BioLiP

>protein
MRYRPFGSTGVAVSALTLRLADNPRLRANDWRALVFTALENGVNSFQIDGDAPELLKGAGEAFASVERHLLFLTWRLRGD
AKQLGPHTLDALKRSAFEGLSLDYLDLLLINDPQSASLPMAFESGLQDLQKGRALRGLGVASRGDIDPGLLANDLVTAVS
SPYNLSSGWAERHRIRQASQNNFAVIGEDFWPQALREVKPSFWQRRTDPLADVGGYEFLTNTPGWSAEDICLGYALTEPS
LATVRVTADNRQEIERLAAVVERDLPTGVCAQIEMARFSAQEREKAARRPKLAAALEHHHH

The query sequence (length=301) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6gs8:A	301	301	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	7b0e:A, 6gs8:B, 6gs8:C, 6gs8:D, 6gs8:E, 6gs8:F, 6gtm:A, 6gtm:B, 6gtm:C, 6gtm:D
2	7s5f:B	309	192	0.1628	0.1586	0.2552	4.75e-04	7s5f:A, 7s5f:C, 7s5f:D
3	3wcz:A	307	124	0.1229	0.1205	0.2984	0.007
4	1pz0:A	311	102	0.0963	0.0932	0.2843	0.15
5	6hg6:A	313	70	0.0631	0.0607	0.2714	0.37
6	2wzm:A	274	103	0.1030	0.1131	0.3010	0.75	2wzm:B
7	4gie:A	288	88	0.0831	0.0868	0.2841	0.81	4fzi:A, 4fzi:B
8	4ijr:A	328	216	0.1827	0.1677	0.2546	0.82	4ijr:C
9	5z6t:A	317	152	0.1362	0.1293	0.2697	1.2	5z6t:B
10	5zog:A	316	42	0.0532	0.0506	0.3810	1.2	1ul1:X, 5zoe:A, 5zof:A
11	4g5d:A	283	93	0.0897	0.0954	0.2903	1.5	4g5d:B
12	3fx4:A	325	82	0.0897	0.0831	0.3293	2.2	1ae4:A, 3cv7:A, 1cwn:A, 3h4g:A, 1hqt:A
13	3h7r:A	307	94	0.0997	0.0977	0.3191	3.1
14	8usu:A	316	129	0.1130	0.1076	0.2636	3.5	8usu:B
15	2hi4:A	480	113	0.1063	0.0667	0.2832	3.7
16	5zcm:A	329	94	0.0864	0.0790	0.2766	4.4
17	2fvl:A	323	67	0.0731	0.0681	0.3284	4.5	2fvl:B, 2fvl:C
18	7wf3:C	328	131	0.1229	0.1128	0.2824	4.9	2a79:A, 3eau:A, 3eb3:A, 3eb4:A, 6ebk:A, 6ebk:C, 6ebk:E, 6ebk:G, 6ebl:A, 6ebl:C, 6ebl:E, 6ebl:G, 7ej1:A, 7ej1:C, 7ej1:E, 7ej1:G, 7ej2:A, 7ej2:C, 7ej2:E, 7ej2:G, 1exb:A, 4jta:A, 4jta:P, 4jtc:A, 4jtc:G, 4jtd:A, 4jtd:G, 3lnm:A, 3lnm:C, 3lut:A, 1qrq:A, 1qrq:B, 1qrq:C, 1qrq:D, 2r9r:A, 2r9r:G, 7sit:A, 7sit:C, 7siz:A, 7siz:C, 7wf3:G, 7wf3:I, 7wf3:M, 7wf4:G, 7wf4:I, 7wf4:M, 7wf4:o, 5wie:A, 5wie:G, 1zsx:A
19	4jb0:A	367	71	0.0764	0.0627	0.3239	4.9	4eyq:A, 4fb4:A, 3tx6:A, 3uk0:A, 3ukj:A
20	1vp5:A	284	77	0.0664	0.0704	0.2597	5.0	1vp5:B
21	2z23:A	517	46	0.0532	0.0309	0.3478	5.1
22	5jh2:A	257	106	0.0963	0.1128	0.2736	5.6
23	5t79:A	315	305	0.2326	0.2222	0.2295	5.9	3erp:A, 3erp:B
24	4l1w:A	325	54	0.0698	0.0646	0.3889	6.7	6a7a:A, 3c3u:A, 3gug:A, 2hdj:A, 2hdj:B, 1ihi:A, 1ihi:B, 6ijx:A, 2ipj:A, 2ipj:B, 1j96:A, 1j96:B, 8jp2:A, 4jq1:A, 4jq1:B, 4jq2:A, 4jq2:B, 4jq3:A, 4jq3:B, 4jq4:A, 4jq4:B, 4jqa:A, 4jqa:B, 4jtq:A, 4jtq:B, 4jtr:A, 4jtr:B, 4l1w:B, 4l1x:A, 4l1x:B, 1mrq:A, 3nty:A, 1xjb:A, 1xjb:B, 4xo6:A, 4xo6:B, 4xo7:A, 4xo7:B, 4yvp:A, 4yvp:B
25	4u94:A	451	11	0.0365	0.0244	1.0000	7.1	4u98:A, 4wzy:A
26	8rbx:f	544	62	0.0698	0.0386	0.3387	9.5	8rbz:f
27	2ccz:A	121	11	0.0365	0.0909	1.0000	9.6	2ccz:B, 1v1q:A, 1v1q:B

[Back]