Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MREVINFNTWAFTKEATEVPKEMPEKWYWVTLPHSWNEIDGQDGGNDYYRGTCYYAKQLKKSELPEADCYYLELRGANAS
ADVYVNGKAVAHHDGGYSTWRVDITKELTEEENLIVIAVENGVNDRVYPQNADFTFYGGLYRDVNIIAVNKSHFDLDYYG
GPGIKVTPEIKGADASVEVEVFLTNAAADQKLVYTVKDAEGKEVAKTETAAGETKAVLSIPAVHLWNGKKDPYLYTAEVA
LVSGEEAVDAVSTRFGCRTFEIDPERGFILNGEEYPLRGVSRHQDRWGIGNALLPEHHREDIDLICELGATTIRLAHYQH
DQYFYDLCDERGLVIWAEIPYISHMPNGRENTISQMKELVVQNYNHPSIVVWGLSNEITMAGSSDEDLLENHRILNDMVH
EMDHTRLTTIAVVSMCDIHDPYIQIPDVISYNHYFGWYGGDVSMNGPWMDNFHKEFPNIPLGMSEYGCEALNWHTSDPKQ
GDYTEEYQAYYHEEMIKQLFTRKYIWATHVWNMFDFGADARNEGGENGQNHKGLVTFDRKYKKDSFYAYKAWLSDEPFVH
LCGKRYVDRVEDTTKVTVYSNLPEVELFVNGKSAGKLQAEDHFFHFEVPNVGESTLVAVAGEYKDESHIRKVDTFNEEYS
LK

The query sequence (length=642) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8get:C 659 644 0.9984 0.9727 0.9953 0.0 8ges:A, 8ges:D, 8ges:C, 8ges:B, 8get:A, 8get:B, 8get:D, 6mvh:A, 6mvh:B, 6mvh:C
2 6mvg:A 637 640 0.7586 0.7645 0.7609 0.0 6mvg:B, 6mvg:C
3 7kgz:B 634 641 0.5389 0.5457 0.5398 0.0 7kgz:A
4 6mvf:A 643 649 0.4813 0.4806 0.4761 0.0 6mvf:B, 6mvf:C, 6mvf:D, 6mvf:E, 6mvf:F
5 5z1a:A 655 602 0.3629 0.3557 0.3870 4.88e-129
6 8dhl:B 853 670 0.3551 0.2673 0.3403 1.40e-101 8dhl:A
7 6d50:B 840 666 0.3411 0.2607 0.3288 2.31e-100 6d50:A, 6nzg:A, 6nzg:B, 5uj6:A, 5uj6:B
8 6mvh:D 305 264 0.2601 0.5475 0.6326 1.89e-93
9 6mvh:D 305 143 0.2040 0.4295 0.9161 1.20e-84
10 6ncz:C 589 542 0.2601 0.2835 0.3081 1.24e-59 6ncz:A, 6ncz:B, 6ncz:D, 6ncz:E, 6ncz:F
11 6d7j:A 799 642 0.2788 0.2240 0.2788 1.25e-58 6d7j:D
12 7vqm:A 584 540 0.2399 0.2637 0.2852 6.23e-49 7vqm:B, 7vqm:C, 7vqm:D
13 8e72:B 598 584 0.2570 0.2759 0.2825 1.92e-44 8dhw:A, 8dhw:B, 8e72:A
14 5t99:A 757 636 0.2632 0.2232 0.2657 3.64e-44 5t99:B
15 6d41:B 579 535 0.2321 0.2573 0.2785 1.25e-43 6d41:A, 6d6w:A, 6d6w:B, 6d6w:C, 6d6w:D, 6d7f:A, 6d7f:B, 6d7f:C, 6d7f:D, 6d7f:E, 6d7f:F
