Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MRILILGLDGAGKTTILYRLQVGEVVTTIPTIGFNVETVTYKNLKFQVWDLGGLTSIRPYWRCYYSNTDAVIYVVDSCDR
DRIGISKSELVAMLEEEELRKAILVVFANKQDMEQAMTSSEMANSLGLPALKDRKWQIFKTSATKGTGLDEAMEWLVETL
KSR

The query sequence (length=163) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1upt:G 170 163 1.0000 0.9588 1.0000 7.41e-120 4dcn:A, 4dcn:B, 5ee5:B, 5j5c:A, 1r4a:A, 1r4a:B, 1r4a:C, 1r4a:D, 1upt:A, 1upt:C, 1upt:E
2 1moz:A 178 161 0.6258 0.5730 0.6335 2.44e-72 8ezj:C, 8ezj:D, 1moz:B
3 8d4c:C 180 163 0.5767 0.5222 0.5767 1.07e-68 8d4c:H, 8d4c:D, 8d4c:F, 8d4d:C, 8d4d:H, 8d4d:D, 8d4d:F, 8d4e:C, 8d4e:H, 8d4e:Z, 8d4f:C, 8d4f:H, 8d4f:Z, 8d4f:D, 8d4f:F, 8d4f:Q, 8d4g:C, 8d4g:H, 8d4g:Z, 8d4g:D, 8d4g:F, 8d4g:Q, 8d9r:C, 8d9r:H, 8d9r:Z, 8d9r:J, 8d9r:X, 8d9r:3, 8d9r:K, 8d9r:a, 8d9r:4, 8d9r:O, 8d9r:b, 8d9r:5, 8d9r:P, 8d9r:c, 8d9r:6, 8d9r:Q, 8d9r:d, 8d9r:7, 8d9s:C, 8d9s:H, 8d9s:Z, 8d9s:J, 8d9s:X, 8d9s:3, 8d9s:K, 8d9s:a, 8d9s:4, 8d9s:O, 8d9s:b, 8d9s:5, 8d9s:P, 8d9s:c, 8d9s:6, 8d9s:Q, 8d9s:d, 8d9s:7, 8d9t:C, 8d9t:H, 8d9t:J, 8d9t:X, 8d9t:K, 8d9t:Z, 8d9t:O, 8d9t:a, 8d9t:P, 8d9t:b, 8d9t:Q, 8d9t:c, 8d9u:C, 8d9u:H, 8d9u:J, 8d9u:X, 8d9u:K, 8d9u:Z, 8d9u:O, 8d9u:a, 8d9u:P, 8d9u:b, 8d9u:Q, 8d9u:c, 8d9v:C, 8d9v:H, 8d9v:D, 8d9v:F, 8d9w:F, 8d9w:I, 1hur:A, 1hur:B, 7ux3:C, 7ux3:H
4 2x77:A 181 163 0.5951 0.5359 0.5951 9.10e-68 2x77:B
5 2k5u:A 181 162 0.5828 0.5249 0.5864 1.77e-67 2ksq:A, 1mr3:F, 4q66:F, 4q66:L, 3tjz:A, 3tjz:D
6 4y0v:A 165 160 0.5890 0.5818 0.6000 7.99e-67 4y0v:B, 4ylg:A, 4ylg:B
7 3lrp:A 181 162 0.5644 0.5083 0.5679 4.93e-66
8 5uf8:D 160 160 0.5828 0.5938 0.5938 1.26e-65
9 2b6h:A 171 163 0.5828 0.5556 0.5828 4.47e-65
10 1z6x:A 175 160 0.5767 0.5371 0.5875 7.29e-65 1z6x:B
11 6a8d:A 181 162 0.5337 0.4807 0.5370 2.31e-64
12 6pta:A 165 156 0.5521 0.5455 0.5769 2.13e-63 6pta:B, 6pta:C, 6pta:D, 5uf8:A, 5uf8:B, 5uf8:C
13 3o47:A 289 162 0.5644 0.3183 0.5679 6.81e-63 4c0a:C, 4c0a:D, 4c0a:G, 4c0a:H, 6cm9:C, 6cm9:H, 6cri:C, 6cri:H, 6cri:K, 6cri:U, 6cri:L, 6cri:V, 6d83:C, 6d83:H, 6d84:C, 6d84:H, 6d84:I, 6d84:N, 6dff:C, 6dff:H, 7dn8:D, 7dn8:B, 7dn8:F, 7dn8:H, 7dn9:B, 7dn9:D, 7dn9:F, 7dn9:H, 3dwd:A, 3dwd:B, 4hmy:C, 6ii6:C, 6ii6:D, 1j2j:A, 2j59:A, 2j59:B, 2j59:C, 2j59:D, 2j59:E, 2j59:F, 7mge:E, 1o3y:A, 1o3y:B, 3o47:B, 8p50:B, 7r4h:C, 7r4h:H, 1r8q:A, 1r8q:B, 1r8s:A, 1re0:A, 1rrf:A, 1rrg:A, 1rrg:B, 1s9d:A, 8sdw:A, 1u81:A, 7wqy:A, 7wqy:B
