Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MSKPVLYYDDISPPVRGVLLTVAALGIKDQVELKLVRLFEREHLLEDFVKLNPLHAVPVLKHDDLVLTDSHAIIMYLCDI
FGQDGDFSLKDPKQRARVHNRLCFNNAVLFQRESIVMRGLINRSIVLEDHHLKPVQEAYDCLEVYLTNSKFVACDQLTVA
DFPIVACMSTVGMVCPLSTSRWPKTAAWFETMKQLPYYQQANQVGVDKLKERLHAVM

The query sequence (length=217) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 7ebt:B 222 218 1.0000 0.9775 0.9954 2.21e-162 7ebt:A, 7ebt:C, 7ebt:D, 7ebu:A, 7ebu:B, 7ebu:C, 7ebu:D, 7ebv:A, 7ebv:B, 7ebv:C, 7ebv:D, 7ebw:A, 7ebw:B, 7ebw:C, 7ebw:D
2 6t2t:A 229 216 0.4286 0.4061 0.4306 7.86e-53 7dax:A, 7dax:B, 7day:A, 7day:B, 7daz:A, 7daz:B, 7db0:A, 7db0:B, 7db1:A, 7db1:B, 7db2:A, 7db2:B, 7db3:A, 7db3:B, 7db4:A, 7db4:B, 6ken:AA, 6ken:BA, 6keo:AA, 6keo:BA, 6kep:AA, 6kep:BA, 6ker:AA, 6ker:BA
3 3vwx:C 220 209 0.3779 0.3727 0.3923 9.93e-48 3vwx:A, 3vwx:B, 3vwx:D
4 3zmk:B 222 207 0.3871 0.3784 0.4058 6.43e-46 4gsn:A, 4gsn:C, 4gsn:D, 2imi:A, 2imi:B, 2imk:A, 2imk:B, 3zmk:D, 3zml:A, 3zml:B
5 4gsn:B 220 206 0.3779 0.3727 0.3981 1.07e-44
6 4png:B 223 208 0.3641 0.3543 0.3798 2.12e-43 4png:A
7 4hi7:A 220 209 0.3502 0.3455 0.3636 9.27e-41 4hi7:B
8 5ft3:B 221 213 0.3456 0.3394 0.3521 4.27e-39 5ft3:A
9 4pnf:B 221 209 0.3502 0.3439 0.3636 4.71e-39 4pnf:A, 4pnf:C, 4pnf:D, 4pnf:E, 4pnf:F, 4pnf:G, 4pnf:H, 4yh2:A, 4yh2:B, 4yh2:C, 4yh2:D
10 3wyw:B 214 212 0.3502 0.3551 0.3585 6.97e-36 3wyw:A
11 9f7k:A 222 201 0.3364 0.3288 0.3632 3.15e-35 9f7k:B
12 1jlv:A 207 206 0.3134 0.3285 0.3301 5.07e-35 1jlv:B, 1jlv:C, 1jlv:D, 1jlv:E, 1jlv:F
13 1pn9:A 209 208 0.3134 0.3254 0.3269 2.87e-32 1pn9:B
14 5zwp:A 207 206 0.3088 0.3237 0.3252 1.70e-31 5zwp:B
15 7rhp:A 215 201 0.2995 0.3023 0.3234 8.02e-29
16 3mak:A 208 209 0.2857 0.2981 0.2967 3.21e-28 3ein:A
17 3f63:A 218 194 0.3134 0.3119 0.3505 2.75e-26 3f63:B, 3f6d:A, 3f6d:B, 3g7i:B, 3g7j:A, 3g7j:B
18 4i97:A 207 206 0.2765 0.2899 0.2913 8.85e-26 4i97:B
19 4e8h:B 216 211 0.2857 0.2870 0.2938 1.04e-25 4e8h:A, 4e8h:C, 4e8h:D
