BioLiP

>protein
MSSAPLRVYVQCNPLLDVSAHVSDEFLVKYGLERGTAILLSERQKGIFDDIEKMPNVRYVPGGSGLNVARVAQWMQQAYK
GKFVTYVGCIADDRYGKVLKEAAEHEGIVMAVEHTTKAGSGACAVCITGKERTLVADLGAANHLSSEHMRSPAVVRAMDE
SRIFYFSGFTLTVDVNHVLQACRKAREVDGLFMINLSAPFIMQFFSAQLGEVLPYTDIIVANRHEAKEFANMMKWDTDCV
EEIARRAVSEVPYTGTKGRVVVFTRDIESTVLATKDGVETVPVPQLDQDKVIDMNGAGDAFMGGFLSAYAVGKDLRRCCE
TGHYTAQEVIQRDGCSFPEKPSFSP

The query sequence (length=345) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4n09:A	345	345	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	4n09:B, 4n09:C, 4n09:D, 3otx:A, 3otx:B, 2xtb:A
2	2i6a:A	343	333	0.3942	0.3965	0.4084	3.76e-84	1bx4:A, 2i6a:B, 2i6a:C, 2i6a:D, 2i6b:A, 2i6b:B, 5kb5:A, 5kb6:A, 5kb6:B, 4o1l:A, 4o1l:B
3	3loo:B	341	333	0.3449	0.3490	0.3574	1.07e-76	3loo:A, 3loo:C
4	3uq6:A	345	343	0.3101	0.3101	0.3120	3.79e-52	4dc3:A, 4dc3:B, 3uq6:B, 3uq9:A, 3uq9:B, 3vaq:A, 3vaq:B, 3vas:A, 3vas:B
5	2a9y:A	351	355	0.3391	0.3333	0.3296	9.76e-46	2a9z:A, 2aa0:A, 2ab8:A, 2abs:A, 1dgm:A, 1lii:A, 1lij:A, 1lik:A
6	2c49:A	299	133	0.1188	0.1371	0.3083	3.59e-14	2c49:B
7	3ubo:A	338	333	0.2464	0.2515	0.2553	9.83e-14	3ubo:B
8	4k8p:A	332	334	0.2290	0.2380	0.2365	3.41e-11	4e3a:A, 4e3a:B, 4jks:A, 4jks:B, 4jku:A, 4jku:B, 4k8c:A, 4k8c:B, 4k8k:A, 4k8k:B, 4k8p:B, 4k8t:A, 4k8t:B, 4k93:A, 4k93:B, 4k9c:A, 4k9c:B, 4k9i:A, 4k9i:B, 4kad:A, 4kad:B, 4kah:A, 4kah:B, 4kal:A, 4kal:B, 4kan:A, 4kan:B, 4kbe:A, 4kbe:B, 4lbg:A, 4lbg:B, 4lbx:A, 4lbx:B, 4lc4:A, 4lc4:B, 4lca:A, 4lca:B
9	1tz3:A	299	261	0.1768	0.2040	0.2337	1.84e-07	1tz6:A, 1tz6:B
10	6a8a:A	327	294	0.2203	0.2324	0.2585	7.21e-07	6a8a:B, 6a8b:A, 6a8b:B, 6a8c:A, 6a8c:B, 5zwy:A, 5zwy:B
11	8cqx:A	300	288	0.2029	0.2333	0.2431	5.39e-06	8cqx:B, 8cqx:C, 8cqx:D, 6znx:A, 6znx:B, 6znx:D
12	6ils:B	313	321	0.2029	0.2236	0.2181	4.95e-05	6ils:A, 6ilt:A, 6ilt:B
13	3in1:A	312	118	0.1101	0.1218	0.3220	5.75e-05	3in1:B