14 3aq4:A 170 163 0.5583 0.5353 0.5583 8.33e-63 3aq4:B
15 3lvq:E 420 161 0.5460 0.2119 0.5528 1.30e-61 2b0o:E, 2b0o:F, 2b0o:G, 2b0o:H, 3lvr:E
16 6bbp:A 520 156 0.5460 0.1712 0.5705 9.88e-61 2a5d:A, 2a5f:A, 2a5g:A, 6bbq:A, 1e0s:A, 1fgy:A, 1fhw:A, 1fhw:B, 1fhx:A, 1fhx:B, 4fme:C, 4fme:F, 2j5x:A, 2j5x:B, 4kax:A, 4kax:B, 3n5c:A, 3n5c:B, 3pcr:B, 2r09:A, 2r09:B, 2r0d:A, 2r0d:B, 3vhx:A, 3vhx:C, 3vhx:E, 3vhx:G, 2w83:A, 2w83:B, 2w83:E, 7xrd:A, 7xrd:B, 7xrd:C, 7xrd:D
17 5de3:A 166 160 0.4785 0.4699 0.4875 5.39e-55 5di3:A
18 1yzg:A 168 155 0.4847 0.4702 0.5097 9.39e-55
19 1zj6:A 173 160 0.4785 0.4509 0.4875 3.00e-52 2h16:A, 2h16:B, 2h16:C, 2h16:D, 2h17:A, 1z6y:A, 1z6y:B
20 7rll:B 177 157 0.4847 0.4463 0.5032 6.54e-52 7rll:A
21 4q66:C 134 154 0.5276 0.6418 0.5584 1.93e-48
22 3doe:A 189 163 0.4233 0.3651 0.4233 6.58e-46 3dof:A, 4gok:B, 4gok:A, 1ksg:A, 1ksh:A, 1ksj:A
23 4zi2:A 185 163 0.4540 0.4000 0.4540 5.65e-44 3bh6:A, 3bh7:A, 1fzq:A, 4goj:A, 4goj:B, 7ok7:A, 7ok7:B, 7ok7:C, 7ok7:D, 7ok7:E, 7ok7:F, 4zi2:B, 4zi3:A, 4zi3:B
24 4v0l:A 168 165 0.4172 0.4048 0.4121 1.06e-41 4v0k:A, 4v0k:B, 4v0l:B, 4v0m:A, 4v0m:C, 4v0m:E, 4v0m:G, 4v0n:A, 4v0n:C, 4v0n:E, 4v0n:G, 4v0o:A, 4v0o:C, 4v0o:E, 4v0o:G
25 4bas:A 172 167 0.4049 0.3837 0.3952 4.57e-37
26 2h57:B 167 165 0.3742 0.3653 0.3697 7.76e-36 2h57:A, 2h57:C, 6vbv:3
27 8oun:A 181 163 0.4049 0.3646 0.4049 3.47e-35 8oum:A, 8oum:B, 8oum:C, 8oum:D, 8oum:E, 8oun:B
28 5di3:B 204 165 0.3865 0.3088 0.3818 2.83e-30 4m9q:A, 4m9q:B, 4m9q:C
29 4ile:A 176 159 0.3006 0.2784 0.3082 1.12e-28 2al7:A, 2h18:A, 8jc5:A, 8jc5:B, 8jca:A, 1zd9:A
30 8oul:A 185 159 0.3374 0.2973 0.3459 1.40e-25 8ouk:A, 8oul:B, 8oul:C
31 6zga:C 168 164 0.3190 0.3095 0.3171 1.70e-25 8bsh:B, 4bzi:B, 4bzi:J, 4bzi:K, 6gni:B, 1m2o:B, 1m2o:D, 2qtv:B, 6zga:G
32 8e0c:A 185 169 0.2822 0.2486 0.2722 5.04e-22 8e0a:B, 8e0b:B, 8e0d:A, 1f6b:A, 1f6b:B, 2fa9:A, 2fa9:B, 2fmx:A, 2fmx:B
33 8e0h:A 179 169 0.2822 0.2570 0.2722 7.23e-17 8dzm:A, 8dzm:B, 8dzn:A, 8dzn:B, 8dzo:A, 8dzo:B, 8dzt:A, 8dzt:B, 8e0h:B, 2gao:A, 2gao:B
34 6vs4:A 223 112 0.2454 0.1794 0.3571 4.65e-15 6vs4:B