20 1r5a:A 214 208 0.2949 0.2991 0.3077 9.59e-25
21 3gh6:A 209 206 0.2581 0.2679 0.2718 2.39e-24
22 1v2a:B 209 208 0.2995 0.3110 0.3125 4.40e-23 1v2a:A, 1v2a:C, 1v2a:D
23 7rka:A 211 194 0.2673 0.2749 0.2990 8.56e-20
24 2c3q:A 239 196 0.2765 0.2510 0.3061 7.93e-14 2c3q:B, 2c3q:C, 2c3q:D
25 4mpg:B 252 192 0.2627 0.2262 0.2969 2.70e-13 1ljr:A, 1ljr:B, 3ljr:A, 3ljr:B, 4mpg:A
26 3qaw:A 219 180 0.2442 0.2420 0.2944 6.65e-12
27 4ivf:F 227 223 0.2396 0.2291 0.2332 2.15e-10 4ivf:A, 4ivf:B, 4ivf:C, 4ivf:D, 4ivf:E, 4ivf:G, 4ivf:H
28 4kdx:A 207 185 0.2304 0.2415 0.2703 3.26e-10 4kdx:B
29 4iel:B 206 141 0.1935 0.2039 0.2979 2.22e-09 4iel:A
30 8ai8:A 183 166 0.1797 0.2131 0.2349 3.56e-09 8ai8:B, 8ai9:A, 8ai9:B, 8aib:A, 8aib:B, 7pka:A, 7pka:B
31 5f06:A 213 182 0.2212 0.2254 0.2637 1.35e-08 5f06:B
32 4kh7:B 212 164 0.1797 0.1840 0.2378 3.65e-08 4kh7:A
33 8ix7:B 221 174 0.2258 0.2217 0.2816 6.60e-08 8ix7:A
34 4f0c:A 228 177 0.1889 0.1798 0.2316 2.75e-07 5o00:A
35 2x64:B 207 170 0.2166 0.2271 0.2765 3.59e-07 2x64:A, 2x64:C, 2x64:D, 2x64:E, 2x64:F
36 4ri6:A 214 169 0.1843 0.1869 0.2367 4.99e-07 4ri6:B, 4ri7:A, 4ri7:B
37 8jzk:A 214 157 0.1797 0.1822 0.2484 2.16e-06
38 7nc5:A 239 169 0.1843 0.1674 0.2367 2.88e-06 7nc5:B, 7nc5:C, 7nc5:D, 7nc5:E, 7nc5:F, 7nc6:A, 7nc6:B, 7nc6:C, 7nc6:D, 7nc6:E, 7nc6:F, 7ncu:A, 7ncu:B
39 3c8e:A 284 166 0.1935 0.1479 0.2530 8.84e-06 3c8e:B
40 4nhw:D 217 168 0.1751 0.1751 0.2262 9.61e-06 4nhw:A, 4nhw:B, 4nhw:C
41 3ubl:A 212 138 0.1705 0.1745 0.2681 1.42e-05 3ubl:B
42 8agq:A 213 195 0.2396 0.2441 0.2667 3.14e-05 5f07:A
43 3uar:A 203 171 0.2028 0.2167 0.2573 3.62e-05
44 4xt0:A 243 54 0.1106 0.0988 0.4444 5.33e-05
45 1bye:A 213 170 0.1889 0.1925 0.2412 8.69e-05 1axd:A, 1axd:B, 1bye:B, 1bye:C, 1bye:D
46 1fw1:A 208 172 0.2350 0.2452 0.2965 1.01e-04
47 4iw9:B 215 61 0.0922 0.0930 0.3279 2.64e-04 4iw9:A, 4iw9:C
48 4pua:A 261 200 0.2028 0.1686 0.2200 3.29e-04