14	4xck:A	306	257	0.1710	0.1928	0.2296	6.64e-05	4xck:B, 4xck:C, 4xck:D, 4xda:A, 4xda:B, 4xda:C, 4xda:D
15	3b1n:B	320	123	0.1043	0.1125	0.2927	1.10e-04	3b1n:A, 3b1p:A, 3b1q:A, 3b1q:B, 3b1q:C, 3b1q:D, 3b1q:E, 3b1q:F, 3b1r:A, 3b1r:B, 3b1r:C, 3b1r:D, 3b1r:E, 3b1r:F
16	5c41:A	317	289	0.1913	0.2082	0.2284	4.47e-04	5byf:A, 5byf:B, 5c3y:A, 5c3y:B, 5c3y:C, 5c3y:D, 5c3y:E, 5c3y:F, 5c3y:G, 5c3y:H, 5c3y:I, 5c3y:J, 5c3y:K, 5c3y:L, 5c3z:A, 5c3z:B, 5c40:A, 5c40:B, 5c41:B, 5c41:C, 5c41:D, 2fv7:A, 2fv7:B, 6wjz:A, 6wjz:B, 6wk0:A, 6wk0:B, 6wk0:C, 6wk0:D
17	3lki:B	322	239	0.1652	0.1770	0.2385	0.003
18	1gqt:B	307	284	0.2000	0.2248	0.2430	0.007	1gqt:A, 1gqt:C, 1gqt:D, 1rk2:A, 1rk2:B, 1rk2:C, 1rk2:D, 1rkd:A, 1rks:A
19	6wb7:A	296	32	0.0464	0.0541	0.5000	0.011	6wb7:B, 6wb7:C, 6wb7:D
20	3kd6:A	300	114	0.0899	0.1033	0.2719	0.089	3kd6:B
21	6c9r:A	337	53	0.0551	0.0564	0.3585	0.11	6c67:A, 6c67:B, 6c9n:A, 6c9n:B, 6c9p:A, 6c9p:B, 6c9q:A, 6c9r:B, 6c9s:A, 6c9s:B, 6c9v:A, 6c9v:B, 4o1g:A, 2pkk:A, 2pkm:A, 2pkn:A, 4pvv:A, 4ube:A
22	1id0:A	146	74	0.0783	0.1849	0.3649	0.20
23	7d8g:A	174	156	0.1072	0.2126	0.2372	0.23	7d8i:A, 7d8l:A, 7d8q:A
24	6ety:A	696	165	0.1159	0.0575	0.2424	0.25	7bfz:A, 3bhx:A, 3bi0:A, 3bi1:A, 8bo8:A, 8bol:A, 8bow:A, 3bxm:A, 2c6c:A, 2c6g:A, 2c6p:A, 2cij:A, 5d29:A, 3d7d:A, 3d7f:A, 3d7g:A, 3d7h:A, 5ely:A, 6ez9:A, 5f09:A, 6f5l:A, 6fe5:A, 6h7y:A, 6h7z:A, 6hkj:A, 6hkz:A, 3iww:A, 2jbj:A, 2jbk:A, 4jyw:A, 4jz0:A, 4lqg:A, 4mcp:A, 4mcq:A, 4mcr:A, 4mcs:A, 4ngm:A, 4ngn:A, 4ngp:A, 4ngq:A, 4ngr:A, 4ngs:A, 4ngt:A, 5o5r:A, 5o5t:A, 5o5u:A, 4oc0:A, 4oc1:A, 4oc2:A, 4oc3:A, 4oc4:A, 4oc5:A, 5of0:A, 4ome:A, 2oot:A, 2or4:A, 4p44:A, 4p45:A, 4p4b:A, 4p4d:A, 4p4e:A, 4p4f:A, 4p4i:A, 4p4j:A, 2pvv:A, 2pvw:A, 3rbu:A, 6rbc:A, 6rti:A, 6s1x:A, 6sgp:A, 3sje:A, 3sjf:A, 3sjg:A, 3sjx:A, 6skh:A, 4w9y:A, 4x3r:A, 2xef:A, 2xeg:A, 2xei:A, 2xej:A, 1z8l:A, 1z8l:B, 1z8l:C, 1z8l:D
