Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MSPQELQLHYFKMHDYDGNNLLDGLELSTAITHAPLMSEDELINIIDGVLRDDDKNNDGYIDYAEFAKSL

The query sequence (length=70) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8jp5:C 101 73 0.9857 0.6832 0.9452 6.63e-44 3a4u:B, 8jp4:C, 8jp4:D, 8jp4:G, 8jp4:H, 8jp5:D, 8jp5:G, 8jp5:H, 8jp6:C, 8jp6:D, 8jp6:G, 8jp6:H, 8jp7:C, 8jp7:D, 8jp7:G, 8jp7:H, 8jp8:C, 8jp8:D, 8jp8:G, 8jp8:H, 8jp9:C, 8jp9:D, 8jp9:G, 8jp9:H, 8jpg:C, 8jpg:G, 8jpg:D, 8jpg:H, 3lcp:C, 3lcp:D, 2vrg:A, 4ygb:B, 4ygb:D, 4ygc:B, 4ygc:D, 4ygd:B, 4ygd:F, 4ygd:H, 4yge:B, 4yge:D, 4yge:F
2 4ygd:D 62 66 0.8857 1.0000 0.9394 2.93e-38 3wht:B, 3whu:B, 3wnx:B, 4ygc:F, 4ygc:H
3 1osa:A 148 70 0.3429 0.1622 0.3429 1.85e-05 1clm:A, 5e1k:A, 5e1n:A, 5e1p:A, 1exr:A, 2kxw:A, 2m5e:A
4 7vus:B 68 71 0.3143 0.3235 0.3099 1.84e-04 7vur:A, 7vur:B, 7vus:A, 7vus:C, 7vus:D, 7vut:A, 7vut:B, 7vuu:A, 7vuu:B, 7vuu:C, 7vuu:D
5 2bec:A 181 71 0.3143 0.1215 0.3099 7.40e-04
6 1tn4:A 157 69 0.3286 0.1465 0.3333 0.001 1tcf:A, 2tn4:A
7 1ggz:A 144 61 0.2714 0.1319 0.3115 0.002
8 1la0:A 161 57 0.3000 0.1304 0.3684 0.003 1aj4:A, 1ap4:A, 2ctn:A, 3ctn:A, 1dtl:A, 1fi5:A, 8fmm:A, 8fmm:D, 8fmn:A, 8fmn:D, 8fmo:A, 8fmo:D, 8fmp:A, 8fmp:D, 8fmq:A, 8fmq:D, 8fmr:A, 8fmr:D, 8fms:A, 8fms:D, 8fmt:A, 8fmt:D, 4gje:A, 1ih0:A, 1j1d:A, 1j1d:D, 1j1e:A, 1j1e:D, 2jxl:A, 2kdh:A, 2kfx:T, 2kgb:C, 6klt:A, 6klu:A, 2krd:C, 2l1r:A, 2l98:A, 1lxf:C, 2mkp:C, 2mle:C, 2mlf:C, 1mxl:C, 2mzp:C, 2n79:C, 1ozs:A, 1r2u:A, 1r6p:A, 3rv5:A, 3rv5:B, 3rv5:C, 3rv5:D, 1sbj:A, 1scv:A, 3sd6:A, 3swb:A, 7uti:U, 7uti:Z, 8uzx:C, 8uzy:C, 8v01:C, 8v0i:C, 8v0k:C, 1wrk:A, 1wrk:B, 1wrl:A, 1wrl:B, 1wrl:C, 1wrl:D, 1wrl:E, 1wrl:F, 4y99:A
9 1ncy:A 162 71 0.3429 0.1481 0.3380 0.003 1a2x:A, 1avs:A, 1avs:B, 1cta:A, 1cta:B, 1ctd:A, 1ctd:B, 1jc2:A, 1npq:A, 1smg:A, 1tnq:A, 4tnc:A, 5tnc:A, 1top:A, 2w49:0, 2w49:3, 2w49:6, 2w49:9, 1ytz:C, 1yv0:C
10 3u0k:A 397 60 0.2571 0.0453 0.3000 0.003
11 3u0k:A 397 59 0.2857 0.0504 0.3390 0.61
12 2lv7:A 100 60 0.2714 0.1900 0.3167 0.004
