BioLiP

>protein
MSFGEALEVLKQGMQVYRSGWNGKNMFLFLKSSDALASDFGFGFGEPVFGNIIFIKTADNKIHAWVPSQTDVLAEDWDIV
S

The query sequence (length=81) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8smf:E	84	84	0.9877	0.9524	0.9524	5.16e-53	8smf:D, 8smf:F, 8smf:B, 8smf:A, 8smf:G
2	8smg:B	76	81	0.9136	0.9737	0.9136	3.48e-48	8smf:C, 8smf:H
3	8kbj:B	104	102	0.4815	0.3750	0.3824	1.41e-14	8kbj:A, 8kbj:C, 8kbj:D, 8kbk:A, 8kbk:C, 8kbk:D, 8kbk:B, 8kbl:A, 8kbm:A, 8kbm:B, 8wjc:A, 8wjc:D, 8wjc:B, 8wjc:C
4	8wjd:A	101	93	0.3951	0.3168	0.3441	1.77e-11
5	8ptk:f	4502	32	0.1481	0.0027	0.3750	0.24	8ptk:e
6	7z8f:e	4579	32	0.1481	0.0026	0.3750	0.24	5owo:A, 8pr2:f, 8ptk:m, 8ptk:n, 7z8f:f, 7z8f:m, 7z8f:n, 7z8h:A
7	2w0a:A	424	66	0.2222	0.0425	0.2727	0.62	2ci0:A, 2cib:A, 2w09:A
8	5gza:A	290	40	0.1852	0.0517	0.3750	0.67
9	8ro0:A	2231	42	0.1728	0.0063	0.3333	0.75	8ro1:A
10	8pb4:A	320	28	0.1605	0.0406	0.4643	1.4	8pb3:A, 8pb3:B, 8pb5:A, 8pb6:A, 8pb7:A, 8pb8:A, 8pb8:B, 8qxq:A
11	8i0p:A	2149	42	0.1728	0.0065	0.3333	1.7	8q7q:A, 8q7v:A, 8q7w:A
12	5z57:A	1978	42	0.1728	0.0071	0.3333	1.8
13	8q7x:A	1914	42	0.1728	0.0073	0.3333	1.8
14	8qp8:A	1918	42	0.1728	0.0073	0.3333	1.8
15	7abg:A	2174	42	0.1728	0.0064	0.3333	1.8	7abi:A, 8q91:A, 8rc0:A
16	5z56:A	2232	42	0.1728	0.0063	0.3333	1.8	7aav:A, 7abf:A, 8ch6:a, 7dvq:A, 8i0s:A, 5z58:A
17	8h6k:5B	2253	42	0.1728	0.0062	0.3333	1.8	8h6l:5B, 8i0u:A, 8i0v:A, 8q7n:A, 8qo9:A, 8qpe:A, 7qtt:a, 8qzs:A
18	8y6o:C	2227	42	0.1728	0.0063	0.3333	1.8	8h6e:5B, 8h6j:5B, 8qp9:A, 6qw6:5A, 6qx9:5A, 8qxd:A, 8r08:A
19	8c6j:A	2261	42	0.1728	0.0062	0.3333	1.8	6ah0:A, 6ahd:A, 8bc8:J, 6ff4:A, 6ff7:A, 9fmd:A, 8i0r:A, 8i0t:A, 8i0w:A, 6icz:A, 6id0:A, 6id1:A, 4jk9:A, 4jk9:B, 4jka:A, 4jka:B, 5mqf:A, 5o9z:A, 6qdv:A, 8qoz:A, 8qpa:A, 8qpb:A, 8qpk:A, 8r09:A, 8r0a:A, 8r0b:A, 8rm5:A, 8ro2:A, 7w59:A, 7w5a:A, 7w5b:A, 5xjc:A, 5yzg:A, 6zym:A
20	6hiv:DT	239	25	0.1235	0.0418	0.4000	1.9	6hiw:DT, 6hiz:DT, 7pua:DT, 7pub:DT
21	6ql9:D	1765	33	0.1235	0.0057	0.3030	2.7	3hmj:A, 3hmj:B, 3hmj:C, 8prv:A, 8prv:B, 8prw:A, 8prw:B, 8prw:C, 8prw:D, 8prw:E, 8prw:F, 8ps1:A, 6ql6:F, 6ql6:E, 6ql6:D, 6ql6:C, 6ql6:B, 6ql6:A, 6ql9:F, 6ql9:A, 6ql9:E, 6ql9:B, 6ql9:C, 6ta1:A, 6ta1:B, 6ta1:D, 6ta1:K, 6ta1:F, 6ta1:I, 6u5u:A, 2vkz:A, 2vkz:B, 2vkz:C, 2wat:A, 2wat:B, 2wat:C, 2wat:D, 2wat:E, 2wat:F
22	7lgp:B	377	31	0.1235	0.0265	0.3226	3.4	7lgp:A
23	5svc:A	763	35	0.1358	0.0144	0.3143	3.6	5m45:A, 5m45:D, 5m45:G, 5m45:J, 5svb:A, 5svb:D, 5svc:D
24	8v87:3	656	33	0.1481	0.0183	0.3636	4.7	8v84:3
25	5fw4:A	368	20	0.1111	0.0245	0.4500	6.2	5fw4:B

[Back]