Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MSAVCTVCGAAPVAKSACGGWFCGNCVPYHAGHCHTTSLFACGHDIMYRSTYCTMCEGSQMVPKVPHPILDHLLCHIDYG
SKEETLVVADRTTSPPGRYKVGHKVVAVDVGGNIVFGCGPGSHIAVPLQDTLKGVVVNKALKNAAASEYVEGPPGSGKTF
HLVKDVLAVVGSATLVVPTHASMLDCINKLKQAGADPYFVVPKYTVLDFPRPGSGNITVRLPQVGTSEGETFVDEVAYFS
PVDLARILTQGRVKGYGDLNQLGCVGPASVPRNLWLRHFVSLEPLRVCHRFGAAVCDLIKGIYPYYEPAPHTTKVVFVPN
PDFEKGVVITAYHKDRGLGHRTIDSIQGCTFPVVTLRLPTPQSLTRPRAVVAVTRASQELYIYDPFDQLSGLLKF

The query sequence (length=395) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4n0n:A 401 401 0.9975 0.9825 0.9825 0.0 4n0o:A, 4n0o:C, 4n0o:E, 4n0o:G
2 6lkx:A 441 403 0.3468 0.3107 0.3400 3.91e-48 6jdr:A, 6jds:A, 6jdu:A, 6lkx:B
3 3ddh:A 229 50 0.0481 0.0830 0.3800 0.028 3ddh:B
4 7olc:Lp 91 34 0.0354 0.1538 0.4118 0.055 8ia0:Lp, 7old:Lp, 8oo0:Lp, 8pv1:Lp, 8pv2:Lp, 8pv3:Lp, 8pv4:Lp, 8pv5:Lp, 8pv6:Lp, 8pv7:Lp, 8pv8:Lp, 8pvk:Lp, 8pvl:Lp, 7r81:r1, 7z3n:Lp, 7z3o:Lp
5 7a01:I2 91 28 0.0278 0.1209 0.3929 0.17 8a3d:j, 5aj0:Ap, 8b5l:p, 8b6c:p, 9bdl:AL43, 9bdn:AL43, 9bdp:AL43, 7bhp:Lp, 8bhf:c1, 8bpo:o2, 8btk:Bp, 7cpu:Lp, 7cpv:Lp, 4d5y:p, 4d67:p, 6d90:p, 6d9j:p, 9f1b:Bp, 9f1c:Bp, 9f1d:Bp, 7f5s:Lp, 8fkz:LX, 8fl2:LX, 8fl3:LX, 8fl4:LX, 8fl6:LX, 8fl7:LX, 8fl9:LX, 8fla:LX, 8flb:LX, 8flc:LX, 8fld:LX, 8fle:LX, 8flf:LX, 6frk:p, 6ftg:p, 6fti:p, 6ftj:p, 8g5y:Lp, 8g5z:Lp, 8g60:Lp, 8g61:Lp, 8g6j:Lp, 8glp:Lp, 6gz3:Ap, 6gz4:Ap, 6gz5:Ap, 6hcf:p3, 6hcj:p3, 6hcm:p3, 6hcq:p3, 8idt:X, 8idy:X, 8ie3:X, 8ifd:2j, 8ife:2j, 8ine:X, 8inf:X, 8ink:X, 6ip5:2j, 6ip6:2j, 6ip8:2j, 8ipd:X, 8ipx:X, 8ipy:X, 8ir1:X, 8ir3:X, 3j7o:p, 3j7p:p, 3j7q:p, 3j7r:p, 3j92:p, 3jag:p, 3jah:p, 3jai:p, 3jaj:p, 3jan:p, 8jdj:u, 8jdk:u, 8jdl:u, 8jdm:u, 8k2c:Lp, 5lks:Lp, 6lqm:X, 6lsr:X, 6lss:X, 7ls1:j2, 7ls2:j2, 6lu8:X, 5lzs:p, 5lzt:p, 5lzu:p, 5lzv:p, 5lzw:p, 5lzx:p, 5lzy:p, 5lzz:p, 7mdz:p, 6mtb:p, 6mtc:p, 6mtd:p, 6mte:p, 7nfx:p, 7nwg:p3, 7nwh:p, 7nwi:p, 7o7y:Bp, 7o7z:Bp, 7o80:Bp, 7o81:Bp, 7obr:p, 8ohd:Lp, 8oj0:Lp, 8oj5:Lp, 8oj8:Lp, 6ole:q, 6olf:q, 6olg:Ap, 6oli:q, 6olz:Ap, 6om0:q, 6om7:q, 7ow7:j, 7oya:p1, 