13 4ieb:A 472 60 0.3000 0.0445 0.3500 0.004 6bfa:A, 3hx4:A, 3i7b:A, 3i7c:A, 4ifg:A, 4ihp:A, 4jbv:A, 5jms:A, 5jn2:A, 3ku2:A, 4m84:A, 4mx9:A, 4mxa:A, 3n51:A, 3nyv:A, 4ona:A, 3sx9:A, 3sxf:A, 3t3u:A, 3t3v:A, 4tzr:A, 3upx:A, 3upz:A, 3v51:A, 3v5p:A, 3v5t:A, 5w80:A, 5w8r:A, 5w91:A, 5w9e:A, 5w9r:A, 4wg3:A, 4wg4:A, 4wg5:A, 4yga:A, 4yga:C, 4yga:E, 4yga:G, 4yjn:A
14 4ieb:A 472 72 0.3000 0.0445 0.2917 9.9 6bfa:A, 3hx4:A, 3i7b:A, 3i7c:A, 4ifg:A, 4ihp:A, 4jbv:A, 5jms:A, 5jn2:A, 3ku2:A, 4m84:A, 4mx9:A, 4mxa:A, 3n51:A, 3nyv:A, 4ona:A, 3sx9:A, 3sxf:A, 3t3u:A, 3t3v:A, 4tzr:A, 3upx:A, 3upz:A, 3v51:A, 3v5p:A, 3v5t:A, 5w80:A, 5w8r:A, 5w91:A, 5w9e:A, 5w9r:A, 4wg3:A, 4wg4:A, 4wg5:A, 4yga:A, 4yga:C, 4yga:E, 4yga:G, 4yjn:A
15 6u2m:A 464 60 0.2571 0.0388 0.3000 0.004 8aht:C, 1ak8:A, 3b32:A, 7cqv:E, 5dsu:A, 2i08:A, 1j7o:A, 6jiu:C, 6jiu:F, 6jiu:I, 6jiu:L, 2kug:A, 6pjx:B, 2pq3:A, 4q57:A, 6u2m:C, 3uct:B, 3ucw:C, 3ucy:A
16 5dvr:A 386 60 0.3000 0.0544 0.3500 0.004
17 4qox:A 462 56 0.2857 0.0433 0.3571 0.005
18 2kz2:A 93 69 0.2857 0.2151 0.2899 0.005
19 8b6q:A 466 56 0.2571 0.0386 0.3214 0.006 1a29:A, 1ahr:A, 8ahs:A, 8aht:D, 6ale:R, 4anj:B, 6b8m:B, 6b8m:D, 6b8m:F, 6b8m:H, 6b8n:B, 6b8n:D, 6b8n:F, 6b8n:H, 6b8p:B, 6b8p:D, 6b8p:F, 6b8p:H, 6b8q:B, 6b8q:D, 6b8q:H, 6b8q:F, 2bbm:A, 2bbn:A, 2bcx:A, 8bd2:A, 2be6:A, 2be6:B, 2be6:C, 7bf1:AAA, 7bf2:AAA, 2bkh:B, 2bki:B, 4bw8:A, 4bw8:B, 3bxk:A, 3bxk:C, 3bxl:A, 3bya:A, 4bya:A, 4byf:D, 1cdl:A, 1cdl:B, 1cdl:C, 1cdl:D, 1cdm:A, 1cff:A, 1ckk:A, 1cll:A, 3cln:A, 4cln:A, 1cm1:A, 1cm4:A, 6cnn:E, 6cnn:F, 6cnn:G, 6cnn:H, 6cno:E, 6cno:F, 6cno:G, 6cno:H, 2col:B, 7cqh:B, 7cqp:B, 7cqv:A, 1ctr:A, 6ctb:A, 6czq:R, 6dad:A, 6dad:B, 6dae:B, 6dae:A, 6daf:A, 6daf:B, 6dah:A, 6dah:B, 6dah:C, 6dah:D, 4dbp:C, 4dbq:B, 5dbr:A, 4dck:B, 8dgh:A, 8dgk:A, 4djc:A, 5dow:A, 5dow:C, 5dow:E, 5dow:G, 3dve:A, 3dvj:A, 3dvk:A, 3dvm:A, 6e2f:E, 6e2g:E, 6eeb:A, 4ehq:A, 3ewt:A, 3ewv:A, 2f2o:A, 2f3y:A, 2f3z:A, 6feg:B, 6feh:B, 8fny:B, 8fny:D, 2fot:A, 8fo6:B, 1fw4:A, 4g27:R, 4g28:R, 1g4y:R, 3g43:A, 3g43:B, 3g43:C, 3g43:D, 6gdk:A, 5ggm:A, 8gm4:B, 8gm5:B, 3gn4:B, 3gn4:D, 3gn4:F, 3gn4:H, 3gof:A, 3gof:B, 4gow:D, 3gp2:A, 6hcs:A, 6hcs:C, 6hcs:E, 6hcs:G, 4hex:A, 4hex:B, 2hf5:A, 5hit:A, 