Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MTKIIKNGTIVTATDTYEAHLLIKDGKIAMIGQNLEEKGAEVIDAKGCYVFPGGIDPHTHLDMPLGGTVTKDDFESGTIA
AAFGGTTTIIDFCLTNKGEPLKKAIETWHNKANGKAVIDYGFHLMISEITDDVLEELPKVLEEEGITSLKVFMAYKNVFQ
ADDGTLYCTLLAAKELGALVMVHAENGDVIDYLTKKALADGNTDPIYHALTRPPELEGEATGRACQLTELAGSQLYVVHV
TCAQAVEKIAEARNKGLDVWGETCPQYLVLDQSYLEKPNFEGAKYVWSPPLREKWHQEVLWNALKNGQLQTLGSDQCSFD
FKGQKELGRGDFTKIPNGGPIIEDRVSILFSEGVKKGRITLNQFVDIVSTRIAKLFGLFPKKGTIVVGSDADLVIFDPNI
ERVISAETHHMAVDYNAFEGMKVTGEPVSVLCRGEFVVRDKQFVGKPGYGQYLKRAKYGT

The query sequence (length=460) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1k1d:A 460 460 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 1k1d:B, 1k1d:C, 1k1d:D, 1k1d:E, 1k1d:F, 1k1d:G, 1k1d:H
2 4kir:A 460 456 0.7413 0.7413 0.7478 0.0 4kir:B, 4kqn:A, 4kqn:B, 1yny:A, 1yny:B
3 3sfw:A 461 459 0.7239 0.7223 0.7255 0.0 3sfw:B
4 1nfg:A 457 458 0.5217 0.5252 0.5240 1.93e-162 1nfg:B, 1nfg:C, 1nfg:D
5 4tqt:D 481 459 0.4696 0.4491 0.4706 1.48e-149 4tqt:A, 4tqt:B, 4tqt:C, 4tqt:E, 4tqt:F
6 3dc8:A 483 458 0.4674 0.4451 0.4694 6.45e-148 3dc8:B
7 5e5c:C 479 460 0.4522 0.4342 0.4522 1.80e-142 6ajd:A, 6ajd:B, 7e3u:A, 7e3u:B, 5e5c:A, 6klk:A, 6klk:B, 8wq9:A, 8wq9:B, 5ykd:A, 5ykd:B, 5ykd:C, 5ykd:D
8 1gkp:A 458 453 0.4478 0.4498 0.4547 1.44e-141 1gkp:B, 1gkp:C, 1gkp:D, 1gkp:E, 1gkp:F, 1gkq:A, 1gkq:B, 1gkq:C, 1gkq:D
9 2ftw:A 484 461 0.4130 0.3926 0.4121 1.54e-116
10 4gz7:A 492 458 0.4152 0.3882 0.4170 3.84e-116 4h00:A, 4h01:A, 4lcq:A, 4lcr:A, 4lcs:A
11 2vr2:A 478 458 0.4196 0.4038 0.4214 1.97e-115
12 4cns:D 479 453 0.3913 0.3758 0.3974 4.16e-108 4cns:A, 4cns:B, 4cns:C
13 2fty:A 532 513 0.3739 0.3233 0.3353 1.31e-88 2fty:B, 2fty:C, 2fty:D, 2fvk:A, 2fvk:B, 2fvk:C, 2fvk:D, 2fvm:A, 2fvm:B, 2fvm:C, 2fvm:D
14 4b92:A 476 452 0.3652 0.3529 0.3717 4.17e-88 4b92:B
15 1gkr:A 451 459 0.3370 0.3437 0.3377 4.31e-64 1gkr:B, 1gkr:C, 1gkr:D
16 8hfd:A 452 458 0.3152 0.3208 0.3166 1.80e-57 3e74:B, 8hfd:B, 8hfd:C, 8hfd:D
17 3e74:A 429 451 0.3087 0.3310 0.3149 5.38e-56 3e74:C, 3e74:D
18 3hm7:B 437 449 0.2848 0.2998 0.2918 3.67e-49 3hm7:A, 3hm7:C, 3hm7:D, 3hm7:E, 3hm7:F
