BioLiP

>protein
MSWRHIRAEGLDSSYTVLFGKAEADEIFQELEKEVEYFTGALARVQVFGKWHSVPRKQATYGDAGLTYTFSGLTLSPKPW
IPVLERIRDHVSGVTGQTFNFVLINRYKDGSDHICEHRDDERELAPGSPIASVSFGASRDFVFRHKDSRGKSPSRRVAVV
RLPLAHGSLLMMNHPTNTHWYHSLPVRKKVLAPRVNLTFRKILL

The query sequence (length=204) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3h8o:A	206	203	0.9853	0.9757	0.9901	4.17e-149	3btx:A, 3bty:A, 3btz:A, 3bu0:A, 3buc:A, 3h8r:A, 3h8x:A, 4mg2:A, 4mgt:A, 3rzg:A, 3rzh:A, 3rzj:A, 3rzk:A, 3rzl:A, 3rzl:D, 3rzm:A, 3s57:A, 3s5a:A
2	8jnr:A	211	182	0.3431	0.3318	0.3846	5.75e-33	2iuw:A, 8jnk:A, 8jnk:C, 8jnk:E, 8jnk:G, 8jnr:E, 8jnr:D
3	8jnr:C	184	154	0.3039	0.3370	0.4026	6.92e-27
4	5ylb:A	187	92	0.1373	0.1497	0.3043	5.88e-04	5yl6:A
5	4ie6:A	447	93	0.1275	0.0582	0.2796	0.80	6aej:A, 6ak4:A, 6akw:A, 7ckk:A, 4cxw:A, 4cxx:A, 4cxy:A, 5dab:A, 7e8z:A, 5f8p:A, 4ie0:A, 4ie4:A, 4ie5:A, 4ie7:A, 8it9:A, 3lfm:A, 4qho:A, 4qkn:A, 7wcv:A, 4zs2:A, 4zs3:A
6	5zmd:G	403	93	0.1275	0.0645	0.2796	0.87	5zmd:A, 5zmd:C, 5zmd:E
7	7xya:F	302	41	0.0735	0.0497	0.3659	1.1
8	5zve:B	384	83	0.1176	0.0625	0.2892	2.2	5zve:A, 5zvg:B, 5zvg:A, 5zvh:B, 5zvh:A
9	3j5s:D	554	23	0.0539	0.0199	0.4783	7.0
10	3fg3:A	687	75	0.1029	0.0306	0.2800	7.7	3fg1:A, 3fg1:B, 3fg1:C, 3fg1:D, 3fg3:B, 3fg3:C, 3fg3:D, 3fg4:A, 3fg4:B, 3fg4:C, 3fg4:D, 2fnq:A, 2fnq:B, 4qwt:A, 4qwt:B, 4qwt:C, 4qwt:D
11	6khu:A	131	102	0.1225	0.1908	0.2451	8.4
12	2c7j:A	162	33	0.0784	0.0988	0.4848	8.7	2c7k:A, 2c7l:A, 2j96:A, 2j96:B
13	6nf0:A	298	35	0.0735	0.0503	0.4286	9.7	6bt2:A

[Back]