2hqw:A, 3hr4:B, 3hr4:D, 3hr4:F, 3hr4:H, 3if7:A, 3ifk:A, 3ifk:B, 1iq5:A, 1iwq:A, 5j03:B, 3j41:E, 3j41:F, 1j7p:A, 5j7j:A, 5j8h:A, 4j9y:R, 4j9z:R, 6jiy:C, 6jiy:F, 6jiy:I, 6jiy:L, 4jpz:C, 4jpz:I, 4jq0:C, 5jqa:A, 5jth:A, 6jv2:B, 6jv2:D, 6jv2:F, 6jv2:H, 2jzi:A, 2k0e:A, 2k0f:A, 2k0j:A, 6k4k:C, 6k4l:C, 6k4l:D, 6k4r:C, 6k4r:D, 2k61:A, 5k8q:A, 1k90:D, 1k90:E, 1k90:F, 1k93:D, 1k93:E, 1k93:F, 8k9z:B, 8k9z:D, 8ka0:B, 8ka0:D, 8ka0:F, 8ka0:H, 8ka1:F, 2kdu:A, 7kl5:A, 2kne:A, 2kuh:A, 1l7z:A, 2l7l:A, 7l8v:A, 3l9i:C, 2lgf:A, 1lin:A, 2ll6:A, 2ll7:A, 2llo:A, 2llq:A, 2lqc:A, 2lqp:A, 1lvc:D, 1lvc:E, 1lvc:F, 2lv6:A, 2m0j:A, 2m0k:A, 4m1l:A, 2m3s:A, 2m55:A, 6m7h:A, 6mba:B, 6mc9:B, 2mes:A, 2mg5:A, 2mgu:A, 7mir:B, 7mis:B, 1mux:A, 6mud:A, 6mue:A, 1mxe:A, 1mxe:B, 2n27:A, 6n5w:C, 2n8j:A, 1niw:A, 1niw:C, 1niw:E, 1niw:G, 5nin:A, 5nin:B, 7nqc:A, 1nwd:A, 6o20:F, 2o5g:A, 6o5g:A, 2o60:A, 5oeo:A, 1ooj:A, 6os4:A, 4ovn:A, 4ovn:B, 4ovn:C, 4ovn:D, 4ovn:E, 3oxq:A, 3oxq:B, 3oxq:C, 3oxq:D, 6paw:D, 6paw:G, 6paw:H, 6paw:C, 4pjj:B, 1pk0:D, 1pk0:E, 1pk0:F, 6plm:C, 6plm:D, 7ppo:B, 7pqe:B, 1prw:A, 7psz:A, 7pu9:A, 4q5u:A, 1qiv:A, 1qiw:A, 1qiw:B, 4qnh:R, 1qs7:A, 1qs7:C, 1qtx:A, 2r28:A, 2r28:B, 4rjd:A, 4rjd:B, 2ro8:A, 1s26:D, 1s26:E, 1s26:F, 7shq:B, 8sik:B, 8sik:F, 8sik:H, 8sim:B, 8sim:D, 8sim:F, 8sim:H, 3sjq:A, 3sjq:B, 1sk6:D, 1sk6:E, 1sk6:F, 3sui:A, 1sw8:A, 1sy9:A, 5sy1:C, 5sy1:D, 6sz5:A, 5t0x:A, 7t2q:A, 7tci:B, 7tci:F, 7tci:D, 7tci:H, 7tcp:B, 7tcp:F, 7tcp:H, 7tcp:D, 5tp6:A, 7tzc:K, 7tzc:D, 7tzc:E, 7tzc:C, 6u39:A, 6u39:C, 6u39:E, 6u39:G, 6u39:I, 6u39:K, 6u39:M, 6u39:O, 6u39:Q, 6u39:S, 6u3a:A, 6u3a:B, 6u3b:A, 6u3d:A, 6u3d:B, 3uct:A, 3ucw:A, 3ucw:B, 3ucw:D, 4umo:C, 4umo:D, 1up5:A, 1up5:B, 4upu:A, 8uxl:I, 8uxl:J, 8uxl:L, 8uxl:K, 8uxm:I, 8uxm:J, 8uxm:L, 8uxm:K, 6uzz:B, 6uzz:D, 6uzz:F, 6uzz:H, 2v01:A, 2v02:A, 4v0c:C, 4v0c:D, 5v02:R, 5v03:R, 6v00:B, 6v00:E, 6v00:H, 6v00:K, 6v01:B, 6v01:E, 6v01:H, 6v01:K, 2vas:B, 2vay:A, 2vb6:B, 5vms:B, 1vrk:A, 7vuo:C, 7vvd:C, 7vvd:E, 7vvh:C, 8w41:B, 2w73:A, 2w73:B, 2w73:E, 2w73:F, 5wbx:R, 5wc5:R, 2wel:D, 1wrz:A, 5wsv:A, 5wsv:C, 1x02:A, 2x0g:B, 2x51:B, 1xa5:A, 