19 3mpg:A 426 452 0.2891 0.3122 0.2942 1.39e-34 3mpg:B, 4yiw:A, 4yiw:B
20 3gri:B 423 443 0.2739 0.2979 0.2844 4.38e-34 3gri:A
21 2z00:A 426 443 0.2543 0.2746 0.2641 8.08e-30
22 4bjh:A 422 453 0.2630 0.2867 0.2671 9.89e-30 3d6n:A
23 6gdd:A 375 449 0.2457 0.3013 0.2517 4.38e-23 6gde:A, 6gdf:A, 1xrf:A, 1xrt:A, 1xrt:B
24 2gwn:A 451 439 0.2261 0.2306 0.2369 3.67e-22
25 7uof:A 423 450 0.2457 0.2671 0.2511 1.43e-21
26 6hg1:A 371 411 0.2130 0.2642 0.2384 2.37e-16 4by3:A, 4c6c:A, 4c6d:A, 4c6e:A, 4c6f:A, 4c6i:A, 4c6j:A, 4c6k:A, 4c6l:A, 4c6m:A, 4c6n:A, 4c6o:A, 4c6p:A, 4c6q:A, 8gvz:A, 8gw0:A, 6hfd:A, 6hfe:A, 6hff:A, 6hfh:A, 6hfi:A, 6hfj:A, 6hfk:A, 6hfl:A, 6hfn:A, 6hfp:A, 6hfq:A, 6hfr:A, 6hfs:A, 6hfu:A, 6hg2:A, 6hg3:A, 8pbe:A, 8pbg:A, 8pbh:A, 8pbi:A, 8pbj:A, 8pbk:A, 8pbm:A, 8pbn:A, 8pbp:A, 8pbq:A, 8pbr:A, 8pbs:A, 8pbt:A, 8pbu:A, 5ynz:A
27 5t5i:A 569 64 0.0565 0.0457 0.4062 7.30e-05 5t5i:I, 5t5m:A, 5t61:A, 5t61:G, 5t61:M, 5t61:S, 5t61:Y, 5t61:e, 5t61:k, 5t61:q
28 5t5i:A 569 88 0.0652 0.0527 0.3409 1.72e-04 5t5i:I, 5t5m:A, 5t61:A, 5t61:G, 5t61:M, 5t61:S, 5t61:Y, 5t61:e, 5t61:k, 5t61:q
29 2vhl:B 393 94 0.0630 0.0738 0.3085 3.21e-04 2vhl:A
30 4v1x:E 474 72 0.0565 0.0549 0.3611 0.003 4v1x:A, 4v1x:B, 4v1x:C, 4v1x:D, 4v1x:F, 4v1y:A, 4v1y:B, 4v1y:C, 4v1y:D, 4v1y:E, 4v1y:F, 4v1y:G, 4v1y:H, 4v1y:I, 4v1y:J, 4v1y:K, 4v1y:L
31 7bkb:G 568 64 0.0565 0.0458 0.4062 0.004 7bkb:g, 7bkc:G, 7bkc:g
32 3gip:A 474 91 0.0674 0.0654 0.3407 0.014 3gip:B, 3giq:A, 3giq:B
33 3gip:A 474 89 0.0565 0.0549 0.2921 0.093 3gip:B, 3giq:A, 3giq:B
34 3qga:C 564 74 0.0522 0.0426 0.3243 0.021 3qga:F, 3qga:I, 3qga:L, 3qga:O, 3qga:R, 3qgk:C, 3qgk:F, 3qgk:I, 3qgk:L, 3qgk:O, 3qgk:R
35 2i9u:A 419 65 0.0500 0.0549 0.3538 0.026 2i9u:B
36 2g3f:A 414 53 0.0500 0.0556 0.4340 0.026 2bb0:A, 2bb0:B, 2g3f:B
37 3icj:A 468 68 0.0500 0.0491 0.3382 0.040
38 5hmd:A 456 45 0.0370 0.0373 0.3778 0.054 5hmd:B, 5hme:A, 5hme:B, 5hmf:A, 5hmf:B, 4lh8:A, 4lh8:B, 3ls9:A, 3ls9:B, 3lsb:A, 3lsb:B, 3lsc:A, 3lsc:B
39 3hpa:A 428 67 0.0500 0.0537 0.3433 0.055 3hpa:B
