BioLiP

>protein
MSGYGLPISQEVAKELAENARKIAAPGKGILAADESTGTIKKRFDSIGVENTEANRAFYRDLLFSTKGLGQYISGAILFE
ETLYQKSPSGVPMVDLLKAEGIIPGIKVDKGLETLPLTDDEKATMGLDGLSERCKKYYEAGARFAKWRAVLSIDPAKGKP
TNLSITEVAHGLARYAAICQANRLVPIVEPEILTDGSHDITVCAEVTERVLAAVFKALNDHHVLLEGALLKPNMVTHGSD
CPKPASHEEIAFYTVRSLKRTVPPALPGVMFLSGGQSEEDASLNLNEMNKMGPHPFQLSFSYGRALQASCLKAWKGVPEN
KAKAQQVLMERARANGEAQLGKYGGGAYVY

The query sequence (length=350) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5tkl:A	350	350	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	5tk3:A, 5tkc:A, 5tkn:A, 5tkp:A
2	2eph:D	351	337	0.6714	0.6695	0.6973	8.48e-174	2pc4:D, 4tr9:A, 4tr9:B, 4tr9:C, 4tr9:D
3	6rng:B	334	334	0.6143	0.6437	0.6437	1.15e-144	6rng:G
4	4ald:A	363	339	0.5714	0.5510	0.5900	4.94e-130	6ald:A, 6ald:B, 3dft:A, 3dft:B, 3dft:C, 3dft:D, 3lge:A, 3lge:B, 3lge:C, 3lge:D, 2ot0:A, 2ot0:B, 2ot0:C, 2ot0:D, 2ot1:A, 2ot1:B, 2ot1:C, 2ot1:D, 2quv:A, 2quv:B, 2quv:D, 5tle:A, 5tle:B, 5tle:C, 5tle:D, 5tlh:A, 5tlh:B, 5tlh:C, 5tlh:D, 5tlw:A, 5tlw:B, 5tlw:C, 5tlw:D, 5tlz:A, 5tlz:B, 5tlz:C, 5tlz:D, 3tu9:A, 3tu9:B, 3tu9:C, 3tu9:D, 6xmh:A, 6xmh:B, 6xml:A, 6xml:B, 6xmm:A, 6xmm:B, 6xmo:A, 6xmo:B, 1zai:A, 1zai:B, 1zai:C, 1zai:D, 1zaj:A, 1zaj:B, 1zaj:C, 1zaj:D, 1zal:A, 1zal:B, 1zal:C, 1zal:D
5	1fdj:A	363	338	0.5371	0.5179	0.5562	7.92e-124	1fdj:B
6	3mmt:A	341	334	0.5200	0.5337	0.5449	7.94e-115	3mmt:B, 3mmt:C, 3mmt:D
7	2qdg:A	366	333	0.4686	0.4481	0.4925	9.04e-101	2qap:A, 2qap:B, 2qap:C, 2qap:D, 2qdg:B, 2qdg:C, 2qdg:D, 2qdh:A, 2qdh:B, 2qdh:C, 2qdh:D
8	3mbf:A	337	318	0.3943	0.4095	0.4340	1.62e-82	3mbd:A, 3qrh:A
9	1c7g:A	456	105	0.0743	0.0570	0.2476	0.97	1c7g:B, 1c7g:C, 1c7g:D, 6dur:A, 6dur:B, 6dvx:A, 6dvx:B, 6dyt:A, 6dyt:B, 6dz5:A, 6dz5:B, 6ecg:A, 2ez2:A, 2ez2:B, 7fjk:A, 7fjk:B, 7fjk:C, 7fjk:D, 6mls:A, 6mls:B, 6mme:A, 6mme:B, 6mo3:A, 6mo3:B, 6mpd:A, 6mpd:B, 6mqq:A, 6mqq:B, 6nv8:A, 6nv8:B, 7tcs:A, 7tcs:B, 7tcs:C, 7tcs:D, 7tdl:A, 7tdl:B, 7tdl:C, 7tdl:D, 2tpl:B, 2vlf:A, 2vlf:B, 2vlh:A, 2vlh:B, 2ycn:A, 2ycn:B, 2ycp:A, 2ycp:B, 2ycp:C, 2ycp:D, 2yct:A, 2yct:B, 2yhk:A, 2yhk:B
10	6rqf:J	160	93	0.0714	0.1562	0.2688	2.6	7qrm:B, 7qrm:J, 6rqf:B, 7zyv:J, 7zyv:B
11	4ur3:A	458	72	0.0571	0.0437	0.2778	6.2	5m2g:A, 5m2g:B, 5m8u:A, 5m8u:B, 5m8w:A, 5m8w:B, 5m8x:A, 5m8x:B, 5m8y:A, 5m8y:B, 5m8z:A, 5m8z:B, 5m90:A, 5m90:B, 5m91:A, 5m91:B, 5m92:A, 5m92:B, 5ma0:A, 5ma0:B, 5ma1:A, 5ma1:B, 5ma2:A, 5ma2:B, 5maa:A, 5maa:B, 5obi:A, 5obi:B, 5obp:A, 5obp:B, 4uqu:A, 4uqu:B, 4ur0:A, 4ur0:B, 4ur1:A, 4ur1:B, 4ur2:A, 4ur2:B, 4ur3:B, 4ur3:C, 4ur3:D, 4ur3:E, 4ur3:F
12	4ga6:A	493	142	0.1086	0.0771	0.2676	7.6	4ga4:A, 4ga4:B, 4ga6:B
13	6fzi:B	332	42	0.0514	0.0542	0.4286	9.6	6fzi:A, 6fzi:C, 6fzi:D

[Back]