35 8e0a:A 168 169 0.2577 0.2500 0.2485 7.27e-15 8e0b:A
36 4q66:I 86 149 0.3252 0.6163 0.3557 1.65e-11
37 8xql:A 240 115 0.2147 0.1458 0.3043 3.10e-11
38 8fn0:B 212 113 0.1963 0.1509 0.2832 5.33e-10
39 3cph:A 175 141 0.2577 0.2400 0.2979 8.86e-10 1g16:A, 1g16:B, 1g16:C, 1g16:D, 1g17:A, 1g17:B, 4z8y:A, 4z8y:B, 4zdw:A
40 4rkf:B 172 170 0.2822 0.2674 0.2706 2.29e-09 4rkf:A
41 3sfv:A 179 175 0.2883 0.2626 0.2686 3.99e-09 8alk:B, 7eq2:A, 7eq2:B, 4fmb:B, 4fmb:D, 4fmb:F, 4fmc:B, 4fmc:D, 4fmd:B, 4fmd:D, 4fmd:F, 4fme:B, 4fme:E, 2fol:A, 4hlq:B, 4hlq:D, 4hlq:F, 4hlq:H, 4hlq:J, 4i1o:A, 4i1o:C, 4i1o:E, 4i1o:G, 4iru:B, 4iru:D, 4iru:F, 4jvs:B, 3nkv:A, 3nkv:B, 5o74:B, 5o74:D, 5o74:F, 5o74:H, 5o74:J, 5o74:L, 6sku:B, 5szh:B, 5szk:B, 3tkl:A
42 1ek0:A 170 156 0.2515 0.2412 0.2628 9.20e-09
43 7opr:A 218 188 0.2883 0.2156 0.2500 1.78e-08 3bc1:A, 3bc1:E, 6huf:A, 6huf:O, 6huf:N, 6huf:B, 6huf:E, 6huf:C, 6huf:K, 6huf:M, 6huf:D, 6huf:P, 6huf:F, 6huf:J, 6huf:G, 6huf:I, 6huf:H, 6huf:L, 7opp:A, 7opp:C, 7opq:A, 7opq:B, 7opr:B
44 1z0j:A 169 125 0.2454 0.2367 0.3200 3.23e-08 1yvd:A
45 7lwb:A 182 174 0.2945 0.2637 0.2759 8.00e-08 7bwt:B, 4lhv:A, 4lhv:B, 4lhv:C, 4lhv:D, 4lhw:A, 4lhw:B, 4lhw:C, 4lhw:D, 4lhw:E, 4lhy:A, 4lhy:B, 4lhz:A, 4lhz:B, 4li0:A, 4li0:B, 3qbt:A, 3qbt:C, 3qbt:E, 3qbt:G, 6rir:A, 6rir:B, 6sq2:A, 6sq2:B, 6stf:A, 6stf:B, 6stf:C, 6stf:D, 6stf:E, 6stg:A, 6stg:B, 5szi:A, 3tnf:A, 6whe:A, 6whe:B, 6yx5:A, 6zsi:A, 6zsi:B, 6zsj:A, 6zsj:B
46 6if2:B 178 168 0.2883 0.2640 0.2798 1.28e-07 6ekk:C, 6ekk:D, 6if3:B
47 8a4a:B 172 167 0.2638 0.2500 0.2575 1.55e-07 6y7g:A, 6y7g:B
48 1zbd:A 177 171 0.2761 0.2542 0.2632 1.81e-07 3rab:A
49 5xc3:A 168 86 0.1656 0.1607 0.3140 4.37e-07 5xc5:A
50 2rhd:A 164 173 0.2638 0.2622 0.2486 9.41e-07
51 4rke:A 176 161 0.2331 0.2159 0.2360 1.69e-06 1z0a:C
52 5szj:A 175 165 0.2515 0.2343 0.2485 1.70e-06 5lpn:A, 5lpn:C
53 1x3s:A 177 167 0.2883 0.2655 0.2814 1.70e-06
54 2zet:A 181 180 0.2393 0.2155 0.2167 5.43e-06 2f7s:A, 2f7s:B, 2iey:A, 2iey:B, 2iez:A, 2iez:B, 2iez:H, 2iez:I, 2if0:A, 2if0:B, 2zet:B
55 2a5j:A 177 156 0.2086 0.1921 0.2179 8.76e-06 1z0a:A, 1z0a:B, 1z0a:D
56 6l6o:A 165 122 0.2147 0.2121 0.2869 9.02e-06 8jqu:A
57 1shz:D 327 94 0.1595 0.0795 0.2766 9.45e-06 1shz:A