40 3be7:A 398 44 0.0413 0.0477 0.4318 0.079 3be7:E, 3be7:B, 3be7:D, 3be7:C, 3be7:F, 3be7:G, 3be7:H, 3dug:A, 3dug:B, 3dug:C, 3dug:D, 3dug:E, 3dug:F, 3dug:G, 3dug:H
41 4cqb:A 402 65 0.0478 0.0547 0.3385 0.085 5akq:A, 5akq:B, 4cqb:B, 4cqc:A, 4cqc:B, 4cqd:A, 4cqd:B, 2qt3:A, 2qt3:B
42 3mtw:A 403 44 0.0370 0.0422 0.3864 0.093
43 2vun:A 385 74 0.0587 0.0701 0.3649 0.21 2vun:B, 2vun:C, 2vun:D
44 8je0:A 378 60 0.0522 0.0635 0.4000 0.21 8je0:B, 8je0:C, 8je0:D
45 8a18:CCC 570 74 0.0522 0.0421 0.3243 0.25 5a6t:C, 4ac7:C, 7b58:CCC, 7b59:CCC, 7b5a:CCC, 4ceu:C, 4cex:C, 5fsd:C, 5fse:C, 6g48:C, 6h8j:C, 6i9y:C, 1ie7:C, 5ol4:C, 7p7n:CCC, 7p7o:CCC, 8q2e:C, 6qdy:C, 6rkg:C, 6rp1:C, 1s3t:C, 1ubp:C, 2ubp:C, 3ubp:C, 4ubp:C, 7zcy:C
46 6s6y:A 548 63 0.0413 0.0347 0.3016 0.30 6s6y:E, 6s6y:I, 6s6y:M
47 2gok:A 404 408 0.1978 0.2252 0.2230 0.34 2gok:B, 2puz:A, 2puz:B
48 3nqb:A 587 62 0.0478 0.0375 0.3548 0.34 3nqb:B, 3t81:A, 3t81:B
49 1m7j:A 474 61 0.0435 0.0422 0.3279 0.39 1rjp:A, 1rjq:A, 1rjr:A, 1rk5:A, 1rk6:A, 1v4y:A, 1v51:A
50 3mkv:A 414 42 0.0370 0.0411 0.4048 0.78 3mkv:B, 3mkv:C, 3mkv:D, 3mkv:E, 3mkv:F, 3mkv:G, 3mkv:H
51 7cf6:A 384 121 0.0674 0.0807 0.2562 0.89 7cdh:X, 7cf6:B, 7cf6:C, 7cf6:D
52 7cf6:A 384 82 0.0522 0.0625 0.2927 7.0 7cdh:X, 7cf6:B, 7cf6:C, 7cf6:D
53 4zsi:A 166 96 0.0587 0.1627 0.2812 1.1 4zsi:B, 4zsk:A, 4zsk:B
54 5eqv:A 336 50 0.0391 0.0536 0.3600 1.3
55 3la4:A 837 77 0.0522 0.0287 0.3117 1.3
56 8rd8:XE 62 29 0.0261 0.1935 0.4138 1.3 8rdv:XE, 8rdw:XE
57 7nut:A 401 42 0.0304 0.0349 0.3333 1.6 7nut:B, 7nuu:A, 7nuu:B
58 5vgm:B 342 220 0.1174 0.1579 0.2455 1.7 5vgm:A
59 8d3d:A 1314 112 0.0500 0.0175 0.2054 1.8 8d3c:A, 8d3c:B, 8d3c:C, 8d3c:D, 8d3c:E, 8d3c:F, 8d3c:G, 8d3c:H, 8d3c:I, 8d3c:J, 8d3c:K, 8d3c:L, 8d3c:M, 8d3c:N, 8d3c:O, 8d3c:P, 8d3d:B, 8d3d:C, 8d3d:D, 8d3d:E, 8d3d:F, 8d3d:G, 8d3d:H, 8d3d:I, 8d3d:J, 8d3d:K, 8d3d:L, 8d3d:M, 8d3d:N, 8d3d:O, 8d3d:P, 7f49:A, 3hxo:A, 3hxq:A, 7wn3:A, 7wn3:B, 7wn3:E, 7wn3:G, 7wn4:E, 7wn4:G, 7wn6:A, 7wn6:B, 7wn6:E, 7wn6:G, 7wpp:E, 7wpp:G, 7wpq:A, 7wpq:B, 7wpq:E, 7wpq:G, 7wpr:A, 7wpr:B, 7wpr:E, 7wpr:F, 7wpr:G, 7wpr:H, 7wpr:I, 7wpr:J, 7wpr:K, 7wpr:L, 7wpr:M, 7wpr:N, 7wpr:O, 7wpr:P, 7wpr:Q, 7wpr:R, 7wps:A, 7wps:B, 7wps:E, 7wps:G, 7wps:I, 7wps:K, 7wps:M, 7wps:O, 7wps:Q, 7wps:S, 7wps:U, 7wps:W, 7wps:Y, 7wps:a, 7wqt:A, 7wqt:B, 7wqt:E, 7wqt:F, 7wqt:G, 7wqt:H, 7wqt:I, 7wqt:J, 7wqt:K, 7wqt:L, 7wqt:M, 7wqt:N, 7wqt:O, 7wqt:P, 7wqt:Q, 7wqt:R