7oyb:p1, 7oyc:p1, 7oyd:p, 8p2k:Bp, 6p5i:Ap, 6p5j:Ap, 6p5k:Ap, 6p5n:Ap, 8q7z:Bp, 8q87:Bp, 8qfd:p, 7qgg:q, 8qoi:Lp, 7qvp:Lp, 7qvp:Mp, 7qwq:p, 7qwr:p, 7qws:p, 6qzp:Lp, 6r5q:p, 6r6g:p, 6r6p:p, 6r7q:p, 8rjb:p, 8rjc:p, 8rjd:p, 8scb:p, 6sgc:p2, 6swa:n, 5t2c:j, 6t59:p3, 7tm3:p, 7toq:AL43, 7tor:AL43, 7tut:p, 7ucj:p, 7uck:p, 4ug0:Lp, 4ujc:Bp, 4ujd:Ap, 4uje:Cp, 4v5z:Bz, 4v6x:Cp, 6w6l:q, 6xa1:Lp, 7xnx:Lp, 7xny:Lp, 8xsx:Lp, 8xsy:Lp, 8xsz:Lp, 6y0g:Lp, 8y0w:Lp, 8y0x:Lp, 6y2l:Lp, 6y57:Lp, 6y6x:Lp, 8yoo:Lp, 8yop:Lp, 6z6l:Lp, 6z6m:Lp, 6z6n:Lp, 7zjw:Lr, 7zjx:Lr, 6zm7:Lp, 6zme:Lp, 6zmi:Lp, 6zmo:Lp, 6zvk:I2
6 8fni:9 858 44 0.0354 0.0163 0.3182 0.29 8fnk:9
7 8c3a:AQ 91 37 0.0354 0.1538 0.3784 0.32 8c3a:CK, 8cq7:AQ, 8cq7:CK, 8cqw:AQ, 8cqw:CK, 8cre:AQ, 8cre:CK, 8oeq:AQ, 8oeq:CK, 7pzy:AQ, 7q08:AQ, 7q0f:AQ, 7q0p:AQ, 7q0r:AQ, 8q5i:AQ
8 5ftx:A 651 181 0.1342 0.0814 0.2928 0.37 5fty:A, 5fty:B, 4uie:A, 4uj7:A, 4uj8:A, 4uj8:B, 4uj8:C, 4uj8:D
9 4v6i:Bm 92 37 0.0354 0.1522 0.3784 0.43 8aaf:c, 8agt:c, 8agu:c, 8agv:c, 8agw:c, 8agx:c, 8agz:c, 5apn:p, 5apo:p, 7azy:U, 7b7d:Ll, 8bip:Lp, 8bjq:Lp, 8bn3:Q3, 8bqd:AT, 8bqx:AT, 7bt6:p, 7btb:p, 8ccs:b, 8cdl:b, 8cdr:b, 8ceh:b, 8cf5:b, 8cg8:b, 8cgn:b, 8civ:b, 8cku:b, 8cmj:b, 5dat:Q3, 5dat:q3, 5dc3:Q3, 5dc3:q3, 5dge:Q3, 5dge:q3, 5dgf:Q3, 5dgf:q3, 5dgv:Q3, 5dgv:q3, 8eub:Ap, 8evp:Ap, 8evq:Ap, 8evr:Ap, 8evs:Ap, 8evt:Ap, 8ewb:Ap, 8ewc:Ap, 5fci:Q3, 5fci:q3, 5fcj:Q3, 5fcj:q3, 6ft6:p, 5gak:D, 6gq1:p, 6gqb:p, 6gqv:p, 5h4p:p, 6hd7:D, 8hfr:nY, 6hhq:AQ, 6hhq:DR, 5i4l:Q3, 5i4l:q3, 6i7o:AT, 6i7o:XT, 3j6x:83, 3j6y:83, 3j77:93, 3j78:93, 3jct:p, 5jcs:p, 5juo:UA, 5jup:UA, 5jus:UA, 5jut:UA, 5juu:UA, 8k2d:Lp, 8k82:Lp, 5lyb:Q3, 5lyb:q3, 5m1j:p5, 6m62:p, 5mc6:AT, 5mei:AQ, 5mei:DR, 7mpi:Ap, 7mpj:Ap, 6n8j:p, 6n8k:p, 6n8l:p, 6n8m:R, 6n8n:R, 6n8o:R, 7n8b:Ap, 5ndg:Q3, 5ndg:q3, 5ndv:Q3, 5ndv:q3, 5ndw:Q3, 5ndw:q3, 7nrc:Lr, 7nrd:Lr, 5obm:Q3, 5obm:q3, 7of1:p, 7oh3:p, 7ohq:p, 6oig:p, 5on6:AQ, 5on6:DR, 7osa:eL43, 7osm:eL43, 8p8m:RT, 8p8n:RT, 8p8u:RT, 8pfr:RT, 6q8y:AT, 6qik:m, 6qt0:m, 6qtz:m, 6r84:D, 6r86:D, 6r87:D, 