BioLiP

>protein
MSFGEALEVLKQGMQVYRSGWNGKNMFLFLKSSDALASDFGFGFGEYINEPVFGNIIFIKTADNKIHAWVPSQTDVLAED
WDIV

The query sequence (length=84) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8smf:E	84	84	1.0000	1.0000	1.0000	1.51e-58	8smf:D, 8smf:F, 8smf:B, 8smf:A, 8smf:G
2	8smg:B	76	84	0.8810	0.9737	0.8810	1.41e-47	8smf:C, 8smf:H
3	8kbj:B	104	102	0.4524	0.3654	0.3725	4.86e-15	8kbj:A, 8kbj:C, 8kbj:D, 8kbk:A, 8kbk:C, 8kbk:D, 8kbk:B, 8kbl:A, 8kbm:A, 8kbm:B, 8wjc:A, 8wjc:D, 8wjc:B, 8wjc:C
4	8wjd:A	101	93	0.3571	0.2970	0.3226	1.95e-11
5	8ptk:f	4502	32	0.1429	0.0027	0.3750	0.26	8ptk:e
6	7z8f:e	4579	32	0.1429	0.0026	0.3750	0.26	5owo:A, 8pr2:f, 8ptk:m, 8ptk:n, 7z8f:f, 7z8f:m, 7z8f:n, 7z8h:A
7	5gza:A	290	40	0.1786	0.0517	0.3750	0.66
8	8ro0:A	2231	36	0.1429	0.0054	0.3333	1.2	8ro1:A
9	4um9:D	455	36	0.1548	0.0286	0.3611	1.9	5ffg:B, 5ffo:B, 5ffo:F, 5neu:B, 8tcg:B, 4um8:B, 4um8:D, 4um9:B
10	8i0p:A	2149	36	0.1429	0.0056	0.3333	2.6	8q7q:A, 8q7v:A, 8q7w:A
11	5z57:A	1978	36	0.1429	0.0061	0.3333	2.7
12	8qp8:A	1918	36	0.1429	0.0063	0.3333	2.7
13	7abg:A	2174	36	0.1429	0.0055	0.3333	2.7	7abi:A, 8q91:A, 8rc0:A
14	5z56:A	2232	36	0.1429	0.0054	0.3333	2.7	7aav:A, 7abf:A, 8ch6:a, 7dvq:A, 8i0s:A, 5z58:A
15	8h6k:5B	2253	36	0.1429	0.0053	0.3333	2.7	8h6l:5B, 8i0u:A, 8i0v:A, 8q7n:A, 8qo9:A, 8qpe:A, 7qtt:a, 8qzs:A
16	8c6j:A	2261	36	0.1429	0.0053	0.3333	2.7	6ah0:A, 6ahd:A, 8bc8:J, 6ff4:A, 6ff7:A, 9fmd:A, 8i0r:A, 8i0t:A, 8i0w:A, 6icz:A, 6id0:A, 6id1:A, 4jk9:A, 4jk9:B, 4jka:A, 4jka:B, 5mqf:A, 5o9z:A, 6qdv:A, 8qoz:A, 8qpa:A, 8qpb:A, 8qpk:A, 8r09:A, 8r0a:A, 8r0b:A, 8rm5:A, 8ro2:A, 7w59:A, 7w5a:A, 7w5b:A, 5xjc:A, 5yzg:A, 6zym:A
17	8q7x:A	1914	36	0.1429	0.0063	0.3333	2.8
18	8y6o:C	2227	36	0.1429	0.0054	0.3333	2.9	8h6e:5B, 8h6j:5B, 8qp9:A, 6qw6:5A, 6qx9:5A, 8qxd:A, 8r08:A
19	8f3i:A	641	63	0.2143	0.0281	0.2857	3.4	8f3g:A, 8f3l:A, 8f3n:A, 8f3p:A, 8f3s:A, 8f3u:A, 8f3w:A, 8f3y:A, 6g88:A, 6mkf:A, 6mkg:A
20	7lgp:B	377	31	0.1190	0.0265	0.3226	3.7	7lgp:A
21	5fw4:A	368	22	0.1071	0.0245	0.4091	4.1	5fw4:B
22	8v87:3	656	33	0.1429	0.0183	0.3636	5.1	8v84:3
23	6hiv:DT	239	23	0.1190	0.0418	0.4348	5.3	6hiw:DT, 6hiz:DT, 7pua:DT, 7pub:DT
24	6g88:C	597	63	0.2143	0.0302	0.2857	5.9	6g88:B
25	6s8g:G	244	46	0.1429	0.0492	0.2609	6.6	7efo:G, 6mi7:G, 6s8h:G, 6s8n:G
26	5gzs:A	432	49	0.1786	0.0347	0.3061	8.9

[Back]