BioLiP

>protein
MRLPILIINFKAYGEAAGKRAVELAKAAERAARELGVNIVVAPNHLELGLVSQSVDIPVYAQGADVEAGGAHTAHVSLEN
IKEAGGSGVILNHSEAPLKLNDLARLVAKAKSLGLDVVVCAPDPRTSLAAAALGPHAVAVEPPELIGTGRAVSRYKPEAI
VETVGLVSRHFPEVSVITGAGIESGDDVAAALRLGTRGVLLASAAVKAKDPYAKIVELAKPLSEL

The query sequence (length=225) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1w0m:A	225	225	1.0000	1.0000	1.0000	9.41e-158	1w0m:B, 1w0m:C, 1w0m:D, 1w0m:E, 1w0m:F, 1w0m:G, 1w0m:H
2	1hg3:A	224	218	0.5200	0.5223	0.5367	2.17e-71	1hg3:B, 1hg3:C, 1hg3:D, 1hg3:E, 1hg3:F, 1hg3:G, 1hg3:H
3	5csr:C	220	205	0.3022	0.3091	0.3317	5.01e-30	5csr:A, 5csr:B, 5csr:D, 5css:A, 5css:B, 5css:C, 5css:D
4	1ci1:B	249	218	0.2889	0.2610	0.2982	3.11e-08
5	8w06:B	251	234	0.2622	0.2351	0.2521	1.09e-06	8v09:A, 8v0a:B, 8w06:A, 8w06:C, 8w06:D, 8w06:E, 8w06:F, 8w06:G, 8w06:H
6	1amk:A	250	217	0.2756	0.2480	0.2857	2.50e-06	7abx:A, 7az3:A, 7az4:A, 7az9:A, 7aza:A, 1if2:A, 1n55:A, 1qds:A, 2vxn:A, 2y61:A, 2y62:A, 2y63:A
7	5zfx:B	248	236	0.2711	0.2460	0.2585	9.42e-05
8	4mva:A	255	258	0.2800	0.2471	0.2442	1.51e-04	4mva:B
9	6nee:B	252	236	0.2667	0.2381	0.2542	0.001	6nee:A
10	4ff7:A	247	111	0.1378	0.1255	0.2793	0.005	4ff7:B, 7tim:A, 7tim:B, 2ypi:A, 2ypi:B, 3ypi:A, 3ypi:B
11	1aw1:A	255	147	0.1867	0.1647	0.2857	0.013	1aw1:B, 1aw1:D, 1aw1:E, 1aw1:G, 1aw1:H, 1aw1:J, 1aw1:K
12	1hti:B	248	88	0.1244	0.1129	0.3182	0.019	4owg:A, 4owg:B, 4poc:B, 4pod:B, 1r2r:B, 7rde:B, 7t0q:A, 6up5:B, 6upf:A, 6upf:B, 7uxv:A, 7uxv:B
13	1btm:A	251	201	0.2489	0.2231	0.2786	0.032	1btm:B, 2btm:A, 2btm:B
14	1ssg:A	247	229	0.2444	0.2227	0.2402	0.034	1ssg:B, 1su5:A, 1su5:B, 1sw0:A, 1sw0:B, 1sw3:A, 1sw3:B, 1sw7:A, 1sw7:B, 1tpb:1, 1tpb:2, 1tpc:1, 1tpc:2, 1tph:1, 1tph:2, 1tpu:A, 1tpu:B, 1tpv:A, 1tpv:B, 1tpw:A, 1tpw:B
15	1tyg:A	242	39	0.0889	0.0826	0.5128	0.065	1tyg:C
16	4y90:A	244	140	0.1778	0.1639	0.2857	0.078	4y90:B, 4y90:C, 4y90:D
17	6ooi:C	255	221	0.2178	0.1922	0.2217	0.15	6ooi:A, 6ooi:B, 6ooi:D, 6ooi:E, 6ooi:F, 6ooi:G, 6ooi:H
18	1ag1:T	249	95	0.1244	0.1124	0.2947	0.17	5i3h:B, 5i3i:A, 5i3i:B, 5i3i:C, 5i3i:D, 5i3k:B, 5i3k:C, 5i3k:D, 1iig:B, 2j27:A, 2j27:B, 1kv5:A, 1kv5:B, 4tim:B, 6tim:B, 1trd:B, 1tsi:A, 2v2c:A
19	5eyw:A	244	183	0.2089	0.1926	0.2568	0.28	5eyw:B
20	6oog:A	252	55	0.0889	0.0794	0.3636	0.28
21	2bsl:A	311	71	0.0889	0.0643	0.2817	0.45	2bsl:B, 2bx7:A, 2bx7:B, 1dor:A, 1dor:B, 2dor:A, 2dor:B, 1jqv:A, 1jqv:B, 1jqx:A, 1jqx:B, 1jrb:A, 1jrb:B, 1jrc:A, 1jrc:B, 1jub:A, 1jub:B, 1jue:A, 1jue:B, 1ovd:A, 1ovd:B
22	4dod:A	454	49	0.0622	0.0308	0.2857	0.69	4doe:A
23	6vde:A	860	28	0.0400	0.0105	0.3214	1.2	6vde:B
24	5abt:A	246	43	0.0622	0.0569	0.3256	1.5	5a5w:A, 5ab3:A, 5ab3:B, 5ab3:C, 5ahf:A, 5ahi:A, 5g4w:A
25	5abt:A	246	38	0.0711	0.0650	0.4211	2.0	5a5w:A, 5ab3:A, 5ab3:B, 5ab3:C, 5ahf:A, 5ahi:A, 5g4w:A
26	7pul:A	347	159	0.1467	0.0951	0.2075	1.9
27	8bmw:N	251	29	0.0533	0.0478	0.4138	2.3
28	7dg7:A	86	26	0.0622	0.1628	0.5385	3.9
29	4mla:B	460	55	0.0756	0.0370	0.3091	3.9
30	4ml8:A	488	54	0.0756	0.0348	0.3148	4.0	4ml8:B, 4ml8:C, 4ml8:D, 4mla:A
31	5z9y:B	234	35	0.0711	0.0684	0.4571	4.3	5z9y:A
32	2uyk:C	127	67	0.1067	0.1890	0.3582	4.5	2uyn:A, 2uyn:B, 2uyn:C
33	5awp:A	596	49	0.0844	0.0319	0.3878	4.6	5awq:A
34	2iss:B	285	74	0.1067	0.0842	0.3243	4.9	2iss:A, 2iss:C
35	3ojl:A	418	76	0.1022	0.0550	0.3026	5.7	3ojl:B, 3ojo:A, 3ojo:B
36	1kbi:A	504	204	0.2044	0.0913	0.2255	5.8	1fcb:A, 1fcb:B, 1kbi:B, 1kbj:A, 1kbj:B, 3ks0:A, 3ks0:B, 1lco:A, 1lco:B, 1ldc:A, 1ltd:A, 1ltd:B, 2oz0:A, 2oz0:B, 1qcw:A, 1qcw:B, 1sze:A, 1sze:B, 1szf:A, 1szf:B, 1szg:A, 1szg:B
37	1p0k:B	309	62	0.0800	0.0583	0.2903	6.3	1p0k:A, 1p0n:A, 1p0n:B
38	3bnk:B	187	82	0.1156	0.1390	0.3171	7.6	3bnk:A
39	6bve:A	242	183	0.1822	0.1694	0.2240	9.9	6bve:B

[Back]