25	3ie7:A	309	111	0.0725	0.0809	0.2252	0.32	3jul:A
26	7c1y:A	356	50	0.0464	0.0449	0.3200	0.37	7c1y:B, 7c1z:A, 7c1z:B
27	2jg1:A	318	292	0.1768	0.1918	0.2089	0.48	2jg1:B, 2jg1:C, 2jg1:D, 2jgv:B, 2jgv:D
28	5ygg:A	310	55	0.0580	0.0645	0.3636	0.54	5eyn:A, 5f0z:A, 5f11:A
29	7na0:A	981	115	0.0928	0.0326	0.2783	0.56	7na0:B, 4nm9:A, 4nm9:B, 4nma:A, 4nma:B, 4nmb:A, 4nmb:B, 4nmc:B, 4nmd:A, 4nmd:B, 4nme:A, 4nme:B, 4nmf:A, 4nmf:B
30	4nmc:A	941	115	0.0928	0.0340	0.2783	0.66
31	3ktn:A	340	124	0.0899	0.0912	0.2500	0.73
32	5xfm:A	632	134	0.0986	0.0538	0.2537	0.97	5xfm:B, 5xfm:C, 5xfm:D
33	3go6:A	287	124	0.0841	0.1010	0.2339	1.1	3go6:B, 3go7:A, 3go7:B
34	2var:A	311	44	0.0522	0.0579	0.4091	1.6	2var:B, 2var:C
35	6xk2:A	320	41	0.0464	0.0500	0.3902	1.7	6xk2:B, 6xk2:C, 6xk2:D
36	8rhf:B	327	31	0.0406	0.0428	0.4516	1.9	8rhe:A, 8rhe:B, 8rhf:A, 8rhi:A, 8rhi:B
37	6vwp:A	435	28	0.0319	0.0253	0.3929	2.3	6vwo:A, 6vwp:B, 6vwp:C, 6vwp:D, 6vwp:E, 6vwp:F, 6vwp:G, 6vwp:H
38	7dvq:v	119	57	0.0522	0.1513	0.3158	2.9	8y7e:v
39	2dcn:A	308	33	0.0406	0.0455	0.4242	5.0	2dcn:B, 2dcn:C, 2dcn:D, 2dcn:E, 2dcn:F, 2dcn:G, 2dcn:H, 2dcn:I, 2dcn:J, 2dcn:K, 2dcn:L
40	3n1c:A	309	89	0.0667	0.0744	0.2584	5.3	3cqd:A, 3cqd:B, 3n1c:D, 3n1c:B, 3n1c:C, 3umo:A, 3umo:B, 3ump:A, 3ump:B, 3uqd:A, 3uqd:C, 3uqd:B, 3uqd:D, 3uqe:A, 3uqe:B
41	5f8b:A	215	46	0.0435	0.0698	0.3261	6.3	5fhi:A
42	8owm:C	413	48	0.0435	0.0363	0.3125	6.9	8owm:A, 8owm:B, 8owm:D, 8owm:E, 8owm:F, 8own:A, 8own:B, 8own:C, 8own:D, 8own:E, 8own:F
43	6wb4:B	306	19	0.0319	0.0359	0.5789	7.2	6wb4:A, 6wb5:A, 6wb5:B
44	2afb:A	329	180	0.1043	0.1094	0.2000	7.4
45	7w93:A	307	272	0.1594	0.1792	0.2022	7.7	7vsk:A, 7vte:A, 7vte:B, 7vte:C, 7vte:D, 7vtf:A, 7vtf:B, 7vtf:C, 7vtf:D, 7vtg:A, 7vtg:B, 7vtg:C, 7vtg:D, 7vva:A, 7vva:B, 7vva:C, 7vva:D

[Back]