1xfu:O, 1xfu:P, 1xfu:Q, 1xfu:R, 1xfu:S, 1xfu:T, 1xfv:O, 1xfv:P, 1xfv:Q, 1xfv:R, 1xfv:S, 1xfv:T, 1xfw:O, 1xfw:P, 1xfw:Q, 1xfw:R, 1xfw:S, 1xfw:T, 1xfx:O, 1xfx:P, 1xfx:Q, 1xfx:R, 1xfx:S, 1xfx:T, 1xfy:O, 1xfy:P, 1xfy:Q, 1xfy:R, 1xfy:S, 1xfy:T, 1xfz:O, 1xfz:P, 1xfz:Q, 1xfz:R, 1xfz:S, 1xfz:T, 6xxf:AAA, 6xxx:AAA, 6xy3:AAA, 1y0v:H, 1y0v:I, 1y0v:J, 1y0v:K, 1y0v:L, 1y0v:M, 2y4v:A, 6y4o:A, 6y4p:A, 1y6w:A, 6y94:A, 2ygg:B, 6yns:A, 6yns:C, 6yns:B, 6yns:K, 6yns:D, 6yns:E, 6yns:F, 6yns:G, 6yns:H, 6yns:I, 6yns:J, 6yns:L, 6ynu:A, 6ynu:C, 1yr5:A, 1yrt:B, 1yru:B, 6zbi:A, 4zlk:B, 1zot:B, 7zrp:A, 7zrp:C, 7zrq:A, 1zuz:A
20 8b6q:A 466 59 0.2857 0.0429 0.3390 0.71 1a29:A, 1ahr:A, 8ahs:A, 8aht:D, 6ale:R, 4anj:B, 6b8m:B, 6b8m:D, 6b8m:F, 6b8m:H, 6b8n:B, 6b8n:D, 6b8n:F, 6b8n:H, 6b8p:B, 6b8p:D, 6b8p:F, 6b8p:H, 6b8q:B, 6b8q:D, 6b8q:H, 6b8q:F, 2bbm:A, 2bbn:A, 2bcx:A, 8bd2:A, 2be6:A, 2be6:B, 2be6:C, 7bf1:AAA, 7bf2:AAA, 2bkh:B, 2bki:B, 4bw8:A, 4bw8:B, 3bxk:A, 3bxk:C, 3bxl:A, 3bya:A, 4bya:A, 4byf:D, 1cdl:A, 1cdl:B, 1cdl:C, 1cdl:D, 1cdm:A, 1cff:A, 1ckk:A, 1cll:A, 3cln:A, 4cln:A, 1cm1:A, 1cm4:A, 6cnn:E, 6cnn:F, 6cnn:G, 6cnn:H, 6cno:E, 6cno:F, 6cno:G, 6cno:H, 2col:B, 7cqh:B, 7cqp:B, 7cqv:A, 1ctr:A, 6ctb:A, 6czq:R, 6dad:A, 6dad:B, 6dae:B, 6dae:A, 6daf:A, 6daf:B, 6dah:A, 6dah:B, 6dah:C, 6dah:D, 4dbp:C, 4dbq:B, 5dbr:A, 4dck:B, 8dgh:A, 8dgk:A, 4djc:A, 5dow:A, 5dow:C, 5dow:E, 5dow:G, 3dve:A, 3dvj:A, 3dvk:A, 3dvm:A, 6e2f:E, 6e2g:E, 6eeb:A, 4ehq:A, 3ewt:A, 3ewv:A, 2f2o:A, 2f3y:A, 2f3z:A, 6feg:B, 6feh:B, 8fny:B, 8fny:D, 2fot:A, 8fo6:B, 1fw4:A, 4g27:R, 4g28:R, 1g4y:R, 3g43:A, 3g43:B, 3g43:C, 3g43:D, 6gdk:A, 5ggm:A, 8gm4:B, 8gm5:B, 3gn4:B, 3gn4:D, 3gn4:F, 3gn4:H, 3gof:A, 3gof:B, 4gow:D, 3gp2:A, 6hcs:A, 6hcs:C, 6hcs:E, 6hcs:G, 4hex:A, 4hex:B, 2hf5:A, 5hit:A, 2hqw:A, 3hr4:B, 3hr4:D, 3hr4:F, 3hr4:H, 3if7:A, 3ifk:A, 3ifk:B, 1iq5:A, 1iwq:A, 5j03:B, 3j41:E, 3j41:F, 1j7p:A, 5j7j:A, 5j8h:A, 4j9y:R, 4j9z:R, 6jiy:C, 6jiy:F, 6jiy:I, 6jiy:L, 4jpz:C, 4jpz:I, 4jq0:C, 5jqa:A, 5jth:A, 6jv2:B, 6jv2:D, 6jv2:F, 6jv2:H, 2jzi:A, 2k0e:A, 2k0f:A, 2k0j:A, 6k4k:C, 6k4l:C, 6k4l:D, 6k4r:C, 6k4r:D, 2k61:A, 5k8q:A, 