49 4hz2:B 206 160 0.1843 0.1942 0.2500 3.93e-04 4hz2:A
50 5f05:C 211 181 0.2028 0.2085 0.2431 5.01e-04 5f05:A, 5f05:B, 5f05:D
51 4zb8:A 220 208 0.2028 0.2000 0.2115 8.67e-04 4zbd:A, 4zbd:B
52 5a4u:A 211 178 0.1935 0.1991 0.2360 0.001 5a4u:B, 5a4u:C, 5a4u:D, 5a4u:E, 5a4u:F, 5a4v:A, 5a4v:B, 5a4v:C, 5a4v:D, 5a4v:E, 5a4v:F, 5a4w:A, 5a4w:B, 5a4w:C, 5a4w:D, 5a4w:E, 5a4w:F, 5a5k:A, 5a5k:B, 5a5k:C, 5a5k:D, 5a5k:E, 5a5k:F, 5a5k:G, 5a5k:H, 5a5k:I, 5a5k:J, 5a5k:K, 5a5k:L, 5a5k:M, 5a5k:N, 5a5k:O, 5a5k:P, 5a5k:Q, 5a5k:R, 5a5k:S, 5a5k:T, 5a5k:U, 5a5k:V, 5a5k:W, 5a5k:X, 1bx9:A, 1gnw:A, 1gnw:B
53 4zb6:D 220 209 0.2028 0.2000 0.2105 0.001 4zb6:A, 4zb6:B, 4zb6:C
54 2aaw:C 211 217 0.2488 0.2559 0.2488 0.001 2aaw:A, 3fr3:A, 3fr3:B, 3fr9:A, 3fr9:B, 3frc:A, 3frc:B, 1q4j:A, 1q4j:B
55 6tah:B 213 151 0.1613 0.1643 0.2318 0.001 4ecj:A, 4ecj:B, 6tah:AAA, 6tah:CAA, 6tah:DAA
56 3lsz:A 223 161 0.1751 0.1704 0.2360 0.001 3lsz:B, 3lsz:C, 3lsz:D
57 4f0b:A 220 175 0.1889 0.1864 0.2343 0.001 4f0b:B
58 7dwe:A 212 184 0.1935 0.1981 0.2283 0.002 7dwg:A
59 5agy:A 219 182 0.2028 0.2009 0.2418 0.003 5agy:B, 4chs:A, 4chs:B, 4top:A, 4top:B, 2vo4:A, 2vo4:B
60 5f8b:A 215 163 0.1797 0.1814 0.2393 0.004 5fhi:A
61 6ezy:B 212 179 0.1797 0.1840 0.2179 0.004 6f01:B, 6f05:A, 6f05:B, 6f05:C, 6f05:D, 6f05:E, 6f05:F, 6f05:G, 6f05:H, 6f05:I, 6f05:J
62 3erg:A 208 213 0.2074 0.2163 0.2113 0.005 3erg:B, 3ibh:A
63 2cz2:A 212 128 0.1521 0.1557 0.2578 0.009
64 4mzw:A 270 202 0.1935 0.1556 0.2079 0.013 4mzw:B
65 4gf0:A 208 79 0.0968 0.1010 0.2658 0.014 4gf0:B
66 1f2e:A 201 60 0.0968 0.1045 0.3500 0.020 1f2e:B, 1f2e:C, 1f2e:D
67 5uun:A 286 161 0.1659 0.1259 0.2236 0.026 5uun:B, 5uuo:B, 5uuo:A
68 6nv6:B 207 159 0.1475 0.1546 0.2013 0.026
69 4zba:A 222 179 0.1843 0.1802 0.2235 0.026 4zb9:A, 4zb9:C, 4zb9:D, 4zba:B, 4zba:C, 4zba:D, 4zbb:A, 4zbb:C, 4zbb:B, 4zbb:D
70 4jbb:A 208 50 0.0876 0.0913 0.3800 0.033