60 7pmv:B 1141 112 0.0500 0.0202 0.2054 1.9 7kwo:V, 6n29:A, 6n29:B, 7pmv:A, 7pmv:D, 7pmv:E, 7pnf:B, 7pnf:D, 7wn3:F, 7wn3:H, 7wn3:C, 7wn3:D, 7wn4:F, 7wn4:H, 7wn6:F, 7wn6:H, 7wn6:C, 7wn6:D, 7wpp:F, 7wpp:H, 7wpq:C, 7wpq:D, 7wpq:F, 7wpq:H, 7wpr:a, 7wpr:b, 7wpr:C, 7wpr:c, 7wpr:D, 7wpr:d, 7wpr:e, 7wpr:f, 7wpr:S, 7wpr:T, 7wpr:U, 7wpr:V, 7wpr:W, 7wpr:X, 7wpr:Y, 7wpr:Z, 7wps:Z, 7wps:b, 7wps:C, 7wps:D, 7wps:F, 7wps:H, 7wps:J, 7wps:L, 7wps:N, 7wps:P, 7wps:R, 7wps:T, 7wps:V, 7wps:X, 7wqt:a, 7wqt:b, 7wqt:C, 7wqt:c, 7wqt:D, 7wqt:d, 7wqt:e, 7wqt:f, 7wqt:S, 7wqt:T, 7wqt:U, 7wqt:V, 7wqt:W, 7wqt:X, 7wqt:Y, 7wqt:Z, 7zwh:D, 7zwh:E
61 6nbo:A 390 63 0.0413 0.0487 0.3016 2.0
62 1a5o:C 566 72 0.0500 0.0406 0.3194 2.0 1a5n:C, 1ef2:A, 1ejr:C, 1ejs:C, 1ejt:C, 1eju:C, 1ejv:C, 1fwa:C, 1fwb:C, 1fwc:C, 1fwd:C, 1fwe:C, 1fwf:C, 1fwg:C, 1fwh:C, 1fwi:C, 1fwj:C, 2kau:C, 1krb:C, 1krc:C
63 8wda:A 517 44 0.0370 0.0329 0.3864 2.6 6e3d:A, 6e4d:A, 7jls:A
64 4g7e:B 833 77 0.0522 0.0288 0.3117 3.3
65 1onx:A 389 44 0.0326 0.0386 0.3409 4.1 2aqo:A, 2aqo:B, 2aqv:A, 2aqv:B, 1onw:A, 1onw:B, 1onx:B, 1po9:A, 1po9:B, 1poj:A, 1poj:B, 1pok:B, 1pok:A, 1ybq:A, 1ybq:B
66 4r88:B 413 47 0.0370 0.0412 0.3617 4.4 4r7w:A, 4r7w:B, 4r7w:C, 4r7w:D, 4r7w:E, 4r7w:F, 4r85:A, 4r85:B, 4r85:C, 4r85:D, 4r85:E, 4r85:F, 4r88:A, 4r88:C, 4r88:D, 4r88:E, 4r88:F
67 3q10:A 285 59 0.0326 0.0526 0.2542 4.6 3q10:B, 3q10:C, 3q10:D, 3q12:A, 3q12:B, 3q12:C, 3q12:D
68 1fig:H 216 84 0.0543 0.1157 0.2976 4.7
69 2ics:A 368 58 0.0435 0.0543 0.3448 5.2
70 8dqn:C 388 41 0.0304 0.0361 0.3415 5.3 8dqn:A, 8dqn:B, 8dqn:D, 8dqn:E, 8dqn:F, 8dqn:G, 8dqn:H
71 1pie:A 388 120 0.0761 0.0902 0.2917 5.4