1k90:D, 1k90:E, 1k90:F, 1k93:D, 1k93:E, 1k93:F, 8k9z:B, 8k9z:D, 8ka0:B, 8ka0:D, 8ka0:F, 8ka0:H, 8ka1:F, 2kdu:A, 7kl5:A, 2kne:A, 2kuh:A, 1l7z:A, 2l7l:A, 7l8v:A, 3l9i:C, 2lgf:A, 1lin:A, 2ll6:A, 2ll7:A, 2llo:A, 2llq:A, 2lqc:A, 2lqp:A, 1lvc:D, 1lvc:E, 1lvc:F, 2lv6:A, 2m0j:A, 2m0k:A, 4m1l:A, 2m3s:A, 2m55:A, 6m7h:A, 6mba:B, 6mc9:B, 2mes:A, 2mg5:A, 2mgu:A, 7mir:B, 7mis:B, 1mux:A, 6mud:A, 6mue:A, 1mxe:A, 1mxe:B, 2n27:A, 6n5w:C, 2n8j:A, 1niw:A, 1niw:C, 1niw:E, 1niw:G, 5nin:A, 5nin:B, 7nqc:A, 1nwd:A, 6o20:F, 2o5g:A, 6o5g:A, 2o60:A, 5oeo:A, 1ooj:A, 6os4:A, 4ovn:A, 4ovn:B, 4ovn:C, 4ovn:D, 4ovn:E, 3oxq:A, 3oxq:B, 3oxq:C, 3oxq:D, 6paw:D, 6paw:G, 6paw:H, 6paw:C, 4pjj:B, 1pk0:D, 1pk0:E, 1pk0:F, 6plm:C, 6plm:D, 7ppo:B, 7pqe:B, 1prw:A, 7psz:A, 7pu9:A, 4q5u:A, 1qiv:A, 1qiw:A, 1qiw:B, 4qnh:R, 1qs7:A, 1qs7:C, 1qtx:A, 2r28:A, 2r28:B, 4rjd:A, 4rjd:B, 2ro8:A, 1s26:D, 1s26:E, 1s26:F, 7shq:B, 8sik:B, 8sik:F, 8sik:H, 8sim:B, 8sim:D, 8sim:F, 8sim:H, 3sjq:A, 3sjq:B, 1sk6:D, 1sk6:E, 1sk6:F, 3sui:A, 1sw8:A, 1sy9:A, 5sy1:C, 5sy1:D, 6sz5:A, 5t0x:A, 7t2q:A, 7tci:B, 7tci:F, 7tci:D, 7tci:H, 7tcp:B, 7tcp:F, 7tcp:H, 7tcp:D, 5tp6:A, 7tzc:K, 7tzc:D, 7tzc:E, 7tzc:C, 6u39:A, 6u39:C, 6u39:E, 6u39:G, 6u39:I, 6u39:K, 6u39:M, 6u39:O, 6u39:Q, 6u39:S, 6u3a:A, 6u3a:B, 6u3b:A, 6u3d:A, 6u3d:B, 3uct:A, 3ucw:A, 3ucw:B, 3ucw:D, 4umo:C, 4umo:D, 1up5:A, 1up5:B, 4upu:A, 8uxl:I, 8uxl:J, 8uxl:L, 8uxl:K, 8uxm:I, 8uxm:J, 8uxm:L, 8uxm:K, 6uzz:B, 6uzz:D, 6uzz:F, 6uzz:H, 2v01:A, 2v02:A, 4v0c:C, 4v0c:D, 5v02:R, 5v03:R, 6v00:B, 6v00:E, 6v00:H, 6v00:K, 6v01:B, 6v01:E, 6v01:H, 6v01:K, 2vas:B, 2vay:A, 2vb6:B, 5vms:B, 1vrk:A, 7vuo:C, 7vvd:C, 7vvd:E, 7vvh:C, 8w41:B, 2w73:A, 2w73:B, 2w73:E, 2w73:F, 5wbx:R, 5wc5:R, 2wel:D, 1wrz:A, 5wsv:A, 5wsv:C, 1x02:A, 2x0g:B, 2x51:B, 1xa5:A, 1xfu:O, 1xfu:P, 1xfu:Q, 1xfu:R, 1xfu:S, 1xfu:T, 1xfv:O, 1xfv:P, 1xfv:Q, 1xfv:R, 1xfv:S, 1xfv:T, 1xfw:O, 1xfw:P, 1xfw:Q, 1xfw:R, 1xfw:S, 1xfw:T, 1xfx:O, 1xfx:P, 1xfx:Q, 1xfx:R, 1xfx:S, 1xfx:T, 1xfy:O, 1xfy:P, 1xfy:Q, 1xfy:R, 1xfy:S, 1xfy:T, 1xfz:O, 1xfz:P, 1xfz:Q, 1xfz:R, 1xfz:S, 1xfz:T, 6xxf:AAA, 6xxx:AAA, 6xy3:AAA, 1y0v:H, 1y0v:I, 1y0v:J, 1y0v:K, 1y0v:L, 1y0v:M, 2y4v:A, 6y4o:A, 6y4p:A, 1y6w:A, 6y94:A, 2ygg:B, 6yns:A, 6yns:C, 6yns:B, 6yns:K, 6yns:D, 6yns:E, 6yns:F, 6yns:G, 6yns:H, 6yns:I, 6yns:J, 6yns:L, 6ynu:A, 6ynu:C, 1yr5:A, 1yrt:B, 1yru:B, 6zbi:A, 4zlk:B, 1zot:B, 7zrp:A, 7zrp:C, 7zrq:A, 1zuz:A