16 6cxs:B 599 578 0.2352 0.2521 0.2612 1.44e-43 6cxs:A
17 5z1b:A 627 597 0.2383 0.2440 0.2563 2.55e-41 6ld0:A, 6ld0:B, 6ld0:C, 6ld0:D, 6ldb:A, 6ldb:B, 6ldb:C, 6ldb:D, 6ldc:A, 6ldc:B, 6ldc:C, 6ldc:D, 6ldd:A, 6ldd:B, 6ldd:C, 6ldd:D, 5z1b:B, 5z1b:C, 5z1b:D
18 4jkl:A 587 592 0.2305 0.2521 0.2500 3.71e-40 4jkl:B
19 6bjq:A 598 589 0.2321 0.2492 0.2530 7.21e-40 6d4o:A, 8gen:A, 8geo:A, 8geq:A, 8ger:A, 8ugt:A
20 7cwd:A 803 672 0.2835 0.2267 0.2708 1.02e-38
21 6ncx:B 559 539 0.2290 0.2630 0.2727 3.64e-38 6ncx:D, 6ncx:A, 6ncx:C
22 6u7j:A 569 553 0.2150 0.2425 0.2495 4.74e-37 6u7j:C, 6u7j:D
23 5c71:A 583 566 0.2181 0.2401 0.2473 1.20e-35 5c71:C
24 6ed2:A 591 511 0.2056 0.2234 0.2583 5.03e-34
25 5t9g:C 811 702 0.2601 0.2059 0.2379 7.88e-34 5t9g:A, 5t9g:B, 5t9g:D
26 7kgy:A 593 521 0.2134 0.2310 0.2630 1.08e-33 7kgy:B, 7kgy:C, 7kgy:D
27 6hpd:A 955 681 0.2648 0.1780 0.2496 4.62e-33
28 6jz4:A 576 511 0.1963 0.2188 0.2466 7.91e-33 6jz5:A, 6jz5:B, 6jz7:A, 6jz7:B, 6jz8:B
29 1bhg:A 611 574 0.2352 0.2471 0.2631 1.17e-32 1bhg:B, 3hn3:A, 3hn3:B, 3hn3:D, 3hn3:E
30 3lpf:A 603 582 0.2290 0.2438 0.2526 3.14e-31 5czk:A, 5czk:B, 4jhz:A, 4jhz:B, 3k4d:A, 3k4d:B, 6leg:A, 6leg:B, 6leg:C, 6leg:D, 6lej:A, 6lej:B, 6lel:A, 6lel:B, 6lem:A, 6lem:B, 3lpf:B, 3lpg:A, 3lpg:B, 8ohx:AAA, 8ohx:BBB, 7pr6:AAA, 7pr6:BBB
31 5z19:B 601 521 0.1963 0.2097 0.2418 6.38e-31 6jz2:A, 6jz2:B, 6jz3:A, 6jz3:B, 6jz4:B, 6jz6:A, 6jz6:B, 6jz8:A, 5z19:A, 5z19:C, 5z19:D, 5z19:E, 5z19:F
32 5ldr:A 731 380 0.1682 0.1477 0.2842 1.47e-30 5ldr:B
33 4cu7:A 848 686 0.2695 0.2040 0.2522 9.36e-28 4cu8:A, 4cuc:A
34 6qud:A 837 405 0.1573 0.1207 0.2494 6.37e-25
35 7nit:D 1253 409 0.1558 0.0798 0.2445 1.21e-22 5dmy:A, 5dmy:B, 5dmy:C, 7nit:A, 7nit:B, 7nit:C, 7nit:E, 7nit:F, 6qub:A, 6qub:B, 6quc:A, 6quc:B
36 6bo6:A 493 334 0.1324 0.1724 0.2545 8.06e-22
37 6bo6:A 493 146 0.0623 0.0811 0.2740 1.57e-05