58 6y09:A 176 180 0.2699 0.2500 0.2444 9.77e-06 2g77:B, 6sur:A, 6sur:B, 6sur:C, 6sur:D, 6sur:E, 6sur:F, 6y09:B, 1z06:A, 6zay:A, 6zay:B
59 1ukv:Y 197 175 0.2822 0.2335 0.2629 1.09e-05 2bcg:Y, 1yzn:A
60 8unx:A 244 122 0.2025 0.1352 0.2705 1.20e-05 7f1o:A, 7f1z:A, 7f23:A, 7f24:A, 5g53:C, 8gfv:A, 8gfw:A, 8gfx:A, 8gfy:A, 8gfz:A, 8gg0:A, 8gg1:A, 8gg2:A, 8gg3:A, 8gg4:A, 8gg5:A, 8gg6:A, 8gg7:A, 8gg8:A, 8gw8:A, 8jr9:A, 8unl:A, 8unm:A, 8unn:A, 8uno:A, 8unp:A, 8unq:A, 8unr:A, 8uns:A, 8unt:A, 8unu:A, 8unv:A, 8unw:A, 8uny:A, 8unz:A, 8uo0:A, 7vui:A, 7vuj:A
61 3dz8:A 178 166 0.2515 0.2303 0.2470 1.49e-05 8a4b:B, 8a4b:D, 8a4c:B, 8a4c:D
62 2gf9:A 176 170 0.2331 0.2159 0.2235 1.99e-05
63 2oil:A 174 121 0.1963 0.1839 0.2645 2.38e-05 3tso:A, 3tso:B
64 1ky2:A 180 175 0.2761 0.2500 0.2571 2.38e-05 1ky3:A, 4phf:A, 4phg:A, 4phh:A, 4phh:B, 4phh:C, 4phh:D
65 2fg5:A 165 118 0.2086 0.2061 0.2881 2.61e-05
66 4cz2:B 179 172 0.2761 0.2514 0.2616 2.88e-05 4cym:A, 4cym:B, 4cym:C, 4cz2:A, 4cz2:C, 6ff8:A, 6ff8:B, 5oec:B, 5oed:B
67 3m1i:A 200 168 0.2454 0.2000 0.2381 3.55e-05 8dyo:B, 8f19:B, 8f1e:D, 8f7a:B, 3icq:B, 3icq:C, 3wyf:A, 3wyf:D, 3wyg:A, 2x19:A, 5xoj:A
68 2o52:A 167 158 0.2454 0.2395 0.2532 4.23e-05 2o52:B
69 6s5f:A 188 138 0.2086 0.1809 0.2464 4.39e-05
70 1agr:A 350 97 0.1656 0.0771 0.2784 4.41e-05 1agr:D, 1as0:A, 1as2:A, 1as3:A, 1bh2:A, 1cip:A, 6crk:A, 3d7m:A, 3ffa:A, 4g5o:A, 4g5o:C, 4g5o:B, 4g5o:D, 4g5q:A, 4g5q:C, 4g5q:B, 4g5q:D, 4g5r:A, 4g5r:B, 4g5r:C, 4g5r:D, 4g5s:A, 4g5s:C, 4g5s:D, 4g5s:B, 2g83:A, 2g83:B, 1gfi:A, 1gg2:A, 1gia:A, 1gil:A, 1git:A, 1gp2:A, 2gtp:A, 2gtp:B, 8gvx:F, 8gvx:E, 8gvx:G, 8gvx:H, 2ihb:A, 2ik8:A, 2ik8:C, 5kdl:A, 5kdl:B, 5kdo:A, 1kjy:A, 1kjy:C, 6m8h:A, 6mhe:A, 6mhf:A, 4n0d:A, 4n0e:A, 2ode:A, 2ode:C, 2om2:A, 2om2:C, 3onw:A, 3onw:B, 8oy1:A, 4pam:A, 4pao:A, 4paq:A, 3qe0:B, 3qe0:A, 3qe0:C, 3qi2:A, 3qi2:B, 7rky:A, 1svk:A, 1svs:A, 5tdh:A, 5tdh:H, 3umr:A, 3ums:A, 2v4z:A, 7x6i:E, 7x6i:F, 7x6i:G, 7x6i:H, 2xns:A, 2xns:B, 1y3a:A, 1y3a:B, 1y3a:C, 1y3a:D, 2zjy:A, 2zjz:A, 2zjz:B
71 4d0g:A 167 119 0.1963 0.1916 0.2689 5.31e-05 4drz:A, 1z0f:A
72 6o62:A 169 81 0.1472 0.1420 0.2963 6.14e-05
73 8pjk:A 222 123 0.1963 0.1441 0.2602 7.56e-05 7e2x:A, 7e2z:A
74 2hei:B 165 116 0.1595 0.1576 0.2241 7.73e-05 2hei:A
