BioLiP

>protein
MSKISVTVNGRRYPWPRVPAIAVCLDGCEPAYLDAAIDAGLMPALKRIKERGAVRLAHSVIPSFANPNNLSIATGSPPAV
HGICGNYLYEPSTGEEVMMNDPKFLRAPTIFQAFYDAGARVAVVTAKDKLRALLGKGLRFDEGRAVCFSSEKSDKATRAE
HGIDNASAWLGRPVPEVYSAALSEFVFAAGVKLLREFRPDIMYLTTTDYVQHKYAPGVPEANSFYEMFDRYLAELDGLGA
AIVVTADHGMKPKHKADGSPDVIYVQDLLDEWLGKDAARVILPITDPYVVHHGALGSFATAYLPDGCDRSEIMARLKAIQ
GVDVVLGREEACRRFELPEDRIGDIVLVSSENKTLGTSEHRHDLAALDEPLRSHGGLTEQEVPFIVNRVLPELPNAPRLR
NFDAFFYAVTAAA

The query sequence (length=413) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3szy:A	413	413	0.9976	0.9976	0.9976	0.0	3szz:A, 3t00:A, 3t01:A, 3t02:A
2	1ei6:A	404	398	0.5303	0.5421	0.5503	1.50e-157	1ei6:B, 1ei6:C, 1ei6:D
3	6xkd:A	679	244	0.1477	0.0898	0.2500	8.93e-07
4	4gtw:A	706	244	0.1477	0.0864	0.2500	1.19e-06	4gtw:B, 4gtx:A, 4gtx:B, 4gty:A, 4gty:B, 4gtz:A, 4gtz:B, 6xkd:B
5	4b56:A	816	244	0.1477	0.0748	0.2500	1.73e-06	6aek:A, 6ael:A, 4b56:B
6	6wev:AbA	817	251	0.1525	0.0771	0.2510	2.86e-06	8ghr:A, 8ghr:B, 6wet:AaA, 6wet:BaB, 6weu:AbA, 6weu:BbB, 6wev:BbB, 6wew:AbA, 6wew:BaB, 6wfj:AcA, 6wfj:BcB
7	3way:A	787	247	0.1477	0.0775	0.2470	4.53e-06	8c3o:B, 8c3p:A, 8c3p:B, 8c4w:A, 8c7r:A, 5dlv:A, 5dlv:B, 5dlw:A, 5inh:A, 5l0b:A, 5l0b:B, 5l0e:A, 5l0e:B, 5l0k:A, 5l0k:B, 6leh:A, 5lqq:A, 5m0d:A, 5m0e:A, 5m0m:A, 5m0s:A, 7mfh:A, 5mhp:A, 3nkn:A, 3nko:A, 3nkq:A, 3nkr:A, 5ohi:A, 5olb:A, 7p0k:AAA, 7p4j:A, 7p4o:A, 3waw:A, 6y5m:A, 4zg7:A
8	5s9m:A	809	247	0.1477	0.0754	0.2470	4.68e-06	8c3o:A, 5dlt:A, 9ent:A, 9eu5:A, 5hrt:A, 5ijq:A, 5ijs:A, 5lia:A, 3nkm:A, 3nkp:A, 5s9l:A, 5s9n:A, 6w35:A, 3wav:A, 3wax:A, 2xr9:A, 7z0n:AAA, 7z3k:AAA, 7z3l:AAA
9	2xrg:A	758	247	0.1477	0.0805	0.2470	4.80e-06
10	4zg9:B	764	247	0.1453	0.0785	0.2429	2.05e-05	5kxa:A, 5m7m:A, 4zg6:A, 4zg6:B, 4zg9:A, 4zga:A
11	5gz4:A	804	250	0.1356	0.0697	0.2240	5.41e-04	7cba:A, 7cba:B, 5gz5:A
12	5egh:B	393	76	0.0581	0.0611	0.3158	6.23e-04	5ege:A, 5ege:B, 5ege:C, 5ege:D, 5egh:A
13	7mw8:C	385	140	0.0799	0.0857	0.2357	0.001	2gsn:A, 2gsn:B, 2gso:A, 2gso:B, 2gsu:A, 2gsu:B, 7mw8:A, 7mw8:D, 7mw8:B, 7mw8:E, 7mw8:F, 7n1s:A, 7n1s:B, 2rh6:A, 2rh6:B
14	6f2t:B	722	73	0.0557	0.0319	0.3151	0.003	6f2t:A, 6f2v:A, 6f2v:B, 6f2y:A, 6f2y:B, 6f30:A, 6f30:B, 6f33:A, 6f33:B
15	6g4g:C	742	73	0.0557	0.0310	0.3151	0.004
16	6g4g:D	781	73	0.0557	0.0294	0.3151	0.004	6g4g:A
17	4lqy:A	379	366	0.1937	0.2111	0.2186	0.013	4lr2:A
18	5tcd:A	388	253	0.1380	0.1469	0.2253	0.021	5udy:A
19	6c01:A	819	106	0.0678	0.0342	0.2642	0.021	6c01:B, 6c02:A, 6c02:B
20	5tj3:A	520	37	0.0363	0.0288	0.4054	0.13	5too:A
21	5tj3:A	520	54	0.0533	0.0423	0.4074	1.6	5too:A
22	6g4g:B	759	50	0.0387	0.0211	0.3200	0.64
23	5xwk:A	530	297	0.1622	0.1264	0.2256	1.3	3q3q:A
24	5xwi:A	503	297	0.1622	0.1332	0.2256	1.3
25	4v5o:AC	229	78	0.0436	0.0786	0.2308	2.1	4bts:AC, 4bts:BC, 4bts:CC, 4bts:DC, 4v5o:BC
26	3egw:A	1244	77	0.0484	0.0161	0.2597	2.8	3ir5:A, 3ir6:A, 3ir7:A, 1q16:A, 1r27:A, 1r27:C, 1siw:A, 1y4z:A, 1y5i:A, 1y5l:A, 1y5n:A
27	5w4c:A	356	52	0.0412	0.0478	0.3269	4.7	5w4c:B
28	7d0p:A	276	77	0.0484	0.0725	0.2597	5.2	7d0o:A, 7d0q:A, 7d0r:A, 7d0s:A, 5gk9:A, 6maj:A, 6mak:A
29	6m5a:A	844	92	0.0508	0.0249	0.2283	6.4
30	9bha:A	793	81	0.0436	0.0227	0.2222	6.5	5a9f:A, 5aga:A, 9bh8:A, 9bh8:B, 9bh9:A, 9bh9:B, 9bha:B, 9c5q:C, 9c5q:A
31	6s1m:A	1010	76	0.0508	0.0208	0.2763	9.3	6s1n:A, 6s1o:A, 6tny:A, 6tnz:A

[Back]