71 4qq7:A 204 68 0.1106 0.1176 0.3529 0.056 4qq7:B
72 4mf6:A 240 154 0.1797 0.1625 0.2532 0.057 4mf5:A
73 4q5q:A 218 205 0.2028 0.2018 0.2146 0.058 4q5q:B
74 6zb6:C 227 173 0.1889 0.1806 0.2370 0.079 7obo:AAA, 7odm:AAA, 6riv:B, 6riv:A, 6tk8:AAA, 6zb6:A, 6zb6:E, 6zb6:B, 6zb6:F, 6zb6:D
75 1gwc:C 222 61 0.0968 0.0946 0.3443 0.088 1gwc:A, 1gwc:B
76 2v6k:A 214 46 0.0922 0.0935 0.4348 0.089 2jl4:A, 2jl4:B, 2v6k:B
77 1b48:A 221 104 0.1336 0.1312 0.2788 0.11 1b48:B
78 1vf1:A 226 95 0.1244 0.1195 0.2842 0.14 1vf2:A, 1vf2:B, 1vf3:A, 1vf3:B
79 7y55:A 224 83 0.1106 0.1071 0.2892 0.19 7y55:B, 7y55:C, 7y55:D
80 4hoj:A 197 122 0.1613 0.1777 0.2869 0.20
81 1pmt:A 201 36 0.0737 0.0796 0.4444 0.20 2pmt:A, 2pmt:B, 2pmt:C, 2pmt:D
82 5ech:B 214 176 0.1751 0.1776 0.2159 0.20 5ech:C, 5ech:E, 5ech:F, 5eci:B, 5eci:C, 5eci:E, 5eci:F, 5eck:B, 5eck:C, 5eck:E, 5eck:F, 5ecl:B, 5ecl:C, 5ecl:E, 5ecl:F, 5ecm:B, 5ecm:C, 5ecm:E, 5ecm:F, 5ecn:B, 5ecn:C, 5ecn:E, 5ecn:F, 5eco:B, 5eco:C, 5eco:E, 5eco:F, 5ecp:B, 5ecp:C, 5ecp:E, 5ecp:F, 5ecq:B, 5ecq:C, 5ecq:E, 5ecq:F, 5ecr:B, 5ecr:C, 5ecr:E, 5ecr:F, 5ecs:A, 5ecs:B
83 1jzr:A 234 176 0.1659 0.1538 0.2045 0.24 1k0a:A, 1k0a:B, 1k0b:A, 1k0c:A, 1k0c:B, 1k0d:A, 1k0d:B
84 6m1t:A 201 64 0.1060 0.1144 0.3594 0.27 6m1t:B
85 6to3:AAA 190 160 0.1843 0.2105 0.2500 0.35
86 6snl:D 320 110 0.1198 0.0813 0.2364 0.35 6snl:A, 6snl:B, 6snl:C, 6snl:E, 6snl:F
87 2gdr:A 202 35 0.0645 0.0693 0.4000 0.39 2dsa:A, 2dsa:B, 2dsa:C, 2dsa:D, 2gdr:B, 2gdr:C, 2gdr:D, 2gdr:E, 2gdr:F
88 4ofm:B 206 165 0.1982 0.2087 0.2606 0.52 4ofm:A, 4ofm:C, 4ofm:D, 4ofn:A, 4ofn:B
89 5b7c:A 206 151 0.1797 0.1893 0.2583 0.55
90 5elg:A 212 55 0.0922 0.0943 0.3636 0.74
91 5j4u:A 218 87 0.1106 0.1101 0.2759 1.1 5j5n:A, 5j5n:B
92 6ep7:B 214 167 0.1659 0.1682 0.2156 1.2 6ep7:A
93 5kej:A 222 50 0.0737 0.0721 0.3200 1.4 5g5f:A, 5kej:B
