BioLiP

>protein
MRLEIPNHTERFGVVRLHEVQRILELDSGRVRDESPAVGLRRLDDADLRDVLEQTAIVVPTRNERLKLLEGVLSGIPHEA
LILVASNSSPDRFQMERDLLEEFAHLTERPALIFHQKDPALAEALRAGGYPHPIGEDGLVRSGKAEGMILALVFAALSGR
RYVGFIDADNYFPGAVWEYVRAYAAGFLMAKTPFAMVRILWRYKPKLTEDEGVVFRRYGRVSERNNRALNQLIGGVSGFE
TDVVKTANAGEHAMSLGLALRLPLASGYAVEPQELVSLLELYGGVFPLEDEEVLQHGVEIFQIETRNPHLHENKGDEHIR
DMLLACLATVYHSKLATEEVRQSVLEELQAAGALAPGEEPPPPVLYPPLSSLDLQAVRKALRGHFSRFRVP

The query sequence (length=391) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2wvk:A	391	391	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	2wvk:B, 2wvl:A, 2wvl:B, 2wvm:A, 2wvm:B
2	2zu8:A	373	388	0.4271	0.4477	0.4304	1.56e-113	2zu8:B, 2zu9:B, 2zu9:A
3	7c3k:B	389	85	0.0486	0.0488	0.2235	0.15	7c3k:A, 8jqz:A, 8jqz:B
4	4dec:A	284	148	0.1176	0.1620	0.3108	0.46	4de7:A, 3e25:A, 5jsx:A, 5jt0:A, 5juc:A, 5jud:A, 4y6n:A, 4y6u:A, 4y7f:A, 4y7g:A, 4y9x:A
5	6qfb:C	1011	27	0.0332	0.0129	0.4815	0.76
6	5xla:A	490	128	0.0767	0.0612	0.2344	0.77	3eyk:B, 5xl3:B, 5xl3:A, 5xl4:A, 5xl4:B, 5xl6:A, 5xl7:A, 5xl7:B, 5xl9:A, 5xla:B, 5xlc:A, 5xlc:B, 5xld:A, 5xld:B
7	7vex:A	412	109	0.0691	0.0655	0.2477	0.79	8h4m:A
8	8g1e:A	1037	27	0.0332	0.0125	0.4815	0.83	8g1e:B, 8g1e:D, 8g1e:C, 8g1f:A, 8g1f:C, 8g1f:B, 8g1f:D, 8g5c:A, 8g5c:B, 8g5c:C, 8g5c:D, 8g5d:A, 8g5d:B, 8g5d:C, 8g5d:D, 6hxh:A, 6hxh:B, 6hxh:C, 6hxh:D, 6hxh:E, 6hxh:F, 6hxh:G, 6hxh:H, 6hxk:A, 6hxk:B, 6hxk:C, 6hxk:D, 6hxl:A, 6hxl:B, 6hxl:C, 6hxl:D, 6hxl:E, 6hxl:F, 6hxl:G, 6hxl:H, 6hxm:A, 6hxm:B, 7liw:B, 7liw:D, 7lj9:A, 7lj9:B, 7lj9:C, 7lj9:D, 7lla:A, 7lla:C, 7lla:B, 7lla:D, 3mwe:A, 6o0h:A, 6o0h:B, 6o0h:C, 6o0h:D, 3pff:A, 6poe:B, 6poe:D, 6poe:A, 6poe:C, 6qfb:A, 6qfb:B, 6qfb:D, 7rig:A, 7rig:C, 7rig:B, 7rig:D, 7rkz:A, 7rkz:C, 7rkz:B, 7rkz:D, 7rmp:A, 7rmp:C, 7rmp:B, 7rmp:D, 5tde:A, 5tde:B, 5tdf:A, 5tdm:A, 5tdm:B, 5tdz:A, 5te1:A, 5te1:B, 5teq:A, 5teq:B, 5tes:A, 5tet:A, 6ui9:A, 6ui9:C, 6ui9:B, 6ui9:D, 6uia:C, 6uia:A, 6uia:D, 6uia:B, 6uuw:A, 6uuw:C, 6uuw:B, 6uuw:D, 6uuz:A, 6uuz:C, 6uuz:B, 6uuz:D, 6uv5:A, 6uv5:C, 6uv5:B, 6uv5:D, 6z2h:A, 6z2h:C, 6z2h:D
9	6u7j:A	569	60	0.0460	0.0316	0.3000	0.93	6u7j:C, 6u7j:D
10	4wa2:A	491	127	0.0793	0.0631	0.2441	0.98	6bkq:A, 6bkq:C, 6bkq:E, 6cex:A, 6cex:C, 6cex:E, 1mqm:A, 1mqm:D, 1mqm:G, 1mqn:A, 1mqn:D, 5t6n:A, 5t6n:E, 5t6n:C, 6tzb:A, 6tzb:C, 6tzb:E, 2vir:C, 2vis:C, 2vit:C, 5vtq:A, 5vtq:C, 5vtq:E, 5vtr:A, 5vtr:C, 5vtr:E, 5vtv:A, 5vtv:C, 5vtv:E, 5vtw:C, 5vtw:E, 5vtw:A, 5vty:A, 5vty:C, 5vty:E, 5vu4:A, 5vu4:C, 5vu4:E, 4wa2:B, 4wa2:C, 4wa2:E, 6y5j:E, 2ypg:A, 2ypg:C, 2ypg:E
11	7pkt:x	167	74	0.0563	0.1317	0.2973	1.4
12	8p5d:LD0	281	36	0.0384	0.0534	0.4167	5.6	8p60:LD0, 8p60:KD0, 7qca:LD0
13	6bbm:A	405	74	0.0563	0.0543	0.2973	6.6
14	5ftx:A	651	35	0.0332	0.0200	0.3714	7.4	5fty:A, 5fty:B, 4uie:A, 4uj7:A, 4uj8:A, 4uj8:B, 4uj8:C, 4uj8:D
15	5dx5:A	399	100	0.0767	0.0752	0.3000	7.9	5dx5:B
16	3hvo:A	559	36	0.0332	0.0233	0.3611	9.0	3hvo:B

[Back]