BioLiP

>protein
MSFDDLHKATERAVIQAVDQICDDFEVTPEKLDELTAYFIEQMEKGLAPPKEGHTLASDKGLPMIPAFVTGSPNGTERGV
LLAADLGGTNFRICSVNLHGDHTFSMEQMKSKIPDDLLDDENVTSDDLFGFLARRTLAFMKKYHPDELAKGKDAKPMKLG
FTFSYPVDQTSLNSGTLIRWTKGFRIADTVGKDVVQLYQEQLSAQGMPMIKVVALTNDTVGTYLSHCYTSDNTDSMTSGE
ISEPVIGCIFGTGTNGCYMEEINKITKLPQELRDKLIKEGKTHMIINVEWGSFDNELKHLPTTKYDVVIDQKLSTNPGFH
LFEKRVSGMFLGEVLRNILVDLHSQGLLLQQYRSKEQLPRHLTTPFQLSSEVLSHIEIDDSTGLRETELSLLQSLRLPTT
PTERVQIQKLVRAISRRSAYLAAVPLAAILIKTNALNKRYHGEVEIGCDGSVVEYYPGFRSMLRHALALSPLGAEGERKV
HLKIAKDGSGVGAALCALVA

The query sequence (length=500) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6pdt:A	500	500	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	6pdt:B, 6pdt:C, 6pdt:D
2	3o5b:A	479	476	0.3640	0.3800	0.3824	2.52e-90	3o5b:B, 3o80:A, 3o8m:A
3	3b8a:X	470	491	0.3660	0.3894	0.3727	1.03e-79
4	3hm8:A	441	462	0.3220	0.3651	0.3485	4.03e-71	3hm8:B, 3hm8:C, 3hm8:D
5	6jj7:A	465	498	0.3600	0.3871	0.3614	3.40e-69	6jj7:C, 6jj7:E, 6jj8:C, 6jj8:A, 6jj8:B, 6jj9:C, 6jj9:A, 6jj9:E, 5zqt:A, 5zqt:B, 5zqt:C
6	5hfu:B	897	492	0.3460	0.1929	0.3516	4.63e-68	5hex:A, 5hex:B, 5hfu:A, 2nzt:A
7	5hfu:B	897	501	0.3180	0.1773	0.3174	4.17e-65	5hex:A, 5hex:B, 5hfu:A, 2nzt:A
8	2nzt:B	867	490	0.3440	0.1984	0.3510	2.25e-67
9	2nzt:B	867	498	0.3060	0.1765	0.3072	3.41e-58
10	4qs7:A	455	492	0.3420	0.3758	0.3476	2.62e-66	4qs9:A
11	5hg1:A	867	498	0.3140	0.1811	0.3153	2.23e-65
12	5hg1:A	867	490	0.3280	0.1892	0.3347	5.32e-56
13	1qha:A	903	489	0.3240	0.1794	0.3313	2.45e-65	1bg3:A, 1bg3:B, 1cza:N, 1dgk:N, 4f9o:A, 4f9o:B, 4foe:A, 4foe:B, 4foi:A, 4foi:B, 4fpa:A, 4fpa:B, 4fpb:A, 4fpb:B, 1hkb:A, 1hkb:B, 1hkc:A, 1qha:B
14	1qha:A	903	493	0.3160	0.1750	0.3205	3.35e-56	1bg3:A, 1bg3:B, 1cza:N, 1dgk:N, 4f9o:A, 4f9o:B, 4foe:A, 4foe:B, 4foi:A, 4foi:B, 4fpa:A, 4fpa:B, 4fpb:A, 4fpb:B, 1hkb:A, 1hkb:B, 1hkc:A, 1qha:B
15	1bdg:A	444	491	0.3160	0.3559	0.3218	7.08e-63
16	3idh:A	453	492	0.2940	0.3245	0.2988	9.81e-59	3a0i:X, 4dhy:A, 6e0e:A, 6e0i:A, 3f9m:A, 3fgu:A, 3fr0:A, 3goi:A, 3h1v:X, 3id8:A, 3imx:A, 4iwv:A, 4ixc:A, 4l3q:A, 4mle:A, 4mlh:A, 4no7:A, 3qic:A, 4rch:A, 3s41:A, 7t78:A, 7t78:B, 7t79:A, 7t79:B, 1v4s:A, 3vev:A, 3vey:A, 3vf6:A
17	4dch:A	434	496	0.2860	0.3295	0.2883	1.71e-46	4ise:A, 4isf:A, 4isg:A, 5v4w:A, 5v4x:A
18	6ksr:A	467	498	0.3160	0.3383	0.3173	2.77e-45
19	7zzi:B	467	498	0.2960	0.3169	0.2972	1.46e-43	7zzi:A
20	2yhx:A	457	292	0.1460	0.1597	0.2500	2.91e-07
21	6sh3:A	376	102	0.0460	0.0612	0.2255	0.16	6sh3:B, 6sh3:C, 6sh3:D, 6sh3:E, 6sh3:F, 6sh3:G
22	6e5v:B	447	103	0.0520	0.0582	0.2524	0.27	6bsz:A, 6bsz:B, 6bt5:A, 6bt5:B, 6e5v:A
23	6xrx:A	551	73	0.0480	0.0436	0.3288	0.42
24	8inh:B	454	180	0.0860	0.0947	0.2389	0.70	8inh:A
25	8p5d:LJ0	167	53	0.0300	0.0898	0.2830	2.1	8p60:LJ0, 8p60:KJ0, 7qca:LJ0
26	5nxb:A	644	91	0.0440	0.0342	0.2418	2.8	4ccc:A, 4ccd:A, 4cce:A, 5nxb:B, 4ufh:A, 4ufi:A, 4ufj:A, 4ufk:A, 4ufl:A, 4ufm:A, 6y6s:A, 6y6t:A, 3zr5:A, 3zr6:A
27	4zgl:F	102	62	0.0380	0.1863	0.3065	3.8	4zgl:B, 4zgl:C, 4zgl:H, 4zgl:I
28	4zsi:A	166	67	0.0380	0.1145	0.2836	5.4	4zsi:B, 4zsk:A, 4zsk:B
29	4q5k:A	237	48	0.0340	0.0717	0.3542	6.0

[Back]