6ri5:m, 7rr5:Lp, 6rzz:m, 6s05:m, 6s47:Ar, 6snt:aa, 6sv4:AT, 6sv4:XT, 6sv4:zT, 6t4q:Lp, 5t62:R, 5t6r:R, 6t7i:Lp, 6t7t:Lp, 6t83:pb, 6t83:aa, 5tbw:AQ, 5tbw:DR, 6tb3:AT, 5tga:Q3, 5tga:q3, 5tgm:Q3, 5tgm:q3, 6tnu:AT, 7too:AL43, 7top:AL43, 7u0h:p, 4u3m:Q3, 4u3m:q3, 4u3n:Q3, 4u3n:q3, 4u3u:Q3, 4u3u:q3, 4u4n:Q3, 4u4n:q3, 4u4o:Q3, 4u4o:q3, 4u4q:Q3, 4u4q:q3, 4u4r:Q3, 4u4r:q3, 4u4u:Q3, 4u4u:q3, 4u4y:Q3, 4u4y:q3, 4u4z:Q3, 4u4z:q3, 4u50:Q3, 4u50:q3, 4u51:Q3, 4u51:q3, 4u52:Q3, 4u52:q3, 4u53:Q3, 4u53:q3, 4u55:Q3, 4u55:q3, 4u56:Q3, 4u56:q3, 4u6f:Q3, 4u6f:q3, 7ug6:p, 7uoo:p, 7uqb:p, 7uqz:p, 7v08:p, 4v4b:B9, 4v7f:k, 4v7h:B9, 4v7r:Bg, 4v7r:Dg, 4v88:Bp, 4v88:Dp, 4v8t:p, 4v91:p, 6woo:p, 6xiq:p, 6xir:p, 8y0u:Lp, 6ylg:p, 6ylh:p, 6yly:p, 7z34:p, 6z6j:Lp, 6z6k:Lp, 7zpq:Bo, 7zrs:Bo, 7zs5:BB, 7zuw:Bo, 7zux:Eo, 7zw0:Ls
10 5it7:pp 87 37 0.0354 0.1609 0.3784 0.48 6uz7:Bp
11 8fru:p 93 32 0.0278 0.1183 0.3438 1.1 8br8:Lq, 8brm:Lq, 8bsi:Lq, 8bsj:Lq, 8btd:Lq, 8btr:Lq, 7pwg:p, 7pwo:p2
12 1qjp:A 137 34 0.0304 0.0876 0.3529 1.1
13 4v3p:Lm 92 32 0.0304 0.1304 0.3750 1.2 8azw:a, 8b2l:a3, 8ip8:GB, 8ipa:GB, 8ipb:GB, 8jiv:Cp, 7qiw:q, 7qiz:q, 4v7e:Cp, 1ysh:D
14 8fth:A 1263 56 0.0405 0.0127 0.2857 1.9
15 7qep:P3 86 29 0.0278 0.1279 0.3793 2.4
16 7kdp:A 638 29 0.0354 0.0219 0.4828 2.5 7kdp:C, 7kdp:B
17 3cxc:Y 73 43 0.0380 0.2055 0.3488 2.8 1jj2:Y, 1k73:1, 1k8a:1, 1k9m:1, 1kc8:1, 1kd1:1, 1kqs:Y, 1m1k:1, 1m90:1, 1n8r:1, 1nji:1, 3ow2:Y, 1q7y:1, 1q81:1, 1q82:1, 1q86:1, 1qvf:Y, 1qvg:Y, 1w2b:Y
18 4bkm:A 304 54 0.0456 0.0592 0.3333 2.8 4bkm:B, 4bkm:C, 4bkm:D
19 7po7:H 311 54 0.0456 0.0579 0.3333 3.0 7poe:A, 7poe:B
20 6nje:A 297 126 0.0734 0.0976 0.2302 3.7
21 5xy3:p 89 34 0.0304 0.1348 0.3529 4.3
22 8jx6:B 451 50 0.0481 0.0421 0.3800 4.7
23 5t2a:m 91 34 0.0304 0.1319 0.3529 4.9 8a3w:o, 8a98:o, 6az3:o, 3jcs:m, 8ova:Bo, 8ove:Bo, 8ovj:o, 8rxh:Lo, 8rxx:Lo, 5t5h:o, 4v8m:Bo
24 8fvu:A 1361 62 0.0506 0.0147 0.3226 5.1 2vm5:A
25 7o9k:G 337 39 0.0304 0.0356 0.3077 5.4 7of5:x, 7of7:x
26 7mgm:A 2274 36 0.0380 0.0066 0.4167 7.0
27 8dzz:A 2363 36 0.0380 0.0063 0.4167 7.0 8dzz:D, 8e00:A