21 6xyr:A 348 60 0.2571 0.0517 0.3000 0.007
22 6gez:B 532 60 0.3000 0.0395 0.3500 0.007 6gel:A, 6gel:B, 6gez:A
23 8c0t:A 281 60 0.3000 0.0747 0.3500 0.008
24 2ggz:A 165 67 0.3286 0.1394 0.3433 0.010 2ggz:B
25 2ggz:A 165 25 0.1429 0.0606 0.4000 4.5 2ggz:B
26 6xu4:A 389 58 0.2714 0.0488 0.3276 0.011 6xu4:B, 6xu4:E
27 6xu4:A 389 59 0.3000 0.0540 0.3559 0.65 6xu4:B, 6xu4:E
28 1rfj:A 148 69 0.3143 0.1486 0.3188 0.011 5a2h:A, 4aqr:A, 4aqr:B, 2ro9:A
29 2f2p:A 169 69 0.2857 0.1183 0.2899 0.011 2f2o:B, 2f2p:B
30 4ysm:A 475 70 0.3429 0.0505 0.3429 0.012 3ma6:A, 3ma6:B, 4ysj:A, 4ysj:B, 4ysm:B, 4yuq:A, 4yuq:B, 4yzb:A, 4yzb:B
31 6dmw:E 113 60 0.2571 0.1593 0.3000 0.013
32 2n6a:A 162 69 0.2857 0.1235 0.2899 0.013
33 8tkp:B 187 72 0.3429 0.1283 0.3333 0.014 8tkp:E, 7usw:C, 7usw:E, 7usx:C, 7usx:E, 7usy:C, 7usy:E
34 3k21:A 178 28 0.1857 0.0730 0.4643 0.017
35 6hr1:A 406 60 0.2571 0.0443 0.3000 0.018 6hr1:B
36 3e3r:A 183 62 0.2571 0.0984 0.2903 0.019 3e3r:B
37 3o78:A 402 60 0.2571 0.0448 0.3000 0.020 7aug:A, 3ek4:A, 3ek7:A, 3ek8:A, 3ekh:A, 3evr:A, 3evu:A, 3evv:A, 4ik1:A, 4ik3:A, 4ik4:A, 4ik5:A, 4ik8:A, 4ik9:A, 3o77:A, 3o78:B, 3sg2:A, 3sg3:A, 3sg4:A, 3sg5:A, 3sg6:A, 3sg7:A, 7st4:A, 6tv7:A, 3wlc:A, 3wld:A, 6ya9:A, 6zsm:A, 6zsn:A
38 4mvf:A 408 63 0.3286 0.0564 0.3651 0.024 3pm8:A, 3pm8:B
39 4jwq:C 73 61 0.2857 0.2740 0.3279 0.034 4jwq:A
40 6tj5:A 131 69 0.2857 0.1527 0.2899 0.045
41 3q5i:A 470 59 0.2857 0.0426 0.3390 0.046
42 8aht:A 140 65 0.2714 0.1357 0.2923 0.047 8aht:B
43 5ukg:A 393 60 0.2571 0.0458 0.3000 0.047 5ukg:B
44 8osi:A 400 58 0.2714 0.0475 0.3276 0.048
45 8osi:A 400 57 0.3000 0.0525 0.3684 0.22
46 2l4h:A 184 65 0.2714 0.1033 0.2923 0.055 2l4i:A, 2lm5:A, 6ocx:D, 6ocx:C, 6ocx:A, 6ocx:B, 6od0:A, 6od0:B, 1xo5:A, 1xo5:B, 1y1a:A, 1y1a:B
47 4i2y:A 381 60 0.2571 0.0472 0.3000 0.069 4i2y:B