75 2il1:A 163 118 0.1840 0.1840 0.2542 1.34e-04
76 3rwm:B 179 81 0.1534 0.1397 0.3086 1.71e-04 3rwo:B, 3rwo:A
77 4fid:A 318 97 0.1595 0.0818 0.2680 1.85e-04 4fid:B
78 2ew1:A 171 131 0.2209 0.2105 0.2748 1.89e-04
79 3v00:C 353 97 0.1534 0.0708 0.2577 2.16e-04 1fqj:A, 1fqj:D, 1fqk:A, 1fqk:C, 1got:A, 7jsn:E, 7jsn:F, 1tad:A, 1tad:B, 1tad:C, 1tag:A, 1tnd:A, 1tnd:B, 1tnd:C, 3v00:B, 3v00:A
80 3bfk:B 179 166 0.2393 0.2179 0.2349 2.24e-04 3bfk:A, 3bfk:C, 3bfk:D, 3bfk:E
81 2ocb:A 173 166 0.2086 0.1965 0.2048 2.31e-04
82 6s5h:A 175 173 0.2577 0.2400 0.2428 2.86e-04 6hdu:A, 6hdu:B, 6hdu:C, 6hdu:D
83 8e05:A 1749 86 0.1718 0.0160 0.3256 2.99e-04 8e05:B, 8e06:A
84 8fac:A 1377 86 0.1718 0.0203 0.3256 3.09e-04 8e04:A
85 1xzq:A 449 173 0.2883 0.1047 0.2717 5.10e-04 1xzq:B
86 2hup:A 162 153 0.2025 0.2037 0.2157 5.24e-04 2hup:B
87 1byu:B 215 168 0.2270 0.1721 0.2202 7.03e-04 6a38:A, 6a3a:A, 6a3b:A, 6a3c:A, 6a3e:A, 3a6p:C, 3a6p:H, 7b51:B, 2bku:A, 2bku:C, 5bxq:C, 5bxq:D, 5bxq:E, 1byu:A, 4c0q:C, 4c0q:D, 3ch5:A, 5ciq:A, 5ciq:B, 5cit:A, 5cit:B, 5ciw:A, 5ciw:B, 6cit:A, 5cj2:A, 5cj2:B, 5cj2:C, 5cj2:D, 5cj2:E, 5cj2:F, 5cj2:G, 5cj2:H, 5cll:A, 5cll:C, 5clq:A, 5clq:C, 7cnd:A, 7dbg:A, 5dh9:A, 5dha:A, 5dhf:A, 5di9:A, 5dif:A, 5dis:B, 5dlq:C, 5dlq:D, 3ea5:A, 3ea5:C, 3gj0:A, 3gj0:B, 3gj3:A, 3gj4:A, 3gj4:C, 3gj5:A, 3gj5:C, 3gj6:A, 3gj7:A, 3gj7:C, 3gj8:A, 3gj8:C, 3gjx:C, 3gjx:F, 4gmx:A, 4gpt:A, 4hat:A, 4hau:A, 4hav:A, 4haw:A, 4hax:A, 4hay:A, 4haz:A, 4hb0:A, 4hb2:A, 4hb3:A, 4hb4:A, 8hq3:A, 8hq4:A, 8hq5:A, 8hq6:A, 8huf:A, 8hug:A, 1ibr:A, 1ibr:C, 8itv:A, 5jlj:A, 1k5d:A, 1k5d:D, 1k5d:G, 1k5d:J, 1k5g:A, 1k5g:D, 1k5g:G, 1k5g:J, 6kft:A, 7l5e:A, 6lq9:A, 6m60:A, 6m6x:A, 7mnp:A, 7mnp:C, 7mnq:A, 7mnr:A, 7mns:A, 7mnt:A, 7mnt:C, 7mnu:A, 7mnv:A, 7mnw:A, 7mnw:C, 7mnw:E, 7mnw:G, 7mnx:A, 7mnx:C, 7mnx:E, 7mnx:G, 7mnx:I, 7mnx:K, 7mny:A, 7mny:C, 7mny:E, 7mny:G, 7mny:I, 7mny:K, 7mnz:A, 7mnz:C, 7mnz:E, 7mnz:G, 7mnz:I, 7mnz:K, 7mo0:A, 7mo0:C, 7mo1:A, 7mo2:A, 7mo2:C, 7mo3:A, 7mo3:C, 7mo4:A, 7mo4:C, 7mo5:A, 3nby:C, 3nby:F, 3nbz:C, 3nbz:F, 3nc0:C, 3nc0:F, 3nc1:C, 4ol0:A, 6q82:B, 6q84:B, 6q84:E, 1qbk:C, 1qg2:A, 1qg4:A, 1qg4:B, 3ran:A, 3ran:B, 3ran:C, 3ran:D, 1rrp:A, 1rrp:C, 6tvo:B, 5uwh:A, 5uwi:A, 5uwj:A, 5uwo:A, 5uwp:A, 5uwq:A, 5uwr:A, 5uws:A, 5uwt:A, 5uwu:A, 5uww:A, 3w3z:B, 1wa5:A, 4wvf:A, 6x2m:A, 6x2o:A, 6x2p:A, 6x2r:A, 6x2s:A, 6x2u:A, 6x2v:A, 6x2w:A, 6x2x:A, 6x2y:A, 6xjp:A, 6xjr:A, 6xjs:A, 6xjt:A, 6xju:A, 7ypz:A, 5yro:A, 5yst:A, 5ysu:A, 5ytb:A, 5yu6:B, 5yu6:D, 3zjy:A, 3zjy:D, 3zjy:F, 5zpu:A