38 3ob8:A 1024 485 0.1713 0.1074 0.2268 2.42e-21 3ob8:B, 3ob8:D, 3ob8:C, 3oba:A, 3oba:C, 3oba:D, 3oba:B
39 6s6z:A 1083 329 0.1402 0.0831 0.2736 8.90e-21 6s6z:D, 6s6z:B, 6s6z:H, 6s6z:F, 6s6z:G, 6s6z:E, 6s6z:C, 6sd0:A, 6sd0:B, 6sd0:C, 6sd0:D
40 1yq2:A 1020 396 0.1604 0.1010 0.2601 3.23e-18 1yq2:B, 1yq2:C, 1yq2:D, 1yq2:E, 1yq2:F
41 3bga:A 1003 314 0.1402 0.0897 0.2866 1.35e-17 3bga:B
42 7xyr:A 546 401 0.1526 0.1795 0.2444 3.21e-16
43 5n6u:A 811 458 0.1682 0.1332 0.2358 8.91e-16 5n6u:B, 5n6u:C, 5n6u:D
44 6se9:A 989 328 0.1231 0.0799 0.2409 6.79e-14 6sea:A, 6seb:A, 6sec:A, 6sed:A, 6zjq:A, 6zjr:A, 6zjs:A, 6zjt:A, 6zju:A, 6zjw:A, 6zjx:A
45 7sf2:A 586 284 0.1090 0.1195 0.2465 2.16e-10 7sf2:B, 7sf2:C, 7sf2:D, 7sf2:E, 7sf2:F
46 7btk:C 1023 326 0.1231 0.0772 0.2423 4.48e-10 5a1a:A, 5a1a:B, 5a1a:C, 5a1a:D, 7brs:A, 7brs:B, 7brs:C, 7brs:D, 7btk:A, 7btk:B, 7btk:D, 6cvm:A, 6cvm:B, 6cvm:C, 6cvm:D, 3czj:A, 3czj:B, 3czj:C, 3czj:D, 1dp0:A, 1dp0:B, 1dp0:C, 1dp0:D, 4duv:A, 4duv:B, 4duv:C, 4duv:D, 4duw:A, 4duw:B, 4duw:C, 4duw:D, 4dux:A, 4dux:B, 4dux:C, 4dux:D, 3dym:A, 3dym:B, 3dym:C, 3dym:D, 3dyo:A, 3dyo:B, 3dyo:C, 3dyo:D, 3dyp:A, 3dyp:B, 3dyp:C, 3dyp:D, 3e1f:1, 3e1f:2, 3e1f:3, 3e1f:4, 1f4a:A, 1f4a:B, 1f4a:C, 1f4a:D, 1f4h:A, 1f4h:B, 1f4h:C, 1f4h:D, 1hn1:A, 1hn1:B, 1hn1:C, 1hn1:D, 3i3b:A, 3i3b:B, 3i3b:C, 3i3b:D, 3i3d:A, 3i3d:B, 3i3d:C, 3i3d:D, 3i3e:A, 3i3e:B, 3i3e:C, 3i3e:D, 3iap:A, 3iap:B, 3iap:C, 3iap:D, 3iaq:A, 3iaq:B, 3iaq:C, 3iaq:D, 3j7h:A, 3j7h:B, 3j7h:C, 3j7h:D, 1jyn:A, 1jyn:B, 1jyn:C, 1jyn:D, 1jyv:A, 1jyv:B, 1jyv:C, 1jyv:D, 1jyw:A, 1jyw:B, 1jyw:C, 1jyw:D, 1jyx:A, 1jyx:B, 1jyx:C, 1jyx:D, 1jz2:A, 1jz2:B, 1jz2:C, 1jz2:D, 1jz3:A, 1jz3:B, 1jz3:C, 1jz3:D, 1jz4:A, 1jz4:B, 1jz4:C, 1jz4:D, 1jz5:A, 1jz5:B, 1jz5:C, 1jz5:D, 1jz6:A, 1jz6:B, 1jz6:C, 1jz6:D, 1jz7:A, 1jz7:B, 1jz7:C, 1jz7:D, 1jz8:A, 1jz8:B, 1jz8:C, 1jz8:D, 6kuz:A, 6kuz:B, 6kuz:C, 6kuz:D, 3muy:1, 3muy:2, 3muy:3, 