BioLiP

>protein
MTIQDIQSLAEAHGLLLTDKMNFNEMGIDFKVVFALDTKGQQWLLRIPRRDGMREQIKKEKRILELVKKHLSVEVPDWRI
SSTELVAYPILKDNPVLNLDAETYEIIWNMDKDSPKYITSLAKTLFEIHSIPEKEVRENDLKIMKPSDLRPEIANNLQLV
KSEIGISEQLETRYRKWLDNDVLWADFTQFIHGDLYAGHVLASKDGAVSGVIDWSTAHIDDPAIDFAGHVTLFGEESLKT
LIIEYEKLGGKVWNKLYEQTLERAAASPLMYGLFALETQNESLIVGAKAQLGV

The query sequence (length=293) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7w15:A	294	293	1.0000	0.9966	1.0000	0.0	7w15:B, 7w19:A, 7w19:B, 7w1a:B, 7w1a:A
2	5igi:A	300	276	0.3686	0.3600	0.3913	1.08e-76	5igj:A, 5igp:A, 5igr:A, 5igs:A, 5igt:A
3	5uxa:A	301	295	0.3720	0.3621	0.3695	1.86e-62	5igv:A, 5igw:A, 5igy:A, 5igz:A, 5ih0:A, 5ih1:A, 5iwu:A
4	5uxd:A	300	267	0.3174	0.3100	0.3483	6.40e-54	5uxc:A, 5uxd:B
5	3ham:A	299	199	0.1877	0.1839	0.2764	2.66e-07	4dca:A, 3ham:B, 3hav:A, 3hav:B, 3hav:C, 3uzr:A
6	3tdw:A	302	199	0.1433	0.1391	0.2111	6.34e-05	6ctz:A, 3tdv:A, 3tdv:B
7	4dfb:B	301	113	0.1024	0.0997	0.2655	1.82e-04	5c4k:A, 5c4l:A, 5c4l:B, 6cd7:B, 4dfb:A, 4dfu:A, 4dfu:B, 4dt8:A, 4dt8:B, 4dt9:A, 4dt9:B, 4dta:A, 4dta:B, 4dtb:A, 4dtb:B, 4n57:A, 4n57:B, 3sg8:A, 3sg8:B, 3sg9:A, 3sg9:B
8	8i85:A	280	69	0.0887	0.0929	0.3768	0.016	8i82:A, 8i84:A, 8i86:A, 8i89:A, 8i8g:A, 8i8h:A
9	7f0b:A	282	79	0.0751	0.0780	0.2785	0.15	7f0c:A, 7f0f:A
10	2gcd:A	309	99	0.1058	0.1003	0.3131	1.1	2gcd:B, 1u5q:A, 1u5q:B, 1u5r:A, 1u5r:B
11	3w0s:A	298	54	0.0614	0.0604	0.3333	1.8	3tyk:A, 3w0n:A, 3w0o:A, 3w0p:A, 3w0q:A, 3w0r:A
12	5iqc:A	301	36	0.0375	0.0365	0.3056	2.1	5byl:A, 5byl:B, 5byl:C, 5byl:D, 6c5u:A, 6c5u:B, 6c5u:C, 6c5u:D, 6cav:A, 6cav:B, 6cav:C, 6cav:D, 6cey:A, 6cey:B, 6cey:C, 6cey:D, 6cgd:A, 6cgd:B, 6cgd:C, 6cgd:D, 6cgg:A, 6cgg:B, 6cgg:C, 6cgg:D, 6ch4:A, 6ch4:B, 6ch4:C, 6ch4:D, 5iqa:A, 5iqa:B, 5iqa:C, 5iqa:D, 5iqb:A, 5iqb:B, 5iqb:C, 5iqb:D, 5iqc:B, 5iqc:C, 5iqc:D, 5iqd:A, 5iqd:B, 5iqd:C, 5iqd:D, 5iqe:A, 5iqe:B, 5iqe:C, 5iqe:D, 5iqf:A, 5iqf:B, 5iqf:C, 5iqf:D, 5iqg:A, 5iqg:B, 5iqg:C, 5iqg:D, 5iqh:A, 5iqh:B, 5iqh:C, 5iqh:D, 5iqi:A, 5iqi:B, 5iqi:C, 5iqi:D, 4ork:A, 4ork:B, 4ork:C, 4ork:D