88 2bme:A 176 160 0.2147 0.1989 0.2188 0.001 2bmd:A, 2bme:B, 2bme:C, 2bme:D, 1yu9:A, 1z0k:A, 1z0k:C
89 2e87:A 356 175 0.2638 0.1208 0.2457 0.001
90 1z08:C 167 164 0.2515 0.2455 0.2500 0.001 1yzt:A, 1yzt:B, 1yzu:A, 1yzu:B, 1z08:A, 1z08:B, 1z08:D, 1z0i:A
91 1n6o:A 170 118 0.1656 0.1588 0.2288 0.002 7bl1:DDD, 1huq:A, 4kyi:B, 4kyi:D, 4kyi:F, 4kyi:H, 3mjh:A, 3mjh:C, 1n6h:A, 1n6i:A, 1n6k:A, 1n6l:A, 1n6n:A, 1n6p:A, 1n6r:A, 1r2q:A, 1tu3:A, 1tu3:B, 1tu3:C, 1tu3:D, 1tu3:E, 1tu4:A, 1tu4:B, 1tu4:C, 1tu4:D, 1z07:A, 1z0d:A, 1z0d:C
92 3c7k:C 311 97 0.1595 0.0836 0.2680 0.003 3c7k:A
93 2efc:B 165 117 0.1718 0.1697 0.2393 0.003 2efc:D, 2efe:B, 2efe:D, 2efh:B, 2efh:D, 4g01:B
94 4djt:B 204 154 0.2454 0.1961 0.2597 0.003 4djt:A
95 3ref:B 180 76 0.1411 0.1278 0.3026 0.004 4dvg:A, 3ref:A, 3reg:A, 3reg:B
96 6hh2:A 174 170 0.2209 0.2069 0.2118 0.004 8fo2:B
97 6ian:E 167 83 0.1534 0.1497 0.3012 0.004 6ia7:A, 6iae:A
98 5ub8:A 174 134 0.2086 0.1954 0.2537 0.005
99 7obq:v 201 124 0.2025 0.1642 0.2661 0.006 2fh5:B, 6frk:v, 7nfx:v
100 8tzh:A 1485 136 0.2147 0.0236 0.2574 0.007 3d6t:B
101 2f9m:A 182 81 0.1411 0.1264 0.2840 0.010 4c4p:A, 5c46:F, 5c4g:B, 4d0l:B, 4d0l:D, 4d0l:F, 4d0m:B, 4d0m:D, 4d0m:H, 4d0m:J, 4d0m:N, 4d0m:P, 4d0m:R, 4d0m:T, 4d0m:X, 4d0m:Z, 4d0m:d, 4d0m:h, 2d7c:A, 2d7c:B, 5euq:B, 5ez5:A, 5ez5:B, 2f9l:A, 5fbl:B, 5fbq:B, 5fbr:B, 5fbv:B, 5fbw:B, 2gzd:A, 2gzd:B, 2gzh:A, 2hv8:A, 2hv8:B, 2hv8:C, 6iy1:A, 6iy1:B, 6iy1:C, 6iy1:D, 6iy1:E, 6iy1:F, 5jcz:A, 5jcz:D, 5jcz:I, 4lwz:A, 4lwz:C, 4lx0:A, 4lx0:C, 1oiv:A, 1oiv:B, 1oiw:A, 1oix:A, 4ojk:A, 4ojk:B, 4uj3:A, 4uj3:D, 4uj3:G, 4uj3:J, 4uj3:M, 4uj3:P, 4uj3:S, 4uj3:V, 4uj4:A, 4uj4:D, 4uj4:G, 4uj4:J, 4uj5:A, 4uj5:B, 8vof:B, 1yzk:A
102 3cpj:B 164 77 0.1288 0.1280 0.2727 0.010
103 1vg8:A 184 162 0.2086 0.1848 0.2099 0.011 7f6j:A, 7f6j:B, 6iyb:A, 6iyb:C, 8kb8:C, 8kb8:D, 3law:A, 3law:B, 3law:C, 3law:D, 3law:E, 1t91:A, 1t91:B, 1t91:C, 1t91:D, 1vg0:B, 1vg1:A, 1vg8:B, 1vg8:C, 1vg8:D, 1vg9:B, 1vg9:D, 1vg9:F, 1vg9:H, 6wcw:B, 1yhn:A, 5z2m:A, 5z2m:C, 8zq3:A
