BioLiP

>protein
MSSFEGQMAEYPTISIDRFDRENLRARAYFLSHCHKDHMKGLRAPTLKRRLECSLKVYLYCSPVTKELLLTSPKYRFWKK
RIISIEIETPTQISLVDEASGEKEEIVVTLLPAGHCPGSVMFLFQGNNGTVLYTGDFRLAQGEAARMELLHSGGRVKDIQ
SVYLDTTFCDPRFYQIPSREECLSGVLELVRSWITRSPYHVVWLNCKAAYGYEYLFTNLSEELGVQVHVNKLDMFRNMPE
ILHHLTTDRNTQIHACRHPKAEEYFQWSKLPCGITSRNRIPLHIISIKPSTMWFGERSRKTNVIVRTGESSYRACFSFHS
SYSEIKDFLSYLCPVNAYPNVIPVGTTMDKVVEILKPLCRSSQSTEPKYKPLGKLKRARTVHRDSEEEDDYLFDDPLPIP
LRHKVP

The query sequence (length=406) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7sgl:D	406	406	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	7abs:A, 7af1:A, 7afs:A, 7afu:A, 7agi:A, 7apv:A, 6tt5:AAA, 6wnl:A, 6wnl:B, 6wo0:A
2	7a1f:L	335	355	0.2586	0.3134	0.2958	7.98e-28	7a1f:A, 5aho:A
3	8c8b:A	341	351	0.2537	0.3021	0.2934	1.22e-21	5ahr:A, 4b87:A, 8c8d:A, 8c8s:A, 8cew:A, 8cf0:A, 8cg9:A, 5nzw:A, 5nzx:A, 5nzy:A, 5q1j:A, 5q1k:A, 5q1l:A, 5q1m:A, 5q1n:A, 5q1o:A, 5q1p:A, 5q1q:A, 5q1r:A, 5q1s:A, 5q1t:A, 5q1u:A, 5q1v:A, 5q1w:A, 5q1x:A, 5q1y:A, 5q1z:A, 5q20:A, 5q22:A, 5q23:A, 5q24:A, 5q25:A, 5q26:A, 5q27:A, 5q28:A, 5q29:A
4	7ev5:A	209	132	0.0985	0.1914	0.3030	0.040
5	3tzw:A	467	65	0.0542	0.0471	0.3385	0.078	3tzx:B, 3tzx:A, 3tzy:B, 3tzy:A, 3tzz:B, 3tzz:A
6	8gyg:B	305	143	0.0961	0.1279	0.2727	0.27	8gyg:A
7	8rbx:k	552	71	0.0394	0.0290	0.2254	0.43	7pks:k, 8rbz:k
8	7ycx:K	590	71	0.0394	0.0271	0.2254	0.44	7cun:K, 8r22:C, 8r23:C, 8r2d:C, 8rc4:k, 8uib:K
9	7sn8:K	588	115	0.0616	0.0425	0.2174	0.57	8uic:K
10	4xww:A	545	183	0.0961	0.0716	0.2131	0.57	4xwt:A, 4xwt:B, 4xww:B
11	7l0b:A	202	136	0.0887	0.1782	0.2647	0.58	7l0b:B, 7l0b:C, 7l0b:D
12	8yhe:H	524	122	0.0887	0.0687	0.2951	0.83	8yhd:H
13	6i1d:A	458	133	0.0862	0.0764	0.2632	0.84
14	3a4y:A	431	25	0.0296	0.0278	0.4800	0.99	3a4y:B, 3a4y:C, 3a4y:D, 2dkf:A, 2dkf:B, 2dkf:C, 2dkf:D, 3idz:A, 3idz:B, 3idz:C, 3idz:D, 3ie0:A, 3ie0:B, 3ie0:C, 3ie0:D, 3ie1:A, 3ie1:B, 3ie1:C, 3ie1:D, 3ie2:A, 3ie2:B, 3ie2:C, 3ie2:D, 3iek:A, 3iek:B, 3iek:C, 3iek:D, 3iel:A, 3iel:B, 3iel:C, 3iel:D, 3iem:A, 3iem:B, 3iem:D, 3iem:C
15	2i7t:A	404	118	0.0788	0.0792	0.2712	1.2
16	2i7v:A	433	118	0.0788	0.0739	0.2712	1.2	8t1q:A, 8t1r:A
17	3v00:C	353	133	0.0788	0.0907	0.2406	1.5	1fqj:A, 1fqj:D, 1fqk:A, 1fqk:C, 1got:A, 7jsn:E, 7jsn:F, 1tad:A, 1tad:B, 1tad:C, 1tag:A, 1tnd:A, 1tnd:B, 1tnd:C, 3v00:B, 3v00:A
18	4dnr:A	1031	74	0.0443	0.0175	0.2432	1.9	3k0i:A, 7kf6:A, 7kf6:B, 7kf6:C, 7kf7:B, 7kf8:B, 7kf8:C, 3t53:A
19	3d36:B	221	59	0.0394	0.0724	0.2712	1.9	3d36:A
20	8cuy:A	1016	44	0.0394	0.0157	0.3636	2.0
21	6v4x:H	499	25	0.0296	0.0240	0.4800	2.1	6m8q:A, 6m8q:B
22	2az4:B	426	115	0.0813	0.0775	0.2870	2.6	2az4:A
23	8bmw:N	251	94	0.0665	0.1076	0.2872	3.0
24	6udj:O	108	63	0.0493	0.1852	0.3175	3.1	6udj:I, 6udj:E
25	6q55:A	461	25	0.0296	0.0260	0.4800	4.1	6q5a:A
26	7w1y:F	643	84	0.0542	0.0342	0.2619	5.1	7w1y:7
27	6x6x:A	417	117	0.0665	0.0647	0.2308	5.5	2wn6:A, 2wn7:A, 6x6r:A, 6x6r:B, 6x6v:A, 6x6v:B, 6x6v:C, 6x6v:D, 6x6x:B
28	5a0t:A	454	193	0.1182	0.1057	0.2487	5.7	5a0t:B, 5a0v:A, 5a0v:B
29	2vfr:A	418	59	0.0419	0.0407	0.2881	7.6	2vfs:A, 2vft:A, 2vfu:A, 2vfv:A
30	5ikf:A	150	37	0.0296	0.0800	0.3243	7.8
31	1xcj:A	229	54	0.0394	0.0699	0.2963	8.1	1khh:A, 1khh:B, 1p1b:A, 1p1b:B, 1p1b:C, 1p1b:D, 1p1c:A, 1p1c:B, 1xcl:A
32	4ad9:A	288	34	0.0320	0.0451	0.3824	8.7	4ad9:B, 4ad9:C, 4ad9:D, 4ad9:E, 4ad9:F
33	4h03:A	414	109	0.0567	0.0556	0.2110	8.9	3buz:A, 1giq:A, 1giq:B, 1gir:A, 4h0t:A, 4h0v:A, 4h0x:A, 4h0y:A

[Back]