72 2q6h:A 512 94 0.0522 0.0469 0.2553 5.5 2a65:A, 7dii:A, 7dii:B, 7dix:A, 7dix:B, 7dj1:A, 7dj1:B, 7dj2:A, 7dj2:B, 7djc:A, 3f3a:A, 3f3c:A, 3f3d:A, 3f3e:A, 3f48:A, 3f4i:A, 3f4j:A, 8ft4:A, 8ft5:A, 4fxz:A, 4fy0:A, 3gjc:A, 3gjc:B, 3gjd:A, 3gwu:A, 3gwv:A, 3gww:A, 4hmk:A, 4hmk:B, 4hod:A, 7lqj:A, 7lqk:A, 7lql:A, 4mm4:A, 4mm4:B, 4mm5:A, 4mm6:A, 4mm7:A, 4mm8:A, 4mm9:A, 4mma:A, 4mmb:A, 4mmc:A, 4mmd:A, 4mmd:B, 4mme:A, 4mme:B, 4mmf:A, 4mmf:B, 3mpn:A, 3mpq:A, 6nle:A, 2q72:A, 2qb4:A, 2qei:A, 2qju:A, 3qs4:A, 3qs5:A, 3qs6:A, 3tt1:A, 3tt1:B, 3tu0:A, 3usg:A, 3usi:A, 3usi:B, 3usj:A, 3usj:B, 3usk:A, 3usk:B, 3usk:C, 3usk:D, 3usl:A, 3usm:A, 3uso:A, 3uso:B, 3usp:A, 6xwm:A, 6xwm:B
73 7pmk:Q 766 122 0.0652 0.0392 0.2459 6.5 7pmn:Q
74 1ws1:A 151 28 0.0261 0.0795 0.4286 6.9
75 2a68:D 1392 68 0.0413 0.0136 0.2794 7.2 2a68:N, 2a69:D, 2a69:N, 2a6e:D, 2a6e:N, 2a6h:D, 2a6h:N, 2be5:D, 2be5:N, 2cw0:D, 2cw0:N, 1iw7:D, 1iw7:N, 1smy:D, 1smy:N, 1zyr:D, 1zyr:N
76 3dxj:D 1504 68 0.0413 0.0126 0.2794 7.2 6cuu:D, 5d4c:D, 5d4c:N, 5d4d:D, 5d4d:N, 5d4e:D, 5d4e:N, 3dxj:N, 5e17:D, 5e18:D, 7eh0:D, 7eh1:D, 7eh2:D, 7eh2:N, 4g7h:D, 4g7h:N, 4g7o:D, 4g7o:N, 4g7z:D, 4g7z:N, 6kqd:D, 6kqd:N, 6kqe:D, 6kqf:D, 6kqg:D, 6kqh:D, 6kql:D, 6kqm:D, 6kqn:D, 6l74:D, 6lts:D, 7mlb:D, 7mli:D, 7mlj:D, 4oin:D, 4oio:D, 4oip:D, 4oiq:D, 4oir:D, 6ovr:D, 6ovy:D, 6ow3:D, 6oy5:D, 6oy6:D, 6oy7:D, 6p70:D, 6p71:D, 4q4z:D, 4q5s:D, 5tmc:D, 5tmf:D, 5vo8:D, 5voi:D, 8w8n:D, 8w8o:D, 8w8p:D, 3wod:D, 6wox:D, 6woy:D, 5x21:D, 5x22:N, 5xj0:D, 4xln:D, 4xlp:D, 4xlq:D, 4xlr:D, 4xls:D, 1ynj:D, 1ynn:D
77 5x22:D 1438 68 0.0413 0.0132 0.2794 7.6
78 3n2c:A 408 46 0.0326 0.0368 0.3261 7.7 3feq:A, 3feq:B, 3feq:C, 3feq:D, 3feq:E, 3feq:F, 3feq:G, 3feq:H, 3feq:I, 3feq:J, 3feq:K, 3feq:L, 3feq:M, 3feq:N, 3feq:O, 3feq:P, 3n2c:B, 3n2c:C, 3n2c:D, 3n2c:E, 3n2c:F, 3n2c:G, 3n2c:H, 3n2c:I, 3n2c:J, 3n2c:K, 3n2c:L, 3n2c:M, 3n2c:N, 3n2c:O, 3n2c:P
79 4dyk:A 437 46 0.0304 0.0320 0.3043 8.0 4dyk:B, 4gbd:A, 4gbd:B
80 4rdv:B 451 64 0.0413 0.0421 0.2969 9.1 3mdu:A, 3mdw:A, 3mdw:B, 3mdw:C, 3mdw:D, 4rdv:A, 4rdv:C, 4rdv:D, 4rdw:A, 4rzb:A, 4rzb:B
81 1kwo:A 780 180 0.0848 0.0500 0.2167 9.7 1b7t:A, 1dfl:A, 1kqm:A, 1l2o:A
82 2paj:A 421 34 0.0239 0.0261 0.3235 10.0

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218