28 4w8f:B 2609 36 0.0380 0.0057 0.4167 7.0 220l:A, 223l:A, 225l:A, 227l:A, 148l:E, 258l:A, 259l:A, 260l:A, 182l:A, 183l:A, 184l:A, 185l:A, 186l:A, 187l:A, 188l:A, 2a4t:A, 1c61:A, 1c62:A, 1c65:A, 1c66:A, 1c67:A, 1c68:A, 1c6a:A, 1c6b:A, 1c6d:A, 1c6e:A, 1c6g:A, 1c6h:A, 1c6j:A, 1c6k:A, 1c6m:A, 1c6n:A, 1c6q:A, 1c6t:A, 2cuu:A, 3dmx:A, 3dmz:A, 3dn0:A, 3dn1:A, 3dn2:A, 3dn3:A, 3dn4:A, 3dn6:A, 3dn8:A, 3dna:A, 1epy:A, 5g27:A, 3g3v:A, 3g3w:A, 3g3x:A, 3guj:A, 3guk:A, 3gul:A, 3gul:B, 3gum:A, 3gum:B, 3gun:A, 3gun:B, 3guo:A, 3guo:B, 3gup:A, 3gup:B, 3hh3:A, 3hh5:A, 3hh6:A, 3ht6:A, 3ht7:A, 3ht8:A, 3ht9:A, 3htb:A, 3htd:A, 3htf:A, 3htg:A, 3hu8:A, 3hu9:A, 3hua:A, 3huk:A, 3huq:A, 3hwl:A, 2igc:A, 5jdt:A, 5jgn:A, 5jgr:A, 5jgv:A, 5jgz:A, 5jws:A, 5jwt:A, 5jwu:A, 5jwv:A, 5jww:A, 3k2r:A, 3l2x:A, 7l3b:A, 7l3c:A, 7l3d:A, 7l3e:A, 7l3f:A, 7l3g:A, 7l3h:A, 7l3i:A, 7l3j:A, 7l3k:A, 1l83:A, 1l84:A, 1lgw:A, 1lgx:A, 1li3:A, 1li6:A, 7loa:A, 7lob:A, 7loc:A, 7lod:A, 7loe:A, 7lof:A, 7log:A, 7loj:A, 5lwo:A, 7lx6:A, 7lx7:A, 7lx8:A, 7lx9:A, 7lxa:A, 4lzm:A, 5lzm:A, 6lzm:A, 7lzm:A, 1nhb:A, 2ntg:A, 2nth:A, 2oty:X, 2otz:X, 2ou0:X, 2ou8:A, 2ou9:A, 1ov5:A, 1ov7:A, 1ovh:A, 1ovj:A, 1ovk:A, 1owy:A, 1owz:A, 6pgy:A, 6pgz:A, 6pgz:B, 4pjz:A, 4pk0:A, 2q9d:A, 2q9e:B, 2q9e:C, 2ray:X, 2raz:X, 2rb0:X, 2rb1:X, 2rb2:X, 2rbn:A, 2rbo:A, 2rbp:A, 2rbq:A, 2rbr:A, 2rbs:A, 3run:A, 3sb5:B, 3sb5:A, 3sb5:C, 3sb5:D, 3sb6:A, 3sb6:B, 3sb8:A, 3sb8:B, 3sb9:A, 3sb9:B, 3sba:B, 3sba:C, 3sba:F, 8tat:A, 6v51:A, 4w52:A, 4w53:A, 4w54:A, 4w55:A, 4w56:A, 4w57:A, 4w58:A, 4w59:A, 4w8f:A, 1xep:A, 1zur:A, 1zwn:A, 1zyt:A
29 4ai6:A 2650 36 0.0380 0.0057 0.4167 7.0 4ai6:B, 4akg:A, 4akg:B, 4akh:A, 4akh:B, 4aki:A, 4aki:B, 3crt:A, 3cru:A, 3d0z:A, 1dug:A, 1dug:B, 1gne:A, 1gtb:A, 8gyd:A, 8gyd:B, 5gzz:B, 5gzz:C, 5gzz:D, 5gzz:E, 5gzz:F, 5gzz:G, 6ji6:A, 1m99:A, 1m9a:A, 1m9b:A, 7mi3:A, 7mi6:A, 6rwd:A, 6rwd:B, 1u87:A, 1u88:A, 1ua5:A, 4wr4:A, 4wr5:A
30 6eff:B 206 58 0.0456 0.0874 0.3103 8.7 6eff:A, 6eff:C, 6eff:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218