13	3dbx:A	279	36	0.0478	0.0502	0.3889	3.4
14	6bdn:A	307	100	0.0956	0.0912	0.2800	3.5
15	1p9b:A	424	77	0.0614	0.0425	0.2338	3.7
16	6cjs:A	218	51	0.0648	0.0872	0.3725	5.0	6cjj:A, 6cjl:A, 6cjl:B, 6cjp:A, 6cjr:A
17	4zo6:B	724	75	0.0751	0.0304	0.2933	5.5	4zo6:A, 4zo7:B, 4zo7:A, 4zo8:A, 4zo8:B, 4zo9:A, 4zo9:B, 4zoa:A, 4zoa:B, 4zob:A, 4zob:B, 4zoc:A, 4zoc:B, 4zod:A, 4zod:B, 4zoe:A, 4zoe:B
18	2bdg:A	223	58	0.0580	0.0762	0.2931	5.7	2bdg:B, 2bdh:A, 2bdh:B, 2bdh:C, 2bdh:D, 2bdi:A, 2bdi:B, 2bdi:C, 2bdi:D, 2bdi:E, 2bdi:F, 2bdi:G, 2bdi:H, 2bdi:I, 2bdi:J, 2bdi:K, 2bdi:L, 2bdi:M, 2bdi:N, 2bdi:O, 2bdi:P, 4k1e:A, 4k8y:A, 4kel:A, 4kga:A, 4kga:B, 6o21:A
19	4u94:A	451	41	0.0546	0.0355	0.3902	6.3	4u98:A, 4wzy:A
20	6cjp:B	185	51	0.0648	0.1027	0.3725	6.4
21	6wpi:A	548	39	0.0375	0.0201	0.2821	7.8	5wty:A, 5wty:B
22	6z1q:BBB	337	60	0.0580	0.0504	0.2833	8.6	4dn5:A, 4dn5:B, 4g3d:A, 4g3d:D, 4idt:A, 4idt:B, 4idv:A, 4idv:B, 4idv:C, 4idv:D, 6wpp:A, 6wpp:B, 8yhw:A, 8yhw:B, 8yhw:C, 8yhw:D, 6z1q:AAA, 6z1t:AAA, 6z1t:BBB
23	2agw:B	361	32	0.0341	0.0277	0.3125	8.6	2agw:A, 2agx:B, 2agx:A, 2agy:B, 2agz:B, 2agz:A, 2ah0:B, 2ah0:A, 2hj4:B, 2hj4:A, 2hjb:B, 2hjb:A, 2hkr:B, 2hkr:A, 2iuq:A, 2iuq:B, 2oiz:A, 2ojy:A, 2q7q:B, 2q7q:A
24	2b0q:A	263	41	0.0580	0.0646	0.4146	8.8	2bkk:A, 2bkk:C, 1j7l:A, 1j7l:B, 1j7u:A, 1j7u:B, 1l8t:A, 3q2j:A, 3q2j:B, 3tm0:A
25	2cg9:B	618	51	0.0614	0.0291	0.3529	9.4	1a4h:A, 1am1:A, 1amw:A, 4as9:A, 4asa:A, 4asb:A, 4asf:A, 4asg:A, 1bgq:A, 2brc:A, 2bre:A, 2bre:B, 3c11:A, 4ce1:A, 4ce2:A, 4ce3:A, 2cg9:A, 2cgf:A, 2fxs:A, 2iws:A, 2iwu:A, 2iwx:A, 8oxu:B, 8oxu:C, 2vw5:A, 2vw5:B, 2vw5:C, 2vw5:D, 2vwc:A, 2wep:A, 2weq:A, 2wer:A, 2wer:B, 2xd6:A, 6xlc:A, 6xlc:B, 6xld:A, 6xld:B, 6xle:A, 6xle:B, 6xlf:A, 6xlf:B, 6xlg:A, 6xlg:B, 6xlh:A, 6xlh:B, 2xx2:A, 2xx2:B, 2xx2:C, 2xx2:D, 2xx4:A, 2xx5:A, 2yga:A, 2yge:A, 2ygf:A, 1zw9:A, 1zwh:A

[Back]