BioLiP

>protein
MTVAYIAIGSNLASPLEQVNAALKALGDIPESHILTVSSFYRTPPLGPQDQPDYLNAAVALETSLAPEELLNHTQRIELQ
QGRVRKAERWGPRTLDLDIMLFGNEVINTERLTVPHYDMKNRGFMLWPLFEIAPELVFPDGEMLRQILHTRAFDKLNKW

The query sequence (length=159) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5etl:D	160	159	1.0000	0.9938	1.0000	1.64e-117	6an4:A, 6an6:A, 6an6:B, 1dy3:A, 1eqm:A, 5etk:A, 5etl:A, 5etl:B, 5etl:C, 5etm:A, 5etn:A, 5eto:A, 5etp:A, 1ex8:A, 4f7v:A, 1f9h:A, 1g4c:B, 3hd1:A, 3hd2:A, 1hq2:A, 3hsd:A, 3hsd:B, 3hsg:A, 3ht0:A, 3ilj:A, 3ilo:A, 3ip0:A, 7kdo:A, 7kdr:A, 3kuh:A, 4m5g:A, 4m5h:A, 4m5i:A, 4m5j:A, 4m5k:A, 4m5l:A, 4m5m:A, 4m5n:A, 4m5n:B, 1q0n:A, 1rao:A, 1rb0:A, 1rtz:A, 1ru1:A, 1ru1:B, 1ru2:A, 8sif:A, 1tmj:A, 1tmm:A, 1tmm:B, 3ud5:A, 3ude:A, 3udv:A
2	2qx0:A	159	159	0.6226	0.6226	0.6226	4.56e-70	2qx0:B
3	1cbk:A	160	158	0.5597	0.5563	0.5633	6.84e-64	1cbk:B
4	3qbc:B	161	143	0.3648	0.3602	0.4056	1.05e-32	4ad6:A, 4ad6:B, 4crj:A, 4cwb:A, 4cyu:A, 4cyu:B, 4cyu:C, 4cyu:D, 5etq:A, 5etq:B, 5etr:B, 5etr:A, 5ets:B, 5ets:A, 5ett:B, 5ett:A, 5etv:A, 3qbc:A
5	8sk1:A	162	135	0.3648	0.3580	0.4296	1.41e-32	8sk1:B
6	8sl9:A	422	134	0.3019	0.1137	0.3582	3.65e-22	4pzv:A
7	3mco:A	397	137	0.3019	0.1209	0.3504	4.51e-20	3mcn:B, 3mco:B
8	2bmb:A	513	142	0.2893	0.0897	0.3239	2.67e-16
9	3mcm:A	368	134	0.2642	0.1141	0.3134	6.69e-14	3mcn:A
10	7weg:B	96	24	0.0755	0.1250	0.5000	0.61	7weg:A
11	8jfk:B	1033	34	0.0943	0.0145	0.4412	1.2	8jfk:N, 8jfk:J, 8jfk:F, 8jfl:B, 8jfl:N, 8jfl:F, 8jfl:J, 8xya:B
12	7aor:ae	574	35	0.0818	0.0226	0.3714	1.3
13	8ebu:A	604	89	0.1572	0.0414	0.2809	1.4	8ebt:A, 8ebx:A, 8eby:A
14	7ena:6	652	89	0.1572	0.0383	0.2809	1.4	7ad8:A, 8bvw:0, 8ebs:A, 8ebv:A, 8ebw:A, 7egb:6, 7egc:6, 7enc:6, 8gxq:HH, 8gxs:HH, 5ivw:V, 5iy6:V, 5iy7:V, 5iy8:V, 5iy9:V, 7nvr:7, 7nvv:7, 7nvw:7, 7nvx:7, 7nvy:7, 7nvz:7, 7nw0:7, 6o9l:7, 6ro4:A, 8wak:6, 8wal:6, 8wan:6, 8wao:6, 8wap:6, 8waq:6, 8war:6, 8was:6
15	7lbm:W	574	89	0.1572	0.0436	0.2809	1.5
16	7pc5:A	405	24	0.0755	0.0296	0.5000	2.8
17	7bqo:A	451	147	0.2264	0.0798	0.2449	3.4
18	7sjr:B	802	37	0.0881	0.0175	0.3784	3.9
19	5w5j:B	257	115	0.1950	0.1206	0.2696	4.3	5ar8:A, 5w5j:A
20	6vqw:A	80	58	0.1006	0.2000	0.2759	5.5
21	5xwd:A	611	87	0.1635	0.0426	0.2989	7.2
22	4eyw:B	634	77	0.1258	0.0315	0.2597	8.6	2deb:A, 2deb:B, 4ep9:A, 4eph:A, 4eyw:A, 2fw3:A, 2rcu:A, 2rcu:B

[Back]