48 3kf9:A 149 65 0.2857 0.1342 0.3077 0.081 3kf9:C
49 2lmt:A 148 57 0.2714 0.1284 0.3333 0.096 2lmu:A, 2lmv:A
50 6iie:A 87 65 0.2429 0.1954 0.2615 0.098
51 3o4y:A 172 62 0.3000 0.1221 0.3387 0.13
52 6xw2:A 387 60 0.2429 0.0439 0.2833 0.15
53 3khe:B 191 66 0.3000 0.1099 0.3182 0.16 3khe:A
54 3khe:B 191 22 0.1286 0.0471 0.4091 8.2 3khe:A
55 3lij:A 465 59 0.2857 0.0430 0.3390 0.16 3l19:A, 3l19:B
56 3lij:A 465 60 0.2429 0.0366 0.2833 1.5 3l19:A, 3l19:B
57 2aao:A 147 56 0.2857 0.1361 0.3571 0.20 2aao:B
58 5g4p:A 184 70 0.3143 0.1196 0.3143 0.21 5g4p:E, 5g58:A, 5g58:E, 5m6c:A, 5m6c:E
59 5g4p:A 184 22 0.1571 0.0598 0.5000 4.9 5g4p:E, 5g58:A, 5g58:E, 5m6c:A, 5m6c:E
60 3qrx:A 145 65 0.2714 0.1310 0.2923 0.22 1oqp:A
61 1s6i:A 182 22 0.1714 0.0659 0.5455 0.23
62 2opo:C 85 68 0.2429 0.2000 0.2500 0.27 2opo:A, 2opo:B, 2opo:D
63 3ox6:E 118 25 0.1429 0.0847 0.4000 0.43
64 5x9a:B 198 57 0.3143 0.1111 0.3860 0.43 5x9a:A, 5ypx:A, 5ypx:B
65 2r2i:A 184 68 0.3000 0.1141 0.3088 0.45
66 2lvj:A 77 58 0.2429 0.2208 0.2931 0.45 1k9u:A, 1k9u:B, 2lvk:A, 5otj:D, 5otj:C
67 1h4b:A 84 56 0.2143 0.1786 0.2679 0.49
68 3ox5:A 153 25 0.1429 0.0654 0.4000 0.61 2k7b:A, 2k7d:A, 2lan:A, 2lap:A, 3ox5:B, 3ox5:C, 3ox5:D, 3ox5:E, 3ox5:F, 3ox6:A, 3ox6:B, 3ox6:C, 3ox6:D, 3ox6:F
69 5e37:A 313 70 0.3143 0.0703 0.3143 0.63 5e37:C
70 5mwc:D 275 69 0.3000 0.0764 0.3043 0.64
71 7m2m:A 183 74 0.3429 0.1311 0.3243 0.76
72 1v1f:A 188 61 0.2571 0.0957 0.2951 0.90 2ehb:A, 1v1g:A
73 1qx7:M 115 82 0.3143 0.1913 0.2683 0.94
74 3fhd:A 456 35 0.1714 0.0263 0.3429 0.94 5hsw:A, 3pov:A
75 6tj7:A 134 22 0.1571 0.0821 0.5000 1.0
76 1bjf:A 181 67 0.3000 0.1160 0.3134 1.1 1bjf:B
77 1bjf:A 181 22 0.1571 0.0608 0.5000 7.2 1bjf:B
78 2m28:A 72 71 0.3286 0.3194 0.3239 1.1
79 8ban:C 251 68 0.2429 0.0677 0.2500 1.3 8ban:D, 8bbj:C, 8bbj:D
80 5ve9:B 91 17 0.1429 0.1099 0.5882 1.4 5ve9:A
81 4l9m:A 522 24 0.1429 0.0192 0.4167 1.5
82 2kn2:A 92 61 0.2286 0.1739 0.2623 1.6
83 6tz8:B 174 60 0.2143 0.0862 0.2500 1.6 6tz8:E
84 7u0u:A 195 68 0.2571 0.0923 0.2647 1.7 6tz7:B
85 5aan:A 183 22 0.1571 0.0601 0.5000 1.7 4by4:A, 4by4:B, 4by5:A, 4by5:B, 4by5:C, 4by5:D, 6epa:A, 5fyx:A, 5g08:A
