BioLiP

>protein
MTPKYEDLRAYYTKPSFEFEKQFGFMLKPWTTVRFMNVIPNRFIYKIALVGKDEKKYKDGPYDNIDVFIVLEDNKYQLKK
YSVGGITKTNSKKVNHKVELSITKKDNQGMISRDVSEYMITKEEISLKELDFKLRKQLIEKHNLYGNMGSGTIVIKMKNG
GKYTFELHKKLQEHRMADVIDGTNIDNIEVNIK

The query sequence (length=193) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5i4d:B	193	193	1.0000	1.0000	1.0000	2.43e-141	5i4d:A
2	4dxg:A	194	193	0.7668	0.7629	0.7668	1.76e-107	4rco:A, 4rco:B
3	4rfb:A	194	190	0.4456	0.4433	0.4526	3.65e-46	4rfb:D, 4rfb:B, 4rfb:C, 4rgt:A, 4rgt:B
4	2rdg:A	192	191	0.4663	0.4688	0.4712	2.02e-44
5	2r61:A	195	190	0.3679	0.3641	0.3737	1.24e-28	2z8l:A
6	5u75:A	144	71	0.1606	0.2153	0.4366	3.58e-07
7	1hqr:D	205	123	0.1865	0.1756	0.2927	1.05e-06
8	1eu4:A	204	95	0.1554	0.1471	0.3158	1.41e-05
9	3ea6:A	215	147	0.2124	0.1907	0.2789	0.003
10	1eu3:A	210	115	0.1917	0.1762	0.3217	0.042	1eu3:B
11	2ici:A	227	71	0.1244	0.1057	0.3380	0.056
12	2xn9:C	215	50	0.0881	0.0791	0.3400	0.16	1ewc:A, 1hxy:D
13	2g9h:D	213	76	0.1192	0.1080	0.3026	0.93
14	6lon:A	804	52	0.0933	0.0224	0.3462	1.1	6lon:B, 6lon:C, 6lon:D
15	5fka:C	221	90	0.1036	0.0905	0.2222	2.7	4udu:C
16	1dyq:A	228	40	0.0777	0.0658	0.3750	3.6	1i4g:A, 1i4h:A, 1i4h:B, 1sxt:A, 1sxt:B
17	2gbp:A	309	40	0.0881	0.0550	0.4250	3.9	2fvy:A, 2fw0:A, 8fxt:A, 3ga5:A, 3ga5:B, 3gbp:A, 1gca:A, 1gcg:A, 1glg:A, 2hph:A, 2ipl:A, 2ipm:A, 2ipn:A, 2qw1:A
18	7fct:B	239	74	0.1140	0.0921	0.2973	4.2	7fct:A
19	1yix:A	265	26	0.0570	0.0415	0.4231	5.7	1yix:B
20	1se3:A	239	63	0.0829	0.0669	0.2540	6.2
21	4v4n:Ak	212	100	0.1347	0.1226	0.2600	6.2	4v6u:Bk
22	5w4l:G	357	76	0.1036	0.0560	0.2632	6.7	6bf4:G, 8dcq:A, 4dko:A, 4dko:C, 4dkp:A, 4dkp:C, 4dkq:A, 4dkr:A, 4dkr:C, 4dku:A, 4dku:B, 4dkv:A, 4dkv:B, 4dvs:A, 4dvs:B, 4dvt:A, 4dvt:B, 4dvv:A, 4dvv:B, 4dvw:A, 4dvw:B, 4dvx:A, 4dvx:B, 8f9z:A, 8fa0:A, 8gcz:A, 8gd0:A, 8gd1:A, 8gd3:A, 8gd5:A, 8gdj:A, 8gdk:A, 8gjt:A, 4i54:A, 4i54:B, 5kjr:G, 4lsq:G, 6mfp:G, 6mfp:A, 6mg7:G, 7n8q:G, 3ngb:G, 3ngb:A, 3ngb:D, 3ngb:I, 6one:A, 6onf:A, 6onh:A, 6onv:A, 6ooo:A, 6p9n:A, 4rfn:G, 4rfn:A, 4rfo:G, 4rz8:A, 4rz8:B, 4rz8:C, 4rz8:D, 3se9:G, 5u6e:A, 5u6e:B, 5uem:G, 6usw:A, 6ut1:A, 5w4l:A, 6w4m:G
23	4y9w:A	327	63	0.0984	0.0581	0.3016	7.1
24	6emu:A	170	29	0.0570	0.0647	0.3793	7.7	6emu:B, 6emu:C, 6emv:A, 6emv:B, 6emv:C
25	6hiv:Cv	1059	39	0.0622	0.0113	0.3077	7.9	6hiw:Cv, 6hiy:Cv, 7pub:Cv
26	1ty2:A	211	106	0.1451	0.1327	0.2642	8.7	1ty2:B, 1ty2:C
27	1ck1:A	239	29	0.0674	0.0544	0.4483	9.3	2aq2:B, 3bvg:A, 3bvm:A, 3bvz:A, 1cqv:A, 1i4p:A, 1i4q:A, 1i4r:A, 1i4x:A, 1ste:A, 1uns:A

[Back]