BioLiP

>protein
MSTPAAEQRKLVEQLMHDPKICKSYLVGECPYDLFQGTKQSLGKCPQMHLTKHKIQYEREVKQGKTFPEFEREYLAILSR
FVNECNGQISVALQNLKHQKLQVCEVCGAYLSRLDTDRRLADHFLGKIHLGYVKMREDYDRLMKNNR

The query sequence (length=147) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6n7r:I	147	147	1.0000	1.0000	1.0000	9.67e-110
2	5zwn:Y	196	197	0.9660	0.7245	0.7208	3.81e-94	6n7p:I, 7oqc:H, 7oqe:H
3	6g90:H	158	165	0.6735	0.6266	0.6000	3.71e-66
4	2e1a:A	75	68	0.1293	0.2533	0.2794	0.45	2e1a:B, 2e1a:C, 2e1a:D, 2z4p:B, 2z4p:C, 2z4p:A, 2z4p:D
5	4fyg:A	743	75	0.1633	0.0323	0.3200	0.67	4fye:A, 4fyf:A
6	6kyl:D	160	90	0.1429	0.1313	0.2333	0.73	6kyl:B
7	4ufc:B	788	31	0.1020	0.0190	0.4839	2.5	4ufc:A
8	8uej:AA	122	53	0.0884	0.1066	0.2453	3.7	8uej:AB, 8uej:AC, 8uej:AG, 8uej:AN, 8uej:AS, 8uej:AT, 8uej:AU, 8uej:AZ, 8uej:BE, 8uej:BG, 8uej:BK, 8uej:BL, 8uej:BM, 8uej:BQ, 8uej:BW, 8uej:BX, 8uej:BY, 8uej:CC, 8uej:CE, 8uej:CI, 8uej:CK, 8uej:CP, 8uej:CU, 8uej:CW, 8uej:DN, 8uej:DS, 8uej:DT, 8uej:DY, 8uej:EA, 8uej:EF, 8uej:EK, 8uej:EL, 8uej:EM, 8uej:EQ, 8uej:ER, 8uej:ES, 8uej:EW, 8uej:EX, 8uej:EY, 8uej:FC, 8uej:FD, 8uej:FJ, 8uej:FK, 8uej:FO, 8uej:FP, 8uej:FQ, 8uej:FU, 8uej:FW, 8uej:GB, 8uej:GG, 8uej:GN, 8uej:GO, 8uej:JS, 8uej:GS, 8uej:GT, 8uej:GU, 8uej:HC, 8uej:HD, 8uej:HE, 8uej:HI, 8uej:HJ, 8uej:HK, 8uej:HO, 8uej:HP, 8uej:HQ, 8uej:HU, 8uej:HW, 8uej:IA, 8uej:IB, 8uej:IC, 8uej:IH, 8uej:II, 8uej:IM, 8uej:IN, 8uej:IT, 8uej:IY, 8uej:IZ, 8uej:JA, 8uej:KE, 8uej:JF, 8uej:JG, 8uej:JK, 8uej:JL, 8uej:JM, 8uej:JQ, 8uej:JR, 8uej:JW, 8uej:KC, 8uej:KD, 8uej:LB, 8uej:KJ, 8uej:KK, 8uej:KO, 8uej:KQ, 8uej:KV, 8uej:LA, 8uej:LG, 8uej:LH, 8uej:LI, 8uej:LM, 8uej:LN, 8uej:LO, 8uej:LS, 8uej:LU, 8uej:LY, 8uej:LZ, 8uej:MA, 8uej:ME, 8uej:MG, 8uej:MK, 8uej:ML, 8uej:MM, 8uej:MR, 8uej:MS, 8uej:NA, 8uej:NN, 2w4y:A, 2w4y:B, 2w4y:C, 2w4z:A, 2w4z:B, 2w4z:C
9	1e8w:A	851	51	0.1020	0.0176	0.2941	5.2	2a5u:A, 4anu:A, 4anw:A, 4anx:A, 4aof:A, 3apc:A, 3apd:A, 3apf:A, 6aud:A, 6c1s:A, 2chw:A, 2chx:A, 2chz:A, 3csf:A, 3cst:A, 3dbs:A, 4dk5:A, 3dpd:A, 1e7v:A, 1e8x:A, 1e8z:A, 1e90:A, 5eds:A, 3ene:A, 4ezj:A, 4ezk:A, 4ezl:A, 4f1s:A, 4fa6:A, 4fad:A, 4fjy:A, 4fjz:A, 4flh:A, 4ful:A, 4g11:A, 5g2n:A, 5g55:A, 4gb9:A, 4hle:A, 4j6i:A, 7jwz:A, 5kae:A, 7kke:A, 4kz0:A, 3l08:A, 3l13:A, 3l16:A, 3l17:A, 3l54:A, 3ml8:A, 3ml9:A, 3nzs:A, 3oaw:A, 5oq4:A, 3pre:A, 3prz:A, 3ps6:A, 4ps3:A, 4ps7:A, 4ps8:A, 3qaq:A, 3qar:A, 3r7q:A, 3r7r:A, 3s2a:A, 8sc8:A, 3t8m:A, 3tjp:A, 3tl5:A, 4urk:A, 2v4l:A, 4wwn:A, 6xrl:A, 4xx5:A, 4xz4:A, 7z61:A
10	1e7u:A	872	27	0.0816	0.0138	0.4444	5.5	4anv:A, 3ibe:A
11	8sod:A	941	27	0.0816	0.0128	0.4444	6.2	8soe:A
12	8sob:A	1005	27	0.0816	0.0119	0.4444	6.5	8soa:A, 8soc:A

[Back]