86 7u0t:A 190 67 0.2429 0.0895 0.2537 1.8
87 4il1:A 529 67 0.2429 0.0321 0.2537 1.8 1aui:A, 1aui:B, 9b9g:H, 9b9g:J, 5c1v:A, 5c1v:B, 4f0z:B, 4il1:B, 4il1:C, 4il1:D, 2jog:A, 3ll8:A, 3ll8:B, 3ll8:C, 3ll8:D, 1m63:A, 1m63:B, 1m63:E, 1m63:F, 1mf8:A, 1mf8:B, 6nuc:A, 6nuc:B, 6nuf:A, 6nuf:B, 6nuu:A, 6nuu:B, 4or9:B, 4ora:B, 4orb:A, 4orb:B, 4orc:B, 2p6b:A, 2p6b:C, 2p6b:B, 2p6b:D, 5sve:A, 5sve:B, 1tco:A, 1tco:B, 6uuq:A
88 2k2f:A 93 22 0.1143 0.0860 0.3636 2.1 2k2f:B, 5k89:A, 5k89:C, 5k89:H, 2kbm:A, 2kbm:B, 2lp2:A, 2lp2:B, 2lp3:A, 2lp3:B, 2lux:A, 2lux:B, 8vk4:I, 8vk4:J, 8vk4:K, 8vk4:L, 8vk4:N, 8vk4:M, 8vk4:O, 8vk4:P, 1zfs:A, 1zfs:B
89 2l1w:A 149 70 0.2571 0.1208 0.2571 2.4 2ksz:A, 2roa:A, 2rob:A
90 5b8i:B 171 68 0.2429 0.0994 0.2500 2.8
91 1ht9:A 76 67 0.2571 0.2368 0.2687 3.3 1b1g:A, 1ht9:B, 3icb:A, 4icb:A, 1ig5:A, 1igv:A, 1n65:A
92 4f2n:B 210 49 0.2000 0.0667 0.2857 3.5 4f2n:A, 4f2n:C, 4f2n:D, 4f2n:E, 4f2n:F, 4f2n:G, 4f2n:H, 4f2n:I, 4f2n:J, 4f2n:K, 4f2n:L
93 2iqx:C 186 78 0.2286 0.0860 0.2051 3.5 2iqx:A, 2iqx:B
94 2lc5:A 85 56 0.2286 0.1882 0.2857 4.0
95 6yeu:A 107 61 0.2143 0.1402 0.2459 4.4 6yig:A
96 1f76:A 336 35 0.2000 0.0417 0.4000 4.4 1f76:B, 1f76:D, 1f76:E, 7t5k:A, 7t5k:B, 7t5y:A, 7t5y:B, 7t6c:A, 7t6c:B, 7t6h:A, 7t6h:B
97 7np8:B 620 33 0.1857 0.0210 0.3939 4.5 7np8:A, 7np8:C, 7np8:D
98 7nmi:B 488 21 0.1286 0.0184 0.4286 5.0 1j55:A
99 7nmi:B 488 21 0.1286 0.0184 0.4286 5.0 1j55:A
100 1s1e:A 181 36 0.1714 0.0663 0.3333 5.6 2i2r:E, 2i2r:F, 2i2r:G, 2i2r:H, 2i2r:M, 2i2r:N, 2i2r:O, 2i2r:P, 2nz0:A, 2nz0:C, 1s6c:A
101 7edb:A 350 38 0.1714 0.0343 0.3158 5.9 7edb:B
102 1qx2:A 76 24 0.1143 0.1053 0.3333 6.4 1qx2:B
103 8bav:C 264 68 0.2143 0.0568 0.2206 6.4 8bav:D
104 4n5x:A 155 62 0.2571 0.1161 0.2903 7.9 4zcu:A, 4zcu:B, 4zcu:C, 4zcv:A, 4zcv:B, 4zcv:C, 4zcv:D
105 4n5x:A 155 17 0.1429 0.0645 0.5882 8.0 4zcu:A, 4zcu:B, 4zcu:C, 4zcv:A, 4zcv:B, 4zcv:C, 4zcv:D
106 4c0k:A 404 18 0.1429 0.0248 0.5556 8.4 4c0l:A
107 8ajy:B 84 55 0.1857 0.1548 0.2364 9.6 8ajy:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218