104 7rkf:A 350 95 0.1350 0.0629 0.2316 0.020
105 4wnr:A 323 83 0.1534 0.0774 0.3012 0.021
106 8tzf:A 1589 56 0.1104 0.0113 0.3214 0.026
107 3ab3:A 322 94 0.1288 0.0652 0.2234 0.031 3ab3:C, 3cx6:A, 3cx7:A, 3cx8:A, 1zcb:A
108 5xr4:B 171 81 0.1350 0.1287 0.2716 0.043 5xr4:A, 5xr6:A, 5xr6:B, 5xr7:A, 5xr7:B
109 6vij:B 191 90 0.1350 0.1152 0.2444 0.053 6vii:B, 6vii:A, 6vij:A, 6vik:B
110 3c5c:B 167 118 0.2025 0.1976 0.2797 0.076 3c5c:A, 3c5c:C, 3c5c:D
111 8u8b:A 1712 144 0.2209 0.0210 0.2500 0.076 8u7l:B, 8u7l:A, 8u8a:B, 8u8a:C, 8u8b:B, 2zej:A
112 6ulg:G 310 86 0.1411 0.0742 0.2674 0.10 8dhb:A, 3llu:A, 6nzd:G, 2q3f:A, 2q3f:B, 6s6a:C, 6s6a:D, 6s6d:D, 6sb0:D, 6sb0:J, 6sb2:D, 6sb2:J, 7t3b:E, 7t3c:E, 6u62:C, 7ux2:C, 7ux2:J, 7uxc:E, 7uxc:L, 7uxh:G, 7uxh:N, 7uxh:W, 7uxh:d, 6wj2:G, 6wj3:G
113 4lhv:E 148 171 0.2454 0.2703 0.2339 0.14
114 3a1s:A 255 173 0.3067 0.1961 0.2890 0.18 3a1s:B, 3a1t:A, 3a1u:A, 3a1u:B
115 8iys:A 355 107 0.1411 0.0648 0.2150 0.20 3ah8:A, 2bcj:Q, 5do9:A, 5do9:C, 5do9:E, 4ekc:A, 4ekc:C, 4ekd:A, 4gnk:A, 4gnk:C, 8jpb:Q, 8jpc:Q, 8jpe:Q, 4qj3:A, 4qj4:A, 4qj5:A, 2rgn:A, 2rgn:D, 7sq2:A, 8uqn:A, 8uqo:A
116 1z22:A 164 165 0.2147 0.2134 0.2121 0.24 1z2a:A
117 8fo9:F 2289 147 0.2147 0.0153 0.2381 0.36 9c61:A, 9c61:B, 8fo2:E, 8fo7:C, 8fo8:C, 8fo8:E, 8fo9:E, 7lht:A, 7lht:B, 7lhw:A, 7li3:A, 7li4:A, 6oje:A, 6oje:B, 6ojf:A, 6ojf:B, 7thy:A, 7thz:A, 6xaf:A, 6xaf:B, 2zej:B
118 3b1v:A 264 172 0.2638 0.1629 0.2500 0.40 3b1w:A, 3b1w:B, 3b1w:C, 3b1w:D, 3b1x:A, 3b1x:B, 3b1y:A, 7bvu:A, 7bvu:B, 7bwv:A, 7bwv:B, 3lx5:A, 3lx8:A, 4non:A, 4non:B, 3ss8:A, 3ss8:B, 3tah:A, 3tah:B
119 8smc:C 1084 66 0.1166 0.0175 0.2879 0.40
120 2ax4:A 198 49 0.1104 0.0909 0.3673 0.41 2ax4:B, 2ax4:C, 2ax4:D, 8i1n:A, 8i1n:B, 8i1n:C, 8i1n:D, 8i1o:A, 8i1o:B, 8i1o:C, 8i1o:D
121 8fo9:A 1173 67 0.1166 0.0162 0.2836 0.50 8fo9:C
122 8htg:B 334 81 0.1350 0.0659 0.2716 0.53 8htg:A, 8htg:C, 8htg:D
123 8u7h:C 1111 67 0.1166 0.0171 0.2836 0.54
124 8glw:A 483 59 0.1288 0.0435 0.3559 0.63 8glu:G, 8glu:F, 8glu:E, 8glw:E, 8glw:F, 8glw:B, 8glw:C, 8glw:D, 8glw:G, 8glx:F, 8glx:B, 8glx:G, 8glx:E, 8glx:C, 8glx:A, 7mbw:A, 7mbw:B, 7mbw:C, 7mbw:D, 7mcs:A, 7mcs:D, 7mcs:B, 7mcs:C, 7mcs:E, 7mcs:F, 8vcj:B, 8vcj:F, 8vcj:C, 8vcj:A, 8vcj:D, 8vcj:E, 8vcj:G, 8vct:C, 8vct:B, 8vct:G, 8vct:E, 8vct:F, 8vct:A