3muy:4, 3muz:1, 3muz:2, 3muz:3, 3muz:4, 3mv0:1, 3mv0:2, 3mv0:3, 3mv0:4, 3mv1:1, 3mv1:2, 3mv1:3, 3mv1:4, 1px3:A, 1px3:B, 1px3:C, 1px3:D, 1px4:A, 1px4:B, 1px4:C, 1px4:D, 3sep:A, 3sep:B, 3sep:C, 3sep:D, 3t08:A, 3t08:B, 3t08:C, 3t08:D, 3t09:A, 3t09:B, 3t09:C, 3t09:D, 3t0a:A, 3t0a:B, 3t0a:C, 3t0a:D, 3t0b:A, 3t0b:B, 3t0b:C, 3t0b:D, 3t0d:A, 3t0d:B, 3t0d:C, 3t0d:D, 3t2o:A, 3t2o:B, 3t2o:C, 3t2o:D, 3t2p:A, 3t2p:B, 3t2p:C, 3t2p:D, 3t2q:A, 3t2q:B, 3t2q:C, 3t2q:D, 6tsh:A, 6tsh:B, 6tsh:C, 6tsh:D, 6tsk:A, 6tsk:B, 6tsk:C, 6tsk:D, 4ttg:A, 4ttg:B, 4ttg:C, 4ttg:D, 6tte:A, 6tte:B, 6tte:C, 6tte:D, 4v40:A, 4v40:B, 4v40:C, 4v40:D, 4v40:E, 4v40:F, 4v40:G, 4v40:H, 4v40:I, 4v40:J, 4v40:K, 4v40:L, 4v40:M, 4v40:N, 4v40:O, 4v40:P, 4v41:A, 4v41:B, 4v41:C, 4v41:D, 4v41:E, 4v41:F, 4v41:G, 4v41:H, 4v41:I, 4v41:J, 4v41:K, 4v41:L, 4v41:M, 4v41:N, 4v41:O, 4v41:P, 4v44:A, 4v44:B, 4v44:C, 4v44:D, 4v44:E, 4v44:F, 4v44:G, 4v44:H, 4v44:I, 4v44:J, 4v44:K, 4v44:L, 4v44:M, 4v44:N, 4v44:O, 4v44:P, 4v45:A, 4v45:B, 4v45:C, 4v45:D, 4v45:E, 4v45:F, 4v45:G, 4v45:H, 4v45:I, 4v45:J, 4v45:K, 4v45:L, 4v45:M, 4v45:N, 4v45:O, 4v45:P, 3vd3:A, 3vd3:B, 3vd3:C, 3vd3:D, 3vd4:A, 3vd4:B, 3vd4:C, 3vd4:D, 3vd5:A, 3vd5:C, 3vd5:D, 3vd5:B, 3vd7:A, 3vd7:B, 3vd7:C, 3vd7:D, 3vd9:A, 3vd9:B, 3vd9:C, 3vd9:D, 3vda:A, 3vda:B, 3vda:C, 3vda:D, 3vdb:A, 3vdb:B, 3vdb:C, 3vdb:D, 3vdc:A, 3vdc:B, 3vdc:C, 3vdc:D, 8vt0:A, 8vt0:B, 8vt0:C, 8vt0:D, 6x1q:A, 6x1q:B, 6x1q:C, 6x1q:D
47 2vzs:A 857 455 0.1589 0.1190 0.2242 5.04e-10 2vzs:B, 2vzt:A, 2vzt:B, 2vzu:A, 2vzu:B, 2vzv:A, 2vzv:B, 2x05:A, 2x05:B, 2x09:A, 2x09:B
48 6bye:A 861 377 0.1262 0.0941 0.2149 3.31e-09 6bye:B, 6byg:A, 6byg:B, 6byi:A, 6byi:B
49 6ddt:A 862 279 0.1059 0.0789 0.2437 3.53e-04 6ddu:A
50 2vl4:B 841 185 0.0732 0.0559 0.2541 0.001 7op6:A, 7op6:B, 7op7:A, 7op7:B, 2vjx:A, 2vjx:B, 2vl4:A, 2vmf:A, 2vmf:B, 2vo5:A, 2vo5:B, 2vot:A, 2vot:B, 2vqt:A, 2vqt:B, 2vqu:A, 2vqu:B, 2vr4:A, 2vr4:B, 2wbk:A, 2wbk:B