94 4ai6:A 2650 140 0.1521 0.0125 0.2357 1.5 4ai6:B, 4akg:A, 4akg:B, 4akh:A, 4akh:B, 4aki:A, 4aki:B, 3crt:A, 3cru:A, 3d0z:A, 1dug:A, 1dug:B, 1gne:A, 1gtb:A, 8gyd:A, 8gyd:B, 5gzz:B, 5gzz:C, 5gzz:D, 5gzz:E, 5gzz:F, 5gzz:G, 6ji6:A, 1m99:A, 1m9a:A, 1m9b:A, 7mi3:A, 7mi6:A, 6rwd:A, 6rwd:B, 1u87:A, 1u88:A, 1ua5:A, 4wr4:A, 4wr5:A
95 4ec0:B 200 128 0.1475 0.1600 0.2500 1.6 5ais:A, 5ais:B, 5ais:C, 5ais:D, 5aiv:A, 5aiv:B, 5aiv:C, 5aiv:D, 5aix:B, 5aix:C, 2cvd:A, 2cvd:B, 2cvd:C, 2cvd:D, 4ec0:A, 4edy:A, 4edy:B, 4edz:A, 4edz:B, 4edz:C, 4edz:D, 3ee2:A, 4ee0:A, 4ee0:B, 1iyh:A, 1iyh:B, 1iyh:C, 1iyh:D, 1iyi:A, 1iyi:B, 1iyi:C, 1iyi:D, 7jr6:A, 7jr6:B, 7jr8:A, 7jr8:B, 3kxo:A, 3kxo:B, 6n4e:A, 1v40:A, 1v40:B, 1v40:C, 1v40:D, 2vcq:A, 2vcq:B, 2vcq:C, 2vcq:D, 2vcw:A, 2vcw:B, 2vcw:D, 2vcx:A, 2vcx:B, 2vcx:C, 2vcx:D, 2vcz:A, 2vcz:B, 2vcz:D, 2vd0:A, 2vd0:B, 2vd0:D, 2vd1:A, 2vd1:B, 2vd1:C, 2vd1:D, 3vi5:A, 3vi5:B, 3vi5:C, 3vi5:D, 3vi7:A, 3vi7:B, 3vi7:C, 3vi7:D, 6w58:A, 6w58:B, 6w8h:A, 6w8h:C, 5ywe:A, 5ywe:B, 5ywe:C, 5ywe:D, 5ywx:A, 5ywx:B, 5ywx:C, 5ywx:D, 5yx1:A, 5yx1:B, 5yx1:C, 5yx1:D, 6ztc:A, 6ztc:B
96 4gqn:B 205 92 0.0922 0.0976 0.2174 1.7 4e0f:A, 4e0f:B, 4g6i:A, 4g6i:B, 4g6i:C, 4gqn:A, 4gqn:C
97 7aia:AAA 259 79 0.1198 0.1004 0.3291 1.8
98 4g9h:A 202 34 0.0691 0.0743 0.4412 2.2 4g9h:B, 4gci:A, 4gci:B
99 4isd:A 187 25 0.0507 0.0588 0.4400 2.2 4isd:B, 4isd:C, 4isd:D, 4isd:E
100 2dym:G 262 62 0.0783 0.0649 0.2742 2.4 2dym:A, 2dym:E, 2dym:C, 3w1s:A
101 1jzr:C 255 43 0.0691 0.0588 0.3488 3.9 1k0b:C, 1k0c:C, 1k0c:D, 1k0d:C
102 3bby:A 191 26 0.0599 0.0681 0.5000 4.6
103 5g5a:A 219 94 0.1152 0.1142 0.2660 5.6 5g5a:B, 5g5a:C, 5g5a:D
104 6ryx:A 626 74 0.0783 0.0272 0.2297 5.7 6ryv:A, 6ryw:A
105 4lo5:B 421 62 0.0691 0.0356 0.2419 6.8 4lo6:B
106 4pxo:A 216 32 0.0737 0.0741 0.5000 7.4 4pxo:B
107 1sg9:A 274 50 0.0599 0.0474 0.2600 8.1 1nv8:A, 1nv8:B, 1nv9:A, 1sg9:B, 1sg9:C, 1vq1:A, 1vq1:B
108 1bor:A 56 18 0.0323 0.1250 0.3889 9.8 2mwx:A, 5yuf:A, 5yuf:B, 5yuf:C, 5yuf:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218