125 8ggb:A 310 80 0.1227 0.0645 0.2500 0.67 8gg9:A, 8ggc:A
126 6eg8:I 372 80 0.1227 0.0538 0.2500 0.72 6au6:A, 1azs:C, 1azt:A, 1azt:B, 7bph:A, 8buz:B, 8bv5:B, 3c14:C, 3c15:C, 3c16:C, 1cjk:C, 1cjt:C, 1cju:C, 1cjv:C, 1cs4:C, 1cul:C, 7e5e:A, 7e5e:B, 7e5e:C, 7e5e:D, 6eg8:J, 6eg8:K, 6eg8:L, 3g82:C, 8gge:A, 8ggf:A, 2gvd:C, 2gvz:C, 3maa:C, 7pde:B, 7pdf:B, 6r3q:B, 6r4o:B, 6r4p:B, 1tl7:C, 1u0h:C, 8uo3:A
127 8uo1:A 334 80 0.1227 0.0599 0.2500 0.74 8gga:A
128 7mcs:G 358 59 0.1288 0.0587 0.3559 0.84
129 7e13:A 475 25 0.0798 0.0274 0.5200 0.94 7e13:B, 7e13:C, 7e13:D
130 2hxs:A 178 126 0.1779 0.1629 0.2302 0.98 3e5h:A
131 3clv:A 175 173 0.2638 0.2457 0.2486 1.1
132 7oar:B 413 31 0.1043 0.0412 0.5484 1.4
133 7oar:A 442 31 0.1043 0.0385 0.5484 1.4 7bil:A, 7bil:B, 6s3h:A, 6s3h:B, 6s3i:A, 6s3m:A, 6s3m:B, 6s3n:A, 6s3n:B, 6s3o:A, 6s3p:A
134 4zu9:A 582 39 0.0920 0.0258 0.3846 1.5
135 6ces:A 300 86 0.1227 0.0667 0.2326 1.8 8dhb:B, 6s6a:A, 6s6a:B, 6s6d:A, 6s6d:B, 6sb0:C, 6sb0:I, 6sb2:C, 6sb2:I, 7t3a:K, 7t3b:D, 7t3c:D, 7t3c:K, 6u62:B, 6ulg:F, 7ux2:B, 7ux2:I, 7uxc:D, 7uxc:K, 7uxh:F, 7uxh:M, 7uxh:V, 7uxh:c, 6wj2:F, 6wj3:F
136 6hxu:A 182 84 0.1350 0.1209 0.2619 2.9 2fv8:A, 6sge:A, 6sge:C
137 8tyq:A 957 115 0.1963 0.0334 0.2783 3.5 8tze:A
138 8ggf:R 202 36 0.0736 0.0594 0.3333 4.0
139 4b4d:A 256 69 0.1288 0.0820 0.3043 4.0
140 2iw3:B 980 44 0.1043 0.0173 0.3864 5.2 7b7d:EF, 2iw3:A, 2iwh:A, 2iwh:B
141 6vno:A 1084 145 0.2209 0.0332 0.2483 5.3 6vp6:A
142 7v2b:D 376 155 0.2209 0.0957 0.2323 5.8 7v2b:A, 7v3w:A, 7v3w:D
143 3q5i:A 470 72 0.1166 0.0404 0.2639 6.2
144 5m7o:A 448 48 0.0736 0.0268 0.2500 6.2 4d6y:A, 4d6y:B, 5m7n:A, 5m7o:B, 5m7p:A, 5m7p:B
145 5m7n:B 428 48 0.0736 0.0280 0.2500 7.1
146 7zhf:A 250 44 0.1043 0.0680 0.3864 8.1 7zhk:A, 7zhk:B, 7zhk:C
147 6s6d:C 284 78 0.1350 0.0775 0.2821 8.3
148 7owj:F 197 20 0.0613 0.0508 0.5000 9.2 7owe:E, 7owe:F, 7owe:D, 7owe:A, 7owe:B, 7owe:C, 7owj:A, 7owj:B, 7owj:C, 7owj:D, 7owj:E, 7owk:B, 7owk:A, 7owk:C, 7owk:D, 7owk:E, 7owk:F, 7owl:A, 7owl:B, 7owl:C, 7owl:D, 7owl:E, 7owl:F
149 1xjq:A 563 51 0.1166 0.0337 0.3725 10.0 2pey:B, 1xnj:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218