, 5nb4:Q, 5nb4:R, 5nb4:P, 5nb4:U, 5nb4:S, 5nb4:T, 5nb4:W, 5nb4:X, 5nb4:V
24	2qm1:B	325	131	0.0545	0.0923	0.2290	8.4	2qm1:A, 2qm1:C, 2qm1:D

[Back]