MVETEPVQGCRDFPPEAMRCRRHLFDVFHATAKTFGFEEYDAPVLESEELYIRKAGEEITEQMFNFITKGGHRVALRPEM
TPSLARLLLGKGRSLLLPAKWYSIPQCWRYERRREHYQWNMDIVGVKSVSAEVELVCAACWAMRSLGLSSKDVGIKVNSR
KVLQTVVEQAGTSDKFAPVCVIVDKMPREEVEAQLAVVDAITTTLSLKSIDEIAQRVGEEHEAVKELRQFFEQVEAYGYG
DWVLFDASVVRGLAYYTGIVFEGFDREGKFRALCGGGRYDNLLTTYGSPTPIPCAGFGFGDCVIVELLQEKRLLPDIPHV
VDDVVIPFDESMRPHALAVLRRLRDAGRSADIILDKKKVVQAFNYADRVGAVRAVLVAPEEWERGEVQVKMLRGFAVPLD
RLV
The query sequence (length=403) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.
| # | Hit | Hit length |
Aligned length |
Identity (normalized by query) |
Identity (normalized by hit) |
Identity (normalized by aligned length) |
E-value | Homologs to hit |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 4yrc:A | 419 | 418 | 1.0000 | 0.9618 | 0.9641 | 0.0 | 3hrk:A, 3hrk:B, 3lc0:A, 4yp0:A, 4ypf:A, 4yre:A, 4yre:B, 4yrf:A, 4yrg:A, 4yri:A, 4yrj:A, 4yrk:A, 4yrk:B, 4yrl:A, 4yrm:A, 4yrm:B, 4yrn:A, 4yrn:B, 4yro:A, 4yrp:A, 4yrp:B, 4yrq:A, 4yrr:A, 4yrr:B, 4yrs:A, 4yrt:A |
| 2 | 4phc:A | 444 | 418 | 0.2680 | 0.2432 | 0.2584 | 6.07e-34 | 4phc:B, 4phc:C, 4phc:D |
| 3 | 4e51:A | 415 | 428 | 0.2953 | 0.2867 | 0.2780 | 1.94e-21 | 4e51:B |
| 4 | 5e3i:B | 398 | 415 | 0.2481 | 0.2513 | 0.2410 | 1.88e-17 | 5e3i:A |
| 5 | 1adj:A | 420 | 416 | 0.2605 | 0.2500 | 0.2524 | 2.85e-17 | 1adj:B, 1adj:C, 1adj:D, 1ady:A, 1ady:B, 1ady:C, 1ady:D, 4rdx:A |
| 6 | 1kmm:C | 387 | 409 | 0.2457 | 0.2558 | 0.2421 | 5.85e-17 | 2el9:A, 2el9:B, 2el9:C, 2el9:D, 1kmm:A, 1kmn:A, 1kmn:C |
| 7 | 1htt:A | 366 | 400 | 0.2258 | 0.2486 | 0.2275 | 2.29e-16 | 1htt:B, 1htt:C, 1htt:D, 1kmm:B, 1kmm:D, 1kmn:B, 1kmn:D |
| 8 | 1z7m:B | 318 | 269 | 0.1489 | 0.1887 | 0.2230 | 3.73e-09 | 1z7m:D |
| 9 | 6ftt:A | 379 | 338 | 0.1935 | 0.2058 | 0.2308 | 2.46e-07 | 6ftt:C, 6ftt:B, 6ftt:D, 6fu7:B, 6r02:A, 6r02:B, 6r02:C, 6r02:D |
| 10 | 4cs3:A | 270 | 84 | 0.0670 | 0.1000 | 0.3214 | 0.006 | 6aac:A, 6aad:A, 6aan:A, 6aao:A, 6aap:A, 6aaq:A, 6aaz:A, 6ab0:A, 6ab1:A, 6ab2:A, 6ab8:A, 6abk:A, 6abl:A, 6abm:A, 4bw9:A, 4bwa:A, 4ch3:A, 4ch4:A, 4ch5:A, 4ch6:A, 4cs4:A, 5k1p:A, 5k1x:A, 8ke1:A, 8ke2:A, 8ke3:A, 8ke4:A, 8ke5:A, 8ke6:A, 6ly3:A, 6ly6:A, 6ly7:A, 6lya:A, 6lyb:A, 4q6g:A, 2q7e:A, 2q7g:A, 2q7h:A, 3qtc:A, 7rsm:A, 7rsm:B, 7rsm:C, 7rsm:D, 4tqd:A, 4tqf:A, 3vqv:A, 3vqw:A, 3vqx:A, 3vqx:B, 3vqx:C, 3vqx:D, 3vqy:A, 2zce:A, 2zim:A, 2zin:A, 2zio:A, 4zib:A |
| 11 | 3vkh:A | 3042 | 141 | 0.0769 | 0.0102 | 0.2199 | 4.0 | |
| 12 | 3vkg:B | 2853 | 141 | 0.0769 | 0.0109 | 0.2199 | 4.1 | |
| 13 | 3vkg:A | 2954 | 141 | 0.0769 | 0.0105 | 0.2199 | 4.2 | |
| 14 | 3vkh:B | 2908 | 141 | 0.0769 | 0.0107 | 0.2199 | 4.3 | |
| 15 | 3ej2:A | 182 | 40 | 0.0347 | 0.0769 | 0.3500 | 5.2 | 3eiy:A, 3ej0:A |
| 16 | 6edz:C | 723 | 81 | 0.0645 | 0.0360 | 0.3210 | 5.5 | |
| 17 | 6edw:B | 746 | 81 | 0.0645 | 0.0349 | 0.3210 | 5.8 | 6edw:A, 6edw:D, 6edz:A, 6edz:B, 6edz:D, 6ee1:B, 6ee1:D |
| 18 | 6edw:C | 724 | 81 | 0.0645 | 0.0359 | 0.3210 | 6.0 | 6ee1:A, 6ee1:C |
| 19 | 7t3p:A | 2066 | 68 | 0.0447 | 0.0087 | 0.2647 | 6.0 | 7t3p:B, 7t3p:C, 7t3p:D |
umich.edu