51 8gai:C 434 189 0.0763 0.1129 0.2593 0.18 5b56:A, 5b56:B, 4ba3:A, 3btr:C, 6bw0:E, 6bw1:E, 7cru:A, 7cru:C, 5ctt:A, 5d5k:C, 5e6q:B, 8ech:E, 1ejl:I, 1ejy:I, 5ekf:A, 5ekg:A, 8f2q:A, 5fc8:E, 8fk3:A, 8fua:A, 8fuc:B, 8fzk:C, 8g8q:A, 8g8r:A, 8g8s:A, 8gai:A, 5gxw:A, 5h43:A, 8he0:A, 8he3:A, 5hhg:E, 4htv:A, 5huw:C, 5huy:C, 1iq1:C, 6iu7:A, 6iua:A, 6iw8:C, 6iwa:C, 7jjm:B, 7jk7:B, 7jvo:A, 6k06:C, 5k9s:A, 5klr:B, 5klt:B, 3knd:A, 7l04:E, 3l3q:A, 7leq:E, 7let:E, 7leu:E, 7m60:A, 6mjl:B, 4mz5:E, 4mz6:E, 7n8j:A, 7n9h:C, 4oih:A, 3oqs:A, 6p6a:B, 6p6e:A, 1pjm:B, 1pjn:B, 1q1s:C, 1q1t:C, 3q5u:A, 8q8k:A, 8q8k:B, 8qxw:A, 8qxx:A, 7rfx:A, 7rfz:A, 7rg0:A, 7rg1:A, 7rg2:A, 7rg3:A, 7rg4:E, 7rg6:A, 3rz9:A, 3rzx:A, 8sg7:B, 8sud:A, 5svz:A, 8sv0:B, 7tmx:I, 7tmy:I, 3tpm:A, 8tuq:A, 8tur:A, 8tus:A, 8tut:A, 8tuu:A, 8tuv:A, 8u36:A, 4u54:A, 4u58:A, 4u5l:A, 4u5n:A, 4u5o:A, 4u5s:A, 4u5u:A, 4u5v:A, 5u5p:A, 5u5r:A, 3ukw:B, 3ukx:B, 3uky:B, 3ukz:B, 3ul0:B, 3ul1:B, 5umz:B, 7umi:E, 3uvu:A, 5v5o:C, 5v5p:C, 3ve6:A, 8vpr:A, 8vpu:A, 5w41:A, 5w4e:B, 5w4f:B, 5w4g:B, 6wba:A, 6wbb:I, 6wbc:A, 5wum:A, 5wun:A, 4wv6:A, 6wx7:A, 5x8n:A, 1y2a:C, 4yi0:C, 2ynr:A, 4zdu:A, 3zin:A, 3zio:A, 3zip:A, 3ziq:A, 3zir:A
52 4uoj:A 917 60 0.0249 0.0174 0.2667 1.9 4cvu:A, 4uoj:B
53 4hi0:E 196 44 0.0249 0.0816 0.3636 2.6 4hi0:F
54 7qy5:B 320 46 0.0234 0.0469 0.3261 2.7 7qy5:D
55 7t1h:A 342 93 0.0374 0.0702 0.2581 3.0 7t1g:A, 7t1h:B, 7t1i:A, 6uj5:A
56 3gz8:C 156 20 0.0171 0.0705 0.5500 6.6 3gz8:A, 3gz8:B, 3gz8:D
57 3loy:A 633 38 0.0218 0.0221 0.3684 7.3 3loy:B, 3loy:C
58 4qpd:A 308 64 0.0280 0.0584 0.2812 7.9 4qpd:B, 4tt8:A, 4tts:A
59 3gz6:A 219 20 0.0171 0.0502 0.5500 8.2 3gz6:B
60 7pog:A 2382 74 0.0343 0.0092 0.2973 9.9 4dmw:A, 3ho6:A, 3ho6:B, 4r04:A, 3srz:A, 3ss1:A, 7u2p:A, 7uby:B, 7uby:A, 5uqk:A, 5uql:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218